Хординовый 1 - Chordin-like 1

CHRDL1
Идентификаторы
Псевдонимы	CHRDL1, хординоподобный 1, CHL, MGC1, MGCN, NRLN1, VOPT, dA141H5.1, хординовый 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 300350 MGI: 1933172 ГомолоГен: 12834 Генные карты: CHRDL1
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq23 Начинать 110,673,856 бп[1] Конец 110,795,819 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X F2 Начинать 143,285,674 бп[2] Конец 143,394,262 бп[2]
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	91851	83453
Ансамбль	ENSG00000101938	ENSMUSG00000031283
UniProt	Q9BU40	Q920C1
RefSeq (мРНК)	NM_001143981 NM_001143982 NM_001143983 NM_145234	NM_001114385 NM_031258 NM_001358592
RefSeq (белок)	NP_001137453 NP_001137454 NP_001137455 NP_660277 NP_001354133 NP_001354134 NP_001354135 NP_001354136 NP_001354137 NP_001354138	NP_001107857 NP_112548 NP_001345521
Расположение (UCSC)	Chr X: 110,67 - 110,8 Мб	Chr X: 143.29 - 143.39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хординовый 1 это белок что у человека кодируется CHRDL1 ген.^[5] Хординоподобный 1 (CHRDL1) представляет собой структурный гликопротеин, который находится на Х-хромосоме и специфически кодирует венотропин, который является антагонистическим белком по отношению к костному морфогенному белку 4.^[6]

Функция

Этот ген кодирует антагонист костный морфогенетический белок 4. Кодируемый белок может играть роль в топографической ретинотектальной проекции и в регуляции сетчатки. ангиогенез в ответ на гипоксия. Альтернативно сращивание Были описаны варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[5]

CHRDL1 играет важную роль в таких процессах, как дифференцировка эмбриональных клеток, остеогенез, нейрогенез, подавление опухолей и метастазов, а также формирование сетчатки.^[7][8] Наибольшая экспрессия этого гена обнаруживается в переднем сегменте глаза и сетчатке, а также в мозжечке и неокортексе.^[6] В неокортексе он достигает пика во время созревания синапсов, чтобы обеспечить правильное синаптическое образование.^[9] Следовательно, этот ген важен для правильного формирования центральной нервной системы и глаз.

Клиническое значение

Мутации в CHRDL1 связаны с Синдром Нойхойзера, Х-сцепленная мегалокорнея и центральная толщина роговицы.^[10]

Мутации в этом гене могут оказывать различное влияние на вышеупомянутые процессы. Одним из возможных результатов мутации CHRDL1 является несиндромальная Х-сцепленная мегалокорнея (XMC), которая возникает в результате бессмысленной, бессмысленной мутации или мутации со сдвигом рамки считывания гена.^[6] XMC - это увеличение передних сегментов глаза, которое может привести к другим проблемам, таким как катаракта и глаукома.^[6] Другой потенциальный результат - канцерогенное образование. Поскольку CHRDL1 является супрессором опухоли и метастазов, мутация в этом гене может привести к образованию опухолевых клеток.^[8] Самый главный эффект, который может иметь мутация, - это стабилизация синапсов. Поскольку ген ограничивает синаптическую пластичность, мутация может вызвать проблемы с правильным созреванием синапсов, что приведет к множеству неврологических расстройств.^[9] В настоящее время существует модель нокаута для этого гена, которая показывает, что нарушение может вызывать изменение синаптических событий и снижение синаптических GluA2 AMPAR, что приводит к снижению пластичности.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101938 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031283 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: подобный Chordin 1". Получено 2014-08-06.
6. Пфиррманн Т., Эммерих Д., Руоконен П., Квандт Д., Бухен Р., Фишер-Цирнзак Б. и др. (Июнь 2015 г.). «Молекулярный механизм CHRDL1-опосредованной X-связанной мегалокорнеи у людей и в модели Xenopus». Молекулярная генетика человека. 24 (11): 3119–32. Дои:10.1093 / hmg / ddv063. PMID  25712132.
7. Лю Т., Ли Б., Чжэн XF, Цзян С.Д., Чжоу З.З., Сюй В.Н. и др. (2019). «Хордин-подобный 1 улучшает остеогенез мезенхимальных стволовых клеток костного мозга за счет усиления пути BMP4-SMAD». Границы эндокринологии. 10: 360. Дои:10.3389 / fendo.2019.00360. ЧВК  6582276. PMID  31249554.
8. Пей Ю.Ф., Чжан Ю.Дж., Лей Ю., Ву В.Д., Ма ТХ, Лю XQ (апрель 2017 г.). «Гиперметилирование промотора CHRDL1 вызывает пролиферацию и метастазирование путем активации Akt и Erk при раке желудка». Oncotarget. 8 (14): 23155–23166. Дои:10.18632 / oncotarget.15513. ЧВК  5410293. PMID  28423564.
9. Бланко-Суарес Э., Лю Т.Ф., Копелевич А., Аллен Нью-Джерси (декабрь 2018 г.). «Секретируемый астроцитами хординоподобный 1 стимулирует созревание синапсов и ограничивает пластичность за счет увеличения синаптических рецепторов GluA2 AMPA». Нейрон. 100 (5): 1116–1132.e13. Дои:10.1016 / j.neuron.2018.09.043. ЧВК  6382071. PMID  30344043.
10. Дэвидсон AE, Cheong SS, Hysi PG, Venturini C, Plagnol V, Ruddle JB и др. (2014). «Ассоциация мутаций и вариантов CHRDL1 с Х-сцепленной мегалокорнеей, синдромом Нойхойзера и центральной толщиной роговицы». PLOS ONE. 9 (8): e104163. Bibcode:2014PLoSO ... 9j4163D. Дои:10.1371 / journal.pone.0104163. ЧВК  4122416. PMID  25093588.

