Полимераза - Polymerase
А полимераза является фермент (EC 2.7.7.6/7/19/48/49), который синтезирует длинные цепочки полимеры или же нуклеиновые кислоты. ДНК-полимераза и РНК-полимераза используются для сборки ДНК и РНК молекул, соответственно, путем копирования цепи матрицы ДНК с использованием спаривание оснований взаимодействия или РНК путем репликации половинной лестницы.
ДНК-полимераза из теплолюбивый бактерия, Thermus aquaticus (Taq) (PDB 1BGX, EC 2.7.7.7) используется в полимеразной цепной реакции, важный метод молекулярная биология.
Полимераза может быть зависимой от матрицы или независимой от матрицы. Поли-А-полимераза является примером независимой от шаблона полимеразы. Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза также известны действия, не зависящие от шаблона и зависимые от шаблона.
Типы
- ДНК-полимераза
- Семья А: ДНК-полимераза I; Pol γ, θ, ν
- Семья B: ДНК-полимераза II; Pol α, δ, ε, ζ
- Семья C: Холофермент ДНК-полимераза III
- Семья X: ДНК-полимераза IV (DinB) - SOS ремонтная полимераза; Pol β, λ, μ
- Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза (TDT), который придает разнообразие тяжелым цепям антител.[1]
- Семья Y: ДНК-полимераза V (UmuD'2C) - полимераза SOS-репарации; Pol η, ι, κ
- Обратная транскриптаза, фермент, используемый РНК ретровирусы подобно ВИЧ, который используется для создания дополнительной цепи к ранее существовавшей цепи вирусного РНК прежде, чем его можно будет интегрировать в ДНК из хозяин клетка. Это также основная мишень для противовирусных препаратов.
- РНК-полимераза
- Многосубъединичный, ДНК-направленный: РНК-полимераза I, РНК-полимераза II, РНК-полимераза III
- Односубъединичный, ДНК-направленный: РНК-полимераза Т7, POLRMT
- РНК-репликаза
- Primase, ПримПол
В общем, вирусные односубъединичные РНК-полимеразы / репликазы / обратная транскриптаза имеют общее происхождение с ДНК-полимеразой. У них есть законсервированный домен «ладонь».[2] Мультисубъединичная РНК-полимераза образует неродственную группу.[3] У примаз более сложная история: бактериальные примазы с доменом Toprim относятся к топоизомераза и митохрондриальная геликаза,[4] в то время как археи и эукариотические примазы образуют неродственное семейство, возможно, связанное с полимеразной пальмой. Тем не менее оба семейства связаны с одним и тем же набором геликаз.[5]
| ДНК-полимераза | РНК-полимераза | |
|---|---|---|
| Шаблон - это ДНК | ДНК-зависимая ДНК-полимераза или обычный ДНК-полимеразы | ДНК-зависимая РНК-полимераза или обычный РНК-полимеразы |
| Шаблон - это РНК | РНК-зависимая ДНК-полимераза или же Обратная транскриптаза | РНК-зависимая РНК-полимераза или же RdRp или РНК-репликаза |
Смотрите также
- Центральная догма молекулярной биологии
- Экзонуклеаза
- Лигаза
- Нуклеаза
- ПЦР
- PARP
- Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией
- РНК-лигаза (АТФ)
Рекомендации
- ^ Loc'h, Жером (2016). «Структурная основа для новой шаблонной активности терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы: последствия для рекомбинации V (D) J». Структура. 24 (9): 1452–1463. Дои:10.1016 / j.str.2016.06.014. PMID 27499438.
- ^ Хансен Дж. Л., Лонг А. М., Шульц СК (август 1997 г.). «Структура РНК-зависимой РНК-полимеразы полиовируса». Структура. 5 (8): 1109–22. Дои:10.1016 / S0969-2126 (97) 00261-X. PMID 9309225.
- ^ Крамер, П. (февраль 2002 г.). «Многосубъединичные РНК-полимеразы». Текущее мнение в структурной биологии. 12 (1): 89–97. Дои:10.1016 / S0959-440X (02) 00294-4. PMID 11839495.
- ^ Аравинд, L; Лейпе, DD; Кунин, Е.В. (15 сентября 1998 г.). «Топрим - консервативный каталитический домен в топоизомеразах типа IA и II, примазах типа DnaG, нуклеазах семейства OLD и белках RecR». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (18): 4205–13. Дои:10.1093 / nar / 26.18.4205. ЧВК 147817. PMID 9722641.
- ^ Айер, Л. М.; Кунин, Э.В. Лейпе, DD; Аравинд, L (2005). «Происхождение и эволюция надсемейства архео-эукариотических примаз и родственных белков пальмового домена: структурные открытия и новые члены». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (12): 3875–96. Дои:10.1093 / нар / gki702. ЧВК 1176014. PMID 16027112.
