Гранула стресса - Stress granule
Гранулы стресса плотные скопления в цитозоль состоит из белки & РНК которые появляются, когда ячейка находится в состоянии стресса.[1] Сохраненные молекулы РНК застопорились перевод прединициативные комплексы: неудачные попытки сделать белок из мРНК. Стресс-гранулы имеют размер 100–200 нм (при биохимической очистке), не окружены мембрана, и связанные с эндоплазматический ретикулум.[2] Обратите внимание, что есть также ядерный стрессовые гранулы. Эта статья о цитозольный разнообразие.
Предлагаемые функции
Функция стрессовых гранул остается в значительной степени неизвестной. Давно предполагалось, что стрессовые гранулы выполняют функцию защиты РНК от вредных условий, таким образом, они появляются при стрессе.[3] Накопление РНК в плотные глобулы может удержать их от реакции с вредными химическими веществами и защитить информацию, закодированную в их последовательности РНК.
Стрессовые гранулы также могут служить точкой принятия решения для нетранслируемых мРНК. Молекулы могут пойти одним из трех путей: дальнейшее хранение, деградация или повторное инициирование перевод.[4] Напротив, также утверждалось, что стрессовые гранулы не являются важными сайтами для хранения мРНК и не служат промежуточным местом для мРНК, находящихся в пути между состоянием хранения и состоянием деградации.[5]
Попытки идентифицировать все РНК в стрессовых гранулах (транскриптом стрессовых гранул) беспристрастным образом путем секвенирования РНК из биохимически очищенных «ядер» стрессовых гранул показали, что РНК рекрутируются для стрессовых гранул не специфическим для последовательности образом, а скорее общим, с обогащением более длинных и / или менее оптимально переведенных транскриптов.[6] Эти данные предполагают, что на транскриптом стрессовых гранул влияет валентность РНК (для белков или других РНК) и скорость оттока РНК из полисомы. Последнее дополнительно подтверждается недавними визуализация одиночных молекул исследования.[7] Кроме того, было подсчитано, что только около 15% общей мРНК в клетке локализовано в стрессовых гранулах,[6] предполагая, что стрессовые гранулы влияют только на меньшую часть мРНК в клетке и могут быть не так важны для процессинга мРНК, как считалось ранее.[6][8] Тем не менее, эти исследования представляют собой только моментальный снимок во времени, и вполне вероятно, что большая часть мРНК в какой-то момент хранится в стрессовых гранулах из-за того, что эти РНК входят и выходят.
Стрессовые белки, которые являются основным компонентом стрессовых гранул в клетках растений, являются молекулярными. шапероны которые изолируют, защищают и, возможно, восстанавливают белки, которые разворачиваются во время жары и других типов стресса.[9][10] Следовательно, любая ассоциация мРНК со стрессовыми гранулами может быть просто побочным эффектом ассоциации частично развернутых РНК-связывающих белков со стрессовыми гранулами,[11] аналогично ассоциации мРНК с протеасомы.[12]
Формирование
Стрессовые факторы окружающей среды запускают клеточную сигнализацию, что в конечном итоге приводит к образованию стрессовых гранул. В пробирке, эти факторы стресса могут включать тепло, холод, окислительный стресс (арсенит натрия), стресс эндоплазматического ретикулума (тапсигаргин), ингибирование протеасомы (MG132), гиперосмотический стресс, ультрафиолетовая радиация, ингибирование eIF4A (патеамин А, гиппуристанол, или RocA ), накопление оксида азота после лечения 3-морфолиносиднонимином (СИН-1),[13] нарушение сплайсинга пре-мРНК,[14] и другие факторы стресса, такие как пуромицин что приводит к разобранному полисомы.[15] Многие из этих факторов стресса приводят к активации определенных стрессовых факторов. киназы (HRI, PERK, PKR и GCN2), ингибирование трансляции и образование стрессовых гранул.[15]
Формирование стрессовых гранул часто происходит после стресс-активируемых фосфорилирование из фактор инициации трансляции эукариот eIF2α, но это не верно для всех типов стрессоров, которые вызывают стрессовые гранулы,[15] например, ингибирование eIF4A. Далее вниз по течению, прион -подобная агрегация белка ТИА-1 способствует образованию стрессовых гранул. Период, термин прион -like используется, потому что агрегация ТИА-1 является концентрация зависимый, сдерживаемый шапероны, и поскольку агрегаты устойчивы к протеазы.[16] Также было предложено, чтобы микротрубочки играют роль в образовании стрессовых гранул, возможно, за счет транспортировки компонентов гранул. Эта гипотеза основана на том факте, что нарушение микротрубочек химическим веществом нокодазол блокирует появление гранул.[17] Более того, было показано, что многие сигнальные молекулы регулируют образование или динамику стрессовых гранул; к ним относятся главный датчик энергии AMP-активированная протеинкиназа (AMPK),[18] то Фермент трансферазы O-GlcNAc (OGT),[19] и проапоптотическая киназа ROCK1.[20]
Возможные роли взаимодействий РНК-РНК
Фазовые переходы РНК, отчасти обусловленные межмолекулярными взаимодействиями РНК-РНК, могут играть роль в образовании стрессовых гранул. Подобно внутренне неупорядоченным белкам, экстракты тотальной РНК способны подвергаться фазовому разделению в физиологических условиях. in vitro.[21] РНК-последовательность анализ показывает, что эти сборки имеют в значительной степени перекрывающиеся транскриптом со стресс-гранулами,[21][6] при этом обогащение РНК в обоих основано преимущественно на длине РНК. Кроме того, стрессовые гранулы содержат много РНК-геликаз,[22] в том числе DEAD / H-бокс геликасы Ded1p /DDX3, eIF4A1, и RHAU.[23] В дрожжах каталитический ded1 мутантные аллели дают рост гранул конститутивного стресса[24] Недостаточные по АТФазе мутантные аллели DDX3X (гомолог Ded1 у млекопитающих) обнаружены в педиатрической практике. медуллобластома,[25] и они совпадают с конститутивными зернистыми сборками в клетках пациента.[26] Эти мутантные белки DDX3 способствуют сборке стрессовых гранул в HeLa клетки.[26] В клетках млекопитающих мутанты RHAU приводят к снижению динамики стрессовых гранул.[23] Таким образом, некоторые предполагают, что агрегация РНК, облегченная межмолекулярными взаимодействиями РНК-РНК, играет роль в формировании стрессовых гранул и что эта роль может регулироваться РНК-геликазами.[27] Также есть свидетельства того, что РНК в стрессовых гранулах более компактна по сравнению с РНК в цитоплазме и что РНК преимущественно посттрансляционно модифицируется N6-метиладенозином (m6А) на его 5 'концах.[28][29] Недавняя работа показала, что очень распространенный фактор инициации трансляции и DEAD-бокс-белок eIF4A ограничивают образование стрессовых гранул. Он делает это благодаря своей способности связывать АТФ и РНК, действуя аналогично белку. шапероны подобно Hsp70.[30]
Связь с обрабатывающими органами
Гранулы стресса и обрабатывающие органы разделяют РНК и белковые компоненты, оба появляются при стрессе и могут физически связываться друг с другом. По состоянию на 2018 год из ~ 660 белков, идентифицированных как локализующиеся в стрессовых гранулах, ~ 11% также были идентифицированы как процессирующие локализованные в организме белки (см. Ниже). Протеин G3BP1 необходим для правильной стыковки обрабатывающих тел и гранул напряжения друг с другом, что может быть важно для сохранения полиаденилированный мРНК.[31]
Хотя некоторые белковые компоненты являются общими для стрессовых гранул и процессинговых тел, большинство белков в любой структуре уникально локализовано в любой структуре.[32] Хотя и стрессовые гранулы, и процессинговые тельца связаны с мРНК, процессинговые тельца долгое время считались сайтами деградации мРНК, поскольку они содержат ферменты, такие как DCP1 / 2 и XRN1, которые, как известно, разрушают мРНК.[33] Однако другие продемонстрировали, что мРНК, ассоциированные с процессирующими телами, в значительной степени трансляционно репрессируются, но не деградируют.[32] Также было высказано предположение, что мРНК, выбранные для деградации, передаются от стрессовых гранул к процессирующим органам,[33] хотя есть также данные, свидетельствующие о том, что обрабатывающие тела предшествуют образованию стрессовых гранул и способствуют им.[34]
Белковый состав стресс-гранул
Полный протеом стрессовых гранул все еще неизвестен, но были предприняты попытки каталогизировать все белки, которые, как было экспериментально продемонстрировано, переходят в стрессовые гранулы.[35][36][37] Важно отметить, что разные факторы стресса могут привести к образованию гранул стресса с разными белковыми компонентами.[15] Многие белки, связанные со стрессовыми гранулами, были идентифицированы путем временного стресса культивируемых клеток и использования микроскопии для обнаружения локализации интересующего белка либо путем экспрессии этого белка, слитого с флуоресцентным белком (т. Е. зеленый флуоресцентный белок (GFP)) и / или фиксация клетки и использование антител для обнаружения интересующего белка наряду с известными белковыми маркерами стрессовых гранул (иммуноцитохимия ).[38]
В 2016 году «ядра» стрессовых гранул были экспериментально идентифицированы и затем впервые подвергнуты биохимической очистке. Белки в ядрах были идентифицированы объективным образом с использованием масс-спектрометрии. Этот технический прогресс привел к идентификации сотен новых белков, локализованных в стрессовых гранулах.[39][22][40]
Протеом стрессовых гранул также был экспериментально определен с использованием двух немного разных маркировка близости подходы. Одним из таких подходов к метке близости является метод аскорбатпероксидазы (APEX), при котором клетки конструируют для экспрессии известного белка стрессовых гранул, такого как G3BP1, слитого с модифицированным ферментом аскорбатпероксидазы, называемым APEX.[35][41] После инкубации клеток в биотин и обрабатывая клетки перекисью водорода, фермент APEX будет кратковременно активирован, чтобы биотинилат все белки в непосредственной близости от интересующего белка, в данном случае G3BP1 в стрессовых гранулах. Затем биотинилированные белки можно выделить с помощью стрептавидин и идентифицированы с использованием масс-спектрометрии. Метод APEX был использован для идентификации ~ 260 белков, связанных со стрессовыми гранулами, в нескольких типах клеток, включая нейроны, и с различными стрессорными факторами. Из 260 белков, идентифицированных в этом исследовании, ~ 143 ранее не были продемонстрированы как связанные со стрессовыми гранулами.[41]
Другой метод метки близости, используемый для определения протеома стрессовых гранул, - это BioID.[42] BioID аналогичен подходу APEX в том, что биотинилирующий белок (BirA * вместо APEX) экспрессировался в клетках как гибридный белок с несколькими известными белками, связанными со стрессовыми гранулами. Белки в непосредственной близости от BirA * будут биотинилированы и затем идентифицированы масс-спектрометрии. Youn et al. использовали этот метод для идентификации / прогнозирования 138 белков как связанных со стрессовыми гранулами и 42 как связанных с процессинговым телом.[42]
Кураторскую базу данных белков, связанных со стрессовыми гранулами, можно найти здесь. [1].[37]
Ниже приводится список белков, которые, как было продемонстрировано, локализуются в стрессовых гранулах (составлен из [35][36][22][41][42][43]):
Идентификатор гена | Название белка | Описание | использованная литература | Также найдено в обрабатывающие органы ? |
---|---|---|---|---|
ABCF1 | ABCF1 | Кассета связывания АТФ, подсемейство F, член 1 | [41] | |
ABRACL | ABRACL | ABRA C-Terminal Нравится | [41] | |
ACAP1 | ACAP1 | ArfGAP с Coiled-Coil, Ankyrin Repeat и PH-доменами 1 | [41] | |
ACBD5 | ACBD5 | Связывающий домен ацил-КоА, содержащий 5 | [41] | |
ACTBL2 | ACTBL2 | Бета-актин-подобный белок 2 | [22] | да[32] |
ACTR1A | ACTR1A | Альфа-центрактин | [22] | |
ACTR1B | ACTR1B | Бета-центрактин | [22] | |
АДАР | ADAR1 | Аденозиндезаминаза, специфическая для РНК | [44][22] | |
ДОБАВИТЬ1 | Аддуцин 1 | Аддуцин 1 | [41] | |
AGO1 | Аргонавт 1 / EIF2C1 | Argonaute 1, каталитический компонент RISC | [41][45] | да[32] |
AGO2 | Аргонавт 2 | Argonaute 2, каталитический компонент RISC | [41][46][45][47][22][48][43] | да[32] |
AKAP8 | AKAP8 | Заякоренный протеин 8-киназы | [43] | |
AKAP9 | AKAP350 | Заякоренный белок А-киназы 9 | [49] | |
AKAP13 | AKAP13 / LBC | Заякоренный белок А-киназы 13 | [41][43] | |
ALDH18A1 | ALDH18A1 | Дельта-1-пирролин-5-карбоксилатсинтаза | [22] | |
ALG13 | ALG13 | ALG13, субъединица UDP-N-ацетилглюкозаминилтрансферазы | [42] | |
ALPK2 | ALPK2 / HAK | Альфа-киназа 2 | [43] | |
AMOTL2 | AMOTL2 / LCCP | Ангиомотин Лайк 2 | [43] | |
АНХД1 | АНХД1 | Анкиринский повтор и домен KH, содержащий 1 | [42] | да[42] |
ANKRD17 | ANKRD17 / MASK2 / GTAR | Анкиринский повторяющийся домен 17 | [41][42] | да[42] |
ANG | Ангиогенин | Ангиогенин | [50] | |
ANP32E | ANP32E | Кислый богатый лейцином ядерный фосфопротеин 32 член семейства E | [22] | |
ANXA1 | ANXA1 | Аннексин А1 | [22] | |
ANXA11 | ANXA11 | Аннексин 11 | [41] | |
ANXA6 | ANXA6 | Аннексин 6 | [22] | |
ANXA7 | ANXA7 | Аннексин 7 | [22][41] | |
APEX1 | APEX1 | ДНК- (апуриновый или апиримидиновый сайт) лиаза | [22] | |
APOBEC3C | APOBEC3C | Аполипопротеин B, редактирующий мРНК фермента, каталитическая субъединица 3C | [41][43] | |
APOBEC3G | APOBEC3G | Аполипопротеин B, редактирующий мРНК фермента, каталитическая субъединица 3G | [45] | |
ARID2 | ARID2 / BAF200 | AT-Rich Interaction Domain 2 | [43] | |
ARPC1B | ARPC1B | Актин-родственный белок 2/3 комплекс субъединица 1B | [22] | |
AHSA1 | AHA1 | Активатор АТФазы активности 1 HSP90 | [51] | |
AQR | AQR / IBP160 | Сплайсосомальный фактор, связывающий интроны Водолея | [41] | |
ARMC6 | ARMC6 | Armadillo Repeat, содержащий 6 | [41] | |
ASCC1 | ASCC1 | Активация комплексной субъединицы 1 сигнального коинтегратора 1 | [41][42] | |
ASCC3 | ASCC3 | Активация комплексной субъединицы 3 сигнального коинтегратора 1 | [42] | |
ATAD2 | ATAD2 | Белок 2, содержащий домен ААА семейства АТФаз | [22] | |
ATAD3A | ATAD3A | Белок 3А, содержащий домен ААА семейства АТФаз | [22] | да[32] |
ATG3 | ATG3 | Связанные с аутофагией 3 | [41] | |
ATP5A1 | ATP5A1 | Субъединица АТФ-синтазы альфа, митохондриальная | [22] | |
ATP6V1G1 | ATP6V1G1 / ATP6G | АТФаза H +, транспортирующая субъединицу G1 V1 | [41] | |
ATXN2 | Атаксин 2 | Атаксин 2 | [22][41][42][43][52][53][54][55][56][57] | |
ATXN2L | Атаксин-2 как | Атаксин 2 Нравится | [22][41][42][43][54][57] | |
BAG3 | BAG3 | Регулятор молекулярных шаперонов семейства BAG 3 | [22] | |
BANF1 | BANF1 | Фактор барьера для автоинтеграции | [22] | |
BCCIP | BCCIP | BRCA2 и CDKN1A взаимодействующий белок | [41] | |
BCLAF1 | BCLAF1 | Связанный с BCL2 фактор транскрипции 1 | [41] | |
BICC1 | BICC1 | РНК-связывающий белок 1 семейства BicC | [42] | |
БОЛЛ | БУЛЬ | Boule Homolog, РНК-связывающий белок | [58] | |
BRAT1 | BRAT1 | BRCA1-ассоциированный активатор ATM 1 | [22] | |
BRF1 | BRF1 | BRF1, субъединица фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы III | [33] | |
BTG3 | BTG3 | Фактор против распространения BTG 3 | [42] | да[42] |
C9orf72 | C9orf72 | Неохарактеризованный белок C9orf72 | [59][60] | |
C15orf52 | C15orf52 | Неохарактеризованный белок C15orf52 | [22] | |
C20orf27 | C20orf72 | Хромосома 20 Открытая рамка чтения 27 | [41] | |
C2CD3 | C2CD3 | C2 кальций-зависимый домен, содержащий 3 | [41] | |
CALML5 | CALML5 | Кальмодулиноподобный белок 5 | [22] | |
CALR | Кальретикулин / CRT | Кальретикулин | [61] | |
CAP1 | CAP1 | Связанный с аденилатциклазой белок 1 | [22] | |
CAPRIN1 | Каприн-1 | Белок, связанный с клеточным циклом 1 | [41][42][62][49][63][22][64][31][65][57] | |
CAPZA2 | CAPZA2 | F-актин-кэпирующая белковая субъединица альфа-2 | [22] | |
CARHSP1 | CARHSP1 | Регулируемый кальцием термостабильный белок 1 | [22] | |
CASC3 | MLN51 / BTZ | Восприимчивость к раку 3 | [41][42][66][67] | |
CBFB | CBFB | Субъединица фактора связывания ядра бета | [22] | |
CBX1 | CBX1 | Гомолог белка Chromobox 1 | [22][57] | |
CCAR1 | КАРП-1 | Цикл деления клеток и регулятор апоптоза 1 | [49] | |
CCDC124 | CCDC124 | Спиральный домен, содержащий 124 | [41] | |
CCDC85C | CCDC85C | Спиральный домен, содержащий 85C | [41] | |
CCT3 | CCT3 | Т-комплексный белок 1 субъединица гамма | [22] | |
CCT6A | CCT6A | Т-комплексный белок 1 субъединица дзета | [22] | |
CDC37 | CDC37 | Цикл деления клеток 37 | [51] | |
CDC5L | CDC5L | 5-подобный белок цикла деления клетки | [22] | |
CDC73 | CDC73 | Парафибромин | [22] | |
CDK1 | CDK1 | Циклинзависимая киназа 1 | [22] | |
CDK2 | CDK2 | Циклинзависимая киназа 2 | [68] | |
CDV3 | CDV3 | CDV3 Гомолог | [41] | |
CELF1 | CUGBP1 | Член семьи CUGBP Elav-Like 1 | [22][41][42][69] | |
CELF2 | CUGBP2 / BRUNOL3 | Член семьи CUGBP Elav-Like 2 | [41] | |
CELF3 | CUGBP3 / BRUNOL1 | Член семьи CUGBP Elav-Like 3 | [41] | |
CENPB | CENPB | Главный центрерный аутоантиген B | [22] | |
CEP78 | CEP78 / CRDHL | Центросомальный белок 78 | [41] | |
CEP85 | CEP85 / CCDC21 | Центросомальный белок 78 | [42] | |
CERKL | Керамид-киназа как | Керамидкиназа Like | [70] | |
CFL1 | Кофилин-1 | Кофилин-1 | [22] | |
ЧЧД3 | ЧЧД3 | Coiled-coil-helix-coiled-coiled-coil-helix домен, содержащий белок 3, митохондриальный | [22] | |
CHORDC1 | CHORDC1 / CHP1 | Цистеин и богатый гистидином домен, содержащий белок 1 | [22] | |
CIRBP | CIRP | Белок, связывающийся с РНК, индуцируемый холодом | [41][71] | |
CIT | CIT | Цитрон-Rho-взаимодействующая киназа | [22] | |
CLIC4 | CLIC4 | Хлорид белка внутриклеточного канала 4 | [22] | |
