Цистовирус - Cystovirus
| Цистовирус | |
|---|---|
 | |
 | |
| Pseudomonas phage phi6 частица, реконструкция и геном | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Царство: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Duplornaviricota |
| Класс: | Vidaverviricetes |
| Порядок: | Миндивиралес |
| Семья: | Cystoviridae |
| Род: | Цистовирус |
| Виды | |
Цистовирус это род двухцепочечные РНК-вирусы который заражает Псевдомонады бактерии. Это единственный род в семье Cystoviridae. Название группы cysto происходит от Греческий Кистис что означает мочевой пузырь или мешок. В настоящее время в этом роде семь видов, включая типовой вид. Вирус псевдомонады phi6.[1][2][3]
Открытие
Вирус псевдомонады phi6 был первым вирусом этого семейства, который был обнаружен и первоначально был охарактеризован в 1973 году Анной Видавер в Университет Небраски. Она обнаружила, что при культивировании бактериального штамма Псевдомонас фазоликола HB1OY с ореол инфицированной фасоли, цитопатические эффекты были обнаружены в культивируемых газонах, что указывает на присутствие литического микроба или бактериофаг подарок.[4]
В 1999 г. phi7–14 были идентифицированы лабораторией Леонарда Миндича в Научно-исследовательском институте общественного здравоохранения, связанном с Нью-Йоркский университет. Они сделали это, выращивая различные листья в Лизогениевый бульон а затем посыпать бульоном лужайки Pseudomonas syringae pv phaseolicola. Они смогли идентифицировать вирусные бляшки отсюда и затем секвенировать их геномы.[5]
Микробиология
Структура
Цистовирусные частицы окутанный, с участием икосаэдр и сферической геометрии, и симметрии T = 13, T = 2. Диаметр вириона составляет около 85 нм. Цистовирусы различаются по внешнему слою. белок и липид конверт. Нет другого бактериофаг есть липиды во внешней оболочке, хотя Tectiviridae и Corticoviridae содержат липиды в капсиды.[1][2]
Геном
Цистовирусы имеют геном трехчастной двухцепочечной РНК, который составляет примерно 14 kbp в общей длине. Геном является линейным и сегментированным и обозначен как большой (L) 6,4 т.п.н., средний (M) 4 т.п.н. и малый (S) длиной 2,9 т.п.н. Геном кодирует двенадцать белков.[1][2]
Жизненный цикл
Цитовирусы проникают в бактерии путем адсорбции на их пилус а затем слияние мембран. Репликация вируса происходит в цитоплазме. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция двухцепочечных РНК вирусов - это метод транскрипции. Вирусы-потомки высвобождаются из клетки лизис.[1][2]
Наиболее идентифицированные цистовирусы инфицируют Псевдомонады видов, но это, вероятно, предвзятое отношение из-за метода отбора и обогащения.[6] Типовой вид Вирус псевдомонады phi6, но есть много других предложенных членов этого семейства. Вирусы Pseudomonas φ7, φ8, φ9, φ10, φ11, φ12 и φ13 были идентифицированы и названы:[5] но были выделены и другие цистовирусоподобные вирусы.[6] Эти семь предполагаемых родственников классифицируются как близкие (φ7, φ9, φ10, φ11) или дальние (φ8, φ12, φ13) родственники φ6,[5] с дальними родственниками, которые считались зараженными через LPS а не пили.[7]
Таксономия
Члены Cystoviridae кажутся наиболее тесно связанными с Reoviridae,[8] но также делиться гомология с Totiviridae. В частности, структурные гены цистовирусов очень похожи на гены, используемые рядом вирусов дцРНК, которые инфицируют эукариот.[9] Род Цистовирус имеет семь видов:[1]
использованная литература
- ^ а б c d е "Отчет ICTV по Cystoviridae".
- ^ а б c d «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
- ^ "Браузер таксономии NCBI: Cystoviridae". NCBI. Получено 19 июн 2016.
- ^ Видавер А.К., Коски Р.К., Ван Эттен Дж.Л. (май 1973 г.). «Бактериофаг Φ6 липид-содержащий вирус Pseudomonas phaseolicola». Журнал вирусологии. 11 (15): 799–805.
- ^ а б c Mindich L, Qiao X, Qiao J, Onodera S, Romantschuk M, Hoogstraten D (август 1999). «Выделение дополнительных бактериофагов с геномами сегментированной двухцепочечной РНК». J. Bacteriol. 181 (15): 4505–8. ЧВК 103579. PMID 10419946.
- ^ а б Силандер ОК, Вайнрайх Д.М., Райт К.М. и др. (Декабрь 2005 г.). «Широко распространенный генетический обмен среди наземных бактериофагов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (52): 19009–14. Bibcode:2005PNAS..10219009S. Дои:10.1073 / pnas.0503074102. ЧВК 1323146. PMID 16365305.
- ^ Готтлиб П., Потгитер С., Вей Х. и Топоровский И. (2002). «Характеристика φ12, бактериофага, связанного с φ6: нуклеотидная последовательность большой двухцепочечной РНК». Вирусология. 295 (2): 266–271. Дои:10.1006 / viro.2002.1436. PMID 12033785.
- ^ Мясник С.Дж., Докланд Т., Ояла П.М., Бамфорд Д.Х., Фуллер С.Д. (июль 1997 г.). "Промежуточные звенья в пути сборки двухцепочечной РНК вируса phi6". EMBO J. 16 (14): 4477–87. Дои:10.1093 / emboj / 16.14.4477. ЧВК 1170074. PMID 9250692.
- ^ Кунин, Евгений В .; Доля, Валериан В .; Крупович, Март (2015). «Происхождение и эволюция вирусов эукариот: абсолютная модульность». Вирусология. 479-480: 2–25. Дои:10.1016 / j.virol.2015.02.039. ЧВК 5898234. PMID 25771806.