G3BP1 - G3BP1

G3BP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3Q90, 4FCJ, 4FCM, 4IIA
Идентификаторы
Псевдонимы	G3BP1, G3BP, HDH-VIII, G3BP фактор сборки стресс-гранул 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608431 MGI: 1351465 ГомолоГен: 38096 Генные карты: G3BP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.1 Начинать 151,771,045 бп[1] Конец 151,812,785 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • GO: 0008026 геликазная активность • GO: 0004003 ДНК-геликазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • нуклеазная активность • эндонуклеазная активность • Связывание АТФ • гидролазная активность • связывание мРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • мембрана • очаговая адгезия • клеточная мембрана • внутриклеточный • Гранула стресса • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • перикарион • рибонуклеопротеин Биологический процесс • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • Передача сигнала белка Ras • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • Раскрутка дуплекса ДНК • транспорт • сборка гранул напряжения Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10146	27041
Ансамбль	ENSG00000145907	ENSMUSG00000018583
UniProt	Q13283	P97855
RefSeq (мРНК)	NM_005754 NM_198395	NM_013716
RefSeq (белок)	NP_005745 NP_938405	NP_038744
Расположение (UCSC)	Chr 5: 151,77 - 151,81 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ras GTPase-активирующий белок-связывающий белок 1 является фермент что у людей кодируется G3BP1 ген.^[4][5][6]

Этот ген кодирует один из ДНК-раскручивающих ферментов, который предпочитает частично раскрученные 3'-хвостовые субстраты и может также раскручивать частичные дуплексы РНК / ДНК и РНК / РНК АТФ-зависимым образом. Этот фермент входит в состав гетерогенных ядерных РНК-связывающих белков, а также является элементом пути передачи сигнала Ras. Первоначально сообщалось, что он специфически связывается с белком, активирующим Ras-GTPase, связываясь с его доменом SH3, но это взаимодействие недавно было оспорено.^[7] Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов не была определена.^[6]

G3BP1 может инициировать стрессовая гранула образование и помеченный G3BP1 обычно используется в качестве маркера стрессовых гранул.^[8]

Взаимодействия

G3BP1 был показан взаимодействовать с USP10.^[9]Он также взаимодействует с SND1 [5].

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145907 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Паркер Ф., Морье Ф., Делюмо I, Дюшен М., Фоше Д., Дебюше Л., Дуге А, Швайгоффер Ф, Ток Б. (июль 1996 г.). «Белок, активирующий Ras-GTPase, связывающий SH3-домен». Mol Cell Biol. 16 (6): 2561–9. Дои:10.1128 / MCB.16.6.2561. ЧВК  231246. PMID  8649363.
5. Коста М., Очем А., Стауб А., Фаласки А. (март 1999 г.). «ДНК-геликаза VIII человека: ДНК- и РНК-геликаза, соответствующая белку G3BP, элементу пути трансдукции ras». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (3): 817–21. Дои:10.1093 / nar / 27.3.817. ЧВК  148252. PMID  9889278.
6. "Ген Entrez: G3BP1 GTPase активирующий белок (SH3 домен) связывающий белок 1".
7. Аннибальди, А; Дусс, А; Мартин, S; Тази, Дж; Видманн, С (2011). «Возвращение к G3BP1 как к связывающему белку RasGAP: сенсибилизация опухолевых клеток к химиотерапии последовательностью RasGAP 317-326 не включает G3BP1». PLOS ONE. 6 (12): e29024. Bibcode:2011PLoSO ... 629024A. Дои:10.1371 / journal.pone.0029024. ЧВК  3242762. PMID  22205990.
8. Махбуби, Хичам; Сточай, Урсула (2017-04-01). «Гранулы цитоплазматического стресса: динамические модуляторы клеточной сигнализации и болезни». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1863 (4): 884–895. Дои:10.1016 / j.bbadis.2016.12.022. ISSN  0925-4439. PMID  28095315.
9. Soncini, C; Бердо I; Draetta G (июнь 2001 г.). «Связывающий белок Ras-GAP SH3-домен (G3BP) является модулятором USP10, новой человеческой убиквитин-специфической протеазы». Онкоген. Англия. 20 (29): 3869–79. Дои:10.1038 / sj.onc.1204553. ISSN  0950-9232. PMID  11439350.

