ДНК-полимераза мю - DNA polymerase mu

ПОЛМ
Протеин POLM PDB 2dun.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыПОЛМ, Pol Mu, Tdt-N, ДНК-полимераза mu, полимераза (ДНК) mu
Внешние идентификаторыOMIM: 606344 MGI: 1860191 ГомолоГен: 41170 Генные карты: ПОЛМ
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение POLM
Геномное расположение POLM
Группа7p13Начните44,072,062 бп[1]
Конец44,082,530 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POLM 222238 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001284330
NM_001284331
NM_013284
NM_001362683

NM_017401

RefSeq (белок)

NP_001271259
NP_001271260
NP_037416
NP_001349612

NP_059097

Расположение (UCSC)Chr 7: 44.07 - 44.08 МбChr 11: 5,83 - 5,84 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-полимераза мю это полимераза фермент нашел в эукариоты. У человека этот белок кодируется ПОЛМ ген.[5]

Функция

Pol μ является членом Семья X из ДНК-полимеразы. Участвует в ресинтезе поврежденных или недостающих нуклеотидов во время негомологичное соединение концов (NHEJ) путь Ремонт ДНК.[6] Pol μ взаимодействует с Ку и ДНК-лигаза IV, которые также участвуют в NHEJ.[7] Он структурно и функционально связан с pol λ, и, как и pol λ, pol μ имеет BRCT домен это, как полагают, опосредует взаимодействия с другими белками репарации ДНК.[8] Однако, в отличие от pol λ, pol μ обладает уникальной способностью добавлять основание к тупому концу, который формируется выступом на противоположном конце двухниточного разрыва.[9] Pol μ также тесно связан с терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза (TdT), специализированная ДНК-полимераза, которая добавляет случайные нуклеотиды к концам ДНК во время V (D) J рекомбинация, процесс, с помощью которого В-клетка и Рецептор Т-клеток разнообразие генерируется в позвоночное животное иммунная система. Подобно TdT, pol μ участвует в рекомбинации V (D) J, но только во время перестройки легкой цепи.[10] Это отличается от pol λ, который участвует в перестройке тяжелой цепи.[11]

POLM мутантные мыши

У мышей, мутантных по полимеразе mu, развитие гемопоэтических клеток является дефектным в нескольких популяциях периферических клеток и клеток костного мозга, при этом количество клеток костного мозга уменьшается примерно на 40%, что включает несколько гематопоэтических клонов.[12] Потенциал роста гемопоэтических клеток-предшественников также снижается. Эти характеристики коррелируют со сниженной способностью восстанавливать двухцепочечные разрывы в кроветворной ткани. Гамма-облучение всего тела мышей, мутантных по полимеразе mu, показывает, что полимераза mu также играет роль в восстановлении двухцепочечных разрывов в других тканях, не связанных с кроветворной тканью. Таким образом, полимераза mu играет важную роль в поддержании генетической стабильности в гемопоэтических и негематопоэтических тканях.

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122678 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020474 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ "Entrez Gene: POLM-полимераза (ДНК-направленная), мю".
  6. ^ Дейли Дж. М., Лаан Р. Л., Суреш А., Уилсон Т. Е. (август 2005 г.). «Совместная ДНК-зависимость действия полимеразы семейства pol X при негомологичном соединении концов». J. Biol. Chem. 280 (32): 29030–7. Дои:10.1074 / jbc.M505277200. PMID  15964833.
  7. ^ Махаджан К.Н., Ник Макэлхинни С.А., Митчелл Б.С., Рамсден Д.А. (июль 2002 г.). «Ассоциация ДНК-полимеразы mu (pol mu) с Ku и лигазой IV: роль pol mu в репарации двухцепочечных разрывов с присоединением концов». Мол. Cell. Биол. 22 (14): 5194–202. Дои:10.1128 / MCB.22.14.5194-5202.2002. ЧВК  139779. PMID  12077346.
  8. ^ Ник Макэлхинни С.А., Рамсден Д.А. (август 2004 г.). «Соперничество братьев и сестер: конкуренция между членами семейства Pol X в рекомбинации V (D) J и общей репарации двухцепочечных разрывов». Иммунол. Rev. 200: 156–64. Дои:10.1111 / j.0105-2896.2004.00160.x. PMID  15242403. S2CID  36516952.
  9. ^ Ник МакЭлхинни С.А., Хавенер Дж. М., Гарсия-Диас М. и др. (Август 2005 г.). «Градиент зависимости от шаблона определяет различные биологические роли полимераз семейства X в негомологичных соединениях концов». Мол. Ячейка. 19 (3): 357–66. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.06.012. PMID  16061182.
  10. ^ Берточчи Б., Де Смет А., Берек С., Вайль Дж. К., Рейно, Калифорния (август 2003 г.). «Перестройка гена каппа-легкой цепи иммуноглобулина нарушена у мышей, дефицитных по ДНК-полимеразе mu». Иммунитет. 19 (2): 203–11. Дои:10.1016 / S1074-7613 (03) 00203-6. PMID  12932354.
  11. ^ Берточчи Б., Де Смет А., Вайль Дж. К., Рейно, Калифорния (июль 2006 г.). «Неперекрывающиеся функции ДНК-полимераз mu, лямбда и терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы во время рекомбинации иммуноглобулина V (D) J in vivo» (PDF). Иммунитет. 25 (1): 31–41. Дои:10.1016 / j.immuni.2006.04.013. PMID  16860755.
  12. ^ Лукас Д., Эскудеро Б., Лигос Дж. М., Сеговия Дж. С., Эстрада Дж. С., Террадос Дж., Бланко Л., Сампер Е., Бернад А. (февраль 2009 г.). «Измененный гемопоэз у мышей, лишенных ДНК-полимеразы mu, происходит из-за неэффективной репарации двухцепочечных разрывов». PLOS Genet. 5 (2): e1000389. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000389. ЧВК  2638008. PMID  19229323.

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9NP87 (ДНК-направленная ДНК / РНК-полимераза человека мю) в PDBe-KB.