CLNS1A | CLNS1A | Чувствительный к хлоридам нуклеотид канал 1A | [41] | |
CLPP | CLPP | Протеолитическая субъединица казеинолитической митохондриальной матричной пептидазы | [41] | |
CNBP | ZNF9 | Белок, связывающий нуклеиновую кислоту цинкового пальца типа CCHC | [72] | |
CNN3 | CNN3 | Кальпонин-3 | [22] | |
CNOT1 | CNOT1 / CCR4 | CCR4-Нет Субъединица 1 транскрипционного комплекса | [22][42] | да[42][73] |
CNOT10 | CNOT10 | CCR4-Нет Субъединица 10 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT11 | CNOT11 | CCR4-Нет Субъединица 11 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT2 | CNOT2 | CCR4-Нет Субъединица 2 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT3 | CNOT3 | CCR4-Нет Субъединица 3 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT4 | CNOT4 | CCR4-Нет Субъединица 4 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT6 | CNOT6 | CCR4-Нет Субъединица 6 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT6L | CNOT6L | CCR4-Нет Субъединица транскрипционного комплекса 6L | [42] | да[42] |
CNOT7 | CNOT7 | CCR4-Нет Субъединица 7 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT8 | CNOT8 | CCR4-Нет Субъединица 8 транскрипционного комплекса | [42] | да[42] |
CNOT9 | CNOT9 | CCR4-Нет Субъединица 9 транскрипционного комплекса | [42] | |
CORO1B | CORO1B | Коронин-1Б | [22] | |
CPB2 | Карбоксипептидаза B2 | Карбоксипептидаза B2 | [74] | |
CPEB1 | CPEB | Цитоплазматический элемент полиаденилирования, связывающий белок 1 | [75] | |
CPEB4 | CPEB4 | Цитоплазматический элемент полиаденилирования, связывающий белок 4 | [41][42] | да[42] |
CPSF3 | CPSF3 | Субъединица 3 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования | [22] | |
CPSF6 | CPSF6 | Субъединица 6 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования | [22] | |
CPSF7 | CPSF7 | Субъединица 7 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования | [22] | |
CPVL | CPVL | Карбоксипептидаза, подобная вителлогену | [42] | да[42] |
CRKL | CRKL | CRK, как протоонкоген, адаптерный белок | [41] | |
CROCC | CROCC | Цилиарный корень Coiled-Coil, Rootletin | [41] | |
CRYAB | CRYAB | Альфа-кристаллин B цепь | [22] | |
CSDE1 | CSDE1 | Белок Е1, содержащий домен холодного шока | [22][41][42][57] | |
CSE1L | CSE1L / XPO2 / Exportin-2 | Экспортин-2 | [22] | |
CSNK2A1 | Казеин киназа 2 альфа | Казеин киназа 2 Альфа 1 | [76] | |
CSTB | Цистатин B | Цистатин B | [41] | |
CSTF1 | CSTF1 | Субъединица 1 фактора стимуляции расщепления | [22] | |
CTNNA2 | CTNNA2 | Катенин альфа-2 | [22] | |
CTNND1 | CTNND1 | Катенин дельта-1 | [22] | |
CTTNBP2NL | CTTNBP2NL | CTTNBP2 N-концевой белок | [22] | |
CWC22 | CWC22 | Гомолог CWC22 фактора сплайсинга пре-мРНК | [22] | |
DAZAP1 | DAZAP1 | DAZ-ассоциированный белок 1 | [22][41][42] | |
DAZAP2 | PRTB | Связанный с DAZ белок 2 | [77] | |
DAZL | DAZL1 | Удалено при азооспермии лайк | [78] | |
DCD | DCD | Дермцидин | [22] | |
DCP1A | DCP1a | Декапирование мРНК 1a | [22][41][75] | да[32] |
DCP1B | DCP1b | Декапирование мРНК 1b | [41] | да[32] |
DCP2 | DCP2 | Декапирование мРНК 2 | [42] | |
DCTN1 | DCTN1 | Субъединица динактина 1 | [22] | |
DDX1 | Мертвый коробчатый белок 1 | DEAD-Box Helicase 1 | [22][41][42][79] | |
DDX19A | DDX19A | АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX19A | [22][57] | |
DDX21 | DDX21 | Ядерная РНК-геликаза 2 | [22] | да[32] |
DDX3 | Мертвый бокс протеин 3 | DEAD-Box Геликаза 3 | [22][80][81] | |
DDX3X | DDX3X | DEAD-Box Helicase 3, X-связанный | [41][42][82][83][57] | |
DDX3Y | DDX3Y | DEAD-Box Helicase 3, соединение Y | [41] | |
DDX47 | DDX47 | Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX47 | [22] | |
DDX50 | DDX50 | АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX50 | [22] | да[32] |
DDX58 | RIG-I | DExD / H-Box Helicase 58 | [84] | |
DDX6 | Мертвый бокс протеин 6 | DEAD-Box Геликаза 6 | [22][41][42][53][85][75][45][86] | да[32][42] |
DERA | DERA | Дезоксирибозо-фосфат-альдолаза | [87] | |
DHX30 | DHX30 | Предполагаемая АТФ-зависимая РНК-геликаза DHX30 | [22][41] | да[32] |
DHX33 | DHX33 | DEAH-Box Helicase 33 | [41] | |
DHX36 | RHAU | DEAH-Box Helicase 36 | [41][42][23] | |
DHX57 | DHX57 | DExH-Box Helicase 57 | [42] | |
DHX58 | LGP2 | DExH-Box Helicase 58 | [84] | |
DIS3L2 | DIS3L2 / FAM3A | DIS3 Like 3'-5 'экзорибонуклеаза 2 | [41] | |
ДИСК1 | Нарушен при шизофрении 1 | Нарушено в шизофрении 1 | [88] | |
DKC1 | DKC1 | дискерин; Субъединица 4 рибонуклеопротеинового комплекса H / ACA | [22][89] | |
ДНКI1 | Промежуточная цепь аксонемала динеина 1 | Промежуточная цепь динеина аксонема 1 | [90] | |
DNAJA1 | DNAJA1 | DnaJ гомолог подсемейства A член 1 | [22] | |
DNAJC8 | DNAJC8 | DnaJ гомолог подсемейства C член 8 | [22] | |
DPYSL2 | DPYSL2 | Родственный дигидропиримидиназе белок 2 | [22] | |
DPYSL3 | DPYSL3 | Родственный дигидропиримидиназе белок 3 | [22] | |
ДРОША | ДРОША | Дроша рибонуклеаза III | [41] | |
DSP | DSP | Десмоплакин | [22][41] | |
Летнее время | Летнее время | Дистонин | [22] | |
DSTN | DSTN | Дестрин | [22] | |
DTX3L | DTX3L | E3 убиквитин-протеинлигаза DTX3L | [22] | |
DUSP12 | DUSP12 / YVH1 | Фосфатаза двойной специфичности 12 | [91] | |
DYNC1H1 | Цитоплазматическая тяжелая цепь динеина 1 | Динеин цитоплазматический 1 Тяжелая цепь 1 | [90] | |
DYNLL1 | Цитоплазматический динеиновый светлый полипептид | Легкая цепь динеина LC8-Тип 1 | [41][92] | |
DYNLL2 | DYNLL2 | Легкая цепь динеина 2, цитоплазматическая | [22] | |
DYRK3 | DYRK3 | Киназа 3, регулируемая фосфорилированием тирозина с двойной специфичностью | [93] | |
DZIP1 | DZIP1 | DAZ взаимодействующий цинковый белок пальца 1 | [94] | |
DZIP3 | DZIP3 | DAZ взаимодействующий цинковый белок пальца 3 | [42] | |
EDC3 | EDC3 | Энхансер Decapping мРНК 3 | [41][42] | да[42] |
EDC4 | EDC4 | Энхансер мРНК-декапирующего белка 4 | [22][41] | да[32] |
EIF1 | EIF1 | Фактор инициации трансляции эукариот 1 | [41] | |
EIF2A | EIF2A | Фактор инициации трансляции эукариот 2А | [33][22][49][95] | |
EIF2AK2 | Протеинкиназа R / PKR | Фактор инициации трансляции эукариот 2 Альфа-киназа 2 | [65][84][96] | |
EIF2B1-5 | EIF2B | Фактор инициации трансляции эукариот 2B | [95] | |
EIF2S1 | EIF2A субъединица 1 | Субъединица альфа фактора инициации трансляции эукариот 2 | [22] | |
EIF2S2 | EIF2A субъединица 2 | Субъединица фактора 2 инициации трансляции эукариот бета | [22] | |
EIF3A | EIF3A | Фактор инициации трансляции эукариот 3, субъединица A | [22][41][46][31][97] | |
EIF3B | EIF3B | Субъединица В фактора инициации трансляции эукариот 3 | [33][22][77][98][99] | |
EIF3C | EIF3C | Субъединица C фактора инициации трансляции эукариот | [41] | |
EIF3D | EIF3D | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица D | [22][41][57] | |
EIF3E | EIF3E | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица E | [22][41][57] | |
EIF3F | EIF3F | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица F | [22] | |
EIF3G | EIF3G | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица G | [22][41][57] | |
EIF3H | EIF3H | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица H | [22][41] | |
EIF3I | EIF3I | Субъединица I фактора инициации трансляции эукариот 3 | [22] | |
EIF3J | EIF3J | Субъединица J фактора инициации трансляции эукариот | [22][41] | |
EIF3K | EIF3K | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица K | [22] | |
EIF3L | EIF3L | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица L | [22][41][57] | |
EIF3M | EIF3M | Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица M | [22] | |
EIF4A1 | EIF4A1 | Фактор инициации трансляции эукариот 4A1 | [22][41][100] | |
EIF4A2 | EIF4A2 | Фактор инициации трансляции эукариот 4A2 | [41][101] | |
EIF4A3 | EIF4A3 | Фактор инициации трансляции эукариот 4A3 | [41] | |
EIF4B | EIF4B | Фактор инициации трансляции эукариот 4B | [22][41] | |
EIF4E | EIF4E | Фактор инициации трансляции эукариот 4E | [97][95][2][102][67][103][104][33] | да[33] |
EIF4E2 | EIF4E2 | Фактор инициации трансляции эукариот 4E Член семьи 2 | [42][104] | да[42] |
EIF4E3 | EIF4E3 | Фактор инициации трансляции эукариот 4E Член семьи 3 | [104] | |
EIF4ENIF1 | EIF4ENIF1 | Фактор инициации трансляции эукариот 4E Фактор ядерного импорта 1 | [41][42] | да[42] |
EIF4G1 | EIF4G1 | Фактор инициации трансляции эукариот 4G1 | [22][41][97][95][2][102][105][106][77][107][31] | |
EIF4G2 | EIF4G2 | Фактор инициации трансляции эукариот 4G2 | [22][42] | |
EIF4G3 | EIF4G3 | Фактор инициации трансляции эукариот 4G3 | [41] | |
EIF4H | EIF4H | Фактор инициации трансляции эукариот 4H | [22][41] | |
EIF5A | EIF5A | Фактор инициации трансляции эукариот 5A | [98] | |
ELAVL1 | HuR | ELAV-подобный РНК-связывающий белок 1 | [22][31][41][108][97][109][102][103][77][92][110][111] | да[32] |
ELAVL2 | ELAVL2 | ELAV-подобный белок 2 | [22][41] | да[32] |
ELAVL3 | ELAVL3 / HuC | ELAV-подобный РНК-связывающий белок 3 | [41] | |
ELAVL4 | HuD | ELAV-подобный РНК-связывающий белок 4 | [41][112] | |
ЕНДОВ | EndoV | Эндонуклеаза V | [113] | |
ENTPD1 | ENTPD1 | Эктонуклеозидтрифосфатдифосфогидролаза 1 | [41] | |
ЭППК1 | ЭППК1 | Эпиплакин | [22] | |
ETF1 | ETF1 | Субъединица 1 фактора высвобождения пептидной цепи эукариот | [22] | |
EWSR1 | EWSR1 | EWS РНК-связывающий белок 1 | [114][115] | |
FABP5 | FABP5 | Белок, связывающий жирные кислоты 5 | [41] | |
FAM120A | FAM120A / OSSA | Конститутивный коактиватор PPAR-гамма-подобного белка 1 | [22][41][42] | да[32] |
FAM120C | FAM120C | Семья с подобием последовательностей 120C | [41][42] | |
FAM168B | FAM168B / MANI | Семья со сходством последовательностей 168 Член B | [41] | |
FAM98A | FAM98A | Семья со сходством последовательностей 98 Член A | [22][41][116] | |
ФАСТК | БЫСТРЫЙ | Fas активированная серин / треонинкиназа | [33] | да[33] |
FBL | FBL | рРНК 2-O-метилтрансфераза фибрилларин | [22] | |
FBRSL1 | Фиброзин Like 1 | Фиброзин Like 1 | [42] | |
FHL1 | FHL1 | Четыре с половиной домена LIM белка 1 | [22] | |
ЛНБ | ЛНБ | Филамин-Б | [22] | |
FMR1 | FMRP | Хрупкий X Умственная отсталость 1 | [20][22][41][42][66][67][102][117][118][91][57] | |
FNDC3B | FNDC3B | Белок 3B, содержащий домен фибронектина типа III | [22][42] | |
FSCN1 | FSCN1 | Очаровательный | [22] | |
FTSJ3 | FTSJ3 | белок процессинга пре-рРНК FTSJ3 | [22] | |
FUBP1 | FUBP1 | Белок, связывающий дальний элемент вверх по течению потока 1 | [41] | |
FUBP3 | FUBP3 | Белок, связывающий элементы 3 далеко вверх по течению | [22][41][42] | |
FUS | FUS | FUS РНК-связывающий белок | [22][41][46][114][115][119][120][121][122][123][124][125] | |
FXR1 | FXR1 | FMR1 Аутосомный гомолог 1 | [22][41][42][117][102][103][126] | |
FXR2 | FXR2 | FMR1 Аутосомный гомолог 2 | [22][41][42][117][102] | |
G3BP1 | G3BP1 | G3BP фактор сборки стресс-гранулы 1 | [22][41][42][64][96][65][127][128][33][103][129][126][130][57] | |
G3BP2 | G3BP2 | G3BP Коэффициент сборки напряженных гранул 2 | [22][41][42][131][132][57] | |
ГАБАРАПЛ2 | GABARAPL2 / GEF2 / ATG8 | GABA-рецептор-ассоциированный белок, подобный 2 | [41] | |
GAR1 | GAR1 | Субъединица 1 рибонуклеопротеинового комплекса H / ACA | [89] | |
GCA | Гранкальцин | Гранкальцин | [41] | |
БЛИЗНЕЦ 5 | Близнец-5 | Белок 5, ассоциированный с ядерной органеллой Gem | [105] | |
GFPT1 | GFPT1 | Глутамин — фруктозо-6-фосфатаминотрансфераза [изомеризация] 1 | [22] | |
GIGYF1 | GIGYF1 / PERQ1 | GRB10, взаимодействующий с GYF-белком 1 | [41] | |
GIGYF2 | GIGYF2 / TNRC15 / PARK11 / PERQ2 | GRB10, взаимодействующий с GYF Protein 2 | [41][42] | да[42] |
GLE1 | GLE1 | GLE1, посредник экспорта РНК | [42][133][134] | |
GLO1 | Глиоксалаза | Глиоксалаза | [41] | |
GLRX3 | GLRX3 / глутаредоксин 3 / TNLX2 | Глутаредоксин 3 | [41] | |
GNB2 | GNB2 | Гуанин-нуклеотид-связывающий белок G (I) / G (S) / G (T) субъединица бета-2 | [22] | |
ГОЛГА2 | Голгин А2 | Голгин А2 | [41] | |
GRB2 | GRB2 / ЯСЕНЬ | Белок 2, связанный с рецептором фактора роста | [41] | |
GRB7 | GRB7 | Белок 7, связанный с рецептором фактора роста | [135][136] | |
GRSF1 | GRSF1 | G-богатый фактор связывания последовательности РНК 1 | [41][42] | |
GSPT1 | eRF3 | Фазовый переход G1 в S 1 | [41][137] | |
H1F0 | H1F0 | Гистон H1.0 | [22] | |
H1FX | H1FX | Гистон H1x | [22] | |
H2AFV | H2AFV | Гистон H2A.V | [22] | |
HABP4 | Ki-1/57 | Гиалуроновый связывающий белок 4 | [138] | |
HDAC6 | HDAC6 | Гистоновая деацетилаза 6 | [83][129][57] | |
HDLBP | HDL-связывающий белок / VGL / Vigilin | Белок, связывающий липопротеины высокой плотности | [41] | |
HELZ | HELZ | Вероятная геликаза с доменом цинковых пальцев | [22][41][42] | да[42] |
HELZ2 | HELZ2 | Геликаза с доменом цинкового пальца 2 | [22] | |
HMGA1 | HMGA1 | Белок группы высокой подвижности HMG-I / HMG-Y | [22] | |
HMGB3 | HMGB3 | Белок группы высокой подвижности B3 | [22] | |
HMGN1 | HMGN1 | Негистоновый хромосомный белок HMG-14 | [22] | |
HNRNPA1 | HnRNPA1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1 | [22][41][46][139][140][141][142] | |
HNRNPA2B1 | HnRNPA2 / B1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A2 / B1 | [22][41][143][57] | |
HNRNPA3 | HNRNPA3 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A3 | [22][41] | |
HNRNPAB | HNRNPAB | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A / B | [22][41][42] | |
HNRNPD | HNRNPD | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин D | [41] | |
HNRNPDL | HNRNPDL | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид D-подобный | [41] | |
HNRNPF | HNRNPF | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин F | [41] | |
HNRNPH1 | HNRNPH1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 | [41] | |
HNRNPH2 | HNRNPH2 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H2 | [22] | |
HNRNPH3 | HNRNPH3 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H3 | [41] | |
ГНРНПК | ГНРНПК | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин К | [22][111][144] | |
HNRNPUL1 | HNRNPUL1 | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеид U-подобный белок 2 | [22] | |
HSBP1 | HSBP1 | Белок, связывающий фактор теплового шока 1 | [41] | |
HSP90AA1 | HSP90 | Белок теплового шока HSP 90-альфа | [22] | |
HSPA4 | HSP70 RY | Тепловой шок, 70 кДа, белок 4 | [22] | |
HSPA9 | HSP70 9B | Белок стресс-70, митохондриальный | [22] | |
HSPB1 | HSP27 | Семейство белков теплового шока B (малое), член 1 | [22][145] | да[32] |
HSPB8 | HSPB8 | Семейство белков теплового шока B (малое), член 8 | [146] | |
HSPBP1 | HSPBP1 | Связывающий белок 1 HSPA (Hsp70) | [147] | |
HSPD1 | HSPD1 | Белок теплового шока 60 кДа, митохондриальный | [22][41] | |
HTT | Хантингтин | Хантингтин | [63] | |
IBTK | IBTK | Ингибитор тирозинкиназы брутона | [42] | |
IFIH1 | MDA5 | Интерферон, индуцированный доменом 1 геликазы С | [84] | |
IGF2BP1 | IGF2BP1 | Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК-связывающий белок 1 | [22][41][42] | да[32] |
IGF2BP2 | IGF2BP2 | Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК-связывающий белок 2 | [22][41][42] | да[32] |
IGF2BP3 | IGF2BP3 | Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК, связывающий белок 3 | [22][41][42][131] | да[32] |
IK | IK | Протеиновый красный | [22] | |
ILF3 | NF90 | Фактор связывания усилителя интерлейкина 3 | [148] | да[32] |
IPO7 | IPO7 | Импортин-7 | [22] | |
ИППК | IP5K | Инозитол-пентакисфосфат-2-киназа | [149] | |
ITGB1 | ITGB1 | Интегрин бета-1 | [22] | |
JMJD6 | JMJD6 | Аргининдеметилаза и лизингидроксилаза | [130] | |
KANK2 | KANK2 | Мотив KN и белок 2, содержащий домен анкиринового повтора | [22] | |
KEAP1 | KEAP1 / KLHL19 | Kelch Like ECH ассоциированный белок 1 | [41] | |
KHDRBS1 | Sam68 | KH РНК-связывающий домен, связанный с сигнальной трансдукцией 1 | [22][150][151][152] | |
KHDRBS3 | KHDRBS3 | KH-домен, содержащий РНК-связывающий белок 3, связанный с сигнальной трансдукцией | [22] | |
ХСРП | KSRP / FBP2 | Регуляторный белок сплайсинга KH-типа | [22][41][153] | |
KIAA0232 | KIAA0232 | KIAA0232 | [42] | да[42] |
KIAA1524 | CIP2A | Белок CIP2A | [22] | |
KIF1B | KIF1B | Член семьи Кинезин 1B | [42] | |
KIF13B | КИФ13Б / ГАКИН | Член семьи Кинезин 13B | [41] | |
KIF23 | KIF23 | Кинезиноподобный белок KIF23 | [22] | да[32] |
KIF2A | Участник тяжелой цепи кинезина 2 | Член семьи Кинезин 2А | [90] | |
KLC1 | Кинезиновая легкая цепь 1 | Кинезиновая легкая цепь 1 | [90] | |
KPNA1 | Импортин-ɑ5 | Кариофериновая субъединица Альфа 1 | [22][41][154] | |
KPNA2 | Импортин-ɑ1 | Кариоферин субъединица Альфа 2 | [22][154][155][134] | |
KPNA3 | Импортин-ɑ4 | Кариоферин субъединица альфа 3 | [41][154] | |
KPNA6 | Импортин-ɑ7 | Импортин субъединица альфа | [22] | |
КПНБ1 | Импортин-β1 | Субъединица кариоферина бета 1 | [22][154][134][57] | |
L1RE1 | LINE1 ORF1p | LINE1 ORF1 белок | [22][46] | |
LANCL1 | LanC Нравится 1 | LanC Нравится 1 | [41] | |
LARP1 | LARP1 | La-родственный белок 1 | [22] | |
LARP1B | LARP1B | La-родственный белок 1b | [42] | |
LARP4 | La-родственный белок 4 | Член семейства La Ribonucleoprotein Domain 4 | [22][41][42][156] | |
LARP4B | LARP4B | Член семейства La Ribonucleoprotein Domain 4B | [41][42] | |
LASP1 | LIM и SH3-белок 1 / MLN50 | LIM и SH3-белок 1 | [41] | |
LBR | LBR | Рецептор ламина-B | [22] | |
LEMD3 | LEMD3 | Белок внутренней ядерной мембраны Man1 | [22] | |
LIG3 | ДНК-лигаза 3 | ДНК-лигаза 3 | [41] | |
LIN28A | LIN28A | Лин-28 Гомолог А | [41][157] | |
LIN28B | LIN28B | Лин-28 Гомолог Б | [41][157] | |
LMNA | LMNA | Преламин-А / С | [22] | |
LPP | LPP | Липома-предпочтительный партнер | [22] | |
LSM1 | LSM1 | Гомолог LSM1, связанная с деградацией мРНК | [41] | да[158] |
LSM12 | LSM12 | LSM12 Гомолог | [41][42] | |
