Белок репарации и рекомбинации ДНК RAD54-подобный - DNA repair and recombination protein RAD54-like

RAD54L
Идентификаторы
Псевдонимы	RAD54L, HR54, RAD54A, hHR54, hRAD54, RAD54-подобный (S. cerevisiae), RAD54-подобный (S. cerevisiae), RAD54-подобный
Внешние идентификаторы	OMIM: 603615 MGI: 894697 ГомолоГен: 48227 Генные карты: RAD54L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п34.1 Начните 46,246,461 бп[1] Конец 46,278,480 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D1 Начните 116,094,264 бп[2] Конец 116,123,690 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • отжиг геликазной активности • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • Связывание АТФ • GO: 0008026 геликазная активность Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • реакция на ионизирующее излучение • Рекомбинация ДНК • восстановление двухниточного разрыва • репарация двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • определение продолжительности взрослой жизни • ответ на наркотик • хромосомная организация • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Ренатурация цепи ДНК • Ремонт ДНК • GO: 0007126 мейотический клеточный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8438	19366
Ансамбль	ENSG00000085999	ENSMUSG00000028702
UniProt	Q92698	P70270
RefSeq (мРНК)	NM_001142548 NM_003579 NM_001370766	NM_001122958 NM_001122959 NM_009015
RefSeq (белок)	NP_001136020 NP_003570 NP_001357695	NP_001116430 NP_001116431 NP_033041
Расположение (UCSC)	Chr 1: 46.25 - 46.28 Мб	Chr 4: 116.09 - 116.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок репарации и рекомбинации ДНК RAD54-подобный это белок что у людей кодируется RAD54L ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к суперсемейству DEAD-подобных геликаз и имеет сходство с Saccharomyces cerevisiae Rad54, белком, который, как известно, участвует в гомологичной рекомбинации и репарации ДНК. Было показано, что этот белок играет роль в репарации двухцепочечных разрывов ДНК, связанной с гомологичной рекомбинацией. Связывание этого белка с двухцепочечной ДНК вызывает топологическое изменение ДНК, которое, как считается, способствует гомологичному спариванию ДНК и стимулирует рекомбинацию ДНК.^[6]

Введение в RAD54

RAD54 - один из ключевых белков, необходимых для гомологичная рекомбинация и Ремонт ДНК у многих организмов. Без функционального RAD54 развитие опухоли более вероятно. RAD54 был первоначально описан у почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae как член эволюционно законсервированной RAD52 группа эпистаза, в которую дополнительно входят факторы RAD51, RAD52, RAD55 и RAD57. Считается, что эта группа участвует в событиях рекомбинации ДНК и механизмах восстановления, особенно в тех, которые связаны с двухцепочечными разрывами ДНК во время обоих митоз и мейоз. Недавно был открыт человеческий гомолог дрожжевого RAD54, названный hRAD54.

RAD54 человека (hRAD54)

RAD54 человека или hRAD54 связан с хромосомой 1p32. Он кодирует белок, состоящий из 747 аминокислот, который на 52% идентичен его дрожжевому аналогу. Эти два белка также имеют много общего по функциональности. Продукт, кодируемый RAD54, является членом семейства белков Swi2 / Snf2, членом подсемейства Swi2 / Snf2 АТФазы. Эти белковые продукты имеют гомологию по семи консервативным мотивам геликазы. Было показано, что очищенный hRAD54 специфически проявляет ДНК-зависимую АТФазу и суперспирализация деятельность. Транскрипты hRAD54 экспрессируются в основном в яичках и тимусе, а более низкие уровни обнаруживаются также в тонком кишечнике, толстой кишке, груди и простате. Мутанты hRAD54 чрезвычайно чувствительны к рентгеновским лучам, а также к метилметансульфонат (MMS). Эти мутанты, скорее всего, дефектны как в процессах спонтанной, так и в индуцированной митотической рекомбинации.

