DYRK1A - DYRK1A

DYRK1A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2VX3, 2WO6, 3ANQ, 3ANR, 4AZE, 4MQ1, 4MQ2, 4NCT, 4YLJ, 4YLK, 4YLL, 4Ю2, 5AIK, 5A4Q, 5A4E, 5A3X, 5A4T, 5A54, 5A4L
Идентификаторы
Псевдонимы	DYRK1A, DYRK, DYRK1, HP86, MNB, MNBH, MRD7, киназа 1A, регулируемая фосфорилированием тирозина двойной специфичности
Внешние идентификаторы	OMIM: 600855 MGI: 1330299 ГомолоГен: 55576 Генные карты: DYRK1A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.13 Начните 37,365,573 бп[1] Конец 37,526,358 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 C4 | 16 55,3 см Начните 94,570,010 бп[2] Конец 94,695,517 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • активность протеинкиназы • связывание нуклеотидов • немембранная активность протеинтирозинкиназы • киназная активность • самоассоциация белков • активность протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • протеин-серин / треонин / тирозинкиназная активность • активность протеинтирозинкиназы • связывание тау-белка • Связывание АТФ • идентичное связывание с белками • активность тау-протеинкиназы Сотовый компонент • ядерное пятнышко • нуклеоплазма • ядро клетки • цитоплазма • цитоскелет • аксон • дендрит • рибонуклеопротеин Биологический процесс • положительная регуляция деацетилирования белков • фосфорилирование • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • развитие нервной системы • фосфорилирование белков • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • отрицательная регуляция ответа на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53 • фосфорилирование пептидил-серина • циркадный ритм • аутофосфорилирование • фосфорилирование пептидилтирозина • фосфорилирование пептидил-треонина • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция полимеризации микротрубочек • положительная регуляция сплайсинга РНК • образование бета-амилоида • аутофосфорилирование пептидил-серина • аутофосфорилирование пептидилтирозина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1859	13548
Ансамбль	ENSG00000157540	ENSMUSG00000022897
UniProt	Q13627	Q61214
RefSeq (мРНК)	NM_001396 NM_101395 NM_130436 NM_130437 NM_130438 NM_001347721 NM_001347722 NM_001347723	NM_001113389 NM_007890 NM_001347731
RefSeq (белок)	NP_001334650 NP_001334651 NP_001334652 NP_001387 NP_567824 NP_569120 NP_569122	NP_001106860 NP_001334660 NP_031916
Расположение (UCSC)	Chr 21: 37,37 - 37,53 Мб	Chr 16: 94,57 - 94,7 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Киназа 1A, регулируемая тирозин-фосфорилированием с двойной специфичностью является фермент что у людей кодируется DYRK1A ген.^[5] Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует несколько вариантов транскриптов, отличающихся друг от друга либо 5 'UTR, либо 3' кодирующей областью.^[6] Эти варианты кодируют по крайней мере пять различных изоформ.^[7]

Функция

DYRK1A является членом семейства киназ, регулируемых фосфорилированием тирозина с двойной специфичностью (DYRK). Этот член содержит сигнал ядерного наведения последовательность, a протеинкиназа домен, а лейциновая молния мотив, и очень консервативный 13-последовательный-гистидин повторение. Это катализирует его аутофосфорилирование на серин /треонин и тирозин остатки. Он может играть важную роль в сигнальном пути, регулирующем пролиферацию клеток, и может участвовать в развитии мозга. Этот ген является гомологом гена Drosophila mnb (minibrain) и гена Dyrk крысы.^[7]

Также было показано, что Dyrk1a модулирует плазменный гомоцистеин уровень в мышиной модели сверхэкспрессии.^[8]

Клиническое значение

DYRK1A локализован в Синдром Дауна критическая область хромосомы 21, и считается сильным геном-кандидатом для дефектов обучения, связанных с синдромом Дауна.^[7] Кроме того, полиморфизм (SNP) в DYRK1A было обнаружено, что он связан с репликацией ВИЧ-1 в макрофагах, происходящих из моноцитов, а также с более медленным прогрессированием до СПИДа в двух независимых когортах ВИЧ-1-инфицированных людей.^[6] Мутации в DYRK1A также связаны с Расстройство аутистического спектра.^[9]

