ДЭК (ген) - DEK (gene)

DEK
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Q1V, 2JX3
Идентификаторы
Псевдонимы	DEK, D6S231E, протоонкоген ДЭК
Внешние идентификаторы	OMIM: 125264 MGI: 1926209 ГомолоГен: 2593 Генные карты: DEK
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.3 Начните 18,223,860 бп[1] Конец 18,264,548 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A5 | 13 24,5 см Начните 47,084,775 бп[2] Конец 47,106,201 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание гистонов • связывание хроматина • Связывание РНК Сотовый компонент • нуклеоплазма • сократительное волокно • ядро клетки Биологический процесс • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • вирусная репликация • регулирование восстановления двухцепочечных разрывов за счет негомологичного соединения концов • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регулирование ремонта двухниточного разрыва • преобразование сигнала • ковалентная модификация хроматина • ремоделирование хроматина • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7913	110052
Ансамбль	ENSG00000124795	ENSMUSG00000021377
UniProt	P35659	Q7TNV0
RefSeq (мРНК)	NM_001134709 NM_003472	NM_025900
RefSeq (белок)	NP_001128181 NP_003463	NP_080176
Расположение (UCSC)	Chr 6: 18.22 - 18.26 Мб	Chr 13: 47.08 - 47.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Человек DEK ген кодирует DEK белок.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок с одним доменом SAP. Белок связывается с крестообразными и надспиральными ДНК и индуцирует положительные суперспирали в замкнутую кольцевую ДНК. Он также участвует в выборе места монтажа во время мРНК обработка. Хромосомные аберрации, затрагивающие эту область, увеличивают экспрессию этого гена, и наличие антител против этого белка связаны с различными заболеваниями.^[6]

Взаимодействия

DEK взаимодействует с участием TFAP2A.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124795 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Йегле М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6; 9), связанная с конкретным подтипом острого миелоидного лейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и к экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can». Мол. Cell. Биол. 12 (4): 1687–97. Дои:10.1128 / mcb.12.4.1687. ЧВК  369612. PMID  1549122.
6. «Ген Entrez: онкоген DEK DEK (связывание с ДНК)».
7. Кампильос М., Гарсия М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Дж. (Март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2alpha модулируется онкогеном DEK». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (5): 1571–5. Дои:10.1093 / нар / gkg247. ЧВК  149840. PMID  12595566.

