Кафедра вычислительной биологии - Computational Biology Department - Wikipedia

Кафедра вычислительной биологии
Департамент вычислительной биологии Logo.jpg
ТипЧастный
Учредил2007 (как Центр вычислительной биологии Лейна)
Место расположения
Питтсбург, Пенсильвания
КампусГородской
Интернет сайтhttp://www.cbd.cmu.edu/

В Вычислительная биология отделение (CBD) - это подразделение внутри Школа компьютерных наук в Университет Карнеги Меллон в Питтсбург, Пенсильвания, Соединенные Штаты. Он расположен в центре Гейтса-Хиллмана.

Основана в 2007 г. Роберт Ф. Мерфи как Центр вычислительной биологии Лейна при финансовой поддержке Раймонд Дж. Лейн и Стефани Лейн,[1] CBD стал отделом в Школе компьютерных наук в 2016 году.[2]

Преподаватели и студенты CBD проводят исследования в геномика,[3][4] системная биология,[5] и биологическая визуализация.[6][7] Его преподаватели были президентом Национальный фонд науки,[8] президент Международного общества передовой цитометрии,[9] и как член Национальные институты здоровья Совет Советов;[10] они выиграли Приз Овертона,[11] то Премия Окавы,[12] а ВВС США Премия молодому исследователю,[13] и Президентская премия молодому исследователю.[14]

В рамках инициативы HHMI-NIBIB Interfaces Initiative,[15] CBD получил финансирование от Медицинский институт Говарда Хьюза[16] и Национальный институт биомедицинской визуализации и биоинженерии (НИБИБ)[17] разработать междисциплинарную кандидатскую диссертацию. программа по вычислительной биологии с Питтсбургский университет, который был основан как Совместная работа CMU-Pitt Ph.D. Программа по вычислительной биологии в 2005 году.[18] Эта программа в настоящее время получает поддержку в обучении в рамках учебного гранта T32 Национального института здравоохранения.[19]

Известный факультет[20]

Заметные встречи организованы

  • РЕКОМБ 2014[21]
  • Конференция по биоинформатике Великих озер 2013 (совместно с Питтсбургским университетом)[22]
  • Автоматический персональный анализ генома (APGA) 2013[23]
  • Биоизображение информатики 2010[24]

Дипломные программы

  • Совместная работа CMU-Pitt Ph.D. Программа по вычислительной биологии (с Питтсбургский университет )[25]
  • РС. в области вычислительной биологии (совместно с отделением биологических наук)[26]
  • РС. в области биотехнологий, инноваций и вычислений (совместно с Институт языковых технологий )[27]
  • Б.С. в вычислительной биологии[28]
  • Незначительное по вычислительной биологии[29]