Действия hRAD54

Взаимодействие между RAD54 и RAD51, другим членом группы эпистаза RAD52, у человека опосредуется N-концевым доменом белка hRAD54. Этот N-концевой конец взаимодействует как со свободными, так и со связанными концами белка RAD51. RAD54 движется по длине ДНК, образуя положительные суперспирали, опережающие движение репликационного белка, и отрицательные суперспирали, следующие за комплексом. Взаимодействие с RAD51 увеличивает способность RAD54 выполнять эту сверхспиральную и деформированную активность открытия. Эти белки также работают вместе, образуя суставы ДНК, при этом RAD54 специально расширяет суставы и стабилизирует D-петли сформирован. Альтернативная функция RAD54 может заключаться в удалении белков RAD51 после образования суставов и инициации рекомбинации.

Инактивация hRAD54 и предрасположенность к раку

Известно, что дефекты RAD51 связаны с развитием опухоли. Обычно RAD51 взаимодействует с обоими BRCA1 и BRCA2 белковые продукты, вызывающие подавление опухоли. Это приводит к предположению, что другие члены группы эпистаза RAD52, включая RAD54, также важны в развитии и подавлении опухоли из-за их гомологичных отношений. Участие RAD54 в качестве необходимого рекомбинационного белка подтверждается обнаружением мутаций RAD54 в небольшом проценте изученных карцином груди и толстой кишки, а также в некоторых лимфомах.

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000085999 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028702 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Канаар Р., Трельстра С., Swagemakers С.М., Эссерс Дж., Смит Б., Франссен Дж. Х., Пастинк А., Беззубова О. Ю., Бюрстедде Дж. М., Клевер Б., Хейер В. Д., Хоймейкерс Дж. «Человеческие и мышиные гомологи гена репарации ДНК Saccharomyces cerevisiae RAD54: доказательства функциональной консервации». Curr Biol. 6 (7): 828–38. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00606-1. HDL:1765/3104. PMID  8805304. S2CID  2195913.
6. «Ген Entrez: RAD54L RAD54-подобный (S. cerevisiae)».

• Голуб Е.И., Коваленко О.В., Гупта Р.С. и др. (1997). «Взаимодействие рекомбинационных белков человека Rad51 и Rad54». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (20): 4106–10. Дои:10.1093 / nar / 25.20.4106. ЧВК  147015. PMID  9321665.
• Леоне П.Е., Мендиола М., Алонсо Дж. И др. (2003). «Влияние полиморфизма RAD54L (2290C / T) на менингиомы человека как фактора риска и / или генетического маркера». BMC Рак. 3: 6. Дои:10.1186/1471-2407-3-6. ЧВК  152652. PMID  12614485.
• Расио Д., Муракумо Ю., Роббинс Д. и др. (1997). «Характеристика человеческого гомолога RAD54: гена, расположенного на хромосоме 1p32 в области высокой потери гетерозиготности в опухолях молочной железы». Рак Res. 57 (12): 2378–83. PMID  9192813.
• Сигурдссон С., Ван Комен С., Петухова Г., Сун П. (2003). «Гомологичное спаривание ДНК с помощью факторов рекомбинации человека Rad51 и Rad54». J. Biol. Chem. 277 (45): 42790–4. Дои:10.1074 / jbc.M208004200. PMID  12205100.
• Swagemakers SM, Essers J, de Wit J и др. (1998). «Белок репарации рекомбинационной ДНК человека RAD54 представляет собой двухцепочечную ДНК-зависимую АТФазу». J. Biol. Chem. 273 (43): 28292–7. Дои:10.1074 / jbc.273.43.28292. PMID  9774452.

