Кертис Хаттенхауэр - Curtis Huttenhower

Кертис Хаттенхауэр
Кертис Хаттенхауэр.PNG
Родившийся (1981-06-18) 18 июня 1981 г. (возраст 39)[1]
Альма-матер
НаградыПриз Овертона (2015)[2]
Научная карьера
Поля
УчрежденияГарвардский университет
ТезисАнализ больших коллекций геномных данных  (2009)
ДокторантОльга Троянская[9]
Интернет сайтwww.huttenhower.org

Кертис Хаттенхауэр это Профессор из Вычислительная биология и Биоинформатика в отделе Биостатистика, Школа Здравоохранение, Гарвардский университет.[8][10][11][12]

Образование

Хаттенхауэр получил степень бакалавра в Технологический институт Роуза-Халмана в 2000 году по специальности информатика, химия и математика. Затем он два года проработал разработчиком программного обеспечения для Microsoft, работающий над платформой разработки естественного языка Microsoft. Хаттенхауэр получил MS в компьютерная лингвистика из Университет Карнеги Меллон в 2003 году, где он учился у Дэнни Дюрана и Эрик Ниберг. В 2003 году Хаттенхауэр переехал в Университет Принстона где он был награжден кандидат наук в 2008 году для исследований в геномика под руководством Ольга Троянская. Его кандидатская диссертация была озаглавлена Анализ больших коллекций геномных данных.[2][13]

Исследование

Хаттенхауэр присоединился к Гарвард Т. Школа общественного здравоохранения Чан в 2009 г. на должности доцента кафедры вычислительная биология и биоинформатика,[2] стал доцентом в 2013 году.[9] Лаборатория Хаттенхауэра активно сотрудничала с NIH. Проект человеческого микробиома (HMP) для идентификации и характеристики микроорганизмов, встречающихся как у здоровых, так и у больных людей.[3][4][5] С 2015 года он является одним из руководителей одного из последующих центров HMP2 по характеристике кишечной микробной экосистемы при воспалительном заболевании кишечника.[14]

Награды и отличия

Хаттенхауэр получил NSF Премия CAREER в 2010 году за исследования микробных сообществ.[9][15] и был награжден Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров в 2012.[16] В 2015 году Хаттенхауэр был удостоен награды Приз Овертона[2] от Международное общество вычислительной биологии. Его научный руководитель Ольга Троянская была удостоена такой же премии в 2011 году.[17] Хаттенхауэр также является членом редакционных коллегий академических журналов. Геномная биология, Микробиом и BMC Биоинформатика.[18][19][20]