дальнейшее чтение

• фон Линдерн М., Форнерод М., Сукарман Н., ван Баал С., Йегле М., Хагемейер А., Бутсма Д., Гросвельд Г. (1992). «Транслокация t (6; 9) при остром нелимфоцитарном лейкозе приводит к образованию слитого гена DEK-CAN». Клиническая гематология Байера. 5 (4): 857–79. Дои:10.1016 / s0950-3536 (11) 80049-1. PMID  1308167.
• Waldmann T, Scholten I, Kappes F, Hu HG, Knippers R (2004). «Белок DEK - распространенный и повсеместный компонент хроматина млекопитающих». Ген. 343 (1): 1–9. Дои:10.1016 / j.gene.2004.08.029. PMID  15563827.
• Денисенко О.Н., О'Нил Б., Островски Дж., Ван Сеунинген И., Бомштык К. (1996). «Zik1, репрессор транскрипции, который взаимодействует с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеидным белком K».. J. Biol. Chem. 271 (44): 27701–6. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27701. PMID  8910362.
• Фу Г.К., Гросвельд Г., Марковиц Д.М. (1997). «DEK, аутоантиген, участвующий в хромосомной транслокации при остром миелогенном лейкозе, связывается с энхансером ВИЧ-2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (5): 1811–5. Bibcode:1997PNAS ... 94.1811F. Дои:10.1073 / пнас.94.5.1811. ЧВК  19999. PMID  9050861.
• Мюррей К.Дж., Сзер В., Гром А.А., Доннелли П., Левинсон Дж. Э., Джаннини Э. Х., Гласс Д. Н., Сзер И. С. (1997). «Антитела к ядерному антигену DEK 45 кДа при малосуставном ювенильном ревматоидном артрите и иридоциклите: селективная ассоциация с геном MHC». J. Rheumatol. 24 (3): 560–7. PMID  9058666.
• Фореро Л., Цвирнер Н. В., Финк К. В., Фернандес-Винья М. А., Стастны П. (1998). «Ювенильный артрит, HLA-A2 и связывание онкогенов-пептидов DEK». Гм. Иммунол. 59 (7): 443–50. Дои:10.1016 / S0198-8859 (98) 00034-2. PMID  9684994.
• Донг X, Мишелис М.А., Ван Дж., Бозе Р., ДеЛанж Т., Ривз WH (1998). «Аутоантитела к онкопротеину DEK у пациента с системной красной волчанкой и саркоидозом». Ревматоидный артрит. 41 (8): 1505–10. Дои:10.1002 / 1529-0131 (199808) 41: 8 <1505 :: AID-ART23> 3.0.CO; 2-N. PMID  9704652.
• Вичманн I, Гарсия-Лозано-младший, Респальдиза Н., Гонсалес-Эскрибано М.Ф., Нуньес-Ролдан А. (1999). «Аутоантитела к белкам регуляции транскрипции DEK и ALY у пациента с системной красной волчанкой». Гм. Иммунол. 60 (1): 57–62. Дои:10.1016 / S0198-8859 (98) 00085-8. PMID  9952027.
• Алексиадис В., Вальдманн Т., Андерсен Дж., Манн М., Книпперс Р., Грусс С. (2000). «Белок, кодируемый протоонкогеном DEK, изменяет топологию хроматина и снижает эффективность репликации ДНК хроматин-специфическим образом». Genes Dev. 14 (11): 1308–12. ЧВК  316669. PMID  10837023.
• МакГарви Т., Розонина Е., Маккракен С., Ли К., Арнаут Р., Миентес Е., Никерсон Дж. А., Ори Д., Гринблатт Дж., Гросвельд Г., Бленкоу Б.Дж. (2000). «Белок, связанный с острым миелоидным лейкозом, DEK, образует зависимое от сплайсинга взаимодействие с комплексами экзон-продукт». J. Cell Biol. 150 (2): 309–20. Дои:10.1083 / jcb.150.2.309. ЧВК  2180225. PMID  10908574.
• Grottke C, Mantwill K, Dietel M, Schadendorf D, Lage H (2000). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов в клетках меланомы человека с приобретенной устойчивостью к различным противоопухолевым препаратам». Int. J. Рак. 88 (4): 535–46. Дои:10.1002 / 1097-0215 ​​(20001115) 88: 4 <535 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-V. PMID  11058868.
• Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). «Сплайсосома откладывает несколько белков на 20-24 нуклеотида выше соединений экзон-экзон мРНК». EMBO J. 19 (24): 6860–9. Дои:10.1093 / emboj / 19.24.6860. ЧВК  305905. PMID  11118221.
• Каппес Ф., Бургер К., Баак М., Факельмайер Ф.О., Грусс С. (2001). «Субклеточная локализация протоонкогенного белка человека DEK». J. Biol. Chem. 276 (28): 26317–23. Дои:10.1074 / jbc.M100162200. PMID  11333257.
• Вальдманн Т., Экерих К., Баак М., Грюсс С. (2002). «Повсеместный хроматиновый белок DEK изменяет структуру ДНК за счет введения положительных суперспиралей». J. Biol. Chem. 277 (28): 24988–94. Дои:10.1074 / jbc.M204045200. PMID  11997399.
• Ларраменди М.Л., Ниини Т., Элонен Э., Надь Б., Оллила Дж., Вихинен М., Кнуутила С. (2002). «Сверхэкспрессия связанных с транслокацией гибридных генов FGFRI, MYC, NPMI и DEK, но отсутствие транслокаций при остром миелоидном лейкозе. Анализ микроматрицы». Haematologica. 87 (6): 569–77. PMID  12031912.
• Холленбах А.Д., Макферсон С.Дж., Миентес Э.Дж., Айенгар Р., Гросвельд Г. (2002). «Daxx и гистондеацетилаза II связываются с хроматином посредством взаимодействия с коровыми гистонами и ассоциированным с хроматином белком Dek». J. Cell Sci. 115 (Пт 16): 3319–30. PMID  12140263.
• Критивас А., Фудзимуро М., Вайднер М., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (2002). «Взаимодействия белков, нацеленные на связанный с латентным периодом ядерный антиген герпесвируса Капоши, связанный с саркомой, с клеточными хромосомами». Дж. Вирол. 76 (22): 11596–604. Дои:10.1128 / JVI.76.22.11596-11604.2002. ЧВК  136775. PMID  12388720.

внешние ссылки

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Human Protein DEK