LSM14A | RAP55 | LSM14A, фактор сборки тела процессинга мРНК | [22][41][42][159][160] | да[32][42] |
LSM14B | LSM14B | Гомолог B белка LSM14 | [22][41][42] | да[32] |
LSM3 | LSM3 | U6 snRNA-ассоциированный Sm-подобный белок LSm3 | [22] | да[158] |
LUC7L | LUC7L | Предполагаемый РНК-связывающий белок Luc7-like 1 | [22] | |
LUZP1 | LUZP1 | Белок лейциновой молнии 1 | [22][42] | |
MACF1 | MACF1 | Фактор сшивания микротрубочек с актином 1, изоформы 1/2/3/5 | [22][57] | |
MAEL | MAEL | Глушитель сперматогенного транспозона Maelstrom | [161] | |
MAGEA4 | MAGEA4 | Ассоциированный с меланомой антиген 4 | [22] | |
MAGED1 | MAGED1 | Ассоциированный с меланомой антиген D1 | [22][41][42] | |
MAGED2 | MAGED2 | Ассоциированный с меланомой антиген D2 | [22] | |
MAGOHB | MAGOHB | Протеин mago nashi homolog 2 | [22] | |
MAP1LC3A | LC3-I | Связанный с микротрубочками белок 1 Легкая цепь 3 Альфа | [162][163] | |
MAP4 | MAP4 | Связанный с микротрубочками белок 4 | [22] | |
MAPK1IP1L | MAPK1IP1L | Митоген-активированная протеинкиназа 1, взаимодействующий с белком 1, как | [41] | |
MAP4K4 | MAP4K4 | Митоген-активированная протеинкиназа киназа киназа киназа 4 | [22] | |
MAPK8 | JNK1 | Митоген-активированная протеинкиназа 8 | [164] | |
MAPRE1 | MAPRE1 | Связанный с микротрубочками белок член семейства RP / EB 1 | [22] | |
MAPRE2 | MAPRE2 | Связанный с микротрубочками белок RP / EB член семейства 2 | [41] | |
MARF1 | MARF1 | Регулятор мейоза и фактор стабильности мРНК 1 | [42] | да[42] |
МАРС | МАРС | Метионин — тРНК лигаза, цитоплазматическая | [22] | |
MBNL1 | MBNL1 | Muscleblind Like регулятор сплайсинга 1 | [79] | |
MBNL2 | MBNL2 | Muscleblind Like регулятор сплайсинга 2 | [42] | |
MCM4 | MCM4 | Фактор лицензирования репликации ДНК MCM4 | [22] | |
MCM5 | MCM5 | Фактор лицензирования репликации ДНК MCM5 | [22] | |
MCM7 | MCM7 | Фактор лицензирования репликации ДНК MCM7 | [22] | да[32] |
METAP1 | METAP1 | Метионин аминопептидаза | [22] | |
METAP2 | METAP2 | Метиониламинопептидаза 2 | [41] | |
MCRIP1 | FAM195B / GRAN2 | Гранулин-2 | [41][42][86] | |
MCRIP2 | FAM195A / GRAN1 | Гранулин-1 | [42][86] | |
MEX3A | MEX3A | РНК-связывающий белок MEX3A | [22] | да[32] |
MEX3B | MEX3B | Член B семейства, связывающий РНК Mex-3 | [41][165] | |
MEX3C | MEX3C | Член C семейства, связывающий РНК Mex-3 | [41][166] | |
MEX3D | MEX3D | Член семейства D, связывающий РНК Mex-3 | [42] | |
MFAP1 | MFAP1 | Микрофибриллярный белок 1 | [22] | |
MKI67 | MKI67 | Антиген KI-67 | [22] | |
MKRN2 | MKRN2 | Макорин безымянный протеин для пальцев 2 | [41][42] | |
MOV10 | MOV-10 | Mov10 RISC Комплексная РНК-геликаза | [22][42][45] | да[32][42] |
MSH6 | MSH6 | Белок репарации несоответствия ДНК Msh6 | [22] | |
MSI1 | Мусаси-1 | РНК-связывающий белок Musashi 1 | [41][160][167] | да[32] |
MSI2 | MSI2 | РНК-связывающий белок Musashi, гомолог 2 | [22][41] | |
MTHFD1 | MTHFD1 | C-1-тетрагидрофолатсинтаза, цитоплазматическая | [22] | |
MTHFSD | MTHFSD | Метенилтетрагидрофолатсинтетазный домен, содержащий | [168] | |
MTOR | MTOR | Механическая мишень рапамицина | [93][169] | |
MYO6 | MYO6 | Нетрадиционный миозин-VI | [22] | |
NCOA3 | SRC-3 | Коактиватор ядерного рецептора 3 | [170] | |
NDEL1 | NUDEL / MITAP1 / EOPA | NudE Neurodevelopment Protein 1 Нравится 1 | [41] | |
NELFE | NELF-E / RD | Элемент комплекса факторов отрицательного удлинения E | [41] | |
NEXN | NEXN | Нексилин | [22] | |
NXF1 | NXF1 / MEX67 / TAP | Фактор экспорта ядерной РНК 1 | [42][57] | |
НКРФ | NRF | Фактор репрессии NFK-B | [41] | |
NOLC1 | Ядрышковый фосфопротеин и фосфопротеин спирального тела 1 / NOPP140 | Ядрышковые и спиралевидные фосфопротеины 1 | [41] | |
НЕТ НЕТ | Нет нет | Домен без POU, содержащий привязку октамера | [22][171] | |
NOP58 | NOP58 | Ядерный белок 58 | [22] | да[32] |
NOSIP | NOSIP | Белок, взаимодействующий с синтазой оксида азота | [22] | |
НОВА2 | НОВА2 | Альтернативный регулятор сварки NOVA 2 | [41] | |
NRG2 | Нейрегулин-2 | Нейрегулин-2 | [99] | |
NSUN2 | NSUN2 | тРНК (цитозин (34) -C (5)) - метилтрансфераза | [22] | |
НТМТ1 | НТМТ1 | N-концевой Xaa-Pro-Lys N-метилтрансфераза 1 | [22] | |
NUDC | NUDC | Белок ядерной миграции nudC | [22] | |
NUFIP1 | NUFIP | NUFIP1, FMR1 взаимодействующий белок 1 | [102] | |
NUFIP2 | NUFIP2 | Ядерный ломкий X-белок, взаимодействующий с умственной отсталостью 2 | [22][41][42][86][57] | |
NUPL2 | NUPL2 | Нуклеопорин Like 2 | [134] | |
NUP153 | NUP153 | Нуклеопорин 153 | [41] | |
NUP205 | NUP205 | Комплексный белок ядерной поры Nup205 | [22][134] | |
NUP210 | NUP210 / GP210 | Нуклеопорин 210 | [134] | |
NUP214 | NUP214 | Нуклеопорин 214 | [134] | |
NUP50 | NUP50 | Нуклеопорин 50 | [134] | |
NUP58 | NUP58 / NUPL1 | Нуклеопорин 58 | [134] | |
NUP85 | NUP85 | Нуклеопорин 85 | [134] | |
NUP88 | NUP88 | Нуклеопорин 88 | [134] | |
NUP98 | NUP98 / NUP96 | Комплексный белок ядерной поры Nup98-Nup96 | [22][134][57] | |
OASL | OASL / OASL1 | 2'-5'-олигоаденилатсинтетаза подобная | [172] | |
OAS1 | ОАГ | 2′-5 ′ олигоаденилатсинтетаза | [84] | |
OAS2 | OAS2 | 2'-5'-Олигоаденилатсинтетаза 2 | [96] | |
OGFOD1 | TPA1 | 2-оксоглутарат и железозависимый домен оксигеназы, содержащий 1 | [173] | |
OGG1 | OGG1 | 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаза | [174] | |
OSBPL9 | Оксистерин-связывающий белок Like 9 | Оксистерин-связывающий белок Like 9 | [41] | |
OTUD4 | OTUD4 / HIN1 | OTU Деубиквитиназа 4 | [41][42][175] | |
P4HB | Бета субъединица пролил-4-гидроксилазы | Бета субъединица пролил-4-гидроксилазы | [41] | |
PABPC1 | PABP1 | Поли (А) связывающий белок цитоплазмы 1 | [22][41][42][145][109][52][117][67][102][131] | |
PABPC4 | PABPC4 | Полиаденилат-связывающий белок 4 | [22][41][42] | |
PAK4 | PAK4 | Серин / треонин-протеинкиназа PAK 4 | [22][41] | |
PALLD | Палладин | Палладин | [22] | |
ПАРГ | PARG / PARG99 / PARG102 | Поли (АДФ-рибоза) гликогидролаза | [176] | |
PARK7 | PARK7 / DJ-1 | Дегликаз, связанный с паркинсонизмом | [177] | да[177] |
ПАРН | ПАРН / ДАН | Поли (А) -специфическая рибонуклеаза | [41] | |
PARP12 | ПАРП-12 / АРТД12 | Член семейства поли (АДФ-рибоза) полимеразы 12 | [42][176][178] | |
PARP14 | ПАРП-14 | Член семейства поли (АДФ-рибоза) полимеразы 14 | [176] | |
PARP15 | ПАРП-15 | Член семейства поли (АДФ-рибоза) полимеразы 15 | [176] | |
PATL1 | PATL1 | PAT1 гомолог 1, фактор распада мРНК процессинга | [41][42] | да[42] |
PAWR | PAWR | Белок-регулятор апоптоза PRKC WT1 | [22] | |
PCBP1 | PCBP1 / HNRNPE1 | Поли (RC) связывающий белок 1 | [41][42] | |
PCBP2 | PCBP2 / HNRNPE2 | Поли (RC) связывающий белок 2 | [22][41][42][74] | |
PCNA | PCNA | Ядерный антиген пролиферирующих клеток | [22] | |
PDAP1 | PDAP1 | Связанный с PDGFA белок 1 | [41] | |
PDCD4 | PDCD4 | Запрограммированная смерть клетки 4 | [179] | |
PDCD6IP | PDCD6IP | Программируемая гибель клеток 6-взаимодействующий белок | [22] | |
PDIA3 | PDIA3 | Протеин-дисульфид-изомераза, член семейства А 3 | [41] | |
PDLIM1 | PDLIM1 | PDZ и белок домена LIM 1 | [22] | |
PDLIM4 | PDLIM4 | PDZ и белок домена LIM 4 | [22] | |
PDLIM5 | PDLIM5 | PDZ и белок домена LIM 5 | [22] | |
PDS5B | PDS5B | Сестринский белок слипания хроматид, гомолог B PDS5 | [22] | |
PEF1 | PEF1 | Домен Penta-EF-Hand, содержащий 1 | [41] | |
ПЭГ10 | ПЭГ10 | Отцовское выражение 10 | [42] | |
ПЕЛО | ПЕЛО | Гомолог белкового пелота | [22] | |
PEPD | Пептидаза D | Пептидаза D | [41] | |
PEX11B | PEX11B | Фактор пероксисомального биогенеза 11 бета | [41] | |
PFDN4 | PFDN4 | Префолдин субъединица 4 | [22] | |
PFN1 | Профилин 1 | Профилин 1 | [22][56] | |
PFN2 | Профилин 2 | Профилин 2 | [22][56] | |
PGAM5 | PGAM5 | Серин / треонин-протеинфосфатаза PGAM5, митохондриальная | [22] | |
PGP | PGP / G3PP | Фосфогликолят фосфатаза | [41] | |
PHB2 | Prohibitin 2 | Prohibitin 2 | [19] | |
PHLDB2 | PHLDB2 | Член 2 семейства гомологически подобных доменов плэкстрина | [22] | |
ПКП1 | Плакофилин 1 | Плакофилин 1 | [126] | |
ПКП2 | Плакофилин 2 | Плакофилин 2 | [22] | |
ПКП3 | Плакофилин 3 | Плакофилин 3 | [126] | |
PNPT1 | PNPase I | Полирибонуклеотид Нуклеотидилтрансфераза 1 | [41] | |
POLR2B | POLR2B | ДНК-направленная РНК-полимераза | [22][57] | |
POM121 | POM121 | POM121 Трансмембранный нуклеопорин | [134] | |
POP7 | RPP20 | Гомолог POP7, субъединица рибонуклеазы P / MRP | [128] | |
PPME1 | PPME1 | Протеиновая фосфатаза метилэстераза 1 | [22] | |
PPP1R8 | PPP1R8 | Регуляторная субъединица 8 протеинфосфатазы 1 | [41] | |
PPP1R10 | PPP1R10 | Регуляторная субъединица 10 серин / треонин-протеинфосфатазы 1 | [22][57] | |
PPP1R18 | PPP1R18 | Фостензин | [22] | |
PPP2R1A | PPP2R1A | Серин / треонин-протеинфосфатаза 2A Регуляторная субъединица A 65 кДа изоформа альфа | [22][57] | |
PPP2R1B | PPP2R1B | Серин / треонин-протеинфосфатаза 2A Регуляторная субъединица A 65 кДа изоформа бета | [41] | |
PQBP1 | PQBP-1 | Полиглутамин-связывающий белок 1 | [180] | |
PRDX1 | PRDX1 | Пероксиредоксин-1 | [22][41] | |
PRDX6 | PRDX6 | Пероксиредоксин-6 | [22] | |
PRKAA2 | АМПК-а2 | Каталитическая субъединица альфа-2, активированная протеинкиназой, активированная АМФ | [18] | |
PRKCA | PKC-ɑ | Протеинкиназа C Альфа | [131] | |
PRKRA | ПАКТ | Белковый активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы EIF2AK2 | [22][51] | |
PRMT1 | PRMT1 | Белок аргинин-N-метилтрансфераза 1 | [22] | |
PRMT5 | PRMT5 | Белок аргинин-N-метилтрансфераза 5 | [22] | |
PRRC2A | PRRC2A | Катушка Proline Rich Coiled-Coil 2A | [22][41][42] | |
PRRC2B | PRRC2B | Катушка Proline Rich Coiled-Coil 2B | [41][42] | |
PRRC2C | PRRC2C | Катушка Proline Rich Coiled-Coil 2C | [22][41][42][57] | |
PSMD2 | PSMD2 | 26S протеасома, не регулирующая АТФаза субъединица 2 | [22][181] | |
PSPC1 | PSP1 | Компонент Paraspeckle 1 | [41] | |
PTBP1 | PTBP1 | Полипиримидиновый тракт-связывающий белок 1 | [41] | |
PTBP3 | PTBP3 | Полипиримидиновый тракт-связывающий белок 3 | [22][41][42] | |
ПТГЭС3 | ПТГЭС3 | Простагландин Е-синтаза 3 | [22] | |
ПТК2 | ФАК | Протеин тирозинкиназа 2 | [135] | |
PUM1 | Пумилио-1 | Pumilio гомолог 1 | [22][41][42] | да[32] |
PUM2 | Пумилио-2 | Член 2 семейства связывания РНК Pumilio | [41][42][67] | |
ПУРА | ПУРА | Белок-активатор транскрипции Pur-alpha | [22][41][121][123] | |
PURB | PURB | Белок-активатор транскрипции Pur-beta | [22][41] | |
PWP1 | PWP1 | Гомолог PWP1, эндонуклеин | [41] | |
PXDNL | PMR1 | Пероксидазин Like | [182] | |
PYCR1 | PYCR1 | Пирролин-5-карбоксилатредуктаза | [22] | |
QKI | QKI / HQK | QKI, домен KH, содержащий связывание РНК | [41] | |
R3HDM1 | R3HDM1 | Домен R3H, содержащий 1 | [41][42] | |
R3HDM2 | R3HDM2 | Домен R3H, содержащий 2 | [42] | |
RAB1A | RAB1A | Связанный с Ras белок Rab-1A | [22][57] | |
RACGAP1 | RACGAP1 | Rac GTPase-активирующий белок 1 | [22] | |
СТОЙКА1 | СТОЙКА1 | Рецептор для активированной C-киназы 1 | [19][107][183] | |
RAD21 | RAD21 | Гомолог белка репарации двухцепочечного разрыва rad21 | [22] | |
RAE1 | RAE1 | Экспорт рибонуклеиновой кислоты 1 | [134] | |
РАН | РАН | РАН, член семейства онкогенов РАН | [155][134] | |
РАНБП1 | РАНБП1 | Ран-специфический белок, активирующий ГТФазу | [22] | |
РАНБП2 | RANBP2 / NUP358 | RAN-связывающий белок 2 | [134] | |
RBBP4 | RBBP4 | Гистон-связывающий белок RBBP4 | [22] | |
RBFOX1 | RBFOX1 | Гомолог РНК-связывающего белка fox-1 | [22][184][185] | да[185] |
RBFOX2 | RBFOX2 | РНК-связывающий белок fox-1, гомолог 2 | [184] | |
RBFOX3 | RBFOX3 | РНК-связывающий белок fox-1, гомолог 3 | [184] | |
РБМ12Б | РБМ12Б | РНК-связывающий белок 12B | [22] | |
RBM15 | RBM15 | РНК-связывающий белок 15 | [41] | |
RBM17 | RBM17 | РНК-связывающий белок 17 | [41] | |
RBM25 | RBM25 | РНК-связывающий белок 25 | [41] | |
RBM26 | RBM26 | РНК-связывающий белок 26 | [22] | |
RBM3 | RBM3 | РНК-связывающий белок 3 | [41] | |
RBM38 | RBM38 | РНК-связывающий белок 38 | [41] | |
RBM4 | RBM4 | РНК-связывающий мотив, белок 4 | [41][186] | |
RBM4B | RBM4B | Белок связывающего РНК-мотива 4B | [41] | |
RBM42 | RBM42 | Белок связывающего РНК-мотива 42 | [144] | |
RBM45 | RBM45 | Белок связывающего РНК-мотива 45 | [187][188] | |
RBM47 | RBM47 | РНК-связывающий мотив, белок 47 | [42] | |
RBMS1 | RBMS1 | РНК-связывающий мотив, одноцепочечный взаимодействующий белок 1 | [22][41][42] | |
RBMS2 | RBMS2 | РНК-связывающий мотив, одноцепочечный взаимодействующий белок 2 | [22][41][42] | |
RBMX | RBMX | Белок связывающего РНК-мотива, Х-связанный | [42] | |
RBPMS | RBPMS | РНК-связывающий белок с множественным сплайсингом | [189] | |
RC3H1 | Рокин-1 | Безымянный палец и домены типа CCCH 1 | [41][42][190] | |
RC3H2 | MNAB | Безымянный палец и домены типа CCCH 2 | [42][190] | |
RCC1 | RCC1 | Регулятор конденсации хромосом | [22] | |
RCC2 | RCC2 | Белок RCC2 | [22] | |
RECQL | RECQL1 | RecQ Like Helicase | [41] | |
RFC3 | RFC3 | Субъединица 3 фактора репликации C | [22] | |
RFC4 | RFC4 | Субъединица 4 фактора репликации C | [22] | |
RGPD3 | RGPD3 | RanBP2-подобный белок 3, содержащий домен GRIP | [22] | |
RHOA | RhoA | Член семейства Ras Homolog A | [20] | |
RNASEL | РНКаза L | Рибонуклеаза L | [84][65] | |
RNF214 | RNF214 | Кольцо пальца белка 214 | [22][41] | |
RNF219 | RNF219 | Кольцо пальца белка 219 | [42] | да[42] |
RNF25 | RNF25 | Протеин безымянного пальца 25 | [41] | |
RNH1 | RNH1 | Ингибитор рибонуклеазы | [22][50] | |
ROCK1 | ROCK1 | Связанная Rho Coiled-Coil, содержащая протеинкиназу 1 | [20] | |
RPS19 | Рибосомный белок S19 | Рибосомный белок S19 | [97] | |
RPS3 | 40S Рибосомный белок S3 | 40S Рибосомный белок S3 | [95][97] | да[32] |
RPS6 | Рибосомный белок S6 | Рибосомный белок S6 | [64][95][2][102][169] | |
RPS11 | Рибосомный белок S11 | Рибосомный белок S11 | [41] | |
RPS24 | Рибосомный белок S24 | Рибосомный белок S24 | [41] | |
RPS6KA3 | RSK2 | Рибосомный протеин S6 Киназа A3 | [191] | |
RPS6KB1 | S6K1 | Рибосомный протеин S6 Киназа B1 | [169] | |
RPS6KB2 | S6K2 | Рибосомный протеин S6 Киназа B2 | [169] | |
RPTOR | RAPTOR | Регулирующий ассоциированный белок mTOR Complex 1 | [85][93][169] | |
RSL1D1 | RSL1D1 | Рибосомный белок 1, содержащий домен L1 | [22] | |
RTCB | RTCB | ТРНК-сплайсинговая лигаза гомолог RtcB, ранее C22orf28 | [22][41] | |
RTRAF | RTRAF (ранее C14orf166) | Фактор транскрипции, трансляции и транспорта РНК | [41] | |
S100A7A | S100A7A | Белок S100-A7A | [22] | |
S100A9 | S100A9 | Белок S100-A9 | [22] | да[32] |
SAFB2 | SAFB2 | Фактор крепления лесов B2 | [22][41] | да[32] |
SAMD4A | SMAUG1 | Стерильный домен альфа-мотива, содержащий 4А | [192] | |
SAMD4B | SMAUG2 | Стерильный домен альфа-мотива, содержащий 4B | [41] | |
СКЭПЕР | СКЭПЕР | Связанный с S-фазой циклин A белок в ER | [42] | |
SEC24C | SEC24C | Белковый транспортный белок Sec24C | [22][41] | |
SECISBP2 | Связывающий белок 2 SECIS | Связывающий белок SECIS 2 | [41][42] | |
SERBP1 | PAI-RBP1 / SERBP1 | SERPINE1 мРНК, связывающий белок 1 | [46][193][81] | |
SERPINE1 | ПАИ-1 / Серпин Е1 | Семья Серпин E, член 1 | [194] | |
SF1 | SF1 | Фактор сращивания 1 | [41] | |
SFN | SFN | 14-3-3 белковая сигма | [22] | |
SFPQ | PSF | Фактор сплайсинга, богатый пролином и глютамином | [22][171] | |
SFRS3 | SFRS3 | Фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 3 | [22] | |
SIPA1L1 | SIPA1L1 | Сигнально-индуцированный 1-подобный белок 1, связанный с пролиферацией | [22] | |
SIRT6 | Сиртуин 6 | Сиртуин 6 | [195] | |
SLBP | Белок, связывающий петлю и стебель | Белок, связывающий петлю и стебель | [41] | |
SMAP2 | SMAP2 | Малый ArfGAP2 | [42] | |
SMARCA1 | SMARCA1 / SNF2L1 | Вероятный глобальный активатор транскрипции SNF2L1 | [22] | |
SMC4 | SMC4 | Структурное поддержание белка хромосом | [22] | |
SMG1 | SMG-1 | SMG1, нонсенс-опосредованная распадом мРНК родственная киназа PI3K | [192][196] | |
SMG6 | SMG6 | SMG6, нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК | [42] | |
SMG7 | SMG7 | SMG7, Нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК | [42] | да[42] |
SMN1 | Выживание моторного нейрона | Выживание моторного нейрона 1, теломерный | [128][197][198] | |
SMU1 | SMU1 | Белок, содержащий повтор WD40, SMU1 | [22] | |
SMYD5 | SMYD5 | SMYD, член семьи 5 | [41] | |
SND1 | Тюдор-СН | Стафилококковая нуклеаза и тюдоровский домен, содержащий 1 | [41][42][44][199] | |
SNRPF | SNRPF | Малый ядерный рибонуклеопротеин F | [22] | |
SNTB2 | SNTB2 | Бета-2-синтрофин | [22] | |
SOGA3 | SOGA3 | Член семьи SOGA 3 | [41] | |
СОРБС1 | СОРБС1 | Сорбин и белок 1, содержащий домен SH3 | [22] | |
СОРБС3 | Винексин | Сорбин и домен SH3, содержащий 3 | [200] | |
SOX3 | SOX3 | SRY-Box 3 | [41] | |
SPAG5 | Астрин | Связанный со спермой антиген 5 | [85][169] | |
SPATS2 | SPATS2 / SPATA10 / SCR59 | Сперматогенез, связанный с высоким содержанием серина 2 | [41] | |
SPATS2L | SGNP | Связанный со сперматогенезом Serine Rich 2 Like | [22][201] | |
SPECC1L | SPECC1L | Цитоспин-А | [22] | |
SQSTM1 | SQSTM1 / p62 | Секвестосома 1 | [60] | |
НИИ | НИИ | Сорчин | [22][41] | |
SRP68 | Частица распознавания сигналов 68 | Частица распознавания сигналов 68 | [41][45] | |
SRP9 | SRP9 | Распознавание сигналов Particle 9 | [202] | |
SRRT | SRRT | Гомолог серратной эффекторной молекулы РНК | [22] | |
SRSF1 | ASF / SF2 | Фактор сплайсинга 1, богатый серином и аргинином | [41][203] | |
SRSF3 | SRp20 | Фактор сплайсинга 3, богатый серином и аргинином | [204][205][206][57] | |
SRSF4 | SRSF4 | Фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 4 | [22] | |
SRSF5 | SRSF5 / SRP40 | Фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 5 | [41] | |
SRSF7 | 9G8 | Богатый серином и аргинином фактор сплайсинга 7 | [46] | |
