Дана Пир - Dana Peer - Wikipedia

Дана Пеер
Дана Пеер ISMB2014.jpg
Дана Пеер выступает на ISMB 2014.
Родившийся1971 (48–49 лет)[1]
Альма-матерЕврейский университет Иерусалима[2]
Супруг (а)Ицик Пеер[3]
ДетиИнбар, Кармель[4][5]
Награды
Научная карьера
ПоляБиология
Вычислительная биология
Системная биология
УчрежденияГарвардская медицинская школа
Колумбийский университет
ТезисОт экспрессии генов к молекулярным путям  (2003)
ДокторантНир Фридман
Другие научные консультантыДжордж М. Черч

Дана Пеер в настоящее время Стул и Профессор в программе вычислительной и системной биологии в Институт Слоана Кеттеринга и считается одним из ведущих исследователей в области вычислительной системной биологии.[3][7] Ранее она была профессором Колумбийского отделения биологических наук. Исследования Пеера сосредоточены на понимании организации, функции и эволюции молекулярных сетей, в частности, как генетические вариации изменяют регулирующая сеть и как эти генетические вариации могут вызывать рак.[8][9][10][11][12][13]

Образование

Пеер получила степень бакалавра в математика в 1995 г., степень магистра в 1999 г. и докторская степень в Информатика в 2003 году все из Еврейский университет Иерусалима. Ее докторская работа использовалась машинное обучение и Байесовские сети для автоматического вывода регуляторных отношений между генами, используя геномика данные. Ее научным руководителем был Нир Фридман.[7][14][15]

Впоследствии она была постдокторское исследование сотрудник лаборатории Джордж М. Черч[16] в отделении генетики при Гарвардская медицинская школа, фокусируясь на том, как генетические вариации изменяют регуляторную сеть между людьми и как это впоследствии проявляется в фенотипический разнообразие.[7][14]

Исследование

Лаборатория Пеер в Колумбийском университете продолжает свои предыдущие исследования; во-первых, разработка вычислительных методов для объединения различных источников данных геномики с высокой пропускной способностью, а во-вторых, для разработки целостного представления о клетке на системном уровне.[17]

Особое внимание уделяется разработке методов определения того, как генетическая изменчивость ДНК изменяет регуляция экспрессии генов, с целью применения этих знаний в индивидуальном лечении рака. Например, способность предсказать, как определенные лекарства (индивидуально или в комбинации) будут реагировать с опухолями, позволит назначать лекарства для каждого пациента.[7][8]

Награды и почести

Пьер в настоящее время является членом редколлегии журнала. Клетка.[18]

Пьер получил несколько престижных наград, в том числе Фонд Берроуза Велкома Премия за карьеру, награда NSF CAREER и Противостоять раку Грант на инновационные исследования. Она была награждена Премия директора NIH за новаторство в 2007 году, чтобы исследовать, как генетические вариации могут вызывать изменения во всем теле, которые могут привести к аутоиммунное заболевание и рак.[3] Пеер был удостоен стипендии Packard в области науки и техники в 2009 году.[19] Она была награждена ISCB Приз Овертона в 2014 г. за значительный вклад в исследования, в частности, в использовании вычислительных методов для понимания организации и функции молекулярных сетей в клетках.[20]

Личная жизнь

Ее муж Ицик Пеер также работает вычислительным биологом в Колумбийском университете.[3]

Рекомендации

  1. ^ http://viaf.org/viaf/98109969
  2. ^ "Дана Пеер - Домашняя страница". Архивировано из оригинал 29 июня 2010 г.. Получено 8 февраля 2014.
  3. ^ а б c d "Columbia News ::: Дана Пеер: Расшифровка генетических вариаций и регуляторных сетей". www.columbia.edu. Получено 8 февраля 2014.
  4. ^ "TEDxYouth @ TheSchool - The Spark! - TEDx - TED.com". www.ted.com. Получено 8 февраля 2014.
  5. ^ "Дана Пеер - Генеалогия". www.geni.com. Получено 19 июля 2014.
  6. ^ Fogg, Christiana N .; Ковац, Дайан Э. (2014). «Международное общество вычислительной биологии награждает Дана Пеер лучшей премией в области биоинформатики / вычислительной биологии за 2014 год». PLOS вычислительная биология. 10 (6): e1003682. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1003682. ЧВК  4063598. PMID  24945496.
  7. ^ а б c d "GET :: особенности среды генома". www.getconference.org. Получено 8 февраля 2014.
  8. ^ а б "Дана Пеер - факультет системной биологии Колумбийского университета". Получено 9 февраля 2014.
  9. ^ Публикации Даны Пеер индексируется Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  10. ^ Friedman, N .; Linial, M .; Нахман, И .; Пеер, Д. (2000). «Использование байесовских сетей для анализа данных выражения». Журнал вычислительной биологии. 7 (3–4): 601–620. CiteSeerX  10.1.1.191.139. Дои:10.1089/106652700750050961. PMID  11108481.
  11. ^ Segal, E .; Шапира, М .; Regev, A .; Pe'er, D .; Botstein, D .; Коллер, Д .; Фридман, Н. (2003). «Модульные сети: определение регуляторных модулей и их регуляторов, зависящих от состояния на основе данных по экспрессии генов». Природа Генетика. 34 (2): 166–176. Дои:10,1038 / ng1165. PMID  12740579.
  12. ^ Sachs, K .; Перес, О; Pe'Er, D; Lauffenburger, D.A .; Нолан, Г. П. (2005). "Причинные белковые сигнальные сети, полученные из многопараметрических данных одной ячейки". Наука. 308 (5721): 523–9. Дои:10.1126 / science.1105809. PMID  15845847.
  13. ^ Bendall, S.C .; Simonds, E. F .; Qiu, P .; Амир, Э. -А. D .; Krutzik, P.O .; Finck, R .; Bruggner, R. V .; Меламед, Р .; Trejo, A .; Орнатский, О. И .; Balderas, R. S .; Плеврит, С.К .; Sachs, K .; Pe'Er, D .; Tanner, S.D .; Нолан, Г. П. (2011). «Одноклеточная масс-цитометрия дифференциальных иммунных и лекарственных ответов в гемопоэтическом континууме человека». Наука. 332 (6030): 687–696. Дои:10.1126 / science.1198704. ЧВК  3273988. PMID  21551058.
  14. ^ а б «Биографии исследователей грантов на инновационные исследования 2011 года». www.aacr.org. Архивировано из оригинал 22 февраля 2014 г.. Получено 9 февраля 2014.
  15. ^ "Дана Пеер - Диссертация". Архивировано из оригинал 28 октября 2014 г.. Получено 9 февраля 2014.
  16. ^ Lee, S. I .; Pe'Er, D; Дадли, А. М .; Церковь, Г. М .; Коллер, Д. (2006). «Идентификация регуляторных механизмов с использованием индивидуальных вариаций показывает ключевую роль модификации хроматина». Труды Национальной академии наук. 103 (38): 14062–7. Дои:10.1073 / pnas.0601852103. ЧВК  1599912. PMID  16968785.
  17. ^ "Лаборатория Даны Пеер". Получено 9 февраля 2014.
  18. ^ «Сотовый - контакт». www.cell.com. Получено 8 февраля 2014.
  19. ^ «Дана Пеер - Фонд Паккарда». www.packard.org. Получено 8 февраля 2014.
  20. ^ «24 января 2014 г .: Джин Майерс и Дана Пьер названы лауреатами премии ISCB 2014». www.iscb.org. ISCB. Получено 8 февраля 2014.