FARSA (ген) - FARSA (gene)

FARSA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3L4G
Идентификаторы
Псевдонимы	FARSA, CML33, FARSL, FARSLA, FRSA, PheHA, альфа-субъединица фенилаланил-тРНК-синтетазы, альфа-субъединица фенилаланил-тРНК-синтетазы
Внешние идентификаторы	OMIM: 602918 MGI: 1913840 ГомолоГен: 3280 Генные карты: FARSA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.13 Начинать 12,922,479 бп[1] Конец 12,934,037 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 C2-C3 Начинать 84,856,989 бп[2] Конец 84,869,257 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • аминоацил-тРНК лигазная активность • связывание тРНК • связывание нуклеотидов • активность лигазы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • активность фенилаланин-тРНК лигазы • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • фенилаланин-тРНК лигазный комплекс Биологический процесс • аминоацилирование тРНК • биосинтез белка • гетеротетрамеризация белков • аминоацилирование тРНК для трансляции белков • аминоацилирование фенилаланил-тРНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2193	66590
Ансамбль	ENSG00000179115	ENSMUSG00000003808
UniProt	Q9Y285	Q8C0C7
RefSeq (мРНК)	NM_004461	NM_025648
RefSeq (белок)	NP_004452	NP_079924
Расположение (UCSC)	Chr 19: 12.92 - 12.93 Мб	Chr 8: 84,86 - 84,87 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Альфа-цепь фенилаланил-тРНК синтетазы является фермент что у людей кодируется FARSA ген.^[5][6]

Аминоацил-тРНК-синтетазы - это класс ферментов, которые заряжают тРНК с их родственными аминокислоты. Этот ген кодирует продукт, который похож на каталитическую субъединицу прокариотический и Saccharomyces cerevisiae фенилаланил -тРНК синтетазы (PheRS). Было показано, что этот генный продукт экспрессируется опухоль-селективным и зависимым от стадии клеточного цикла и дифференцировки образом, первый член семейства генов тРНК-синтетазы демонстрирует этот тип регулируемой экспрессии.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000179115 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003808 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сен С., Чжоу Х., Рипмастер Т., Хиттельман В.Н., Шиммель П., Уайт Р.А. (июль 1997 г.). «Экспрессия гена, кодирующего протеин, подобный тРНК-синтетазе, усилена в онкогенных клетках миелоидной лейкемии человека и зависит от стадии клеточного цикла и дифференцировки». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (12): 6164–9. Дои:10.1073 / пнас.94.12.6164. ЧВК  21020. PMID  9177188.
6. «Ген Entrez: фенилаланил-тРНК синтетаза FARSA, альфа-субъединица».

дальнейшее чтение

• Родова М, Анкилова В, Сафро МГ (1999). «Человеческая фенилаланил-тРНК синтетаза: клонирование, характеристика выведенных аминокислотных последовательностей с точки зрения структурных доменов и скоординированно регулируемая экспрессия альфа- и бета-субъединиц в клетках хронического миелоидного лейкоза». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 255 (3): 765–73. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0141. PMID  10049785.
• Сан Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х. и др. (2002). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (1): 158–64. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID  11829477.
• Моор Н., Линшиз Г., Сафро М. (2002). «Клонирование и экспрессия фенилаланил-тРНК синтетазы человека в Escherichia coli: сравнительное исследование очищенных рекомбинантных ферментов». Protein Expr. Purif. 24 (2): 260–7. Дои:10.1006 / преп.2001.1560. PMID  11858721.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.