SRSF9 | SRSF9 / SRP30C | Фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 9 | [41] | |
SS18L1 | SS18L1 / CREST | SS18L1, субъединица комплекса ремоделирования хроматина nBAF | [207] | |
ST7 | ST7 / FAM4A1 / HELG / RAY1 / TSG7 | Подавление онкогенности 7 | [42] | да[42] |
STAT1 | STAT1 | Преобразователь сигналов и активатор транскрипции 1-альфа / бета | [22] | |
STAU1 | Штауфен 1 | Staufen Двухцепочечный связывающий РНК белок 1 | [22][41][109][67][208] | |
STAU2 | Штауфен 2 | Двухцепочечный РНК-связывающий белок 2 Staufen | [22][41][42][109] | да[32] |
STIP1 | STIP1 / HOP | Стресс-индуцированный фосфопротеин 1 | [22][51] | |
РЕМЕНЬ | РЕМЕНЬ | Белок, связанный с рецептором серин-треонинкиназы | [22][41] | |
SUGP2 | SUGP2 | SURP и белок 2, содержащий домен G-patch | [22] | |
SUGT1 | SUGT1 | SGT1 Homolog, MIS12 Kinetochore Complex Assembly Cohaperone | [42] | |
ВС 1 | ВС 1 | Белок, содержащий домен SUN 1 | [22] | |
SYCP3 | SYCP3 | Синаптонемный комплексный белок 3 | [22] | |
SYK | SYK | Тирозинкиназа, ассоциированная с селезенкой | [136] | |
SYNCRIP | SYNCRIP | Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин Q | [22][41][42][209] | да[32] |
TAGLN3 | Трансгелин 3 | Трансгелин 3 | [41] | |
TAF15 | TAF15 | TATA-бокс связывающий белок, ассоциированный фактор 15 | [22][41][114][115][119][57] | |
TARDBP | ТДП-43 | ДНК-связывающий белок TAR | [22][110][210][211][140][143][100][188][212][213] | |
TBRG1 | TBRG1 | Преобразование бета-регулятора фактора роста 1 | [41] | |
TCEA1 | TCEA1 | Фактор элонгации транскрипции А белок 1 | [22] | |
TCP1 | TCP1 | Т-комплексный белок 1 субъединица альфа | [22] | |
TDRD3 | Тюдоровский домен, содержащий 3 | Тюдоровский домен, содержащий 3 | [41][42][81][214][215][216] | |
TDRD7 | Тюдоровский домен, содержащий 7 | Тюдоровский домен, содержащий 7 | [42] | |
TERT | TERT | Обратная транскриптаза теломеразы | [217] | |
THOC2 | THOC2 | THO Комплекс 2 | [134] | |
THRAP3 | THRAP3 | Белок 3, связанный с рецепторами тиреоидных гормонов | [41] | |
TIA1 | ТИА-1 | РНК-связывающий белок, связанный с цитотоксическими гранулами TIA1 | [2][22][41][46][53][31][67][77][92][118][129][139][145][197][212][218][57] | |
TIAL1 | TIAR | TIA1 цитотоксические гранулы, ассоциированные с РНК-связывающим белком, подобным 1 | [22][41][42][67][102][109][110][145][187][197][207] | |
TMEM131 | TMEM131 | Трансмембранный белок 131 | [42] | да[42] |
TMOD3 | TMOD3 | Тропомодулин-3 | [22] | |
ТНКС | ПАРП-5а | Tankyrase | [176] | |
ТНКС1БП1 | ТНКС1БП1 | 182 кДа белок, связывающий танкиразу-1 | [22][42] | да[42] |
TNPO1 | Транспортин-1 | Транспортин-1 / Кариоферин (Импортин) Бета 2 | [22][41][134][219][220] | |
TNPO2 | Транспортин-2 | Транспортин-2 | [22][42] | |
TNRC6A | TNRC6A | Ген 6А, содержащий тринуклеотидный повтор, белок | [41][42] | да[42] |
TNRC6B | TNRC6B | Ген 6B, содержащий тринуклеотидный повтор, белок | [22][41][42] | да[42] |
TNRC6C | TNRC6C | Ген 6С, содержащий тринуклеотидный повтор, белок | [41][42] | да[42] |
TOMM34 | TOMM34 | Субъединица рецептора импорта митохондрий TOM34 | [22] | |
TOP3B | Топоизомераза (ДНК) III бета | Топоизомераза (ДНК) III бета | [42][215][221] | |
TPM1 | TPM1 | Цепь тропомиозина альфа-1 | [22] | |
TPM2 | TPM2 | Бета-цепь тропомиозина | [22] | |
TPR | TPR | Транслоцированная область промотора, белок ядерной корзины | [134] | |
TRA2B | TRA2B | Трансформер 2 Beta Homolog | [42] | |
TRAF2 | TRAF2 | Фактор 2, связанный с рецептором TNF | [106] | |
TRDMT1 | DNMT2 | тРНК Метилтрансфераза аспарагиновой кислоты 1 | [222] | |
TRIM21 | TRIM21 | E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM21 | [22] | |
TRIM25 | TRIM25 | Убиквитин E3 / лигаза ISG15 TRIM25 | [22][41][57] | |
TRIM56 | TRIM56 | E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM56 | [22][42][57] | |
TRIM71 | TRIM71 | E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM71 | [41] | |
TRIP6 | TRIP6 | Белок 6, взаимодействующий с рецепторами щитовидной железы | [22][41] | |
TROVE2 | РОРНП | Член семьи TROVE Domain 2 | [41] | |
TTC17 | TTC17 | Тетратрикопептидный повторяющийся домен 17 | [42] | да[42] |
TUBA1C | TUBA1C | Цепь тубулина альфа-1С | [22] | |
TUBA3C | TUBA3C | Цепь тубулина альфа-3C / D | [22] | |
TUBA4A | TUBA4A | Цепь тубулина альфа-4А | [22] | |
TUBB3 | TUBB3 | Цепь тубулина бета-3 | [22] | |
TUBB8 | TUBB8 | Цепь тубулина бета-8 | [22] | |
TUFM | TUFM | Фактор элонгации Tu, митохондриальный | [22] | |
TXN | TXN | Тиоредоксин | [22] | |
TXNDC17 | TXNDC17 | Тиоредоксиновый домен, содержащий 17 | [41] | |
U2AF1 | U2AF1 | Фактор сплайсинга U2AF субъединица 35 кДа | [22] | |
UBA1 | UBA1 | Убиквитин-подобный модификатор-активирующий фермент 1 | [22] | |
UBAP2 | UBAP2 | Убиквитин-ассоциированный белок 2 | [22][41][42][57] | |
UBAP2L | UBAP2L | Убиквитин-ассоциированный белок 2-подобный | [22][41][42][223][224][57] | |
UBB | Убиквитин | Убиквитин | [111][129] | |
UBL5 | Убиквитин Like 5 | Убиквитин Like 5 | [41] | |
UBQLN2 | Убихилин 2 | Убихилин 2 | [225] | |
ULK1 | ULK1 | Unc-51, как киназа 1, активирующая аутофагию | [226] | |
ULK2 | ULK2 | Unc-51, как киназа 2, активирующая аутофагию | [226] | |
UPF1 | UPF1 | UPF1, РНК-геликаза и АТФаза | [22][41][42][196][57] | да[32] |
UPF2 | UPF2 | UPF2, РНК-геликаза и АТФаза | [196] | |
UPF3B | UPF3B | UPF3B, регулятор нонсенс-опосредованного распада мРНК | [41] | |
USP10 | USP10 | Убиквитинспецифическая пептидаза 10 | [22][41][42][64][31][183][57] | |
USP11 | USP11 | Убиквитинспецифическая пептидаза 11 | [41] | |
USP13 | USP13 | Убиквитинспецифическая пептидаза 13 | [227] | |
USP5 | USP5 | Убиквитинкарбоксил-терминальная гидролаза 5 | [22][227] | |
USP9X | USP9X | Убиквитинспецифическая пептидаза 9, Х-связанная | [216] | |
UTP18 | UTP18 | UTP18, компонент технологического процесса малых субъединиц | [41] | |
ВАСП | ВАСП | Фосфопротеин, стимулируемый вазодилататорами | [22] | |
VBP1 | VBP1 | VHL-связывающий белок 1 | [41] | |
VCP | VCP | Валозин, содержащий белок | [22][228][181][226] | |
WBP2 | WBP2 | Белок, связывающий домен WW 2 | [41] | |
WDR47 | WDR47 | Повторяющийся домен WD 47 | [41] | |
WDR62 | WDR62 | Повторяющийся домен WD 62 | [164] | |
XPO1 | XPO1 / CRM1 | Экспорт 1 | [134] | |
XRN1 | XRN1 | 5'-3 'экзорибонуклеаза 1 | [33][41][42] | да[33][42] |
XRN2 | XRN2 | 5'-3 'экзорибонуклеаза 2 | [41] | |
ЯР | ЯР | Тирозин — тРНК лигаза, цитоплазматическая | [22] | |
YBX1 | YB-1 | Y-Box связывающий белок 1 | [22][41][46][45][79][91][229] | |
YBX3 | YBX3 / ZONAB | Y-бокс-связывающий белок 3 | [22][41][42] | |
ДА1 | ДА1 | Тирозин-протеинкиназа Да | [22] | |
YLPM1 | YLPM1 | Мотив YLP, содержащий 1 | [41] | |
YTHDF1 | YTHDF1 | Белок 1 семейства доменов YTH | [22][41][42][230][231] | |
YTHDF2 | YTHDF2 | Белок 2 семейства доменов YTH | [22][41][42][230][231] | да[230][231] |
YTHDF3 | YTHDF3 | Белок 3 семейства доменов YTH | [22][29][41][42][230][231] | |
YWHAB | 14-3-3 | Бета-белок активации тирозин-3-монооксигеназы / триптофан-5-монооксигеназы | [22][165] | |
YWHAH | 14-3-3 | 14-3-3 белка эта | [22] | |
YWHAQ | 14-3-3 | 14-3-3 белка тета | [22] | |
ZBP1 | ZBP1 | Z-ДНК-связывающий белок 1 | [232][233] | |
ZCCHC11 | ZCCHC11 | Цинковый палец, содержащий домен CCCH 11 | [42] | |
ZCCHC14 | ZCCHC14 | Цинковый палец, содержащий домен CCCH 14 | [42] | |
ZC3H11A | ZC3H11A | Цинковый палец, содержащий домен CCCH 11a | [41] | |
ZC3H14 | ZC3H14 | Цинковый палец, содержащий домен CCCH 14 | [22] | |
ZCCHC2 | ZCCHC2 | Цинковый палец, содержащий домен CCCH 2 | [42] | |
ZCCHC3 | ZCCHC3 | Цинковый палец, содержащий домен CCCH 3 | [42] | |
ZC3H7A | ZC3H7A | Цинковый палец, содержащий домен CCCH, 7A | [22] | |
ZC3H7B | ZC3H7B | Цинковый палец, содержащий домен CCCH, 7B | [22][41] | |
ZC3HAV1 | PARP-13.1 / PARP-13.2 / ARTD13 | Цинк-палец, содержащий CCCH, противовирусный 1 | [22][42][176] | да[32] |
ZFAND1 | ZFAND1 | Цинковый палец типа AN1, содержащий 1 | [181] | |
ZFP36 | TTP / TIS11 | ZFP36 безымянный протеин / трисетраполин | [33][41][164][234][235][236] | да[33] |
ZNF598 | ZNF598 | Белок цинковых пальцев 598 | [42] | |
ZNF638 | ZNF638 | Цинковые пальцы 638 | [22] |
использованная литература
- ^ Гутьеррес-Бельтран Э., Мощоу П.Н., Смертенко А.П., Божков П.В. (март 2015 г.). «Стафилококковая нуклеаза Tudor связывает образование стрессовых гранул и процессинговых тел с катаболизмом мРНК у Arabidopsis». Растительная клетка. 27 (3): 926–43. Дои:10.1105 / tpc.114.134494. ЧВК 4558657. PMID 25736060.
- ^ а б c d е Каяли Ф, Монти Х.Л., Рафолс Дж.А., ДеГрасия Диджей (2005). «Длительная остановка трансляции в реперфузированном гиппокампе рога Ammonis 1 опосредуется стрессовыми гранулами». Неврология. 134 (4): 1223–45. Дои:10.1016 / j.neuroscience.2005.05.047. PMID 16055272. S2CID 15066267.
- ^ Новер Л., Шарф К.Д., Нойман Д. (март 1989 г.). «Цитоплазматические гранулы теплового шока образуются из частиц-предшественников и связаны с определенным набором мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 9 (3): 1298–308. Дои:10.1128 / mcb.9.3.1298. ЧВК 362722. PMID 2725500.
- ^ Пол Дж. Андерсон, Бригам и женская больница
- ^ Моллет С., Кугот Н., Вильчинска А., Даутри Ф., Кресс М., Бертран Э., Вейл Д. (октябрь 2008 г.). «Трансляционно репрессированная мРНК временно проходит через стрессовые гранулы во время стресса». Молекулярная биология клетки. 19 (10): 4469–79. Дои:10.1091 / mbc.E08-05-0499. ЧВК 2555929. PMID 18632980.
- ^ а б c d Кхонг А., Матени Т., Джайн С., Митчелл С.Ф., Уилер Дж. Р., Паркер Р. (ноябрь 2017 г.). «Транскриптом стрессовых гранул раскрывает принципы накопления мРНК в стрессовых гранулах». Молекулярная клетка. 68 (4): 808–820.e5. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.10.015. ЧВК 5728175. PMID 29129640.
- ^ Хонг А., Паркер Р. (октябрь 2018 г.). «Архитектура мРНП в условиях трансляции и напряжения показывает упорядоченный путь уплотнения мРНП». Журнал клеточной биологии. 217 (12): 4124–4140. Дои:10.1083 / jcb.201806183. ЧВК 6279387. PMID 30322972.
- ^ Хонг А., Джайн С., Матени Т., Уилер-младший, Паркер Р. (март 2018 г.). «Выделение ядер стрессовых гранул млекопитающих для анализа RNA-Seq». Методы. 137: 49–54. Дои:10.1016 / j.ymeth.2017.11.012. ЧВК 5866748. PMID 29196162.
- ^ Форрайтер С., Киршнер М., Новер Л. (декабрь 1997 г.). «Стабильная трансформация суспензионной культуры клеток арабидопсиса люциферазой светлячка, обеспечивающая клеточную систему для анализа активности шаперона in vivo». Растительная клетка. 9 (12): 2171–81. Дои:10.1105 / tpc.9.12.2171. ЧВК 157066. PMID 9437862.
- ^ Лёв Д., Брандл К., Новер Л., Форрайтер С. (сентябрь 2000 г.). «Цитозольные белки теплового стресса Hsp17.7 класса I и Hsp17.3 класса II томатов действуют как молекулярные шапероны in vivo». Planta. 211 (4): 575–82. Дои:10.1007 / s004250000315. PMID 11030557. S2CID 9646838.
- ^ Stuger R, Ranostaj S, Materna T, Forreiter C (май 1999 г.). «Связывающие свойства матричной РНК неполисомных рибонуклеопротеидов из клеток томатов, подвергшихся тепловому стрессу». Физиология растений. 120 (1): 23–32. Дои:10.1104 / pp.120.1.23. ЧВК 59255. PMID 10318680.
- ^ Schmid HP, Akhayat O, Martins De Sa C., Puvion F, Koehler K, Scherrer K (январь 1984). «Просома: повсеместная морфологически отличная частица РНП, связанная с репрессированными мРНП и содержащая специфическую ScRNA и характерный набор белков». Журнал EMBO. 3 (1): 29–34. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1984.tb01757.x. ЧВК 557293. PMID 6200323.
- ^ Алас А, Лайонс С.М., Фэй М.М., Андерсон П., Иванов П. (ноябрь 2018 г.). «Оксид азота запускает сборку стрессовых гранул« типа II », связанных со снижением жизнеспособности клеток». Смерть и болезнь клеток. 9 (11): 1129. Дои:10.1038 / с41419-018-1173-х. ЧВК 6234215. PMID 30425239.
- ^ Берхтольд, Дорис; Баттич, Нико; Пелкманс, Лукас (2018-11-02). «Исследование на системном уровне выявляет регуляторы безмембранных органелл в клетках человека». Молекулярная клетка. 72 (6): 1035–1049.e5. Дои:10.1016 / j.molcel.2018.10.036. ISSN 1097-4164. PMID 30503769.
- ^ а б c d Алас А., Фэй М.М., Лайонс С.М., Ачорн К.А., Кедерша Н., Андерсон П., Иванов П. (март 2017 г.). «Стресс-специфические различия в сборке и составе гранул напряжения и связанных очагов». Журнал клеточной науки. 130 (5): 927–937. Дои:10.1242 / jcs.199240. ЧВК 5358336. PMID 28096475.
- ^ Гилкс Н., Кедерша Н., Айоделе М., Шен Л., Стоклин Г., Дембер Л. М., Андерсон П. (декабрь 2004 г.). «Сборка стрессовых гранул опосредуется прионоподобной агрегацией TIA-1». Молекулярная биология клетки. 15 (12): 5383–98. Дои:10.1091 / mbc.E04-08-0715. ЧВК 532018. PMID 15371533.
- ^ Иванов П.А., Чудинова Е.М., Надеждина Е.С. (ноябрь 2003 г.). «Разрушение микротрубочек подавляет образование стрессовых гранул цитоплазматического рибонуклеопротеина». Экспериментальные исследования клеток. 290 (2): 227–33. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00290-8. PMID 14567982.
- ^ а б Mahboubi H, Barisé R, Stochaj U (июль 2015 г.). «5'-АМФ-активированная протеинкиназа альфа регулирует биогенез стрессовых гранул». Biochimica et Biophysica Acta. 1853 (7): 1725–37. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2015.03.015. PMID 25840010.
- ^ а б c Он Т., Кедерша Н., Хикман Т., Тисдейл С., Андерсон П. (октябрь 2008 г.). «Функциональный скрининг РНКи связывает модификацию рибосомных белков с помощью O-GlcNAc с воздействием на гранулы и процессинг сборки тела». Природа клеточной биологии. 10 (10): 1224–31. Дои:10.1038 / ncb1783. ЧВК 4318256. PMID 18794846.
- ^ а б c d Цай Н.П., Вэй Л.Н. (апрель 2010 г.). «Передача сигналов RhoA / ROCK1 регулирует образование стрессовых гранул и апоптоз». Сотовая связь. 22 (4): 668–75. Дои:10.1016 / j.cellsig.2009.12.001. ЧВК 2815184. PMID 20004716.
- ^ а б Ван Трик Б., Проттер Д.С., Матени Т., Кхонг А., Link CD, Паркер Р. (март 2018 г.). «Самосборка РНК способствует образованию стрессовых гранул и определению транскриптома стрессовых гранул». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (11): 2734–2739. Дои:10.1073 / pnas.1800038115. ЧВК 5856561. PMID 29483269.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль я ан ао ap водный ар так как в au средний ау топор ай az ба bb до н.э bd быть парень bg бх би Ъ bk бл бм млрд бо бп бк br bs bt бу bv чб bx к bz ок cb cc компакт диск ce ср cg ch ci cj ск cl см сп co cp cq cr cs ct у.е. резюме cw сх Сай cz да db Округ Колумбия дд де df dg dh ди диджей dk дл дм дн делать дп dq доктор ds dt ду dv dw dx dy дз еа eb ec ред ее ef например а эй эдж эк эль Эм en эо ep экв э es et ЕС ev фу бывший эй эз фа fb fc fd fe ff фг fh фи fj fk эт FM fn fo fp fq fr фс футов фу fv fw FX фу fz га ГБ gc б-г ge gf gg gh джи gj gk gl гм gn идти GP gq гр GS gt гу gv gw gx гы gz ха hb hc HD он hf hg чч Здравствуй гдж гонконгский гл хм hn хо л.с. штаб-квартира час hs ht ху hv hw hx хай Гц ia ib IC я бы т.е. если ig ах ii ij ik il я в io ip iq ir является Это iu iv iw ix иу iz я jb jc jd je jf jg jh джи jj jk jl jm jn Джо jp jq младший js jt ju СП jw jx jy jz ка kb kc kd ke kf кг кх ки кДж кк kl км кн ко КП kq кр кс kt ку кв кВт kx ты kz ля фунт lc ld ле lf LG lh Ли lj lk ll lm пер вот lp lq lr ls lt Лу lv Джайн С., Уилер-младший, Уолтерс Р.В., Агравал А., Барсик А., Паркер Р. (январь 2016 г.). «Гранулы стресса, модулируемые АТФазой, содержат разнообразный протеом и субструктуру». Ячейка. 164 (3): 487–98. Дои:10.1016 / j.cell.2015.12.038. ЧВК 4733397. PMID 26777405.
- ^ а б c Халупникова К., Латтманн С., Селак Н., Ивамото Ф., Фуджики Ю., Нагамин Ю. (декабрь 2008 г.). «Привлечение РНК-геликазы RHAU к стрессовым гранулам через уникальный РНК-связывающий домен». Журнал биологической химии. 283 (50): 35186–98. Дои:10.1074 / jbc.M804857200. ЧВК 3259895. PMID 18854321.
- ^ Хилликер А., Гао З., Янковски Е., Паркер Р. (сентябрь 2011 г.). «Белок DEAD-бокса Ded1 модулирует трансляцию путем образования и разрешения комплекса eIF4F-мРНК». Молекулярная клетка. 43 (6): 962–72. Дои:10.1016 / j.molcel.2011.08.008. ЧВК 3268518. PMID 21925384.
- ^ Эплинг Л. Б., Грейс С. Р., Лоу Б. Р., Партридж Дж. Ф., Энемарк Е. Дж. (Май 2015 г.). «Связанные с раком мутанты РНК-геликазы DDX3X дефектны в РНК-стимулированном гидролизе АТФ». Журнал молекулярной биологии. 427 (9): 1779–1796. Дои:10.1016 / j.jmb.2015.02.015. ЧВК 4402148. PMID 25724843.
- ^ а б Валентин-Вега Ю.А., Ван Ю.Д., Паркер М., Патмор Д.М., Канагарадж А., Мур Дж., Руш М., Финкельштейн Д., Эллисон Д.В., Гилбертсон Р.Дж., Чжан Дж., Ким Г.Дж., Тейлор Дж.П. (май 2016 г.). «Связанные с раком мутации DDX3X вызывают сборку стрессовых гранул и нарушают глобальную трансляцию». Научные отчеты. 6 (1): 25996. Bibcode:2016НатСР ... 625996В. Дои:10.1038 / srep25996. ЧВК 4867597. PMID 27180681.
- ^ Ван Трик Б., Паркер Р. (август 2018 г.). «Новые роли межмолекулярных взаимодействий РНК-РНК в сборках РНП». Ячейка. 174 (4): 791–802. Дои:10.1016 / j.cell.2018.07.023. ЧВК 6200146. PMID 30096311.
- ^ Адиварахан С., Ливингстон Н., Николсон Б., Рахман С., Ву Б., Риссланд ОС, Зенклусен Д. (ноябрь 2018 г.). «Пространственная организация одиночных мРНП на разных стадиях пути экспрессии генов». Молекулярная клетка. 72 (4): 727–738.e5. Дои:10.1016 / j.molcel.2018.10.010. ЧВК 6592633. PMID 30415950.
- ^ а б Андерс, Максимилиан; Челышева Ирина; Гебель, Ингрид; Тренкнер, Тимо; Чжоу, Цзюнь; Мао, Юаньхуэй; Верзини, Сильвия; Цянь, Шу-Бин; Игнатова, Зоя (август 2018). «Динамическое метилирование m6A облегчает сортировку мРНК для стрессовых гранул». Альянс наук о жизни. 1 (4): e201800113. Дои:10.26508 / lsa.201800113. ISSN 2575-1077. ЧВК 6238392. PMID 30456371.