дальнейшее чтение

• Расио Д., Муракумо Ю., Роббинс Д. и др. (1997). «Характеристика человеческого гомолога RAD54: гена, расположенного на хромосоме 1p32 в области высокой потери гетерозиготности в опухолях молочной железы». Рак Res. 57 (12): 2378–83. PMID  9192813.
• Голуб Е.И., Коваленко О.В., Гупта Р.С. и др. (1997). «Взаимодействие рекомбинационных белков человека Rad51 и Rad54». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (20): 4106–10. Дои:10.1093 / nar / 25.20.4106. ЧВК  147015. PMID  9321665.
• Swagemakers SM, Essers J, de Wit J и др. (1998). «Белок репарации рекомбинационной ДНК человека RAD54 представляет собой двухцепочечную ДНК-зависимую АТФазу». J. Biol. Chem. 273 (43): 28292–7. Дои:10.1074 / jbc.273.43.28292. PMID  9774452.
• Мацуда М., Миягава К., Такахаши М. и др. (1999). «Мутации в гене рекомбинации RAD54 при первичном раке». Онкоген. 18 (22): 3427–30. Дои:10.1038 / sj.onc.1202692. PMID  10362365.
• Карлинг Т., Иманиши Ю., Газ Р. Д., Арнольд А. (1999). «Анализ гена RAD54 на хромосоме 1р как потенциального гена-супрессора опухоли в аденомах паращитовидной железы». Int. J. Рак. 83 (1): 80–2. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19990924) 83: 1 <80 :: AID-IJC15> 3.0.CO; 2-E. PMID  10449612.
• Белло М.Дж., де Кампос Дж. М., Вакеро Дж. И др. (2000). «Анализ гена hRAD54 и картирования делеций с высоким разрешением 1p в олигодендроглиомах». Рак Генет. Цитогенет. 116 (2): 142–7. Дои:10.1016 / S0165-4608 (99) 00122-3. PMID  10640146.
• Плут Дж. М., Фрид Л. М., Кирхгесснер CU (2001). «Тяжелые комбинированные иммунодефицитные клетки, экспрессирующие мутантный hRAD54, демонстрируют заметную репарацию двухцепочечных разрывов ДНК и склонный к ошибкам дефект репарации хромосом». Рак Res. 61 (6): 2649–55. PMID  11289143.
• Ристич Д., Вайман С., Паулюсма С., Канаар Р. (2001). «Архитектура комплекса человеческого Rad54-ДНК свидетельствует о транслокации белка вдоль ДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (15): 8454–60. Дои:10.1073 / pnas.151056798. ЧВК  37457. PMID  11459989.
• Рен Б., Кам Х., Такахаши Ю. и др. (2002). «E2F интегрирует развитие клеточного цикла с репарацией ДНК, репликацией и контрольными точками G (2) / M». Genes Dev. 16 (2): 245–56. Дои:10.1101 / gad.949802. ЧВК  155321. PMID  11799067.
• Сигурдссон С., Ван Комен С., Петухова Г., Сун П. (2003). «Гомологичное спаривание ДНК с помощью факторов рекомбинации человека Rad51 и Rad54». J. Biol. Chem. 277 (45): 42790–4. Дои:10.1074 / jbc.M208004200. PMID  12205100.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Леоне П.Е., Мендиола М., Алонсо Дж. И др. (2003). «Влияние полиморфизма RAD54L (2290C / T) на менингиомы человека как фактора риска и / или генетического маркера». BMC Рак. 3: 6. Дои:10.1186/1471-2407-3-6. ЧВК  152652. PMID  12614485.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ким Дж., Бхинг А.А., Морган XC, Айер В.Р. (2005). «Картирование взаимодействий ДНК-белок в больших геномах с помощью анализа последовательности тегов геномного обогащения». Nat. Методы. 2 (1): 47–53. Дои:10.1038 / nmeth726. PMID  15782160. S2CID  6135437.
• Томя Н.Х., Чижевский Б.К., Алексеев А.А. и др. (2005). "Структура домена ремоделирования хроматина SWI2 / SNF2 эукариотического Rad54". Nat. Struct. Мол. Биол. 12 (4): 350–6. Дои:10.1038 / nsmb919. PMID  15806108. S2CID  3226377.
• Аль-Вахиби С., Вонг Х.П., Слижепчевич П. (2005). «Укороченные теломеры в мышиных scid-клетках, экспрессирующих мутантный hRAD54, совпадают с уменьшением рекомбинации на теломерах». Мутат. Res. 578 (1–2): 134–42. Дои:10.1016 / j.mrfmmm.2005.04.008. PMID  15975611.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Бугреев Д.В., Мазина О.М., Мазин А.В. (2006). «Белок Rad54 способствует миграции ветвей соединений Холлидея». Природа. 442 (7102): 590–3. Дои:10.1038 / природа04889. PMID  16862129. S2CID  4324847.
• Акияма К., Юса К., Хашимото Х. и др. (2007). «Rad54 незаменим для пути ALT». Гены Клетки. 11 (11): 1305–15. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.01020.x. PMID  17054727.