GGA2 - GGA2

GGA2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1MHQ
Идентификаторы
Псевдонимы	GGA2, VEAR, ассоциированный с Гольджи, гамма-адаптин, содержащий ухо, ARF-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 606005 MGI: 1921355 ГомолоГен: 22860 Генные карты: GGA2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16п12.2 Начните 23,463,542 бп[1] Конец 23,521,995 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F2 Начните 121,986,722 бп[2] Конец 122,021,222 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание фактора ADP-рибозилирования Сотовый компонент • эндосома • сеть транс-Гольджи • аппарат Гольджи • эндосомная мембрана • внутриклеточный • мембрана • везикула, покрытая клатрином • клатриновый адаптерный комплекс • мембрана ранней эндосомы Биологический процесс • транспорт белка • метаболический процесс клеточного белка • внутриклеточный транспорт белка • везикулярный транспорт • локализация белка на поверхности клетки • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23062	74105
Ансамбль	ENSG00000103365	ENSMUSG00000030872
UniProt	Q9UJY4	Q6P5E6
RefSeq (мРНК)	NM_015044	NM_028758
RefSeq (белок)	NP_055859	NP_083034
Расположение (UCSC)	Chr 16: 23.46 - 23.52 Мб	Chr 7: 121.99 - 122.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий фактор рибозилирования, GGA2 это белок что у людей кодируется GGA2 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства ARF-связывающих (GGA), локализованных по Гольджи, содержащих ухо гамма-адаптин. Это семейство включает в себя повсеместно распространенные белки оболочки, которые регулируют перемещение белков между транс-сетью Гольджи и лизосомой. Эти белки имеют общий амино-концевой домен VHS, который опосредует сортировку маннозо-6-фосфатных рецепторов в транс-сети Гольджи. Они также содержат карбокси-концевую область, гомологичную ушному домену гамма-адаптинов. Этот член семейства может играть важную роль в регуляции молекул груза и сборки покрытых клатрином везикул.^[7]

Взаимодействия

GGA2 показал себя взаимодействовать с участием RABEP1,^[8] Сортилин 1,^[9][10] BACE2^[11] и CLINT1.^[12][13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103365 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030872 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Херст Дж., Луи У. С., Брайт Н. А., Тотти Н., Матрос М. Н., Робинсон М. С. (апрель 2000 г.). «Семейство белков с гамма-адаптином и доменами VHS, которые облегчают перенос между сетью транс-Гольджи и вакуолью / лизосомой». Журнал клеточной биологии. 149 (1): 67–80. Дои:10.1083 / jcb.149.1.67. ЧВК  2175106. PMID  10747088.
6. Боман А.Л., Чжан СиДжей, Чжу Х, Кан Р.А. (апрель 2000 г.). «Семейство эффекторов фактора ADP-рибозилирования, которые могут изменять мембранный транспорт через транс-Гольджи». Молекулярная биология клетки. 11 (4): 1241–55. Дои:10.1091 / mbc.11.4.1241. ЧВК  14844. PMID  10749927.
7. «Ген Entrez: GGA2, связанный с гольджи, содержащий гамма-адаптин, ARF-связывающий белок 2».
8. Маттера Р., Ариги С. Н., Лодж Р., Зериал М., Бонифачино Д. С. (январь 2003 г.). «Двухвалентное взаимодействие GGA с комплексом Рабаптин-5-Рабекс-5». Журнал EMBO. 22 (1): 78–88. Дои:10.1093 / emboj / cdg015. ЧВК  140067. PMID  12505986.
9. Нильсен М.С., Мадсен П., Кристенсен Е.И., Никьяер А., Глиманн Дж., Каспер Д., Польманн Р., Петерсен С.М. (май 2001 г.). «Цитоплазматический хвост сортилина передает транспорт через эндосомы Гольджи и связывает домен VHS сортирующего белка GGA2». Журнал EMBO. 20 (9): 2180–90. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2180. ЧВК  125444. PMID  11331584.
10. Якобсен Л., Мадсен П., Нильсен М.С., Гераертс В.П., Глиманн Дж., Смит А.Б., Петерсен С.М. (январь 2002 г.). «Цитоплазматический домен sorLA взаимодействует с GGA1 и -2 и определяет минимальные требования для связывания GGA». Письма FEBS. 511 (1–3): 155–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. PMID  11821067. S2CID  21977507.
11. He X, Chang WP, Koelsch G, Tang J (июль 2002 г.). «Цитозольный домен мемапсина 2 (бета-секретаза) связывается с доменами VHS GGA1 и GGA2: влияние на механизм эндоцитоза мемапсина 2». Письма FEBS. 524 (1–3): 183–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. PMID  12135764. S2CID  42042430.
12. Васиак С., Лежандр-Гийемен В., Пуэртольяно Р., Блондо Ф., Жирар М., де Хёвель Е., Бойменю Д., Белл А. В., Бонифачино Дж. С., Макферсон П. С. (сентябрь 2002 г.). «Энтопротин: новый клатрин-связанный белок, идентифицированный с помощью субклеточной протеомики». Журнал клеточной биологии. 158 (5): 855–62. Дои:10.1083 / jcb.200205078. ЧВК  2173151. PMID  12213833.
13. Kalthoff C, Groos S, Kohl R, Mahrhold S, Ungewickell EJ (ноябрь 2002 г.). «Клинт: новый клатрин-связывающий белок-домен ENTH в Гольджи». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 4060–73. Дои:10.1091 / mbc.E02-03-0171. ЧВК  133614. PMID  12429846.

дальнейшее чтение

• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 6 (3): 197–205. Дои:10.1093 / днарес / 6.3.197. PMID  10470851.
• Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттес Мейс А., Цао Y, Сюй RX, Кан Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э. ПК, Вентер Дж. С., Адамс, доктор медицины (сентябрь 1999 г.). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID  10493829.
• Пуссу А., Лохи О., Лехто В.П. (март 2000 г.). "Vear, новый ассоциированный с Гольджи белок с VHS и гамма-адаптином" ушными "доменами". Журнал биологической химии. 275 (10): 7176–83. Дои:10.1074 / jbc.275.10.7176. PMID  10702286.
• Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (апрель 2000 г.). «GGA: семейство белков, связывающих фактор рибозилирования АДФ, связанных с адаптерами и связанных с комплексом Гольджи». Журнал клеточной биологии. 149 (1): 81–94. Дои:10.1083 / jcb.149.1.81. ЧВК  2175099. PMID  10747089.
• Такацу Х., Йошино К., Накаяма К. (май 2000 г.). «Адаптерный домен гомологии уха гамма консервативен в белках гамма-адаптина и GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 271 (3): 719–25. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID  10814529.
• Пуэртоллано Р., Рандаццо П.А., Пресли Дж. Ф., Хартнелл Л. М., Бонифачино Дж. С. (апрель 2001 г.). «GGAs способствуют ARF-зависимому привлечению клатрина в TGN». Ячейка. 105 (1): 93–102. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00299-9. PMID  11301005. S2CID  1158816.
• Нильсен М.С., Мадсен П., Кристенсен Э.И., Никьяер А., Глиманн Дж., Каспер Д., Полманн Р., Петерсен С.М. (май 2001 г.). «Цитоплазматический хвост сортилина передает транспорт через эндосомы Гольджи и связывает домен VHS сортирующего белка GGA2». Журнал EMBO. 20 (9): 2180–90. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2180. ЧВК  125444. PMID  11331584.
• Пуэртоллано Р., Агилар Р. К., Горшкова И., Крауч Р. Дж., Бонифачино Дж. С. (июнь 2001 г.). «Сортировка маннозо-6-фосфатных рецепторов, опосредованных GGA». Наука. 292 (5522): 1712–6. Дои:10.1126 / science.1060750. PMID  11387475. S2CID  30836125.
• Чжу Й., Дорей Б., Пуссу А., Лехто В. П., Корнфельд С. (июнь 2001 г.). «Связывание GGA2 с мотивом сортировки лизосомальных ферментов рецептора маннозы 6-фосфата». Наука. 292 (5522): 1716–8. Дои:10.1126 / science.1060896. PMID  11387476. S2CID  9453730.
• Такацу Х, Като Й, Сиба Й, Накаяма К. (июль 2001 г.). «Гольджи-локализующийся домен гомологии уха с гамма-адаптином, белки, связывающие фактор рибозилирования АДФ (GGA), взаимодействуют с кислыми дилейциновыми последовательностями в цитоплазматических доменах сортирующих рецепторов через свои домены Vps27p / Hrs / STAM (VHS)». Журнал биологической химии. 276 (30): 28541–5. Дои:10.1074 / jbc.C100218200. PMID  11390366.
• Якобсен Л., Мадсен П., Нильсен М.С., Гераертс В.П., Глиманн Дж., Смит А.Б., Петерсен С.М. (январь 2002 г.). «Цитоплазматический домен sorLA взаимодействует с GGA1 и -2 и определяет минимальные требования для связывания GGA». Письма FEBS. 511 (1–3): 155–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. PMID  11821067. S2CID  21977507.
• Дорей Б., Брунс К., Гош П., Корнфельд С. (май 2002 г.). «Взаимодействие катион-зависимого маннозо-6-фосфатного рецептора с белками GGA». Журнал биологической химии. 277 (21): 18477–82. Дои:10.1074 / jbc.M201879200. PMID  11886874.
• Такацу Х., Йошино К., Тода К., Накаяма К. (июль 2002 г.). «Белки GGA связываются с мембранами Гольджи посредством взаимодействия между их доменами GGAH и факторами ADP-рибозилирования». Биохимический журнал. 365 (Pt 2): 369–78. Дои:10.1042 / BJ20020428. ЧВК  1222692. PMID  11950392.
• He X, Chang WP, Koelsch G, Tang J (июль 2002 г.). «Цитозольный домен мемапсина 2 (бета-секретаза) связывается с доменами VHS GGA1 и GGA2: влияние на механизм эндоцитоза мемапсина 2». Письма FEBS. 524 (1–3): 183–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. PMID  12135764. S2CID  42042430.
• Васиак С., Лежандр-Гийемен В., Пуэртольяно Р., Блондо Ф., Жирар М., де Хёвель Е., Бойменю Д., Белл А. В., Бонифачино Дж. С., Макферсон П. С. (сентябрь 2002 г.). «Энтопротин: новый клатрин-связанный белок, идентифицированный с помощью субклеточной протеомики». Журнал клеточной биологии. 158 (5): 855–62. Дои:10.1083 / jcb.200205078. ЧВК  2173151. PMID  12213833.
• Kalthoff C, Groos S, Kohl R, Mahrhold S, Ungewickell EJ (ноябрь 2002 г.). «Клинт: новый клатрин-связывающий белок с доменом ENTH в Гольджи». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 4060–73. Дои:10.1091 / mbc.E02-03-0171. ЧВК  133614. PMID  12429846.