- ^ Таубер, Девин; Таубер, Габриэль; Хонг, Энтони; Ван Трик, Бриана; Пеллетье, Джерри; Паркер, Рой (9 января 2020 г.). «Модуляция конденсации РНК DEAD-Box-белком eIF4A». Ячейка. 180 (3): 411–426.e16. Дои:10.1016 / j.cell.2019.12.031. ЧВК 7194247. PMID 31928844. Получено 9 января 2020.
- ^ а б c d е ж г Алас А., Карон Дж., Гкогкас К. Г., Мохамед Н. В., Destroismaisons Л., Зоненберг Н., Леклерк Н., Паркер Дж. А., Ванде Велде С. (апрель 2015 г.). «G3BP1 способствует стресс-индуцированному взаимодействию гранул РНК для сохранения полиаденилированной мРНК». Журнал клеточной биологии. 209 (1): 73–84. Дои:10.1083 / jcb.201408092. ЧВК 4395486. PMID 25847539.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак Hubstenberger A, Courel M, Bénard M, Souquere S, Ernoult-Lange M, Chouaib R, Yi Z, Morlot JB, Munier A, Fradet M, Daunesse M, Bertrand E, Pierron G, Mozziconacci J, Kress M, Weil D ( Октябрь 2017 г.). «Очистка P-Body выявляет конденсацию репрессированных регулонов мРНК». Молекулярная клетка. 68 (1): 144–157.e5. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.09.003. PMID 28965817.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п Кедерша Н., Стоклин Г., Айоделе М., Яконо П., Ликке-Андерсен Дж., Фрицлер М.Дж., Шойнер Д., Кауфман Р.Дж., Голан Д.Е., Андерсон П. (июнь 2005 г.). «Стресс-гранулы и обрабатывающие тела - это динамически связанные сайты ремоделирования мРНП». Журнал клеточной биологии. 169 (6): 871–84. Дои:10.1083 / jcb.200502088. ЧВК 2171635. PMID 15967811.
- ^ Бучан Дж. Р., Мюльрад Д., Паркер Р. (ноябрь 2008 г.). «Р-тельца способствуют сборке стрессовых гранул у Saccharomyces cerevisiae». Журнал клеточной биологии. 183 (3): 441–55. Дои:10.1083 / jcb.200807043. ЧВК 2575786. PMID 18981231.
- ^ а б c Фигли, доктор медицины (2015). Профилин 1, стрессовые гранулы и патогенез БАС (Кандидат наук). Стэндфордский Университет.
- ^ а б Алас А., Ванде Вельде С. (2015). «Изменения в динамике стрессовых гранул, вызванные TDP-43 и FUS: связь с патологическими включениями при БАС?». Границы клеточной неврологии. 9: 423. Дои:10.3389 / fncel.2015.00423. ЧВК 4615823. PMID 26557057.
- ^ а б Юн, Джи Ён; Дьяков, Борис Дж. А .; Чжан, Цзяньпин; Найт, Джеймс Д. Р .; Вернон, Роберт М .; Forman-Kay, Julie D .; Жинграс, Анн-Клод (17.10.2019). «Свойства стрессовых гранул и протеомов П-тел». Молекулярная клетка. 76 (2): 286–294. Дои:10.1016 / j.molcel.2019.09.014. ISSN 1097-2765. PMID 31626750.
- ^ Алас А., Фэй М.М., Шафлярски В., Кедерша Н., Андерсон П., Иванов П. (май 2017 г.). «Методы классификации цитоплазматических очагов как стрессовых гранул млекопитающих». Журнал визуализированных экспериментов (123). Дои:10.3791/55656. ЧВК 5607937. PMID 28570526.
- ^ Уилер Дж. Р., Матени Т., Джайн С., Абриш Р., Паркер Р. (сентябрь 2016 г.). «Четкие этапы сборки и разборки напряженных гранул». eLife. 5. Дои:10.7554 / eLife.18413. ЧВК 5014549. PMID 27602576.
- ^ Уилер Дж. Р., Джайн С., Хонг А., Паркер Р. (август 2017 г.). «Выделение ядер стрессовых гранул дрожжей и млекопитающих». Методы. 126: 12–17. Дои:10.1016 / j.ymeth.2017.04.020. ЧВК 5924690. PMID 28457979.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль я ан ао ap водный ар так как в au средний ау топор ай az ба bb до н.э bd быть парень bg бх би Ъ bk бл бм млрд бо бп бк br bs bt бу bv чб bx к bz ок cb cc компакт диск ce ср cg ch ci cj ск cl см сп co cp cq cr cs ct у.е. резюме cw сх Сай cz да db Округ Колумбия дд де df dg dh ди диджей dk дл дм дн делать дп dq доктор ds dt ду dv dw dx dy дз еа eb ec ред ее ef например а эй эдж эк эль Эм en эо ep экв э es et ЕС ev фу бывший эй эз фа fb fc fd fe ff фг fh фи fj fk эт FM fn fo fp fq fr фс футов фу fv fw FX фу fz га ГБ gc б-г ge gf gg gh джи gj gk gl гм gn идти GP gq гр GS gt гу gv gw gx гы gz ха hb hc HD он hf hg чч Здравствуй гдж гонконгский гл хм hn хо л.с. штаб-квартира час hs ht ху hv hw hx хай Гц ia ib IC я бы т.е. если ig ах ii ij ik il я в io ip iq ir является Это iu iv iw ix иу iz я Маркмиллер С., Солтание С., Сервер KL, Мак Р., Джин В., Фанг М.Ю., Ло ЕС, Крач Ф, Ян Д., Сен А., Фулзеле А., Возняк Дж. М., Гонсалес Д. Д., Канкель М. В., Гао Ф. Б., Беннетт Е. Дж., Лекуйер Э. , Yeo GW (январь 2018 г.). «Контекстно-зависимое и зависящее от заболевания разнообразие во взаимодействии белков в стрессовых гранулах». Ячейка. 172 (3): 590–604.e13. Дои:10.1016 / j.cell.2017.12.032. ЧВК 5969999. PMID 29373831.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль я ан ао ap водный ар так как в au средний ау топор ай az ба bb до н.э bd быть парень bg бх би Ъ bk бл бм млрд бо бп бк br bs bt бу bv чб bx к bz ок cb cc компакт диск ce ср cg ch ci cj ск cl см сп co cp cq cr cs ct у.е. резюме cw сх Сай cz да db Округ Колумбия дд де df dg dh ди диджей dk дл дм дн делать дп dq доктор ds dt ду dv dw dx dy дз еа eb ec ред ее ef например а эй эдж эк эль Эм en эо ep экв э es et ЕС ev фу бывший эй эз фа fb fc fd fe ff фг fh фи fj fk эт FM fn fo fp fq fr фс футов фу Youn JY, Dunham WH, Hong SJ, Knight JD, Башкуров M, Chen GI, Bagci H, Rathod B, MacLeod G, Eng SW, Angers S, Morris Q, Fabian M, Côté JF, Gingras AC (февраль 2018 г.). «Картирование близости с высокой плотностью выявляет субклеточную организацию гранул и тел, связанных с мРНК». Молекулярная клетка. 69 (3): 517–532.e11. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.12.020. PMID 29395067.
- ^ а б c d е ж г час я j Мармор-Коллет, Хагай; Сианы, Авиад; Кедерша, Нэнси; Кнафо, Наама; Ривкин Наталья; Данино, Иегуда М .; Moens, Thomas G .; Олендер, Цвия; Шебан, Дауд; Коэн, Нир; Дадош, Тали (19.11.2020). «Пространственно-временной протеомный анализ разборки стрессовых гранул с использованием APEX выявляет регуляцию посредством SUMOylation и связи с патогенезом БАС». Молекулярная клетка. 0 (0). Дои:10.1016 / j.molcel.2020.10.032. ISSN 1097-2765.
- ^ а б Weissbach R, Scadden AD (март 2012 г.). «Tudor-SN и ADAR1 являются компонентами гранул цитоплазматического стресса». РНК. 18 (3): 462–71. Дои:10.1261 / rna.027656.111. ЧВК 3285934. PMID 22240577.
- ^ а б c d е ж г Галлуа-Монбран С., Крамер Б., Суонсон С.М., Байерс Х., Линхэм С., Уорд М., Малим М. Х. (март 2007 г.). «Противовирусный белок APOBEC3G локализуется в комплексах рибонуклеопротеидов, обнаруженных в Р-тельцах и стрессовых гранулах». Журнал вирусологии. 81 (5): 2165–78. Дои:10.1128 / JVI.02287-06. ЧВК 1865933. PMID 17166910.
- ^ а б c d е ж г час я Гудье Дж. Л., Чжан Л., Веттер М. Р., Казазян Х. Х. (сентябрь 2007 г.). «Белок ORF1 LINE-1 локализуется в стрессовых гранулах вместе с другими РНК-связывающими белками, включая компоненты комплекса РНК-интерференции, индуцированного РНК сайленсинга». Молекулярная и клеточная биология. 27 (18): 6469–83. Дои:10.1128 / MCB.00332-07. ЧВК 2099616. PMID 17562864.
- ^ Detzer A, Engel C, Wünsche W, Sczakiel G (апрель 2011 г.). «Клеточный стресс связан с изменением локализации Argonaute 2 и снижением интерференции РНК в клетках человека». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (7): 2727–41. Дои:10.1093 / nar / gkq1216. ЧВК 3074141. PMID 21148147.
- ^ Лу Кью, Ху Й, Ма И, Донг Зи (2019). «РНК-интерференция может подавлять образование стрессовых гранул, предотвращая рекрутирование Argonaute 2». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология. 316 (1): C81 – C91. Дои:10.1152 / ajpcell.00251.2018. ЧВК 6383145. PMID 30404558.
- ^ а б c d Колобова Е., Ефимов А., Каверина И., Риши А. К., Шредер Дж. В., Хэм А. Дж., Ларокка М. С., Голденринг Дж. Р. (февраль 2009 г.). «Зависимая от микротрубочек ассоциация AKAP350A и CCAR1 с гранулами стресса РНК». Экспериментальные исследования клеток. 315 (3): 542–55. Дои:10.1016 / j.yexcr.2008.11.011. ЧВК 2788823. PMID 19073175.
- ^ а б Пиццо Е., Сарчинелли С., Шенг Дж., Фуско С., Формиджини Ф., Нетти П., Ю В., Д'Алессио Дж., Ху Г.Ф. (сентябрь 2013 г.). «Ингибитор 1 рибонуклеазы / ангиогенина регулирует индуцированную стрессом субклеточную локализацию ангиогенина для контроля роста и выживания». Журнал клеточной науки. 126 (Pt 18): 4308–19. Дои:10.1242 / jcs.134551. ЧВК 3772394. PMID 23843625.
- ^ а б c d Pare JM, Tahbaz N, López-Orozco J, LaPointe P, Lasko P, Hobman TC (июль 2009 г.). «Hsp90 регулирует функцию аргонаута 2 и его рекрутирование на стрессовые гранулы и Р-тела». Молекулярная биология клетки. 20 (14): 3273–84. Дои:10.1091 / mbc.E09-01-0082. ЧВК 2710822. PMID 19458189.
- ^ а б Ральсер М., Альбрехт М., Нонхофф У., Ленгауэр Т., Лехрах Х., Кробич С. (февраль 2005 г.). «Интегративный подход к пониманию клеточной функции человеческого атаксина-2». Журнал молекулярной биологии. 346 (1): 203–14. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.11.024. HDL:11858 / 00-001М-0000-0010-86ДЕ-Д. PMID 15663938.
- ^ а б c Nonhoff U, Ralser M, Welzel F, Piccini I, Balzereit D, Yaspo ML, Lehrach H, Krobitsch S (апрель 2007 г.). «Атаксин-2 взаимодействует с DEAD / H-box РНК-геликазой DDX6 и мешает Р-тельцам и стрессовым гранулам». Молекулярная биология клетки. 18 (4): 1385–96. Дои:10.1091 / mbc.E06-12-1120. ЧВК 1838996. PMID 17392519.
- ^ а б Kaehler C, Isensee J, Nonhoff U, Terrey M, Hucho T., Lehrach H, Krobitsch S (2012). «Атаксин-2-подобный регулятор стрессовых гранул и обрабатывающих тел». PLOS ONE. 7 (11): e50134. Bibcode:2012PLoSO ... 750134K. Дои:10.1371 / journal.pone.0050134. ЧВК 3507954. PMID 23209657.
- ^ Нихей Ю., Ито Д., Сузуки Н. (ноябрь 2012 г.). «Роль атаксина-2 в патологических каскадах, опосредованных ДНК-связывающим белком TAR 43 (TDP-43) и слитых в саркоме (FUS)». Журнал биологической химии. 287 (49): 41310–23. Дои:10.1074 / jbc.M112.398099. ЧВК 3510829. PMID 23048034.
- ^ а б c Фигли, доктор медицины, Биери Г., Колайтис Р.М., Тейлор Дж. П., Гитлер А.Д. (июнь 2014 г.). «Профилин 1 ассоциирует со стрессовыми гранулами, а мутации, связанные с БАС, изменяют динамику стрессовых гранул». Журнал неврологии. 34 (24): 8083–97. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.0543-14.2014. ЧВК 4051967. PMID 24920614.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай Ян, Пейго; Матье, Сесиль; Колайтис Регина-Мария; Чжан, Пейпей; Мессинг, Джеймс; Юрцевер, Угур; Ян, Цзэминь; Ву, Джинджун; Ли, Юсинь; Пан, Цинфэй; Ю, Цзиян (2020-04-16). «G3BP1 - настраиваемый переключатель, запускающий разделение фаз для сборки гранул напряжения». Ячейка. 181 (2): 325–345.e28. Дои:10.1016 / j.cell.2020.03.046. ISSN 0092-8674. ЧВК 7448383. PMID 32302571.
- ^ Ким Б., Ри К. (2016). «BOULE, удаленный в гомологе азооспермии, задействован для стресса гранул в зародышевых клетках самцов мышей». PLOS ONE. 11 (9): e0163015. Bibcode:2016PLoSO..1163015K. Дои:10.1371 / journal.pone.0163015. ЧВК 5024984. PMID 27632217.
- ^ Махарджан Н., Кюнцли С., Бутхи К., Саксена С. (май 2017 г.). «C9ORF72 регулирует образование стрессовых гранул, а его дефицит ухудшает сборку стрессовых гранул, повышая чувствительность клеток к стрессу». Молекулярная нейробиология. 54 (4): 3062–3077. Дои:10.1007 / s12035-016-9850-1. PMID 27037575. S2CID 27449387.
- ^ а б Chitiprolu M, Jagow C, Tremblay V, Bondy-Chorney E, Paris G, Savard A, Palidwor G, Barry FA, Zinman L, Keith J, Rogaeva E, Robertson J, Lavallée-Adam M, Woulfe J, Couture JF, Côté Дж., Гиббингс Д. (июль 2018 г.). «Комплекс C9ORF72 и p62 использует метилирование аргинина для устранения стрессовых гранул путем аутофагии». Nature Communications. 9 (1): 2794. Bibcode:2018НатКо ... 9.2794C. Дои:10.1038 / s41467-018-05273-7. ЧВК 6052026. PMID 30022074.
- ^ Decca MB, Carpio MA, Bosc C, Galiano MR, Job D, Andrieux A, Hallak ME (март 2007 г.). «Посттрансляционное аргинилирование кальретикулина: новый изовид кальретикулинового компонента стрессовых гранул». Журнал биологической химии. 282 (11): 8237–45. Дои:10.1074 / jbc.M608559200. ЧВК 2702537. PMID 17197444.
- ^ Соломон С., Сюй И, Ван Б., Дэвид М.Д., Шуберт П., Кеннеди Д., Шредер Дж. В. (март 2007 г.). «Отличительные структурные особенности каприна-1 опосредуют его взаимодействие с G3BP-1 и индукцию фосфорилирования эукариотического фактора инициации трансляции 2альфа, проникновение в цитоплазматические стрессовые гранулы и избирательное взаимодействие с подмножеством мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 27 (6): 2324–42. Дои:10.1128 / MCB.02300-06. ЧВК 1820512. PMID 17210633.
- ^ а б Ратовицкий Т., Чигладзе Э., Арбез Н., Боронина Т., Хербрих С., Коул Р.Н., Росс КА (май 2012 г.). «Взаимодействие с белком Хантингтина, измененное экспансией полиглутамина, как определено количественным протеомным анализом». Клеточный цикл. 11 (10): 2006–21. Дои:10.4161 / cc.20423. ЧВК 3359124. PMID 22580459.
- ^ а б c d Кедерша Н., Панас, доктор медицины, Ачорн, Калифорния, Лайонс С., Тисдейл С., Хикман Т., Томас М., Либерман Дж., Макинерни Г.М., Иванов П., Андерсон П. (март 2016 г.). «Комплексы G3BP-Caprin1-USP10 опосредуют конденсацию стрессовых гранул и связываются с 40S-субъединицами». Журнал клеточной биологии. 212 (7): 845–60. Дои:10.1083 / jcb.201508028. ЧВК 4810302. PMID 27022092.
- ^ а б c d Reineke LC, Kedersha N, Langereis MA, van Kuppeveld FJ, Lloyd RE (март 2015 г.). «Стресс-гранулы регулируют активацию двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы через комплекс, содержащий G3BP1 и Caprin1». мБио. 6 (2): e02486. Дои:10,1128 / мБио.02486-14. ЧВК 4453520. PMID 25784705.
- ^ а б Баге А., Дегот С., Кугот Н., Бертран Э., Шенар М.П., Вендлинг С., Кесслер П., Ле Хир Х, Рио МС, Томасетто С. (август 2007 г.). «Метастатический лимфатический узел 51 с соединением экзонов и комплексным компонентом функционирует в сборке стресс-гранул». Журнал клеточной науки. 120 (Pt 16): 2774–84. Дои:10.1242 / jcs.009225. PMID 17652158.
- ^ а б c d е ж г час Vessey JP, Vaccani A, Xie Y, Dahm R, Karra D, Kiebler MA, Macchi P (июнь 2006 г.). «Дендритная локализация трансляционного репрессора Pumilio 2 и его вклад в дендритные стрессовые гранулы». Журнал неврологии. 26 (24): 6496–508. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.0649-06.2006. ЧВК 6674044. PMID 16775137.
- ^ Moujalled D, James JL, Yang S, Zhang K, Duncan C, Moujalled DM, et al. (Март 2015 г.). «Фосфорилирование hnRNP K циклин-зависимой киназой 2 контролирует цитозольное накопление TDP-43». Молекулярная генетика человека. 24 (6): 1655–69. Дои:10.1093 / hmg / ddu578. PMID 25410660.
- ^ Фудзимура К., Кано Ф., Мурата М. (февраль 2008 г.). «Двойная локализация РНК-связывающего белка CUGBP-1 для стресса гранулы и перинуклеолярного компартмента». Экспериментальные исследования клеток. 314 (3): 543–53. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.10.024. PMID 18164289.
- ^ Фатинахафабади А., Перес-Хименес Э., Риера М., Кнехт Э., Гонсалес-Дуарте Р. (2014). «CERKL, ген заболевания сетчатки, кодирует мРНК-связывающий белок, который локализуется в компактных и нетранслируемых мРНП, связанных с микротрубочками». PLOS ONE. 9 (2): e87898. Bibcode:2014PLoSO ... 987898F. Дои:10.1371 / journal.pone.0087898. ЧВК 3912138. PMID 24498393.
- ^ Де Леу Ф., Чжан Т., Вокье С., Хюэз Дж., Крюйс В., Гейдан С. (декабрь 2007 г.). «Индуцируемый холодом РНК-связывающий белок мигрирует из ядра в цитоплазматические стрессовые гранулы по механизму, зависящему от метилирования, и действует как репрессор трансляции». Экспериментальные исследования клеток. 313 (20): 4130–44. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.09.017. PMID 17967451.
- ^ Рохас М., Фарр Г. В., Фернандес К. Ф., Лауден Л., МакКормак Дж. К., Волин С. Л. (2012). «Дрожжи Gis2 и его человеческий ортолог CNBP являются новыми компонентами стресс-индуцированных гранул РНП». PLOS ONE. 7 (12): e52824. Bibcode:2012PLoSO ... 752824R. Дои:10.1371 / journal.pone.0052824. ЧВК 3528734. PMID 23285195.
- ^ Cougot N, Babajko S, Séraphin B (апрель 2004 г.). «Цитоплазматические очаги - это места распада мРНК в клетках человека». Журнал клеточной биологии. 165 (1): 31–40. Дои:10.1083 / jcb.200309008. ЧВК 2172085. PMID 15067023.
- ^ а б Фудзимура К., Кано Ф., Мурата М (март 2008 г.). «Идентификация PCBP2, посредника IRES-опосредованной трансляции, как нового компонента стрессовых гранул и обрабатывающих тел». РНК. 14 (3): 425–31. Дои:10.1261 / rna.780708. ЧВК 2248264. PMID 18174314.
- ^ а б c Wilczynska A, Aigueperse C, Kress M, Dautry F, Weil D (март 2005 г.). «Регулятор трансляции CPEB1 обеспечивает связь между телами dcp1 и стрессовыми гранулами». Журнал клеточной науки. 118 (Pt 5): 981–92. Дои:10.1242 / jcs.01692. PMID 15731006.
- ^ Reineke LC, Tsai WC, Jain A, Kaelber JT, Jung SY, Lloyd RE (февраль 2017 г.). «Казеинкиназа 2 связана с динамикой стрессовых гранул посредством фосфорилирования нуклеирующего белка стрессовых гранул G3BP1». Молекулярная и клеточная биология. 37 (4): e00596–16. Дои:10.1128 / MCB.00596-16. ЧВК 5288577. PMID 27920254.
- ^ а б c d е Kim JE, Ryu I, Kim WJ, Song OK, Ryu J, Kwon MY, Kim JH, Jang SK (январь 2008 г.). «Богатый пролином транскрипт в мозговом белке вызывает образование стрессовых гранул». Молекулярная и клеточная биология. 28 (2): 803–13. Дои:10.1128 / MCB.01226-07. ЧВК 2223406. PMID 17984221.
- ^ Ким Б., Кук Х. Дж., Ри К. (февраль 2012 г.). «DAZL необходим для образования стрессовых гранул, участвующих в выживании половых клеток при тепловом стрессе». Разработка. 139 (3): 568–78. Дои:10.1242 / дев.075846. PMID 22223682.
- ^ а б c Ониси Х., Кино Й., Морита Т., Футаи Э., Сасагава Н., Ишиура С. (июль 2008 г.). «MBNL1 связывается с YB-1 в цитоплазматических стрессовых гранулах». Журнал неврологических исследований. 86 (9): 1994–2002. Дои:10.1002 / jnr.21655. PMID 18335541. S2CID 9431966.
- ^ Ясуда-Иноуэ М., Куроки М., Ариуми Ю. (ноябрь 2013 г.). «DDX3 РНК-геликаза необходима для функции Tat ВИЧ-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 441 (3): 607–11. Дои:10.1016 / j.bbrc.2013.10.107. PMID 24183723.