Взаимодействия

DYRK1A был показан взаимодействовать с участием WDR68.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157540 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022897 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Guimera J, Pritchard M, Nadal M, Estivill X (сентябрь 1997 г.). «Минибрейн (MNBH) представляет собой картирование гена одной копии на хромосоме 21q22.2 человека». Cytogenet Cell Genet. 77 (3–4): 182–4. Дои:10.1159/000134571. PMID  9284911.
6. Bol SM, Moerland PD, Limou S, van Remmerden Y, Coulonges C, van Manen D, Herbeck JT, Fellay J, Sieberer M, Sietzema JG, van 't Slot R, Martinson J, Zagury JF, Schuitemaker H, van' t Wout AB (2011). «Полногеномное исследование ассоциации выявляет однонуклеотидный полиморфизм в DYRK1A, связанный с репликацией ВИЧ-1 в макрофагах, происходящих из моноцитов». PLOS ONE. 6 (2): e17190. Bibcode:2011PLoSO ... 617190B. Дои:10.1371 / journal.pone.0017190. ЧВК  3045405. PMID  21364930.
7. «Ген Entrez: киназа 1A, регулируемая тирозин- (Y) -фосфорилированием двойной специфичности DYRK1A».
8. Noll C, Planque C, Ripoll C, Guedj F, Diez A, Ducros V, Belin N, Duchon A, Paul JL, Badel A, de Freminville B, Grattau Y, Bléhaut H, Herault Y, Janel N, Delabar JM (2009 г. ). «DYRK1A, новый детерминант цикла метионин-гомоцистеин в различных моделях мышей, сверхэкспрессирующих эту киназу, ассоциированную с синдромом Дауна». PLOS ONE. 4 (10): e7540. Bibcode:2009PLoSO ... 4.7540N. Дои:10.1371 / journal.pone.0007540. ЧВК  2760102. PMID  19844572.
9. О'Роак Б.Дж., Вивес Л., Фу В., Эгертсон Д.Д., Стэнэуэй И.Б., Фелпс И.Г., Карвилл Дж., Кумар А., Ли С., Анкенман К., Мансон Дж., Хиатт Дж. Б., Тернер Э. Х., Леви Р., О'Дей Д. Р., Крамм N, Коу Б.П., Мартин Б.К., Боренштейн Е., Никерсон Д.А., Меффорд ХК, Доэрти Д., Эйки Дж. М., Бернье Р., Эйхлер Е. Е., Шендур Дж. (Декабрь 2012 г.). «Мультиплексное целевое секвенирование позволяет идентифицировать гены с повторяющимися мутациями при расстройствах аутистического спектра». Наука. 338 (6114): 1619–22. Bibcode:2012Sci ... 338.1619O. Дои:10.1126 / science.1227764. ЧВК  3528801. PMID  23160955.
10. Скурат А.В., Дитрих А.Д. (январь 2004 г.). «Фосфорилирование Ser640 в мышечной гликогенсинтазе протеинкиназами семейства DYRK». J. Biol. Chem. 279 (4): 2490–8. Дои:10.1074 / jbc.M301769200. PMID  14593110.

