DHRS1 - DHRS1

DHRS1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2QQ5
Идентификаторы
Псевдонимы	DHRS1, SDR19C1, дегидрогеназа / редуктаза (семейство SDR) член 1, дегидрогеназа / редуктаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610410 MGI: 1196314 ГомолоГен: 41696 Генные карты: DHRS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q12 Начинать 24,290,598 бп[1] Конец 24,299,780 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 C3 | 14 28,19 см Начинать 55,739,020 бп[2] Конец 55,745,690 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • окислительно-восстановительный процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	115817	52585
Ансамбль	ENSG00000157379 ENSG00000284868	ENSMUSG00000002332
UniProt	Q96LJ7	Q99L04
RefSeq (мРНК)	NM_001136050 NM_138452	NM_026819
RefSeq (белок)	NP_001129522 NP_612461	NP_081095
Расположение (UCSC)	Chr 14: 24.29 - 24.3 Мб	Chr 14: 55.74 - 55.75 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Член 1 семейства дегидрогеназы / редуктазы SDR, также известный как Член 1 семейства короткоцепочечных дегидрогеназ / редуктаз 19C является фермент что у людей кодируется DHRS1 ген расположен на хромосома 14.^[5][6][7]

Структура

Ген DHRS1 расположен в районе хромосомы 14q21.3 и содержит 9 экзоны. Он кодирует 314-аминокислотный белок массой 33 кДа, который, как полагают, расположен в эндоплазматический ретикулум и митохондриальная внутренняя мембрана внутри клетки.

Функция

Считается, что белок DHRS1 имеет оксидоредуктаза активность, основанная на сходстве последовательностей и сохраненная каталитические центры с другими ферментами оксидоредуктазы с короткой цепью. Обнаружено, что фермент экспрессируется в плодном мозг.^[8]

Взаимодействия

Считается, что белок DHRS1 взаимодействует с белком фосфолипидной скрамбазой 1 (PLSCR1 ).^[9]

Рекомендации

1. ENSG00000284868 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000157379, ENSG00000284868 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002332 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Wu Q, Xu M, Cheng C, Zhou Z, Huang Y, Zhao W., Zeng L, Xu J, Fu X, Ying K, Xie Y, Mao Y (август 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика нового гена члена 1 дегидрогеназы / редуктазы (семейства SDR) из головного мозга человека». Мол Биол Реп. 28 (4): 193–8. Дои:10.1023 / А: 1015722001960. PMID  12153138.
6. Перссон Б., Каллберг И., Брей Дж. Э., Бруфорд Е., Деллапорта С. Л., Фавиа А. Д., Дуарте Р. Г., Йорнвалл Х., Кавана К. Л., Кедишвили Н., Кисиела М., Мазер Е., Минднич Р., Орчард С., Пеннинг TM, Торнтон Д. М., Адамски Дж. , Oppermann U (февраль 2009 г.). «Инициатива по номенклатуре SDR (короткоцепочечная дегидрогеназа / редуктаза и родственные ферменты)». Chem Biol Взаимодействие. 178 (1–3): 94–8. Дои:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. ЧВК  2896744. PMID  19027726.
7. «Ген Entrez: член 1 дегидрогеназы / редуктазы DHRS1 (семейство SDR)».
8. Ву Цюй, Сюй М, Ченг Ц., Чжоу З., Хуанг И, Чжао В., Цзэн Л., Сюй Дж, Фу Х, Инь К, Се И, Мао И (2001). «Молекулярное клонирование и характеристика нового гена члена 1 дегидрогеназы / редуктазы (семейства SDR) из мозга плода человека». Мол. Биол. Представитель. 28 (4): 193–8. Дои:10.1023 / А: 1015722001960. PMID  12153138.
9. http://www.ebi.ac.uk/intact/pages/interactions/interactions.xhtml?query=Q96LJ7*

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.