- ^ а б c Goulet I, Boisvenue S, Mokas S, Mazroui R, Côté J (октябрь 2008 г.). «TDRD3, новый белок, содержащий тюдоровский домен, локализуется в цитоплазматических стрессовых гранулах». Молекулярная генетика человека. 17 (19): 3055–74. Дои:10.1093 / hmg / ddn203. ЧВК 2536506. PMID 18632687.
- ^ Валентин-Вега Ю.А., Ван Ю.Д., Паркер М., Патмор Д.М., Канагарадж А., Мур Дж., Руш М., Финкельштейн Д., Эллисон Д.В., Гилбертсон Р.Дж., Чжан Дж., Ким Г.Дж., Тейлор Дж.П. (май 2016 г.). «Связанные с раком мутации DDX3X вызывают сборку стрессовых гранул и нарушают глобальную трансляцию». Научные отчеты. 6: 25996. Bibcode:2016НатСР ... 625996В. Дои:10.1038 / srep25996. ЧВК 4867597. PMID 27180681.
- ^ а б Сайто, Макото; Гесс, Дэниел; Эглингер, Ян; Fritsch, Anatol W .; Крейсинг, Мориц; Weinert, Brian T .; Чоудхари, Чунарам; Матиас, Патрик (январь 2019 г.). «Ацетилирование внутренне неупорядоченных областей регулирует разделение фаз». Природа Химическая Биология. 15 (1): 51–61. Дои:10.1038 / s41589-018-0180-7. ISSN 1552-4469. PMID 30531905. S2CID 54471609.
- ^ а б c d е ж Onomoto K, Jogi M, Yoo JS, Narita R, Morimoto S, Takemura A, Sambhara S, Kawaguchi A, Osari S, Nagata K, Matsumiya T, Namiki H, Yoneyama M, Fujita T (2012). «Критическая роль антивирусной стрессовой гранулы, содержащей RIG-I и PKR, в обнаружении вирусов и врожденном иммунитете». PLOS ONE. 7 (8): e43031. Bibcode:2012PLoSO ... 743031O. Дои:10.1371 / journal.pone.0043031. ЧВК 3418241. PMID 22912779.
- ^ а б c Thedieck K, Holzwarth B, Prentzell MT, Boehlke C, Kläsener K, Ruf S, Sonntag AG, Maerz L, Grellscheid SN, Kremmer E, Nitschke R, Kuehn EW, Jonker JW, Groen AK, Reth M, Hall MN, Baumeister R (Август 2013). «Ингибирование mTORC1 астрином и стрессовыми гранулами предотвращает апоптоз раковых клеток». Ячейка. 154 (4): 859–74. Дои:10.1016 / j.cell.2013.07.031. PMID 23953116.
- ^ а б c d Биш Р., Куэвас-Поло Н., Ченг З., Амбарцумян Д., Мюншауэр М., Ландталер М., Фогель С. (июль 2015 г.). «Комплексный белковый интерактомный анализ ключевой РНК-геликазы: обнаружение новых белков стрессовых гранул». Биомолекулы. 5 (3): 1441–66. Дои:10.3390 / biom5031441. ЧВК 4598758. PMID 26184334.
- ^ Salleron L, Magistrelli G, Мэри C, Fischer N, Bairoch A, Lane L (декабрь 2014 г.). «DERA представляет собой человеческую дезоксирибозофосфатальдолазу, участвующую в реакции на стресс». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1843 (12): 2913–25. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2014.09.007. PMID 25229427.
- ^ Огава Ф, Касаи М., Акияма Т. (декабрь 2005 г.). «Функциональная связь между Disrupted-In-Schizophrenia 1 и фактором инициации эукариотической трансляции 3». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 338 (2): 771–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.10.013. PMID 16243297.
- ^ а б Белли, Валентина; Матроне, Нунция; Саглиокки, Серена; Инкарнато, Роза; Конте, Андреа; Пиццо, Элио; Турано, Миммо; Ангрисани, Альберто; Фурия, Мария (2019-08-11). «Динамическая связь между компонентами H / ACA snoRNP и цитоплазматическими стрессовыми гранулами». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1866 (12): 118529. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2019.118529. ISSN 0167-4889. PMID 31412274.
- ^ а б c d Loschi M, Leishman CC, Berardone N, Boccaccio GL (ноябрь 2009 г.). «Динеин и кинезин регулируют динамику стресс-гранул и Р-тел». Журнал клеточной науки. 122 (Пт 21): 3973–82. Дои:10.1242 / jcs.051383. ЧВК 2773196. PMID 19825938.
- ^ а б c Гэн К., Хабиджа Б., Накл С., Бонэм, Калифорния, Вакратсис, ПО (январь 2017 г.). «Атипичная фосфатаза с двойной специфичностью hYVH1 ассоциируется с множественными частицами рибонуклеопротеина». Журнал биологической химии. 292 (2): 539–550. Дои:10.1074 / jbc.M116.715607. ЧВК 5241730. PMID 27856639.
- ^ а б c Цай Н.П., Цуй Ю.С., Вэй Л.Н. (март 2009 г.). «Динеиновый мотор способствует динамике стрессовых гранул в первичных нейронах». Неврология. 159 (2): 647–56. Дои:10.1016 / j.neuroscience.2008.12.053. ЧВК 2650738. PMID 19171178.
- ^ а б c Виппич Ф., Боденмиллер Б., Трайковска М.Г., Ванка С., Эберсолд Р., Пелкманс Л. (февраль 2013 г.). «Киназа двойной специфичности DYRK3 связывает конденсацию / растворение стрессовых гранул с передачей сигнала mTORC1». Ячейка. 152 (4): 791–805. Дои:10.1016 / j.cell.2013.01.033. PMID 23415227.
- ^ Шигунов П., Сотело-Сильвейра Дж., Стимамиглио М.А., Кулиговски С., Иригоин Ф., Бадано Дж. Л., Манро Д., Корреа А., Даллагиованна Б. (июль 2014 г.). «Рибономический анализ человеческого DZIP1 показывает его участие в рибонуклеопротеидных комплексах и стрессовых гранулах». BMC Молекулярная биология. 15: 12. Дои:10.1186/1471-2199-15-12. ЧВК 4091656. PMID 24993635.
- ^ а б c d е ж Kimball SR, Horetsky RL, Ron D, Jefferson LS, Harding HP (февраль 2003 г.). «Стресс-гранулы млекопитающих представляют собой места скопления остановившихся комплексов инициации трансляции». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология. 284 (2): C273–84. Дои:10.1152 / ajpcell.00314.2002. PMID 12388085. S2CID 14681272.
- ^ а б c Reineke LC, Lloyd RE (март 2015 г.). «Белок стрессовых гранул G3BP1 задействует протеинкиназу R для стимулирования множественных противовирусных реакций врожденного иммунитета». Журнал вирусологии. 89 (5): 2575–89. Дои:10.1128 / JVI.02791-14. ЧВК 4325707. PMID 25520508.
- ^ а б c d е ж Кедерша Н., Чен С., Гилкс Н., Ли В., Миллер И. Дж., Шталь Дж., Андерсон П. (январь 2002 г.). «Доказательства того, что тройной комплекс (eIF2-GTP-тРНК (i) (Met)) - дефицитные преинициативные комплексы являются основными составляющими стрессовых гранул млекопитающих». Молекулярная биология клетки. 13 (1): 195–210. Дои:10.1091 / mbc.01-05-0221. ЧВК 65082. PMID 11809833.
- ^ а б Ли Ч., Он Т., Иванов П., Тисдейл С., Андерсон П. (апрель 2010 г.). «eIF5A способствует удлинению трансляции, разборке полисомов и сборке стрессовых гранул». PLOS ONE. 5 (4): e9942. Bibcode:2010PLoSO ... 5.9942L. Дои:10.1371 / journal.pone.0009942. ЧВК 2848580. PMID 20376341.
- ^ а б Ким Дж.А., Джаябалан А.К., Котхандан В.К., Мариаппан Р., Ки Й., Он Т. (август 2016 г.). «Идентификация Neuregulin-2 как нового компонента стрессовых гранул». BMB отчеты. 49 (8): 449–54. Дои:10.5483 / BMBRep.2016.49.8.090. ЧВК 5070733. PMID 27345716.
- ^ а б Даммер Э.Б., Фаллини С., Гозал Ю.М., Дуонг Д.М., Россолл В., Сюй П, Ла Дж.Дж., Леви А.И., Пэн Дж., Басселл Г.Дж., Сейфрид Н.Т. (2012). «Коагрегация РНК-связывающих белков в модели протеинопатии TDP-43 с селективным метилированием мотива RGG и ролью для убиквитинирования RRM1». PLOS ONE. 7 (6): e38658. Bibcode:2012PLoSO ... 738658D. Дои:10.1371 / journal.pone.0038658. ЧВК 3380899. PMID 22761693.
- ^ Jongjitwimol J, Baldock RA, Morley SJ, Watts FZ (июнь 2016 г.). «Сумоилирование eIF4A2 влияет на формирование стрессовых гранул». Журнал клеточной науки. 129 (12): 2407–15. Дои:10.1242 / jcs.184614. ЧВК 4920252. PMID 27160682.
- ^ а б c d е ж г час я j Ким С.Х., Донг В.К., Вейлер И.Дж., Гриноу В.Т. (март 2006 г.). «Хрупкий белок X-умственной отсталости смещается между полирибосомами и стрессовыми гранулами после повреждения нейронов в результате арсенитного стресса или введения электрода в гиппокамп in vivo». Журнал неврологии. 26 (9): 2413–8. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.3680-05.2006. ЧВК 6793656. PMID 16510718.
- ^ а б c d Мазруи Р., Ди Марко С., Кауфман Р.Дж., Галлузи И.Е. (июль 2007 г.). «Ингибирование системы убиквитин-протеасома вызывает образование стрессовых гранул». Молекулярная биология клетки. 18 (7): 2603–18. Дои:10.1091 / mbc.E06-12-1079. ЧВК 1924830. PMID 17475769.
- ^ а б c Фридрыскова К., Масек Т., Борчин К., Мрвова С., Вентури В., Поспишек М. (август 2016 г.). «Отчетливое привлечение изоформ eIF4E человека к процессинговым органам и стрессовым гранулам». BMC Молекулярная биология. 17 (1): 21. Дои:10.1186 / s12867-016-0072-х. ЧВК 5006505. PMID 27578149.
- ^ а б Battle DJ, Kasim M, Wang J, Dreyfuss G (сентябрь 2007 г.). "SMN-независимые субъединицы комплекса SMN. Идентификация небольшого промежуточного звена сборки ядерного рибонуклеопротеина". Журнал биологической химии. 282 (38): 27953–9. Дои:10.1074 / jbc.M702317200. PMID 17640873.
- ^ а б Kim WJ, Back SH, Kim V, Ryu I, Jang SK (март 2005 г.). «Секвестрация TRAF2 в стрессовые гранулы прерывает передачу сигналов фактора некроза опухоли в стрессовых условиях». Молекулярная и клеточная биология. 25 (6): 2450–62. Дои:10.1128 / MCB.25.6.2450-2462.2005. ЧВК 1061607. PMID 15743837.
- ^ а б Аримото К., Фукуда Х., Имаджо-Оми С., Сайто Х., Такекава М. (ноябрь 2008 г.). «Формирование стрессовых гранул ингибирует апоптоз, подавляя стресс-ответные пути MAPK». Природа клеточной биологии. 10 (11): 1324–32. Дои:10.1038 / ncb1791. PMID 18836437. S2CID 21242075.
- ^ Галлузи И.Е., Бреннан С.М., Стенберг М.Г., Суонсон М.С., Эверсол А., Майзельс Н., Стейтц Дж. А. (март 2000 г.). «Связывание HuR с цитоплазматической мРНК нарушается тепловым шоком». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (7): 3073–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.3073G. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3073. ЧВК 16194. PMID 10737787.
- ^ а б c d е Томас М.Г., Мартинес Тосар Л.Дж., Лоши М., Паскини Дж. М., Корреале Дж., Киндлер С., Боккаччо Г.Л. (январь 2005 г.). «Рекрутирование Staufen в стрессовые гранулы не влияет на ранний транспорт мРНК в олигодендроцитах». Молекулярная биология клетки. 16 (1): 405–20. Дои:10.1091 / mbc.E04-06-0516. ЧВК 539183. PMID 15525674.
- ^ а б c Коломбрита С., Зеннаро Е., Фаллини С., Вебер М., Соммакал А., Буратти Е., Силани В., Ратти А. (ноябрь 2009 г.). «TDP-43 задействуется для стресса гранул в условиях окислительного повреждения». Журнал нейрохимии. 111 (4): 1051–61. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2009.06383.x. PMID 19765185. S2CID 8630114.
- ^ а б c Мейеровиц Дж., Паркер С.Дж., Велла Л.Дж., Нг округ Колумбия, Прайс К.А., Лидделл Дж. Р. и др. (Август 2011 г.). «N-концевая киназа C-Jun контролирует накопление TDP-43 в стрессовых гранулах, вызванное окислительным стрессом». Молекулярная нейродегенерация. 6: 57. Дои:10.1186/1750-1326-6-57. ЧВК 3162576. PMID 21819629.
- ^ Берри Р.В., Смит С.Л. (октябрь 2006 г.). «Распределение HuD изменяется в ответ на тепловой шок, но не на нейротрофическую стимуляцию». Журнал гистохимии и цитохимии. 54 (10): 1129–38. Дои:10.1369 / jhc.6A6979.2006. ЧВК 3957809. PMID 16801526.
- ^ Наваз М.С., Вик Э.С., Бергес Н., Флэдби С., Бьёрас М., Далхус Б., Альсет I (октябрь 2016 г.). "Регулирование активности человеческой эндонуклеазы V и перемещение в цитоплазматические стрессовые гранулы". Журнал биологической химии. 291 (41): 21786–21801. Дои:10.1074 / jbc.M116.730911. ЧВК 5076846. PMID 27573237.
- ^ а б c Андерссон М.К., Стольберг А., Арвидссон Ю., Олофссон А., Семб Х., Стенман Г., Нильссон О., Аман П. (июль 2008 г.). «Многофункциональные протоонкопротеины FUS, EWS и TAF15 показывают характерные для клеточного типа экспрессии и участие в распространении клеток и ответе на стресс». BMC Cell Biology. 9: 37. Дои:10.1186/1471-2121-9-37. ЧВК 2478660. PMID 18620564.
- ^ а б c Нойманн М., Бентманн Э., Дорманн Д., Джавайд А., ДеХесус-Эрнандес М., Ансорге О. и др. (Сентябрь 2011 г.). «Белки FET TAF15 и EWS являются селективными маркерами, которые отличают FTLD с патологией FUS от бокового амиотрофического склероза с мутациями FUS». Мозг. 134 (Pt 9): 2595–609. Дои:10.1093 / мозг / awr201. ЧВК 3170539. PMID 21856723.
- ^ Озэки К., Сугияма М, Актер К.А., Нишиваки К., Асано-Инами Э., Сенга Т. (2019). «FAM98A локализован в стрессовых гранулах и ассоциируется с множественными локализованными в стрессовых гранулах белками». Молекулярная и клеточная биохимия. 451 (1–2): 107–115. Дои:10.1007 / s11010-018-3397-6. PMID 29992460. S2CID 49667042.
- ^ а б c d Mazroui R, Huot ME, Tremblay S, Filion C, Labelle Y, Khandjian EW (ноябрь 2002 г.). «Захват матричной РНК белком Fragile X Mental Retardation в цитоплазматические гранулы вызывает репрессию трансляции». Молекулярная генетика человека. 11 (24): 3007–17. Дои:10.1093 / hmg / 11.24.3007. PMID 12417522.
- ^ а б Должанская Н., Мерц Г., Денман РБ (сентябрь 2006 г.). «Окислительный стресс выявляет неоднородность гранул FMRP в нейритах клеток PC12». Исследование мозга. 1112 (1): 56–64. Дои:10.1016 / j.brainres.2006.07.026. PMID 16919243. S2CID 41514888.
- ^ а б Блехингберг Дж., Луо Й., Болунд Л., Дамгаард К. К., Нильсен А. Л. (2012). «Ответы на экспрессию генов на снижение FUS, EWS и TAF15, а также анализ секвестрации стрессовых гранул выявляет неизбыточные функции FET-белка». PLOS ONE. 7 (9): e46251. Bibcode:2012PLoSO ... 746251B. Дои:10.1371 / journal.pone.0046251. ЧВК 3457980. PMID 23049996.
- ^ Sama RR, Ward CL, Kaushansky LJ, Lemay N, Ishigaki S, Urano F, Bosco DA (ноябрь 2013 г.). «FUS / TLS собирается в гранулы напряжения и является фактором выживания во время гиперосмолярного стресса». Журнал клеточной физиологии. 228 (11): 2222–31. Дои:10.1002 / jcp.24395. ЧВК 4000275. PMID 23625794.
- ^ а б Ди Сальвио М., Пиччинни В., Гербино В., Мантони Ф., Камерини С., Лензи Дж., Роза А., Челлини Л., Лорени Ф., Карри М. Т., Боццони I, Коццолино М., Цестра Дж. (Октябрь 2015 г.). «Pur-alpha функционально взаимодействует с FUS, несущим мутации, связанные с БАС». Смерть и болезнь клеток. 6 (10): e1943. Дои:10.1038 / cddis.2015.295. ЧВК 4632316. PMID 26492376.
- ^ Лензи Дж., Де Сантис Р., де Туррис В., Морландо М., Ланев П., Кальво А., Калиендо В., Чио А., Роза А., Боззони I. (июль 2015 г.). «Мутантные белки FUS при БАС рекрутируются в стрессовые гранулы в индуцированных плюрипотентных мотонейронах, происходящих из стволовых клеток». Модели и механизмы заболеваний. 8 (7): 755–66. Дои:10.1242 / дмм.020099. ЧВК 4486861. PMID 26035390.
- ^ а б Дэйгл Дж. Г., Кришнамурти К., Рамеш Н., Каши И., Монаган Дж., МакЭвой К., Годфри Е. В., Дэниел Д. К., Джонсон Е. М., Монахан З., Шумейкер Ф., Пазинелли П., Панди У. Б. (апрель 2016 г.). «Pur-альфа регулирует динамику гранул цитоплазматического стресса и снижает токсичность FUS». Acta Neuropathologica. 131 (4): 605–20. Дои:10.1007 / s00401-015-1530-0. ЧВК 4791193. PMID 26728149.
- ^ Ло Белло М, Ди Фини Ф, Нотаро А, Спатаро Р, Конфорти Флорида, Ла Белла V (2017-10-17). «Связанный с БАС мутантный белок FUS неправильно локализован в цитоплазме и рекрутируется в стрессовые гранулы фибробластов из бессимптомных носителей мутации FUS P525L». Нейродегенеративные заболевания. 17 (6): 292–303. Дои:10.1159/000480085. PMID 29035885. S2CID 40561105.
- ^ Marrone L, Poser I, Casci I, Japtok J, Reinhardt P, Janosch A, Andree C, Lee HO, Moebius C, Koerner E, Reinhardt L, Cicardi ME, Hackmann K, Klink B, Poletti A, Alberti S, Bickle M , Герман А., Пандей Ю., Хайман А. А., Стернекерт Дж. Л. (январь 2018 г.). «Изогенные репортерные линии FUS-eGFP iPSC позволяют количественно оценить патологию стрессовых гранул FUS, которая устраняется лекарствами, вызывающими аутофагию». Отчеты о стволовых клетках. 10 (2): 375–389. Дои:10.1016 / j.stemcr.2017.12.018. ЧВК 5857889. PMID 29358088.
- ^ а б c d Hofmann I, Casella M, Schnölzer M, Schlechter T, Spring H, Franke WW (март 2006 г.). «Идентификация соединительного белка бляшки плакофилин 3 в цитоплазматических частицах, содержащих РНК-связывающие белки, и привлечение плакофилинов 1 и 3 к стрессовым гранулам». Молекулярная биология клетки. 17 (3): 1388–98. Дои:10.1091 / mbc.E05-08-0708. ЧВК 1382326. PMID 16407409.
- ^ Tourrière H, Chebli K, Zekri L, Courselaud B, Blanchard JM, Bertrand E, Tazi J (март 2003 г.). «Связанная с RasGAP эндорибонуклеаза G3BP собирает стрессовые гранулы». Журнал клеточной биологии. 160 (6): 823–31. Дои:10.1083 / jcb.200212128. ЧВК 2173781. PMID 12642610.
- ^ а б c Хуа И, Чжоу Дж (январь 2004 г.). «Rpp20 взаимодействует с SMN и перераспределяется в гранулы SMN в ответ на стресс». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 314 (1): 268–76. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.084. PMID 14715275.
- ^ а б c d Квон С., Чжан Ю., Матиас П. (декабрь 2007 г.). «Деацетилаза HDAC6 - новый критический компонент стрессовых гранул, участвующих в стрессовой реакции». Гены и развитие. 21 (24): 3381–94. Дои:10.1101 / gad.461107. ЧВК 2113037. PMID 18079183.
- ^ а б Цай В.К., Рейнеке Л.К., Джайн А., Юнг С.И., Ллойд Р.Э. (сентябрь 2017 г.). «Гистоновая аргининдеметилаза JMJD6 связана со сборкой стрессовых гранул посредством деметилирования зародышевого белка стрессовых гранул G3BP1». Журнал биологической химии. 292 (46): 18886–18896. Дои:10.1074 / jbc.M117.800706. ЧВК 5704473. PMID 28972166.
- ^ а б c d Кобаяши Т., Уинслоу С., Санессон Л., Хеллман Ю., Ларссон С. (2012). «PKCα связывает G3BP2 и регулирует образование стрессовых гранул после клеточного стресса». PLOS ONE. 7 (4): e35820. Bibcode:2012PLoSO ... 735820K. Дои:10.1371 / journal.pone.0035820. ЧВК 3335008. PMID 22536444.
- ^ Мацуки Х., Такахаши М., Хигучи М., Макоха Г.Н., Оие М., Фуджи М. (февраль 2013 г.). «И G3BP1, и G3BP2 способствуют образованию стрессовых гранул». Гены в клетки. 18 (2): 135–46. Дои:10.1111 / gtc.12023. PMID 23279204. S2CID 11859927.
- ^ Folkmann AW, Wente SR (апрель 2015 г.). «Цитоплазматический hGle1A регулирует стрессовые гранулы путем модуляции трансляции». Молекулярная биология клетки. 26 (8): 1476–90. Дои:10.1091 / mbc.E14-11-1523. ЧВК 4395128. PMID 25694449.
- ^ а б c d е ж г час я j k л м п о п q р s т Zhang K, Daigle JG, Cunningham KM, Coyne AN, Ruan K, Grima JC, Bowen KE, Wadhwa H, Yang P, Rigo F, Taylor JP, Gitler AD, Rothstein JD, Lloyd TE (апрель 2018 г.). «Сборка стрессовых гранул нарушает ядерно-цитоплазматический транспорт». Ячейка. 173 (4): 958–971.e17. Дои:10.1016 / j.cell.2018.03.025. ЧВК 6083872. PMID 29628143.
