Каприн-1 - Caprin-1

CAPRIN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4WBE, 4WBP
Идентификаторы
Псевдонимы	CAPRIN1, GPIAP1, GPIP137, GRIP137, M11S1, RNG105, p137GPI, белок 1, связанный с клеточным циклом
Внешние идентификаторы	OMIM: 601178 MGI: 1858234 ГомолоГен: 4310 Генные карты: CAPRIN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p13 Начинать 34,051,731 бп[1] Конец 34,102,610 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E2 Начинать 103,762,941 бп[2] Конец 103,797,649 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • Гранула стресса • дендрит • П-боди • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • проекция клетки • мембрана • цитоплазма • цитозоль • синапс Биологический процесс • дифференциация клеток • отрицательное регулирование перевода • положительная регуляция морфогенеза дендритов • положительная регуляция морфогенеза дендритного шипа Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4076	53872
Ансамбль	ENSG00000135387	ENSMUSG00000027184
UniProt	Q14444	Q60865
RefSeq (мРНК)	NM_005898 NM_203364	NM_001111289 NM_001111290 NM_001111291 NM_001111292 NM_016739
RefSeq (белок)	NP_005889 NP_976240	NP_001104759 NP_001104760 NP_001104761 NP_001104762 NP_058019
Расположение (UCSC)	Chr 11: 34.05 - 34,1 Мб	Chr 2: 103,76 - 103,8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Каприн-1 это белок что у людей кодируется CAPRIN1 ген.^{[5][6][7][8][9][10]} Предполагается, что Caprin1 (a.k.a. RNG105) необходим для образования Долгосрочная память.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135387 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027184 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Эллис Дж. А., Лусио Дж. П. (октябрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового белка (p137), который двунаправленно трансцитозирует в клетках Caco-2». J Biol Chem. 270 (35): 20717–23. Дои:10.1074 / jbc.270.35.20717. PMID  7657653.
6. Ван Б., Дэвид, доктор медицины, Шредер, Дж. У. (сентябрь 2005 г.). «Отсутствие каприна-1 приводит к дефектам клеточной пролиферации». J Immunol. 175 (7): 4274–82. Дои:10.4049 / jimmunol.175.7.4274. PMID  16177067.
7. Соломон С., Сюй Й., Ван Б., Дэвид М.Д., Шуберт П., Кеннеди Д., Шрейдер Дж. В. (февраль 2007 г.). «Отличительные структурные особенности каприна-1 опосредуют его взаимодействие с G3BP-1 и индукцию фосфорилирования фактора инициации трансляции эукариот 2α, проникновение в цитоплазматические стрессовые гранулы и селективное взаимодействие с подмножеством мРНК». Mol Cell Biol. 27 (6): 2324–42. Дои:10.1128 / MCB.02300-06. ЧВК  1820512. PMID  17210633.
8. Гриль Б, Уилсон Г.М., Чжан К.Х., Ван Б., Дойоннас Р., Квадрони М., Шрейдер Дж. В. (февраль 2004 г.). «Активация / деление лимфоцитов приводит к увеличению уровня цитоплазматической активации / связанного с пролиферацией белка-1: прототип нового семейства белков». J Immunol. 172 (4): 2389–400. Дои:10.4049 / jimmunol.172.4.2389. PMID  14764709.
9. Кацафанас GC, Moss B (декабрь 2004 г.). «Транскрипция промежуточной стадии вируса осповакцины дополняется белком, активирующим Ras-GTPase, связывающим домен SH3-белком (G3BP) и белком, ассоциированным с активацией / пролиферацией цитоплазмы (p137) индивидуально или в виде гетеродимера». J Biol Chem. 279 (50): 52210–7. Дои:10.1074 / jbc.M411033200. PMID  15471883.
10. «Ген Entrez: GPIAP1 GPI-заякоренный мембранный белок 1».
11. https://elifesciences.org/articles/29677

дальнейшее чтение

• Гесслер М., Кламт ​​Б., Цауссиду С. и др. (1996). «Ген, кодирующий GPI-заякоренный мембранный белок p137GPI (M11S1), отображается на хромосоме 11p13 человека и является высококонсервативным у мышей». Геномика. 32 (1): 169–70. Дои:10.1006 / geno.1996.0099. PMID  8786113.
• de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W. и др. (2000). «Фактор расщепления пре-мРНК человека IIm содержит гомологи дрожжевых белков и связывает два других фактора расщепления». EMBO J. 19 (21): 5895–904. Дои:10.1093 / emboj / 19.21.5895. ЧВК  305781. PMID  11060040.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.