Рекомендации

  1. ^ (CMU), Университет Карнеги-Меллона. «20 сентября: Карнеги-Меллон создает Центр вычислительной биологии Рэя и Стефани Лейн - Университет Карнеги-Меллона». www.cmu.edu. Получено 2016-03-14.
  2. ^ (CMU), Университет Карнеги-Меллона. "22 сентября: Вычислительная биология становится кафедрой в Школе компьютерных наук Карнеги-Меллона - Университете Карнеги-Меллона". www.cmu.edu. Получено 2016-03-14.
  3. ^ «Вычислительный метод значительно ускоряет оценку экспрессии генов, CMU, отчет исследователей UMD | Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона». www.cs.cmu.edu. Получено 2016-03-15.
  4. ^ Патро, Роб; Mount, Стивен М .; Кингсфорд, Карл (01.05.2014). «Sailfish обеспечивает количественную оценку изоформ без выравнивания на основе считываний последовательностей РНК с использованием легких алгоритмов». Природа Биотехнологии. 32 (5): 462–464. arXiv:1308.3700. Дои:10.1038 / nbt.2862. ISSN  1087-0156. ЧВК  4077321. PMID  24752080.
  5. ^ Канфи, Ярив; Найман, Шошана; Амир, Гейл; Пешти, Виктория; Зинман, Гай; Наум, Лиат; Бар-Джозеф, Зив; Коэн, Хаим Й. (март 2012 г.). «Сиртуин SIRT6 регулирует продолжительность жизни мышей-самцов». Природа. 483 (7388): 218–221. Bibcode:2012Натура.483..218K. Дои:10.1038 / природа10815. PMID  22367546.
  6. ^ Naik, Armaghan W .; Кангас, Джошуа Д.; Салливан, Девин П .; Мерфи, Роберт Ф. (03.02.2016). «Активные эксперименты, основанные на машинном обучении, для определения влияния соединений на структуру белков». eLife. 5: e10047. Дои:10.7554 / eLife.10047. ЧВК  4798950. PMID  26840049.
  7. ^ «Роботизированная система ученых может снизить затраты на открытие взаимодействий с лекарствами и мишенями | Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона». www.cs.cmu.edu. Получено 2016-03-15.
  8. ^ "Биография Субра Суреш". www.nsf.gov. Получено 2016-03-15.
  9. ^ «Прошлые президенты - ISAC-NET». isac-net.org. Архивировано из оригинал на 2016-03-06. Получено 2016-03-29.
  10. ^ «Мерфи назначен в Совет советов NIH | Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона». www.cs.cmu.edu. Получено 2016-03-29.
  11. ^ "Премия Овертона 2012: Зив Бар-Джозеф". www.iscb.org. Получено 2016-03-15.
  12. ^ «Карбонелл выигрывает премию Окавы». www.scs.cmu.edu. Получено 2016-03-15.
  13. ^ «ВВС инвестируют более 14 миллионов долларов в программу исследований молодых исследователей 2010 года». www.wpafb.af.mil. Архивировано из оригинал на 2016-04-13. Получено 2016-03-15.
  14. ^ "Поиск награды NSF: Награда № 8351364 - Премия Президента" Молодому исследователю ". www.nsf.gov. Получено 2016-03-29.
  15. ^ "Инициатива интерфейсов HHMI-NIBIB". HHMI.org. Архивировано из оригинал на 2016-03-12. Получено 2016-03-14.
  16. ^ "Новости института: HHMI присуждает 10 миллионов долларов за междисциплинарное последипломное образование". HHMI.org. Получено 2016-03-14.
  17. ^ «NIBIB инвестирует в междисциплинарную подготовку аспирантов». www.nibib.nih.gov. Получено 2016-03-14.
  18. ^ "Пресс-релиз Карнеги-Меллона: 6 сентября 2005 г.". www.cmu.edu. Архивировано из оригинал 9 апреля 2016 г.. Получено 2016-03-14.
  19. ^ «Информация о проекте - NIH RePORTER - Инструменты онлайн-отчетности NIH Research Portfolio: расходы и результаты». projectreporter.nih.gov. Получено 2016-03-15.
  20. ^ Университет Карнеги-Меллона. «Факультет голосования - факультет вычислительной биологии - Университет Карнеги-Меллона». cbd.cmu.edu. Архивировано из оригинал на 2015-03-08. Получено 2016-03-14.
  21. ^ «РЕКОМБ 2014 - 2-5 апреля, Питтсбург, Пенсильвания». murphylab.web.cmu.edu. Получено 2016-03-14.
  22. ^ "ДОМА". www.iscb.org. Получено 2016-03-14.
  23. ^ Университет Карнеги-Меллона. «Автоматизированный персональный анализ генома для клинических консультантов: проблемы и решения - Департамент вычислительной биологии - Университет Карнеги-Меллона». cbd.cmu.edu. Архивировано из оригинал на 2015-09-06. Получено 2016-03-29.
  24. ^ Университет Карнеги-Меллона. "Bioimage Informatics 2010 - факультет вычислительной биологии - Университет Карнеги-Меллона". cbd.cmu.edu. Архивировано из оригинал на 2015-03-30. Получено 2016-03-14.
  25. ^ «Совместная программа CMU-Pitt Ph.D. в области вычислительной биологии (CPCB)». Получено 2018-03-06.
  26. ^ Университет Карнеги-Меллона. "Магистр вычислительной биологии - Университет Карнеги-Меллона". www.cmu.edu. Получено 2016-03-14.
  27. ^ «Биотехнологические инновации и вычисления в Университете Карнеги-Меллона». bic.cs.cmu.edu. Архивировано из оригинал на 2016-03-09. Получено 2016-03-14.
  28. ^ "Бакалавр компьютерной биологии | Кафедра вычислительной биологии". Отдел вычислительной биологии | Университет Карнеги Меллон. Получено 2017-02-07.
  29. ^ Университет Карнеги-Меллона. «Майнор в области вычислительной биологии-вычислительной биологии, Университет Карнеги-Меллона». cbd.cmu.edu. Получено 2016-03-14.