- ^ а б Цай Н.П., Хо П.С., Вэй Л.Н. (март 2008 г.). «Регулирование динамики стрессовых гранул с помощью сигнального пути Grb7 и FAK». Журнал EMBO. 27 (5): 715–26. Дои:10.1038 / emboj.2008.19. ЧВК 2265756. PMID 18273060.
- ^ а б Крисенко М.О., Хиггинс Р.Л., Гош С., Чжоу К., Трибула Дж.С., Ван У.Х., Гелен Р.Л. (ноябрь 2015 г.). «Syk нанят для стресса гранул и способствует их удалению с помощью аутофагии». Журнал биологической химии. 290 (46): 27803–15. Дои:10.1074 / jbc.M115.642900. ЧВК 4646026. PMID 26429917.
- ^ Гроусл Т., Иванов П., Мальцова И., Помпач П., Фрыдлова И., Слаба Р., Сенограбкова Л., Новакова Л., Гашек Дж. (2013). «Вызванное тепловым шоком накопление факторов удлинения и терминации трансляции предшествует сборке стрессовых гранул в S. cerevisiae». PLOS ONE. 8 (2): e57083. Bibcode:2013PLoSO ... 857083G. Дои:10.1371 / journal.pone.0057083. ЧВК 3581570. PMID 23451152.
- ^ Гонсалвеш Кде А., Брессан Г.К., Сайто А., Морелло Л.Г., Занчин Н.И., Кобарг Дж. (Август 2011 г.). «Доказательства ассоциации человеческого регуляторного белка Ki-1/57 с механизмом трансляции». Письма FEBS. 585 (16): 2556–60. Дои:10.1016 / j.febslet.2011.07.010. PMID 21771594.
- ^ а б Guil S, Long JC, Cáceres JF (август 2006 г.). «Перемещение hnRNP A1 к стрессовым гранулам отражает роль в стрессовой реакции». Молекулярная и клеточная биология. 26 (15): 5744–58. Дои:10.1128 / MCB.00224-06. ЧВК 1592774. PMID 16847328.
- ^ а б Дьюи С.М., Сеник Б., Сефтон С.Ф., Дрис Д.Р., Майер П., Гуд С.К., Джонсон Б.А., Херц Дж., ЮГ (март 2011 г.). «TDP-43 направлен на стрессовые гранулы сорбитолом, новым физиологическим осмотическим и окислительным стрессором». Молекулярная и клеточная биология. 31 (5): 1098–108. Дои:10.1128 / MCB.01279-10. ЧВК 3067820. PMID 21173160.
- ^ Пападопулу С., Гану В., Патрину-Георгула М., Гиалис А. (январь 2013 г.). «Взаимодействия HuR-hnRNP и влияние клеточного стресса». Молекулярная и клеточная биохимия. 372 (1–2): 137–47. Дои:10.1007 / s11010-012-1454-0. PMID 22983828. S2CID 16261648.
- ^ Нарусэ Х, Ишиура Х, Мицуи Дж., Дате Х, Такахаши И, Мацукава Т., Танака М, Исии А, Тамаока А, Хоккоку К., Сону М, Сегава М, Угава Й, Дои К., Йошимура Дж, Моришита С., Гото Дж. , Tsuji S (январь 2018 г.). «Молекулярно-эпидемиологическое исследование семейного бокового амиотрофического склероза в популяции Японии путем секвенирования всего экзома и идентификации новой мутации HNRNPA1». Нейробиология старения. 61: 255.e9–255.e16. Дои:10.1016 / j.neurobiolaging.2017.08.030. PMID 29033165. S2CID 38838445.
- ^ а б McDonald KK, Aulas A, Destroismaisons L, Pickles S, Beleac E, Camu W, Rouleau GA, Vande Velde C (апрель 2011 г.). «ДНК-связывающий белок TAR 43 (TDP-43) регулирует динамику стрессовых гранул посредством дифференциальной регуляции G3BP и TIA-1». Молекулярная генетика человека. 20 (7): 1400–10. Дои:10.1093 / hmg / ddr021. PMID 21257637.
- ^ а б Фукуда Т., Наики Т., Сайто М., Ирие К. (февраль 2009 г.). «hnRNP K взаимодействует с белком 42 связывающего РНК-мотива и функционирует в поддержании клеточного уровня АТФ в стрессовых условиях». Гены в клетки. 14 (2): 113–28. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2008.01256.x. PMID 19170760. S2CID 205293176.
- ^ а б c d Кедерша Н.Л., Гупта М., Ли В., Миллер И., Андерсон П. (декабрь 1999 г.). «РНК-связывающие белки TIA-1 и TIAR связывают фосфорилирование eIF-2 альфа со сборкой стрессовых гранул млекопитающих». Журнал клеточной биологии. 147 (7): 1431–42. Дои:10.1083 / jcb.147.7.1431. ЧВК 2174242. PMID 10613902.
- ^ Ganassi M, Mateju D, Bigi I, Mediani L, Poser I, Lee HO, Seguin SJ, Morelli FF, Vinet J, Leo G, Pansarasa O, Cereda C, Poletti A, Alberti S, Carra S (сентябрь 2016 г.). «Функция наблюдения шаперонного комплекса HSPB8-BAG3-HSP70 обеспечивает целостность и динамизм стрессовых гранул». Молекулярная клетка. 63 (5): 796–810. Дои:10.1016 / j.molcel.2016.07.021. PMID 27570075.
- ^ Махбуби, Хичам; Муджабер, Оссама; Кодиха, Мохамед; Сточай, Урсула (29 марта 2020 г.). «Ко-шаперон HspBP1 - новый компонент стрессовых гранул, регулирующий их образование». Клетки. 9 (4): 825. Дои:10.3390 / ячейки9040825. ISSN 2073-4409. ЧВК 7226807. PMID 32235396.
- ^ Вэнь Х, Хуан Х, Мок Б.В., Чен И, Чжэн М., Лау С.Ю., Ван П, Сон В., Джин Д.Й., Юэнь К.Ю., Чен Х. (апрель 2014 г.). «NF90 проявляет противовирусную активность за счет регуляции фосфорилирования PKR и стрессовых гранул в инфицированных клетках». Журнал иммунологии. 192 (8): 3753–64. Дои:10.4049 / jimmunol.1302813. PMID 24623135.
- ^ Брем М.А., Шенк Т.М., Чжоу Х, Фаник В., Лин Х., Виндхорст С., Наласковски М.М., Кобрас М., Ширс С.Б., Майр Г.В. (декабрь 2007 г.). «Внутриклеточная локализация человеческой Ins (1,3,4,5,6) P5 2-киназы». Биохимический журнал. 408 (3): 335–45. Дои:10.1042 / BJ20070382. ЧВК 2267366. PMID 17705785.
- ^ Пиотровска Дж., Хансен С.Дж., Парк Н., Ямка К., Сарнов П., Густин К.Е. (апрель 2010 г.). «Стабильное образование уникальных по составу стрессовых гранул в инфицированных вирусом клетках». Журнал вирусологии. 84 (7): 3654–65. Дои:10.1128 / JVI.01320-09. ЧВК 2838110. PMID 20106928.
- ^ Хенао-Мехиа Дж., Хэ Дж. Дж. (Ноябрь 2009 г.). «Перемещение Sam68 в стрессовые гранулы в ответ на окислительный стресс посредством образования комплекса с TIA-1». Экспериментальные исследования клеток. 315 (19): 3381–95. Дои:10.1016 / j.yexcr.2009.07.011. ЧВК 2783656. PMID 19615357.
- ^ Чжан Х, Чен Н, Ли П, Пань З, Дин И, Цзоу Д, Ли Л, Сяо Л, Шэнь Б., Лю С., Цао Х, Цуй Й (июль 2016 г.). «Ядерный белок Sam68 рекрутируется в гранулы цитоплазматического стресса во время инфекции энтеровирусом 71». Микробный патогенез. 96: 58–66. Дои:10.1016 / j.micpath.2016.04.001. PMID 27057671.
- ^ Rothé F, Gueydan C, Bellefroid E, Huez G, Kruys V (апрель 2006 г.). «Идентификация FUSE-связывающих белков как взаимодействующих партнеров TIA белков». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 343 (1): 57–68. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.02.112. PMID 16527256.
- ^ а б c d Махбуби Х, Сеганати Э, Конг Д., Стохадж У. (2013). «Идентификация новых компонентов гранул напряжения, которые участвуют в ядерном транспорте». PLOS ONE. 8 (6): e68356. Bibcode:2013PLoSO ... 868356M. Дои:10.1371 / journal.pone.0068356. ЧВК 3694919. PMID 23826389.
- ^ а б Фуджимура К., Сузуки Т., Ясуда Ю., Мурата М., Катахира Дж., Йонеда Ю. (июль 2010 г.). «Идентификация импортина альфа1 как нового компонента стрессовых гранул РНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1803 (7): 865–71. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2010.03.020. PMID 20362631.
- ^ Ян Р., Гайдамаков С.А., Се Дж., Ли Дж., Мартино Л., Козлов Г., Кроуфорд А.К., Руссо А.Н., Конте М.Р., Геринг К., Марайя Р.Дж. (февраль 2011 г.). «La-родственный белок 4 связывает поли (A), взаимодействует с доменом MLLE поли (A)-связывающего белка через вариантный мотив PAM2w и может способствовать стабильности мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 31 (3): 542–56. Дои:10.1128 / MCB.01162-10. ЧВК 3028612. PMID 21098120.
- ^ а б Бальцер Э., Мосс Э. Г. (январь 2007 г.). «Локализация регулятора времени развития Lin28 в комплексах мРНП, Р-тельцах и стрессовых гранулах». РНК Биология. 4 (1): 16–25. Дои:10.4161 / rna.4.1.4364. PMID 17617744.
- ^ а б Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (декабрь 2002 г.). «Белки LSm1-7 человека совместно локализуются с ферментами, разрушающими мРНК Dcp1 / 2 и Xrnl, в отдельных цитоплазматических очагах». РНК. 8 (12): 1489–501. Дои:10.1017 / S1355838202021726 (неактивно 12.11.2020). ЧВК 1370355. PMID 12515382.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2020 г. (ссылка на сайт)
- ^ Ян У.Х., Ю. Дж. Х., Гулик Т., Блох К.Д., Блох Д.Б. (апрель 2006 г.). «РНК-ассоциированный белок 55 (RAP55) локализуется в телах, обрабатывающих мРНК, и стрессовых гранулах». РНК. 12 (4): 547–54. Дои:10.1261 / rna.2302706. ЧВК 1421083. PMID 16484376.
- ^ а б Кавахара Х., Имаи Т., Иматака Х., Цудзимото М., Мацумото К., Окано Х. (май 2008 г.). «Нервный РНК-связывающий белок Musashi1 ингибирует инициацию трансляции, конкурируя с eIF4G за PABP». Журнал клеточной биологии. 181 (4): 639–53. Дои:10.1083 / jcb.200708004. ЧВК 2386104. PMID 18490513.
- ^ Юань Л., Сяо Ю., Чжоу Ц., Юань Д., Ву Б., Чен Г., Чжоу Дж. (Январь 2014 г.). «Протеомный анализ показывает, что MAEL, компонент nuage, взаимодействует с белками стрессовых гранул в раковых клетках». Отчеты онкологии. 31 (1): 342–50. Дои:10.3892 / или 2013.2836. PMID 24189637.
- ^ Сегин С.Дж., Морелли Ф.Ф., Винет Дж., Аморе Д., Де Биази С., Полетти А., Рубинштейн Д.К., Карра С. (декабрь 2014 г.). «Ингибирование аутофагии, лизосом и функции VCP нарушает сборку стрессовых гранул». Гибель клеток и дифференциация. 21 (12): 1838–51. Дои:10.1038 / cdd.2014.103. ЧВК 4227144. PMID 25034784.
- ^ Ryu HH, Jun MH, Min KJ, Jang DJ, Lee YS, Kim HK, Lee JA (декабрь 2014 г.). «Аутофагия регулирует связанный с амиотрофическим боковым склерозом, слитый с саркома-положительными стрессовыми гранулами в нейронах». Нейробиология старения. 35 (12): 2822–2831. Дои:10.1016 / j.neurobiolaging.2014.07.026. PMID 25216585. S2CID 36917292.
- ^ а б c Вассерман Т., Каценельсон К., Данилюк С., Хасин Т., Чодер М., Аронхейм А. (январь 2010 г.). «Новый белок WDR62, связывающий N-концевую киназу c-Jun (JNK), задействован в стрессовых гранулах и опосредует неклассическую активацию JNK». Молекулярная биология клетки. 21 (1): 117–30. Дои:10.1091 / mbc.E09-06-0512. ЧВК 2801705. PMID 19910486.
- ^ а б Курше Дж., Букет-Пояу К., Потемски А., Брес А., Яриэль-Энконтр I, Бийо М. (ноябрь 2008 г.). «Взаимодействие с адаптерами 14-3-3 регулирует сортировку РНК-связывающего белка hMex-3B по отдельным классам гранул РНК». Журнал биологической химии. 283 (46): 32131–42. Дои:10.1074 / jbc.M802927200. PMID 18779327.
- ^ Куниёси К., Такеучи О, Пандей С., Сато Т., Ивасаки Х., Акира С., Каваи Т. (апрель 2014 г.). «Основная роль РНК-связывающей E3 убиквитинлигазы MEX3C в RIG-I-опосредованном противовирусном врожденном иммунитете». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (15): 5646–51. Bibcode:2014ПНАС..111.5646К. Дои:10.1073 / pnas.1401674111. ЧВК 3992669. PMID 24706898.
- ^ ErLin S, WenJie W, LiNing W, BingXin L, MingDe L, Yan S, RuiFa H (май 2015 г.). «Musashi-1 поддерживает барьерную структуру между кровью и яичками во время сперматогенеза и регулирует образование стрессовых гранул при тепловом стрессе». Молекулярная биология клетки. 26 (10): 1947–56. Дои:10.1091 / mbc.E14-11-1497. ЧВК 4436837. PMID 25717188.
- ^ Макнейр Л., Сяо С., Милетик Д., Гани М., Жюльен Дж. П., Кейт Дж., Зинман Л., Рогаева Е., Робертсон Дж. (Январь 2016 г.). «MTHFSD и DDX58 - новые РНК-связывающие белки, аномально регулируемые при боковом амиотрофическом склерозе». Мозг. 139 (Pt 1): 86–100. Дои:10.1093 / мозг / awv308. PMID 26525917.
- ^ а б c d е ж Сфакианос А.П., Меллор Л.Е., Панг Ю.Ф., Крицилигку П., Нидс Х, Абу-Хамдан Х., Дезобри Л., Пулин Г.Б., Эш М.П., Уитмарш А.Дж. (март 2018 г.). «Путь киназы mTOR-S6 способствует сборке стрессовых гранул». Гибель клеток и дифференциация. 25 (10): 1766–1780. Дои:10.1038 / s41418-018-0076-9. ЧВК 6004310. PMID 29523872.
- ^ Ю К., Йорк Б., Ван С., Фенг Кью, Дж. Сюй, О'Мэлли Б. В. (март 2007 г.). «Существенная функция коактиватора SRC-3 в подавлении трансляции цитокиновой мРНК и воспалительной реакции». Молекулярная клетка. 25 (5): 765–78. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.01.025. ЧВК 1864954. PMID 17349961.
- ^ а б Фурукава М.Т., Сакамото Х., Иноуэ К. (апрель 2015 г.). «Взаимодействие и совместная локализация HERMES / RBPMS с NonO, PSF и G3BP1 в нейрональных цитоплазматических гранулах RNP в клетках линии сетчатки мыши». Гены в клетки. 20 (4): 257–66. Дои:10.1111 / gtc.12224. PMID 25651939. S2CID 22403884.
- ^ Кан Дж. С., Хван Ю. С., Ким Л. К., Ли С., Ли В. Б., Ким-Ха Дж, Ким Ю. Дж. (Март 2018 г.). «OASL1 улавливает вирусные РНК в стрессовых гранулах для усиления противовирусного ответа». Молекулы и клетки. 41 (3): 214–223. Дои:10.14348 / molcells.2018.2293. ЧВК 5881095. PMID 29463066.
- ^ Венер К.А., Шютц С., Сарнов П. (апрель 2010 г.). «OGFOD1, новый модулятор фосфорилирования фактора инициации трансляции 2альфа эукариот и клеточного ответа на стресс». Молекулярная и клеточная биология. 30 (8): 2006–16. Дои:10.1128 / MCB.01350-09. ЧВК 2849474. PMID 20154146.
- ^ Bravard A, Campalans A, Vacher M, Gouget B, Levalois C, Chevillard S, Radicella JP (март 2010 г.). «Инактивация путем окисления и вовлечения в стрессовые гранулы hOGG1, но не APE1 в человеческих клетках, подвергшихся воздействию сублетальных концентраций кадмия». Мутационные исследования. 685 (1–2): 61–9. Дои:10.1016 / j.mrfmmm.2009.09.013. PMID 19800894.
- ^ Дас, Рича; Швинцер, Лукас; Винопал, Станислав; Рока, Ева Агуадо; Сильвестр, Марк; Оприсореану, Ана-Мария; Шох, Сюзанна; Брадке, Франк; Брумер, Мейке (28 мая 2019 г.). «Новые роли деубиквитилирующего фермента OTUD4 в РНК-белковой сети и гранулах РНК». Журнал клеточной науки. 132 (12): jcs229252. Дои:10.1242 / jcs.229252. ISSN 1477-9137. ЧВК 6602300. PMID 31138677.
- ^ а б c d е ж Леунг А.К., Вьяс С., Руд Дж. Э., Бхуткар А., Шарп П.А., Чанг П. (май 2011 г.). «Поли (АДФ-рибоза) регулирует стрессовые реакции и активность микроРНК в цитоплазме». Молекулярная клетка. 42 (4): 489–99. Дои:10.1016 / j.molcel.2011.04.015. ЧВК 3898460. PMID 21596313.
- ^ а б Репичи М., Хассанджани М., Мэддисон, округ Колумбия, Гарсао П., Чимини С., Патель Б., Сегё ЭМ, Страатман К.Р., Лилли К.С., Борселло Т., Отейро Т.Ф., Панман Л., Джорджини Ф. (2019). «Связанный с болезнью Паркинсона белок DJ-1 ассоциируется с цитоплазматическими гранулами мРНП во время стресса и нейродегенерации». Молекулярная нейробиология. 56 (1): 61–77. Дои:10.1007 / s12035-018-1084-у. ЧВК 6334738. PMID 29675578.
- ^ Catara G, Grimaldi G, Schembri L, Spano D, Turacchio G, Lo Monte M, Beccari AR, Valente C, Corda D (октябрь 2017 г.). «Поли-АДФ-рибоза, продуцируемая PARP1, вызывает транслокацию PARP12 в стрессовые гранулы и нарушение функций комплекса Гольджи». Научные отчеты. 7 (1): 14035. Bibcode:2017НатСР ... 714035C. Дои:10.1038 / s41598-017-14156-8. ЧВК 5656619. PMID 29070863.
- ^ Бай И, Донг З, Шан Цзиньпин, Чжао Х, Ван Л., Го Ц, Гао Ф, Чжан Л., Ван Ц. (2016). «Pdcd4 участвует в образовании стрессовых гранул в ответ на окисленный липопротеин низкой плотности или диету с высоким содержанием жиров». PLOS ONE. 11 (7): e0159568. Bibcode:2016PLoSO..1159568B. Дои:10.1371 / journal.pone.0159568. ЧВК 4959751. PMID 27454120.
- ^ Kunde SA, Musante L, Grimme A, Fischer U, Müller E, Wanker EE, Kalscheuer VM (декабрь 2011 г.). «Связанный с Х-хромосомой белок умственной отсталости PQBP1 является компонентом нейрональных гранул РНК и регулирует появление стрессовых гранул». Молекулярная генетика человека. 20 (24): 4916–31. Дои:10,1093 / hmg / ddr430. PMID 21933836.
- ^ а б c Турахия А., Мейер С.Р., Маринкола Г., Бём С., Ванзелов Дж. Т., Шлоссер А., Хофманн К., Бухбергер А. (июнь 2018 г.). «ZFAND1 привлекает протеасому p97 и 26S для облегчения снятия стрессовых гранул, вызванных арсенитом». Молекулярная клетка. 70 (5): 906–919.e7. Дои:10.1016 / j.molcel.2018.04.021. PMID 29804830.
- ^ Ян Ф, Пэн Й, Мюррей Э.Л., Оцука Й., Кедерша Н., Шенберг Д.Р. (декабрь 2006 г.). «Связанная с полисомами эндонуклеаза PMR1 нацелена на стрессовые гранулы посредством стресс-специфического связывания с TIA-1». Молекулярная и клеточная биология. 26 (23): 8803–13. Дои:10.1128 / MCB.00090-06. ЧВК 1636822. PMID 16982678.
- ^ а б Такахаши М., Хигучи М., Мацуки Х., Йошита М., Осава Т., Ойе М., Фуджи М. (февраль 2013 г.). «Стресс-гранулы подавляют апоптоз за счет снижения производства активных форм кислорода». Молекулярная и клеточная биология. 33 (4): 815–29. Дои:10.1128 / MCB.00763-12. ЧВК 3571346. PMID 23230274.
- ^ а б c Park C, Choi S, Kim YE, Lee S., Park SH, Adelstein RS, Kawamoto S, Kim KK (сентябрь 2017 г.). «Стресс-гранулы содержат Rbfox2 с мРНК, связанной с клеточным циклом». Научные отчеты. 7 (1): 11211. Bibcode:2017НатСР ... 711211П. Дои:10.1038 / s41598-017-11651-w. ЧВК 5593835. PMID 28894257.
- ^ а б Кучеренко М.М., Щербата Х.Р. (январь 2018). «Стресс-зависимая регуляция Rbfox1 / A2bp1 с помощью miR-980 способствует образованию гранул рибонуклеопротеина и выживанию клеток». Nature Communications. 9 (1): 312. Bibcode:2018НатКо ... 9..312K. Дои:10.1038 / s41467-017-02757-w. ЧВК 5778076. PMID 29358748.
- ^ Лин JC, Hsu M, Tarn WY (февраль 2007 г.). «Клеточный стресс модулирует функцию сплайсинга регуляторного белка RBM4 в контроле трансляции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (7): 2235–40. Bibcode:2007ПНАС..104.2235Л. Дои:10.1073 / pnas.0611015104. ЧВК 1893002. PMID 17284590.
- ^ а б Баккар Н., Кусари А., Ковалик Т., Ли Ю., Баузер Р. (июль 2015 г.). «RBM45 модулирует антиоксидантный ответ при боковом амиотрофическом склерозе посредством взаимодействия с KEAP1». Молекулярная и клеточная биология. 35 (14): 2385–99. Дои:10.1128 / MCB.00087-15. ЧВК 4475920. PMID 25939382.