Рекомендации

  1. ^ Хаттенхауэр, Кертис, 1981-, Библиотека Конгресса
  2. ^ а б c d Fogg, Christiana N .; Ковац, Дайан Э. (2015). «Премия ISCB Overton 2015 присуждена Кертису Хаттенхауэру». PLOS вычислительная биология. 11 (6): e1004319. Bibcode:2015PLSCB..11E4319F. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1004319. ISSN  1553-7358. ЧВК  4466272. PMID  26067840. открытый доступ
  3. ^ а б Консорциум проекта "Микробиом человека"; Геверс, Дирк; Рыцарь, Роб; Абубукер, Сахар; Барсук, Джонатан Х .; Chinwalla, Asif T .; Creasy, Heather H .; Earl, Ashlee M .; Фитцджеральд, Майкл Дж .; Фултон, Роберт С .; Giglio, Michelle G .; Холлсворт-Пепин, Кимберли; Лобос, Элизабет А .; Мадупу, Рамана; Магрини, Винсент; Мартин, Джон С .; Митрева, Македонка; Музны, Донна М .; Содергрен, Эрика Дж .; Версалович, Джеймс; Wollam, Aye M .; Worley, Kim C .; Wortman, Jennifer R .; Янг, Сара К .; Цзэн, Цяньдун; Aagaard, Kjersti M .; Abolude, Olukemi O .; Аллен-Верко, Эмма; Альм, Эрик Дж .; и другие. (2012). «Структура, функции и разнообразие здорового микробиома человека». Природа. 486 (7402): 207–14. Bibcode:2012Натура 486..207т. Дои:10.1038 / природа11234. ЧВК  3564958. PMID  22699609.
  4. ^ а б Консорциум проекта по микробиому человека; Нельсон, Карен Э .; Поп, Михай; Creasy, Heather H .; Giglio, Michelle G .; Хаттенхауэр, Кертис; Геверс, Дирк; Петросино, Джозеф Ф .; Абубукер, Сахар; Барсук, Джонатан Х .; Chinwalla, Asif T .; Earl, Ashlee M .; Фитцджеральд, Майкл Дж .; Фултон, Роберт С .; Холлсворт-Пепин, Кимберли; Лобос, Элизабет А .; Мадупу, Рамана; Магрини, Винсент; Мартин, Джон С .; Митрева, Македонка; Музны, Донна М .; Содергрен, Эрика Дж .; Версалович, Джеймс; Wollam, Aye M .; Worley, Kim C .; Wortman, Jennifer R .; Янг, Сара К .; Цзэн, Цяньдун; Aagaard, Kjersti M .; и другие. (2012). «Основа для исследования микробиома человека». Природа. 486 (7402): 215–21. Bibcode:2012Натура 486..215т. Дои:10.1038 / природа11209. ЧВК  3377744. PMID  22699610.
  5. ^ а б Abubucker, S; Segata, N; Голл, Дж; Шуберт, А. М .; Изард, Дж; Cantarel, B.L .; Родригес-Мюллер, Б. Цукер, Дж; Thiagarajan, M; Henrissat, B; Белый, О; Kelley, S.T .; Мете, В; Schloss, P.D .; Геверс, Д; Митрева, М; Хаттенхауэр, К. (2012). «Метаболическая реконструкция метагеномных данных и ее применение к микробиому человека». PLOS вычислительная биология. 8 (6): e1002358. Bibcode:2012PLSCB ... 8E2358A. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1002358. ЧВК  3374609. PMID  22719234.
  6. ^ Хаттенхауэр, C; Mutungu, K. T .; Индик, Н; Ян, Вт; Шредер, М; Forman, J. J .; Троянская, О.Г .; Коллер, Х.А. (2009). «Детализация регуляторных сетей посредством крупномасштабной интеграции данных». Биоинформатика. 25 (24): 3267–74. Дои:10.1093 / биоинформатика / btp588. ЧВК  2788929. PMID  19825796.
  7. ^ Хаттенхауэр, C; Хофманн, О. (2010). «Краткое руководство по крупномасштабному интеллектуальному анализу геномных данных». PLOS вычислительная биология. 6 (5): e1000779. Bibcode:2010PLSCB ... 6E0779H. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1000779. ЧВК  2877728. PMID  20523745.
  8. ^ а б Кертис Хаттенхауэр публикации, проиндексированные Google ученый
  9. ^ а б c "Резюме Кертиса Хаттенхауэра" (PDF). huttenhower.org. 2015. Архивировано с оригинал (PDF) на 2015-03-02.
  10. ^ Chi, A; Хаттенхауэр, C; Geer, L. Y .; Coon, J. J .; Syka, J. E .; Bai, D. L .; Shabanowitz, J; Берк, Д. Дж .; Троянская, О.Г .; Хант, Д. Ф. (2007). «Анализ сайтов фосфорилирования белков из Saccharomyces cerevisiae с помощью масс-спектрометрии с диссоциацией с переносом электрона (ETD)». Труды Национальной академии наук. 104 (7): 2193–8. Bibcode:2007PNAS..104.2193C. Дои:10.1073 / pnas.0607084104. ЧВК  1892997. PMID  17287358.
  11. ^ Хаттенхауэр, C; Рыцарь, R; Brown, C.T .; Caporaso, J.G .; Clemente, J.C .; Геверс, Д; Franzosa, E.A .; Kelley, S.T .; Рыцари, D; Ley, R.E .; Махуркар, А; Равель, Дж; Ученые за продвижение исследований микробиома; Белый, О (2014). «Развитие сообщества исследователей микробиома». Клетка. 159 (2): 227–30. Дои:10.1016 / j.cell.2014.09.022. ЧВК  4221798. PMID  25303518.
  12. ^ Публикации Кертиса Хаттенхауэра индексируется Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  13. ^ Хаттенхауэр, Кертис (2009). Анализ больших коллекций геномных данных (Кандидатская диссертация). Университет Принстона. OCLC  298182845.
  14. ^ "Home - Curtis Huttenhower - Гарвардская школа общественного здравоохранения им. Т. Х. Чана". www.hsph.harvard.edu. Получено 4 августа 2015.
  15. ^ «Кертис Хаттенхауэр получил высшую награду среди младших преподавателей в области биоинформатики». hsph.harvard.edu. 2015-02-11. Получено 4 августа 2015.
  16. ^ «Президент Обама чествует молодых ученых и инженеров - NSF - Национальный научный фонд». www.nsf.gov. Получено 4 августа 2015.
  17. ^ Маллинз, Джастин; Моррисон Маккей, Би Джей (2 июня 2011 г.). «Международное общество вычислительной биологии награждает Майкла Эшбернера и Ольгу Троянскую высшими наградами в области биоинформатики / вычислительной биологии за 2011 год». PLOS вычислительная биология. 7 (6): e1002081. Bibcode:2011PLSCB ... 7E2081M. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1002081. ЧВК  3107244.
  18. ^ «Геномная биология - редколлегия». www.genomebiology.com. Получено 4 августа 2015.
  19. ^ «Микробиом - Редакция». www.microbiomejournal.com. Получено 4 августа 2015.
  20. ^ "BMC Bioinformatics - Редакция журнала". www.biomedcentral.com. Получено 4 августа 2015.