DEDD - DEDD

DEDD
Идентификаторы
Псевдонимы	DEDD, CASP8IP1, DEDD1, DEFT, FLDED1, KE05, эффекторный домен смерти, содержащий
Внешние идентификаторы	OMIM: 606841 MGI: 1333874 ГомолоГен: 7980 Генные карты: DEDD
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.3 Начинать 161,120,974 бп[1] Конец 161,132,688 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H3 | 1 79,34 см Начинать 171,329,145 бп[2] Конец 171,342,331 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ДНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • ядрышко Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • апоптотический процесс • сперматогенез • внешний апоптотический сигнальный путь через рецепторы домена смерти • отрицательная регуляция катаболического процесса белков • децидуализация • отрицательная регуляция транскрипции ядерного транскрипта большой рРНК с промотора РНК-полимеразы I. Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9191	21945
Ансамбль	ENSG00000158796	ENSMUSG00000013973
UniProt	O75618	Q9Z1L3
RefSeq (мРНК)	NM_001039711 NM_001039712 NM_004216 NM_032998 NM_001330765	NM_001128609 NM_011615 NM_001357550 NM_001357551 NM_001357552 NM_001357553
RefSeq (белок)	NP_001034800 NP_001034801 NP_001317694 NP_127491	NP_001122081 NP_035745 NP_001344479 NP_001344480 NP_001344481 NP_001344482
Расположение (UCSC)	Chr 1: 161.12 - 161.13 Мб	Chr 1: 171.33 - 171.34 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий эффекторный домен смерти это белок что у людей кодируется DEDD ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует белок, содержащий эффектор смерти. домен (ДЭД). DED - это белок-белковое взаимодействие домен разделяют адаптеры, регуляторы и исполнители запрограммированная гибель клеток путь. Сверхэкспрессия этого гена вызывает слабую апоптоз. Было обнаружено, что при стимуляции этот белок перемещать из цитоплазмы в ядро ​​и совместно с UBTF, базальный фактор, необходимый для РНК-полимераза I транскрипция, в ядрышко. Для этого гена было найдено по крайней мере три варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[7]

Взаимодействия

DEDD был показан взаимодействовать с:

• CFLAR,^[8][9]
• Каспаза 8,^[8][10][11] и
• FADD.^[5][9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158796 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013973 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Stegh AH, Schickling O, Ehret A, Scaffidi C, Peterhänsel C, Hofmann TG, Grummt I, Krammer PH, Peter ME (декабрь 1998 г.). «DEDD, новый белок, содержащий эффекторный домен смерти, нацеленный на ядрышко». EMBO J. 17 (20): 5974–86. Дои:10.1093 / emboj / 17.20.5974. ЧВК  1170924. PMID  9774341.
6. Лео С.П., Сюй С.Ю., Макги Е.А., Саланова М., Сюэ А.Дж. (декабрь 1998 г.). «DEFT, новая молекула, содержащая эффекторный домен смерти, преимущественно экспрессируемая в половых клетках семенников». Эндокринология. 139 (12): 4839–48. Дои:10.1210 / en.139.12.4839. PMID  9832420.
7. «Ген Entrez: DEDD, содержащий эффекторный домен смерти».
8. Zhan Y, Hegde R, Srinivasula SM, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (апрель 2002 г.). "Белки, содержащие эффекторный домен смерти DEDD и FLAME-3, образуют ядерные комплексы с субъединицей TFIIIC102 человеческого фактора транскрипции IIIC". Разница в гибели клеток. 9 (4): 439–47. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401038. PMID  11965497.
9. Рот В., Стеннер-Левен Ф, Павловски К., Годзик А., Рид Дж. К. (март 2002 г.). «Идентификация и характеристика DEDD2, белка, содержащего эффекторный домен смерти». J. Biol. Chem. 277 (9): 7501–8. Дои:10.1074 / jbc.M110749200. PMID  11741985.
10. Stegh AH, Schickling O, Ehret A, Scaffidi C, Peterhänsel C, Hofmann TG, Grummt I, Krammer PH, Peter ME (октябрь 1998 г.). «DEDD, новый белок, содержащий эффекторный домен смерти, нацеленный на ядрышко». EMBO J. 17 (20): 5974–86. Дои:10.1093 / emboj / 17.20.5974. ЧВК  1170924. PMID  9774341.
11. Алкивар А., Ху С., Тан Дж, Ян X (январь 2003 г.). «DEDD и DEDD2 связываются с каспазой-8/10 и сигнальной клеточной смертью». Онкоген. 22 (2): 291–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1206099. PMID  12527898.

дальнейшее чтение

• Park MY, Ryu SW, Kim KD, Lim JS, Lee ZW, Kim E (2005). «Связанный с Fas фактор-1 опосредует апоптоз, индуцированный химиотерапевтическими средствами, посредством образования эффекторных филаментов гибели». Int. J. Рак. 115 (3): 412–8. Дои:10.1002 / ijc.20857. PMID  15688372.
• Алкивар А, Ху С., Тан Дж, Ян Х (2003). «DEDD и DEDD2 связываются с каспазой-8/10 и сигнальной клеточной смертью». Онкоген. 22 (2): 291–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1206099. PMID  12527898.
• Ли Дж. К., Шиклинг О., Стег А. Х., Осима Р. Г., Динсдейл Д., Коэн Г. М., Питер М. Е. (2002). «DEDD регулирует деградацию промежуточных филаментов во время апоптоза». J. Cell Biol. 158 (6): 1051–66. Дои:10.1083 / jcb.200112124. ЧВК  2173221. PMID  12235123.
• Zhan Y, Hegde R, Srinivasula SM, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (2002). "Белки, содержащие эффекторный домен смерти DEDD и FLAME-3, образуют ядерные комплексы с субъединицей TFIIIC102 человеческого фактора транскрипции IIIC". Разница в гибели клеток. 9 (4): 439–47. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401038. PMID  11965497.
• Шиклинг О., Стег А.Х., Берд Дж., Питер М.Э. (2002). «Ядерная локализация DEDD приводит к активации каспазы-6 через ее эффекторный домен смерти и ингибированию транскрипции, зависимой от РНК-полимеразы I.». Разница в гибели клеток. 8 (12): 1157–68. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400928. PMID  11753564.
• Рот В., Стеннер-Левен Ф, Павловски К., Годзик А., Рид Дж. К. (2002). «Идентификация и характеристика DEDD2, белка, содержащего эффекторный домен смерти». J. Biol. Chem. 277 (9): 7501–8. Дои:10.1074 / jbc.M110749200. PMID  11741985.