- ^ а б Ли Ю., Коллинз М., Гейзер Р., Баккар Н., Риаскос Д., Баузер Р. (сентябрь 2015 г.). «Гомоолигомеризация RBM45 опосредует ассоциацию с ALS-связанными белками и стрессовыми гранулами». Научные отчеты. 5: 14262. Bibcode:2015НатСР ... 514262Л. Дои:10.1038 / srep14262. ЧВК 4585734. PMID 26391765.
- ^ Фарази Т.А., Леонхардт К.С., Мукерджи Н., Михайлович А., Ли С., Макс К.Э., Мейер С., Ямаджи М., Чекан П., Джейкобс Н.С., Герстбергер С., Богнанни С., Ларссон Е., Олер Ю., Тушл Т. (июль 2014 г.). «Идентификация элемента распознавания РНК из семейства РНК-связывающих белков RBPMS и их мРНК-мишеней по всему транскриптому». РНК. 20 (7): 1090–102. Дои:10.1261 / rna.045005.114. ЧВК 4114688. PMID 24860013.
- ^ а б Атанасопулос В., Баркер А., Ю Д., Тан А. Х., Шривастава М., Контрерас Н., Ван Дж., Лам К. П., Браун С.Х., Гуднау С.К., Диксон Н.Э., Лидман П.Дж., Сент-Р., Винуеса К.Г. (май 2010 г.). «Семейство белков ROQUIN локализуется в стрессовых гранулах через домен ROQ и связывает целевые мРНК». Журнал FEBS. 277 (9): 2109–27. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2010.07628.x. PMID 20412057. S2CID 13387108.
- ^ Эйзингер-Матасон Т.С., Андраде Дж., Грёлер А.Л., Кларк Д.Е., Мураторе-Шредер Т.Л., Пасич Л., Смит Дж. А., Шабановиц Дж., Хант Д.Ф., Макара И.Г., Ланниган Д.А. (сентябрь 2008 г.). «Созависимые функции RSK2 и фактора, способствующего апоптозу TIA-1, в сборке стрессовых гранул и выживании клеток». Молекулярная клетка. 31 (5): 722–36. Дои:10.1016 / j.molcel.2008.06.025. ЧВК 2654589. PMID 18775331.
- ^ а б Баез М.В., Боккаччо Г.Л. (декабрь 2005 г.). «Смауг млекопитающих - репрессор трансляции, который образует цитоплазматические очаги, похожие на стрессовые гранулы». Журнал биологической химии. 280 (52): 43131–40. Дои:10.1074 / jbc.M508374200. PMID 16221671.
- ^ Ли Ю.Дж., Вей Х.М., Чен Л.Й., Ли К. (январь 2014 г.). «Локализация SERBP1 в стрессовых гранулах и ядрышках». Журнал FEBS. 281 (1): 352–64. Дои:10.1111 / фев.12606. PMID 24205981. S2CID 20464730.
- ^ Омер А., Патель Д., Лиан XJ, Садек Дж., Ди Марко С., Пауза А., Гороспе М., Галлузи И.Е. (март 2018 г.). «Стресс-гранулы противодействуют старению за счет секвестрации PAI-1». EMBO отчеты. 19 (5): e44722. Дои:10.15252 / набр.201744722. ЧВК 5934773. PMID 29592859.
- ^ Jedrusik-Bode M, Studencka M, Smolka C, Baumann T, Schmidt H, Kampf J, Paap F, Martin S, Tazi J, Müller KM, Krüger M, Braun T, Bober E (ноябрь 2013 г.). «Сиртуин SIRT6 регулирует образование стрессовых гранул у C. elegans и млекопитающих». Журнал клеточной науки. 126 (Пт 22): 5166–77. Дои:10.1242 / jcs.130708. PMID 24013546.
- ^ а б c Браун Дж. А., Робертс Т. Л., Ричардс Р., Вудс Р., Биррелл Дж., Лим Ю. К., Оно С., Ямасита А., Абрахам Р. Т., Гевен Н., Лавин М. Ф. (ноябрь 2011 г.). «Новая роль hSMG-1 в формировании стрессовых гранул». Молекулярная и клеточная биология. 31 (22): 4417–29. Дои:10.1128 / MCB.05987-11. ЧВК 3209244. PMID 21911475.
- ^ а б c Хуа И, Чжоу Дж (август 2004 г.). «Белок выживания мотонейрона облегчает сборку стрессовых гранул». Письма FEBS. 572 (1–3): 69–74. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.07.010. PMID 15304326. S2CID 27599172.
- ^ Цзоу Т., Ян X, Пан Д., Хуан Дж, Сахин М., Чжоу Дж. (Май 2011 г.). «Дефицит SMN снижает способность клеток образовывать стрессовые гранулы, повышая чувствительность клеток к стрессу». Клеточная и молекулярная нейробиология. 31 (4): 541–50. Дои:10.1007 / s10571-011-9647-8. PMID 21234798. S2CID 8763933.
- ^ Гао Х, Фу Х, Сон Дж, Чжан И, Цуй Х, Су Ц, Ге Л, Шао Дж, Синь Л, Саарикетту Дж, Мэй М, Ян Х, Вэй М, Сильвеннойнен О, Яо З, Хе Дж, Ян Дж. (Март 2015 г.). «Поли (A) (+) мРНК-связывающий белок Tudor-SN регулирует динамику агрегации стрессовых гранул». Журнал FEBS. 282 (5): 874–90. Дои:10.1111 / фев.13186. PMID 25559396. S2CID 27524910.
- ^ Чанг Ю.В., Хуанг Ю.С. (2014). «Арсенит-активируемая передача сигналов JNK усиливает взаимодействие CPEB4-винексин для облегчения сборки стрессовых гранул и выживания клеток». PLOS ONE. 9 (9): e107961. Bibcode:2014PLoSO ... 9j7961C. Дои:10.1371 / journal.pone.0107961. ЧВК 4169592. PMID 25237887.
- ^ Чжу Ч., Ким Дж., Шай Дж. В., Райт В.Е. (2008). «SGNP: важная стрессовая гранула / ядерный белок, потенциально участвующий в процессинге / транспорте 5.8s рРНК». PLOS ONE. 3 (11): e3716. Bibcode:2008PLoSO ... 3.3716Z. Дои:10.1371 / journal.pone.0003716. ЧВК 2579992. PMID 19005571.
- ^ Бергер А., Иванова Е., Гаро С., Шеррер А., Мазруи Р., Струб К. (2014). «Прямое связывание димера Alu-связывающего белка SRP9 / 14 с 40S рибосомными субъединицами способствует образованию стрессовых гранул и регулируется Alu РНК». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (17): 11203–17. Дои:10.1093 / нар / gku822. ЧВК 4176187. PMID 25200073.
- ^ Делестиен Н., Вокье С., Сойн Р., Диерик Дж. Ф., Гейдан С., Крюс В. (июнь 2010 г.). «Фактор сплайсинга ASF / SF2 связан с TIA-1-родственными / TIA-1-содержащими рибонуклеопротеическими комплексами и вносит вклад в посттранскрипционную репрессию экспрессии генов». Журнал FEBS. 277 (11): 2496–514. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2010.07664.x. PMID 20477871. S2CID 24332251.
- ^ Фицджеральд К.Д., Семлер Б.Л. (сентябрь 2013 г.). «Инфекция полиовируса индуцирует совместную локализацию клеточного белка SRp20 с TIA-1, цитоплазматическим белком гранул стресса». Вирусные исследования. 176 (1–2): 223–31. Дои:10.1016 / j.virusres.2013.06.012. ЧВК 3742715. PMID 23830997.
- ^ Kano S, Nishida K, Kurebe H, Nishiyama C, Kita K, Akaike Y, Kajita K, Kurokawa K, Masuda K, Kuwano Y, Tanahashi T, Rokutan K (февраль 2014 г.). «Вызываемый окислительным стрессом усеченный серин / богатый аргинином фактор сплайсинга 3 регулирует выработку интерлейкина-8 в раковых клетках толстой кишки человека». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология. 306 (3): C250–62. Дои:10.1152 / ajpcell.00091.2013. PMID 24284797. S2CID 17352565.
- ^ Джаябалан А.К., Санчес А., Пак Р.Й., Юн С.П., Кан Г.Й., Пэк Дж. Х., Андерсон П., Ки Ю., Он Т. (июль 2016 г.). «NEDDylation способствует сборке стрессовых гранул». Nature Communications. 7: 12125. Bibcode:2016 НатКо ... 712125J. Дои:10.1038 / ncomms12125. ЧВК 4935812. PMID 27381497.
- ^ а б Кухарский М.С., Квинтьеро А., Мацумото Т., Мацукава К., Ан Х, Хашимото Т., Ивацубо Т., Бухман В.Л., Шелковникова Т.А. (апрель 2015 г.). «Кальций-чувствительный трансактиваторный белок (CREST) разделяет набор структурных и функциональных характеристик с другими белками, связанными с боковым амиотрофическим склерозом». Молекулярная нейродегенерация. 10: 20. Дои:10.1186 / s13024-015-0014-у. ЧВК 4428507. PMID 25888396.
- ^ Томас MG, Мартинес Тосар LJ, Desbats MA, Leishman CC, Boccaccio GL (февраль 2009 г.). «Млекопитающие Staufen 1 действуют на гранулы и нарушают их сборку». Журнал клеточной науки. 122 (Pt 4): 563–73. Дои:10.1242 / jcs.038208. ЧВК 2714435. PMID 19193871.
- ^ Куарежма А.Дж., Брессан Г.К., Гава Л.М., Ланца, округ Колумбия, Рамос С.Х., Кобарг Дж. (Апрель 2009 г.). «Человеческий hnRNP Q повторно локализуется в цитоплазматических гранулах после лечения ФМА, тапсигаргина, арсенита и теплового шока». Экспериментальные исследования клеток. 315 (6): 968–80. Дои:10.1016 / j.yexcr.2009.01.012. PMID 19331829.
- ^ Лю-Есуцевиц Л., Билгутай А., Чжан Ю. Дж., Вандервейд Т., Вандервайд Т., Ситро А, Мехта Т., Заарур Н., Макки А., Баузер Р., Шерман М., Петручелли Л., Волозин Б. (октябрь 2010 г.). «Тар ДНК связывающий белок-43 (TDP-43) ассоциируется со стрессовыми гранулами: анализ культивируемых клеток и патологической ткани мозга». PLOS ONE. 5 (10): e13250. Bibcode:2010PLoSO ... 513250L. Дои:10.1371 / journal.pone.0013250. ЧВК 2952586. PMID 20948999.
- ^ Freibaum BD, Chitta RK, High AA, Taylor JP (февраль 2010 г.). «Глобальный анализ взаимодействующих белков с TDP-43 показывает сильную связь со сплайсингом РНК и механизмом трансляции». Журнал протеомных исследований. 9 (2): 1104–20. Дои:10.1021 / pr901076y. ЧВК 2897173. PMID 20020773.
- ^ а б Маккензи И. Р., Николсон А. М., Саркар М., Мессинг Дж., Пурис М. Д., Поттье С. и др. (Август 2017 г.). «Мутации TIA1 при боковом амиотрофическом склерозе и лобно-височной деменции способствуют разделению фаз и изменяют динамику стрессовых гранул». Нейрон (Представлена рукопись). 95 (4): 808–816.e9. Дои:10.1016 / j.neuron.2017.07.025. ЧВК 5576574. PMID 28817800.
- ^ Khalfallah Y, Kuta R, Grasmuck C, Prat A, Durham HD, Vande Velde C (май 2018 г.). «Регуляция динамики стрессовых гранул TDP-43 в типах клеток, релевантных нейродегенеративным заболеваниям». Научные отчеты. 8 (1): 7551. Bibcode:2018НатСР ... 8.7551K. Дои:10.1038 / s41598-018-25767-0. ЧВК 5953947. PMID 29765078.
- ^ Линдер Б., Плеттнер О., Кройсс М., Хартманн Э., Лаггербауэр Б., Мейстер Г., Кейдел Э., Фишер Ю. (октябрь 2008 г.). «Tdrd3 представляет собой новый белок, связанный со стрессовыми гранулами, взаимодействующий с белком синдрома ломкой X FMRP». Молекулярная генетика человека. 17 (20): 3236–46. Дои:10.1093 / hmg / ddn219. PMID 18664458.
- ^ а б Столл Г., Пиетилайнен О.П., Линдер Б., Сувисаари Дж., Броси С., Хенна В. и др. (Сентябрь 2013). «Делеция TOP3β, компонента мРНП, содержащих FMRP, способствует нарушениям нервного развития». Природа Неврология. 16 (9): 1228–1237. Дои:10.1038 / № 3484. ЧВК 3986889. PMID 23912948.
- ^ а б Нараянан Н., Ван З., Ли Л., Ян Ю. (2017). «Метилирование аргинина USP9X способствует его взаимодействию с TDRD3 и его антиапоптотической активности в клетках рака груди». Cell Discovery. 3: 16048. Дои:10.1038 / celldisc.2016.48. ЧВК 5206711. PMID 28101374.
- ^ Яннилли Ф., Зальфа Ф., Гартнер А., Баньи С., Дотти К.Г. (2013). «Цитоплазматический TERT ассоциируется с гранулами РНК в полностью зрелых нейронах: роль в трансляционном контроле ингибитора клеточного цикла p15INK4B». PLOS ONE. 8 (6): e66602. Bibcode:2013PLoSO ... 866602I. Дои:10.1371 / journal.pone.0066602. ЧВК 3688952. PMID 23825548.
- ^ Ли Ю., Джонсон П.Х., Сарпаранта Дж., Пальмио Дж., Саркар М., Вихола А., Эвила А., Суоминен Т., Пенттила С., Саварезе М., Джохари М., Майнот М.С., Хилтон-Джонс Д., Мэддисон П., Чинери П., Рейманн Дж. Корнблюм С., Крайа Т., Зирц С., Сью С., Гебель Х., Азфер А., Ральстон С.Х., Хакман П., Бучелли Р.С., Тейлор Дж. П., Вейл С. К., Удд Б. (март 2018 г.). «Вариант TIA1 управляет миодегенерацией при мультисистемной протеинопатии с мутациями SQSTM1». Журнал клинических исследований. 128 (3): 1164–1177. Дои:10.1172 / JCI97103. ЧВК 5824866. PMID 29457785.
- ^ Чанг В.Л., Тарн В.Й. (октябрь 2009 г.). «Роль транспортина в отложении ТТР на гранулы цитоплазматической РНК и распаде мРНК». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (19): 6600–12. Дои:10.1093 / nar / gkp717. ЧВК 2770677. PMID 19729507.
- ^ Guo L, Kim HJ, Wang H, Monaghan J, Freyermuth F, Sung JC, O'Donovan K, Fare CM, Diaz Z, Singh N, Zhang ZC, Coughlin M, Sweeny EA, DeSantis ME, Jackrel ME, Rodell CB, Бурдик Дж. А., Кинг О. Д., Гитлер А. Д., Лагье-Туренн С., Пандей У. Б., Чук Ю. М., Тейлор Дж. П., Шортер Дж. (Апрель 2018 г.). «Ядерные рецепторы обратных аберрантных фазовых переходов РНК-связывающих белков с прионоподобными доменами». Ячейка. 173 (3): 677–692.e20. Дои:10.1016 / j.cell.2018.03.002. ЧВК 5911940. PMID 29677512.
- ^ Хуанг Л., Ван З., Нараянан Н., Ян Ю. (апрель 2018 г.). «Метилирование аргинина С-концевого мотива RGG способствует активности топоизомеразы TOP3B и локализации стрессовых гранул». Исследования нуклеиновых кислот. 46 (6): 3061–3074. Дои:10.1093 / нар / gky103. ЧВК 5888246. PMID 29471495.
- ^ Schaefer M, Pollex T, Hanna K, Tuorto F, Meusburger M, Helm M, Lyko F (август 2010 г.). «Метилирование РНК с помощью Dnmt2 защищает РНК-переносчики от стресс-индуцированного расщепления». Гены и развитие. 24 (15): 1590–5. Дои:10.1101 / gad.586710. ЧВК 2912555. PMID 20679393.
- ^ Хуанг, Чую; Чен, Ян; Дай, Хуайцянь; Чжан, Хуань; Се Минъюй; Чжан, Ханьбинь; Чен, Фейлонг; Канг, Сянцзинь; Бай, Сяочунь (21.05.2019). «Метилирование аргинина UBAP2L с помощью PRMT1 модулирует сборку стрессовых гранул». Гибель клеток и дифференциация. 27 (1): 227–241. Дои:10.1038 / s41418-019-0350-5. ISSN 1476-5403. ЧВК 7205891. PMID 31114027.
- ^ Чирилло, Лука; Сирен, Аделина; Барбьери, София; Хонг, Энтони; Швагер, Франсуаза; Паркер, Рой; Надо, Моника (10.01.2020). «UBAP2L образует отчетливые ядра, которые действуют в зародышеобразующих стресс-гранулах перед G3BP1». Текущая биология. 30 (4): 698–707.e6. Дои:10.1016 / j.cub.2019.12.020. ISSN 1879-0445. PMID 31956030. S2CID 210597276.
- ^ Дао Т.П., Колайтис Р.М., Ким Х.Дж., О'Донован К., Мартыняк Б., Количино Е., Хенли Х., Тейлор Дж. П., Кастаньеда, Калифорния (март 2018 г.). «Убиквитин модулирует разделение жидкой и жидкой фаз UBQLN2 через нарушение поливалентных взаимодействий». Молекулярная клетка. 69 (6): 965–978.e6. Дои:10.1016 / j.molcel.2018.02.004. ЧВК 6181577. PMID 29526694.
- ^ а б c Кунду, Мондира; Тейлор, Дж. Пол; Пэн, Цзюньминь; Ким, Хон Джу; Фогель, Питер; Берторини, Тулио; Pruett-Miller, Shondra M .; Сакурада, Сэди Мики; Цюань, Хунху (2019-04-09). «ULK1 и ULK2 регулируют разборку стрессовых гранул посредством фосфорилирования и активации VCP / p97». Молекулярная клетка. 0 (4): 742–757.e8. Дои:10.1016 / j.molcel.2019.03.027. ISSN 1097-2765. ЧВК 6859904. PMID 30979586.
- ^ а б Xie X, Matsumoto S, Endo A, Fukushima T, Kawahara H, Saeki Y, Komada M (март 2018 г.). «Деубиквитиназы USP5 и USP13 задействуются и регулируют гранулы теплового стресса за счет деубиквитинирующей активности». Журнал клеточной науки. 131 (8): jcs210856. Дои:10.1242 / jcs.210856. PMID 29567855.
- ^ Бучан Дж. Р., Колайтис Р. М., Тейлор Дж. П., Паркер Р. (июнь 2013 г.). «Гранулы эукариотического стресса очищаются за счет аутофагии и функции Cdc48 / VCP». Ячейка. 153 (7): 1461–74. Дои:10.1016 / j.cell.2013.05.037. ЧВК 3760148. PMID 23791177.
- ^ Сомасекхаран С.П., Эль-Наггар А., Лепривье Дж., Ченг Х., Хаджи С., Грюневальд Т.Г., Чжан Ф., Нг Т., Делаттре О, Евдокимова В., Ван И, Глив М., Соренсен PH (март 2015 г.). «YB-1 регулирует образование стрессовых гранул и прогрессирование опухоли путем трансляционной активации G3BP1». Журнал клеточной биологии. 208 (7): 913–29. Дои:10.1083 / jcb.201411047. ЧВК 4384734. PMID 25800057.
- ^ а б c d Jaffrey, Samie R .; Ли, Джун Хи; Квак, Ходжун; Патил, Дипак П .; Брайан Ф. Пикеринг; Намкунг, Сим; Оларерин-Джордж, Энтони; Кляйн, Пьер; Заккара, Сара (10.07.2019). «m 6 A увеличивает потенциал разделения фаз мРНК». Природа. 571 (7765): 424–428. Дои:10.1038 / s41586-019-1374-1. ISSN 1476-4687. ЧВК 6662915. PMID 31292544.
- ^ а б c d Фу, Е; Чжуан, Сяовэй (25 мая 2020 г.). «m 6 A-связывающие белки YTHDF способствуют образованию стрессовых гранул». Природа Химическая Биология. 16 (9): 955–963. Дои:10.1038 / с41589-020-0524-у. ISSN 1552-4469. ЧВК 7442727. PMID 32451507.
- ^ Stöhr N, Lederer M, Reinke C, Meyer S, Hatzfeld M, Singer RH, Hüttelmaier S (ноябрь 2006 г.). «ZBP1 регулирует стабильность мРНК во время клеточного стресса». Журнал клеточной биологии. 175 (4): 527–34. Дои:10.1083 / jcb.200608071. ЧВК 2064588. PMID 17101699.
- ^ Deigendesch N, Koch-Nolte F, Rothenburg S (2006). «Субклеточная локализация ZBP1 и ассоциация со стрессовыми гранулами контролируются его связывающими доменами Z-ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (18): 5007–20. Дои:10.1093 / нар / gkl575. ЧВК 1636418. PMID 16990255.
- ^ Стоуклин Г., Стаббс Т., Кедерша Н., Вакс С., Ригби В.Ф., Блэквелл Т.К., Андерсон П. (март 2004 г.). «MK2-индуцированные комплексы тристетрапролина: 14-3-3 предотвращают ассоциацию стрессовых гранул и распад ARE-мРНК». Журнал EMBO. 23 (6): 1313–24. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600163. ЧВК 381421. PMID 15014438.
- ^ Холмс Б., Артиниан Н., Андерсон Л., Мартин Дж., Масри Дж., Клонингер С., Бернат А., Башир Т., Бенавидес-Серрато А., Гера Дж. (Январь 2012 г.). «Protor-2 взаимодействует с тристетрапролином для регулирования стабильности мРНК во время стресса». Сотовая связь. 24 (1): 309–15. Дои:10.1016 / j.cellsig.2011.09.015. ЧВК 3205320. PMID 21964062.
- ^ Мурата Т., Морита Н., Хикита К., Киучи К., Киучи К., Канеда Н. (февраль 2005 г.). «Привлечение мРНК-дестабилизирующего белка TIS11 к стрессовым гранулам опосредуется его доменом цинкового пальца». Экспериментальные исследования клеток. 303 (2): 287–99. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.09.031. PMID 15652343.
дальнейшее чтение
- Андерсон П., Кедерша Н. (март 2006 г.). «Гранулы РНК». Журнал клеточной биологии. 172 (6): 803–8. Дои:10.1083 / jcb.200512082. ЧВК 2063724. PMID 16520386.
- Кедерша Н., Андерсон П. (ноябрь 2002 г.). «Стресс-гранулы: сайты сортировки мРНК, которые регулируют стабильность и транслируемость мРНК». Сделки Биохимического Общества. 30 (Pt 6): 963–9. Дои:10.1042 / BST0300963. PMID 12440955. S2CID 2833183.
- молекулярные детали сборки и функции стрессовых гранул - Сандквист А., Систонен Л. (январь 2004 г.). «Гранулы ядерного стресса: пробуждение спящей красавицы?». Журнал клеточной биологии. 164 (1): 15–7. Дои:10.1083 / jcb.200311102. ЧВК 2171964. PMID 14709538.
внешняя ссылка
Лаборатории: