POLD2 - POLD2

POLD2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3E0J
Идентификаторы
Псевдонимы	POLD2, ДНК-полимераза дельта 2, дополнительная субъединица
Внешние идентификаторы	OMIM: 600815 MGI: 1097163 ГомолоГен: 4538 Генные карты: POLD2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p13 Начните 44,114,681 бп[1] Конец 44,124,358 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A1 Начните 5,872,180 бп[2] Конец 5,878,292 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • ДНК-направленная активность ДНК-полимеразы Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • комплекс дельта-ДНК-полимеразы Биологический процесс • эксцизионная репарация нуклеотидов, заполнение пробелов в ДНК • Репликация ДНК • транслезионный синтез • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК • поддержание теломер • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения • Ремонт ДНК • Удлинение цепи ДНК, участвующее в репликации ДНК • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации • ремонт несоответствия • Процесс биосинтеза ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5425	18972
Ансамбль	ENSG00000106628	ENSMUSG00000020471
UniProt	P49005	O35654
RefSeq (мРНК)	NM_001127218 NM_001256879 NM_006230	NM_008894 NM_001361942
RefSeq (белок)	NP_001120690 NP_001243808 NP_006221	NP_032920 NP_001348871
Расположение (UCSC)	Chr 7: 44.11 - 44.12 Мб	Chr 11: 5,87 - 5,88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дельта-субъединица 2 ДНК-полимеразы является фермент что у людей кодируется POLD2 ген.^[5][6] Это компонент ДНК-полимераза дельта сложный.

Взаимодействия

POLD2 был показан взаимодействовать с участием PCNA.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106628 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020471 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан Дж., Тан С.К., МакМаллен Б., Дауни К.М., Со А.Г. (февраль 1996 г.). «Клонирование кДНК малых субъединиц бычьей и человеческой ДНК-полимеразы дельта и хромосомное положение гена человека (POLD2)». Геномика. 29 (1): 179–86. Дои:10.1006 / geno.1995.1229. PMID  8530069.
6. «Ген Entrez: полимераза POLD2 (ДНК-направленная), дельта 2, регуляторная субъединица 50 кДа».
7. Лу, Сяоцин; Тан Ченг-Кит; Чжоу Цзинь-Цю; Вы Мин; Карастро Л. Майкл; Дауни Кэтлин М; So Antero G (июль 2002 г.). «Прямое взаимодействие ядерного антигена пролиферирующих клеток с малой субъединицей дельта ДНК-полимеразы». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 277 (27): 24340–5. Дои:10.1074 / jbc.M200065200. ISSN  0021-9258. PMID  11986310.

дальнейшее чтение

• Hindges R, Hübscher U (1997). «Клонирование, хромосомная локализация и межвидовое взаимодействие малой субъединицы дельта-дельта-субъединицы ДНК-полимеразы мыши (PolD2)». Геномика. 44 (1): 45–51. Дои:10.1006 / geno.1997.4838. PMID  9286699.
• Хисама FM, Чен Ю.Х., Мейн М.С. и др. (2000). «Конструкции WRN или теломеразы обращают обратную чувствительность к 4-нитрохинолин-1-оксиду в трансформированных фибробластах синдрома Вернера». Рак Res. 60 (9): 2372–6. PMID  10811112.
• Мо Дж, Лю Л., Леон А. и др. (2000). «Доказательства того, что ДНК-полимераза дельта, выделенная с помощью иммуноаффинной хроматографии, демонстрирует высокомолекулярные характеристики и связана с белком KIAA0039 и RPA». Биохимия. 39 (24): 7245–54. Дои:10.1021 / bi0000871. PMID  10852724.
• Перес А., Леон А., Ли М.Я. (2000). «Характеристика 5'-фланкирующей области гена, кодирующего субъединицу 50 кДа дельта ДНК-полимеразы человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1493 (1–2): 231–6. Дои:10.1016 / s0167-4781 (00) 00153-6. PMID  10978529.
• Секели А.М., Чен Ю.Х., Чжан С. и др. (2000). «Белок Вернера привлекает ДНК-полимеразу δ к ядрышку». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (21): 11365–70. Bibcode:2000PNAS ... 9711365S. Дои:10.1073 / pnas.97.21.11365. ЧВК  17206. PMID  11027336.
• Хе Х, Тан СК, Дауни К.М., Со А.Г. (2001). «Фактор некроза опухоли α- и интерлейкин 6-индуцируемый белок, который взаимодействует с малой субъединицей ДНК-полимеразы δ и ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (21): 11979–84. Bibcode:2001PNAS ... 9811979H. Дои:10.1073 / pnas.221452098. ЧВК  59753. PMID  11593007.
• Лу X, Тан CK, Zhou JQ и др. (2002). «Прямое взаимодействие ядерного антигена пролиферирующих клеток с малой субъединицей дельта ДНК-полимеразы». J. Biol. Chem. 277 (27): 24340–5. Дои:10.1074 / jbc.M200065200. PMID  11986310.
• Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К. и др. (2002). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». J. Biol. Chem. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID  12171929.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Лю Л., Родригес-Бельмонте Э.М., Мазлум Н. и др. (2003). «Идентификация нового белка PDIP38, который взаимодействует с субъединицей p50 дельта ДНК-полимеразы и ядерным антигеном пролиферирующих клеток». J. Biol. Chem. 278 (12): 10041–7. Дои:10.1074 / jbc.M208694200. PMID  12522211.
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Bibcode:2003Наука ... 300..767С. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК  2882961. PMID  12690205.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Цуримото Т., Шинозаки А., Яно М. и др. (2005). «Человеческий белок 1, взаимодействующий с геликазой Вернера (WRNIP1), функционирует как новый модулятор дельта ДНК-полимеразы». Гены Клетки. 10 (1): 13–22. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2004.00812.x. PMID  15670210. S2CID  24977510.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P49005 (Дельта-субъединица 2 ДНК-полимеразы человека (POLD2)) на PDBe-KB.