[5] Гао X, Ge L, Shao J, Su C, Zhao H, Saarikettu J, Yao X, Yao Z, Silvennoinen O, Yang J., Tudor-SN взаимодействует и совместно локализуется с G3BP в стрессовых гранулах при стрессе. Письма FEBS, том 584, выпуск 16, страницы 3525-3532.

дальнейшее чтение

• Ирвин К., Стирлинг Р., Хьюм Д., Кеннеди Д. (2005). «Распутин, более беспорядочный, чем когда-либо: обзор G3BP». Int. J. Dev. Биол. 48 (10): 1065–77. Дои:10.1387 / ijdb.041893ki. PMID  15602692.
• Онно М, Накамура Т, Хиллова Дж, Хилл М (1993). «Перестройка треонкогена человека путем гомологичной рекомбинации между Alu-повторами нуклеотидных последовательностей из двух разных хромосом». Онкоген. 7 (12): 2519–23. PMID  1461655.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Галлузи И.Е., Паркер Ф., Чебли К. и др. (1998). «Новая фосфорилированная РНКазная активность GAP-SH3-связывающего белка: потенциальная связь между передачей сигнала и стабильностью РНК». Мол. Клетка. Биол. 18 (7): 3956–65. Дои:10.1128 / MCB.18.7.3956. ЧВК  108980. PMID  9632780.
• Kociok N, Esser P, Unfried K, et al. (1999). «Повышение активности белка, активирующего RAS-GTPase (GAP), связывающего белок (G3BP) в пролиферирующих клетках RPE». J. Cell. Биохим. 74 (2): 194–201. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19990801) 74: 2 <194 :: AID-JCB5> 3.0.CO; 2-M. PMID  10404389.
• Сончини C, Бердо I, Драетта G (2001). «Связывающий белок Ras-GAP SH3-домен (G3BP) является модулятором USP10, новой человеческой убиквитин-специфической протеазы». Онкоген. 20 (29): 3869–79. Дои:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID  11439350.
• Tourrière H, Gallouzi IE, Chebli K, et al. (2001). «RasGAP-ассоциированная эндорибонуклеаза G3BP: селективная деградация РНК и локализация, зависимая от фосфорилирования». Мол. Клетка. Биол. 21 (22): 7747–60. Дои:10.1128 / MCB.21.22.7747-7760.2001. ЧВК  99945. PMID  11604510.
• Барнс К.Дж., Ли Ф., Мандал М. и др. (2002). «Херегулин индуцирует экспрессию, активность АТФазы и ядерную локализацию G3BP, компонента передачи сигналов Ras, в опухолях груди человека». Рак Res. 62 (5): 1251–5. PMID  11888885.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Туррьер Х., Чебли К., Зекри Л. и др. (2003). «Связанная с RasGAP эндорибонуклеаза G3BP собирает стрессовые гранулы». J. Cell Biol. 160 (6): 823–31. Дои:10.1083 / jcb.200212128. ЧВК  2173781. PMID  12642610.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Кацафанас Г.К., Мосс Б. (2005). «Транскрипция промежуточной стадии вируса осповакцины дополняется белком, активирующим Ras-GTPase, связывающим домен SH3-белком (G3BP) и белком, ассоциированным с активацией / пролиферацией цитоплазмы (p137) индивидуально или в виде гетеродимера». J. Biol. Chem. 279 (50): 52210–7. Дои:10.1074 / jbc.M411033200. PMID  15471883.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Онг С.Е., Миттлер Г., Манн М. (2005). «Идентификация и количественная оценка сайтов метилирования in vivo тяжелым метиловым SILAC». Nat. Методы. 1 (2): 119–26. Дои:10.1038 / nmeth715. PMID  15782174. S2CID  6654604.

внешняя ссылка

• G3BP1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• G3BP1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.