EXOC1 - EXOC1

EXOC1
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOC1, BM-102, SEC3, SEC3L1, SEC3P, компонент 1 комплекса экзоцисты
Внешние идентификаторы	OMIM: 607879 MGI: 2445020 ГомолоГен: 41241 Генные карты: EXOC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q12 Начинать 55,853,648 бп[1] Конец 55,905,086 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 C3.3 | 5 Начинать 76,529,311 бп[2] Конец 76,570,294 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание GTP-Rho • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазматическая сторона апикальной плазматической мембраны • цитозоль • клеточная мембрана • мембрана • экзоциста • цитоплазма • перинуклеарная область цитоплазмы • Тело Флемминга Биологический процесс • транспорт белка • локализация экзоцисты • Гольджи к транспорту через плазматическую мембрану • регуляция макроаутофагии • фосфатидилинозит-опосредованная передача сигналов • положительное регулирование секреции белка • экзоцитоз • транспорт • GO: 0022415 вирусный процесс • защитный ответ на вирус Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55763	69940
Ансамбль	ENSG00000090989	ENSMUSG00000036435
UniProt	Q9NV70	Q8R3S6
RefSeq (мРНК)	NM_001024924 NM_018261 NM_178237	NM_001289770 NM_001289771 NM_027270 NM_001359370 NM_001359372 NM_001359373
RefSeq (белок)	NP_001020095 NP_060731 NP_839955	NP_001276699 NP_001276700 NP_081546 NP_001346299 NP_001346301 NP_001346302
Расположение (UCSC)	Chr 4: 55,85 - 55,91 Мб	Chr 5: 76,53 - 76,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент 1 комплекса экзоцисты это белок что в люди кодируется EXOC1 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является компонентом комплекса экзоцисты, множественного белкового комплекса, необходимого для воздействия на экзоцисты. пузырьки к определенным стыковочным узлам на плазматическая мембрана. Хотя лучше всего охарактеризованы дрожжи, составные белки и функции комплекс экзоцисты была продемонстрирована высокая консервативность у высших эукариот. Установлено, что по крайней мере восемь компонентов комплекса экзоцисты, включая этот белок, взаимодействуют с ремоделирование цитоскелета актина и механизмы транспорта везикул. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы были описаны.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000090989 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036435 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
6. Бримора А., Валова В.А., Ларсен М.Р., Руфогалис Б.Д., Робинсон П.Дж. (август 2001 г.). «Комплекс экзоцисты мозга взаимодействует с RalA GTP-зависимым образом: идентификация нового гена Sec3 млекопитающих и второго гена Sec15». J Biol Chem. 276 (32): 29792–7. Дои:10.1074 / jbc.C100320200. PMID  11406615.
7. "Ген Entrez: компонент 1 комплекса экзоцисты EXOC1".

дальнейшее чтение

• Сюй СК, ТерБуш Д., Абрахам М., Го В. (2004). «Комплекс экзоцисты в поляризованном экзоцитозе». Int. Преподобный Цитол. Международный обзор цитологии. 233: 243–65. Дои:10.1016 / S0074-7696 (04) 33006-8. ISBN  978-0-12-364637-8. PMID  15037366.
• Kee Y, Yoo JS, Hazuka CD и др. (1998). «Субъединичная структура комплекса экзоцист млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (26): 14438–43. Дои:10.1073 / пнас.94.26.14438. ЧВК  25013. PMID  9405631.
• Hsu SC, Hazuka CD, Roth R и др. (1998). «Субъединичный состав, белковые взаимодействия и структуры комплекса sec6 / 8 мозга млекопитающих и филаментов септина». Нейрон. 20 (6): 1111–22. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80493-6. PMID  9655500. S2CID  10915358.
• Matern HT, Yeaman C, Нельсон WJ, Scheller RH (2001). «Комплекс Sec6 / 8 в клетках млекопитающих: характеристика Sec3 млекопитающих, взаимодействия субъединиц и экспрессия субъединиц в поляризованных клетках». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (17): 9648–53. Дои:10.1073 / pnas.171317898. ЧВК  55506. PMID  11493706.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Иноуэ М., Чанг Л., Хван Дж. И др. (2003). «Комплекс экзоцисты необходим для доставки Glut4 к плазматической мембране инсулином» (PDF). Природа. 422 (6932): 629–33. Дои:10.1038 / природа01533. HDL:2027.42/62982. PMID  12687004. S2CID  4395760.
• Москаленко С., Тонг С., Росс С. и др. (2004). «ГТФазы Ral регулируют сборку экзоцист посредством взаимодействий двойных субъединиц». J. Biol. Chem. 278 (51): 51743–8. Дои:10.1074 / jbc.M308702200. PMID  14525976.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.