дальнейшее чтение

• Сакута Х., Сузуки Р., Такахаши Х., Като А., Синтани Т., Ямамото Т.С. и др. (Июль 2001 г.). «Вентроптин: антагонист BMP-4, экспрессирующийся в сетчатке с двойным градиентом». Наука. 293 (5527): 111–5. Дои:10.1126 / science.1058379. PMID  11441185.
• Webb TR, Matarin M, Gardner JC, Kelberman D, Hassan H, Ang W и др. (Февраль 2012 г.). «Х-связанная мегалокорнея, вызванная мутациями в CHRDL1, указывает на важную роль вентроптина в развитии переднего сегмента». Американский журнал генетики человека. 90 (2): 247–59. Дои:10.1016 / j.ajhg.2011.12.019. ЧВК  3276677. PMID  22284829.
• Кейн Р., Годсон С., О'Брайен С. (июнь 2008 г.). «Хордин-подобный 1, костный морфогенетический антагонист протеина-4, активируется гипоксией в перицитах сетчатки человека и играет роль в регуляции ангиогенеза». Молекулярное зрение. 14: 1138–48. ЧВК  2435163. PMID  18587495.
• Fernandes H, Dechering K, van Someren E, Steeghs I, Apotheker M, Mentink A и др. (2010). «Влияние хординоподобного 1 на MC3T3-E1 и мезенхимальные стволовые клетки человека». Клетки Ткани Органы. 191 (6): 443–52. Дои:10.1159/000281825. PMID  20130390.
• Консорциум генетики ишемической болезни сердца (C4D) (март 2011 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование европейцев и выходцев из Южной Азии выявило пять новых локусов ишемической болезни сердца». Природа Генетика. 43 (4): 339–44. Дои:10,1038 / нг.782. PMID  21378988.
• Ларман Б.В., Каролак М.Дж., Адамс, округ Колумбия, Оксбург Л. (май 2009 г.). «Хординоподобный 1 и скрученная гаструляция 1 регулируют передачу сигналов BMP после повреждения почек». Журнал Американского общества нефрологов. 20 (5): 1020–31. Дои:10.1681 / ASN.2008070768. ЧВК  2678041. PMID  19357253.
• Coffinier C, Tran U, Larraín J, De Robertis EM (январь 2001 г.). «Нейралин-1 представляет собой новую молекулу, родственную Хордину, экспрессирующуюся в нервной пластинке мыши». Механизмы развития. 100 (1): 119–22. Дои:10.1016 / s0925-4773 (00) 00507-4. PMID  11118896.
• Газзерро Э., Каналис Э. (июнь 2006 г.). «Костные морфогенетические белки и их антагонисты». Обзоры в эндокринных и метаболических расстройствах. 7 (1–2): 51–65. Дои:10.1007 / s11154-006-9000-6. PMID  17029022.
• Чен Д., Чжао М., Манди Г.Р. (декабрь 2004 г.). «Костные морфогенетические белки». Факторы роста. 22 (4): 233–41. Дои:10.1080/08977190412331279890. PMID  15621726.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.