дальнейшее чтение

• Hämmerle B, Elizalde C, Galceran J и др. (2004). «Протеинкиназа MNB / DYRK1A: нейробиологические функции и последствия синдрома Дауна». J. Neural Transm. Suppl. Приложение к Журналу передачи нейронных сигналов 67. 67 (67): 129–37. Дои:10.1007/978-3-7091-6721-2_11. ISBN  978-3-211-40776-9. PMID  15068245.
• Галсеран Дж., Де Грааф К., Техедор Ф. Дж., Беккер В. (2004). «Протеинкиназа MNB / DYRK1A: генетические и биохимические свойства». J. Neural Transm. Suppl. Приложение к Журналу передачи нейронных сигналов 67. 67 (67): 139–48. Дои:10.1007/978-3-7091-6721-2_12. ISBN  978-3-211-40776-9. PMID  15068246.
• Шульц SJ, Нигг EA (1994). «Идентификация 21 новой протеинкиназы человека, включая 3 члена семейства, связанного с регулятором клеточного цикла nimA Aspergillus nidulans». Рост клеток отличается. 4 (10): 821–30. PMID  8274451.
• Шиндо Н., Кудо Дж., Маеда Х. и др. (1996). «Клонирование человеческого гомолога гена Dyrk Drosophila minibrain / крысы из« критической области синдрома Дауна »хромосомы 21». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 225 (1): 92–9. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1135. PMID  8769099.
• Guimerá J, Casas C, Pucharcòs C и др. (1997). «Человеческий гомолог Drosophila minibrain (MNB) экспрессируется в нейрональных областях, пораженных синдромом Дауна, и отображается в критической области». Гм. Мол. Genet. 5 (9): 1305–10. Дои:10.1093 / hmg / 5.9.1305. PMID  8872470.
• Song WJ, Sternberg LR, Kasten-Sportès C и др. (1997). Критическая область «Выделение человеческих и мышиных гомологов гена минибрена Drosophila: человеческий гомолог соответствует 21q22.2 при синдроме Дауна»"". Геномика. 38 (3): 331–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0636. PMID  8975710.
• Охира М., Секи Н., Нагасе Т. и др. (1997). «Идентификация гена в области 1,6 МП в области синдрома Дауна на 21 хромосоме». Genome Res. 7 (1): 47–58. Дои:10.1101 / гр.7.1.47. PMID  9037601.
• Чен Х, Антонаракис С.Е. (1997). «Локализация человеческого гомолога генов Drosophila mnb и крысы Dyrk на хромосоме 21q22.2». Гм. Genet. 99 (2): 262–5. Дои:10.1007 / s004390050350. PMID  9048932. S2CID  26729330.
• Смит Д. Д., Стивенс М. Е., Суданагунта С. П. и др. (1997). «Функциональный скрининг 2 МБ хромосомы 21q22.2 человека у трансгенных мышей указывает на участие мини-мозга в дефектах обучения, связанных с синдромом Дауна». Nat. Genet. 16 (1): 28–36. Дои:10.1038 / ng0597-28. PMID  9140392. S2CID  29490013.
• Дахман Н., Гезала Г.А., Госсет П. и др. (1998). «Транскрипционная карта области CBR-ERG 2,5 Mb хромосомы 21, вовлеченной в синдром Дауна». Геномика. 48 (1): 12–23. Дои:10.1006 / geno.1997.5146. PMID  9503011.
• Сюй X, Рич ES, Селдин, округ Колумбия (1998). «Мышиная протеинкиназа CK2 alpha ': кДНК, геномное клонирование и хромосомное картирование». Геномика. 48 (1): 79–86. Дои:10.1006 / geno.1997.5154. PMID  9503019.
• Беккер В., Вебер Ю., Ветцель К. и др. (1998). «Характеристики последовательности, субклеточная локализация и субстратная специфичность DYRK-родственных киназ, нового семейства протеинкиназ с двойной специфичностью». J. Biol. Chem. 273 (40): 25893–902. Дои:10.1074 / jbc.273.40.25893. PMID  9748265.
• Ван Дж., Кудо Дж., Шинтани А. и др. (1998). «Идентификация двух новых 5'-некодирующих экзонов в гене MNB / DYRK человека и альтернативно сплайсированных транскриптов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 250 (3): 704–10. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9392. PMID  9784410.
• Гимера Дж., Касас С., Эстивилл Х, Притчард М. (1999). «Гомолог минибрена человека (MNBH / DYRK1): характеристика, альтернативный сплайсинг, дифференциальная тканевая экспрессия и сверхэкспрессия при синдроме Дауна». Геномика. 57 (3): 407–18. Дои:10.1006 / geno.1999.5775. PMID  10329007.
• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
• Вудс Ю.Л., Рена Дж., Моррис Н. и др. (2001). «Киназа DYRK1A фосфорилирует фактор транскрипции FKHR по Ser329 in vitro, новому сайту фосфорилирования in vivo». Biochem. J. 355 (Pt 3): 597–607. Дои:10.1042 / bj3550597. ЧВК  1221773. PMID  11311120.
• Мао Дж., Майе П., Когерман П. и др. (2002). «Регулирование транскрипционной активности Gli1 в ядре с помощью Dyrk1». J. Biol. Chem. 277 (38): 35156–61. Дои:10.1074 / jbc.M206743200. PMID  12138125.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Марти Э., Альтафадж Х, Дирссен М. и др. (2003). «Паттерн экспрессии Dyrk1A поддерживает определенные роли этой киназы в центральной нервной системе взрослого человека». Мозг Res. 964 (2): 250–63. Дои:10.1016 / S0006-8993 (02) 04069-6. PMID  12576186. S2CID  35092325.
• Джархад ДБ, Машелкар К.К., Ким Х.Р., Но М., Чжон Л.С. (2018). «Ингибиторы киназы 1A (DYRK1A), регулируемой фосфорилированием тирозина с двойной специфичностью, в качестве потенциальных терапевтических средств». Журнал медицинской химии. 61 (22): 9791–9810. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.8b00185. PMID  29985601.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q13627 (Киназа 1А, регулируемая тирозин-фосфорилированием двойной специфичности) на PDBe-KB.