EFCAB6 - EFCAB6 - Wikipedia

EFCAB6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WLZ, 5D67
Идентификаторы
Псевдонимы	EFCAB6, DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, кальций-связывающий домен EF-руки 6
Внешние идентификаторы	MGI: 1924877 ГомолоГен: 11259 Генные карты: EFCAB6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.2-q13.31 Начинать 43,528,744 бп[1] Конец 43,812,337 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E1-E2 Начинать 83,866,712 бп[2] Конец 84,065,379 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание ионов кальция Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64800	77627
Ансамбль	ENSG00000186976	ENSMUSG00000022441
UniProt	Q5THR3	Q6P1E8
RefSeq (мРНК)	NM_022785 NM_198856	NM_001161628 NM_001161629 NM_029946
RefSeq (белок)	NP_073622 NP_942153	NP_001155100 NP_001155101 NP_084222
Расположение (UCSC)	Chr 22: 43,53 - 43,81 Мб	Chr 15: 83.87 - 84.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

EF-ручной кальций-связывающий домен, содержащий белок 6 это белок что у людей кодируется EFCAB6 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

EFCAB6 был показан взаимодействовать с PARK7^[6] и Рецептор андрогенов.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186976 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022441 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хиросава М., Нагасе Т., Мурахаши Ю., Кикуно Р., Охара О. (март 2001 г.). «Идентификация новых транскрибируемых последовательностей на хромосоме 22 человека путем картирования меток экспрессии». ДНК Res. 8 (1): 1–9. Дои:10.1093 / dnares / 8.1.1. PMID  11258795.
6. Ники Т., Такахаши-Ники К., Тайра Т., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (март 2003 г.). «DJBP: новый белок, связывающий DJ-1, отрицательно регулирует рецептор андрогенов, рекрутируя комплекс гистондеацетилазы, и DJ-1 противодействует этому ингибированию, отменяя этот комплекс». Мол Рак Res. 1 (4): 247–61. PMID  12612053.
7. «Ген Entrez: FLJ23588 CAP-связывающий белковый комплекс, взаимодействующий с белком 1».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Коллинз Дж. Э., Говард М. Е., Коул К. Г. и др. (2003). «Переоценка аннотации человеческого гена: анализ второго поколения хромосомы 22». Genome Res. 13 (1): 27–36. Дои:10.1101 / гр.695703. ЧВК  430954. PMID  12529303.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.