GMEB1 - GMEB1

GMEB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OQJ
Идентификаторы
Псевдонимы	GMEB1, P96PIF, PIF96, белок 1, модулирующий глюкокортикоидный элемент
Внешние идентификаторы	OMIM: 604409 MGI: 2135604 ГомолоГен: 10647 Генные карты: GMEB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п35.3 Начните 28,668,732 бп[1] Конец 28,719,353 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D2.3 Начните 132,221,025 бп[2] Конец 132,261,602 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ионов металлов • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10691	56809
Ансамбль	ENSG00000162419	ENSMUSG00000028901
UniProt	Q9Y692	Q9JL60
RefSeq (мРНК)	NM_006582 NM_024482 NM_001319674	NM_001122992 NM_020273
RefSeq (белок)	NP_001306603 NP_006573 NP_077808	NP_001116464 NP_064669
Расположение (UCSC)	Chr 1: 28.67 - 28.72 Мб	Chr 4: 132,22 - 132,26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий модуляторный элемент глюкокортикоидов 1 это белок что у людей кодируется GMEB1 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген является членом семейства генов KDWK. Продукт этого гена ассоциируется с белком GMEB2, и этот комплекс необходим для репликации ДНК парвовируса. Изучение гомолога крыс указывает на роль этого гена в модуляции трансактивации рецептором глюкокортикоидов, связанным с элементами ответа глюкокортикоидов. Существуют два альтернативных варианта сращивания транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

GMEB1 показал взаимодействовать с участием TRIM63.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162419 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028901 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Терио Дж. Р., Шарет С. Дж., Ламберт Х., Ландри Дж. (Июль 1999 г.). «Клонирование и характеристика hGMEB1, нового белка, связывающего модулирующий элемент глюкокортикоидов». FEBS Lett. 452 (3): 170–176. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00634-1. PMID  10386584.
6. Кристенсен Дж., Котмор С.Ф., Таттерсолл П. (ноябрь 1999 г.). «Два новых члена появляющегося семейства комбинаторных модуляторов транскрипции KDWK связываются как гетеродимер с гибко расположенными полусайтами PuCGPy». Mol Cell Biol. 19 (11): 7741–50. Дои:10.1128 / MCB.19.11.7741. ЧВК  84824. PMID  10523663.
7. «Ген Entrez: белок 1, связывающий модулирующий элемент глюкокортикоида GMEB1».
8. McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (2002). «Мышечно-специфический RING finger-1 взаимодействует с тайтином для регулирования саркомерной M-линии и структуры толстых филаментов и может выполнять ядерные функции через свое взаимодействие с глюкокортикоидным модулирующим элементом, связывающим белок-1». J Cell Biol. 157 (1): 125–136. Дои:10.1083 / jcb.200108089. ЧВК  2173255. PMID  11927605.

дальнейшее чтение

• Хименес-Лара AM, Хайне MJ, Гронемейер H (2000). «Клонирование белка, связывающего модулирующий элемент глюкокортикоидов мыши, нового члена семейства KDWK». FEBS Lett. 468 (2–3): 203–210. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01209-6. PMID  10692587.
• Цзэн Х., Каул С., Саймонс СС (2000). «Геномная организация GMEB-1 человека и GMEB-2 крысы: структурная консервация двух многофункциональных белков». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (8): 1819–1829. Дои:10.1093 / nar / 28.8.1819. ЧВК  102812. PMID  10734202.
• Каул С., Блэкфорд Дж.А., Чен Дж., Огрызко В.В., Саймонс СС (2000). «Свойства белков, связывающих модуляторный элемент глюкокортикоидов GMEB-1 и -2: потенциальные новые модификаторы трансактивации глюкокортикоидных рецепторов и члены семейства белков KDWK». Мол. Эндокринол. 14 (7): 1010–1027. Дои:10.1210 / мэ.14.7.1010. PMID  10894151.
• Бернетт Э, Кристенсен Дж, Таттерсолл П. (2002). «Консенсусный мотив узнавания ДНК для двух факторов транскрипции KDWK идентифицирует гибкие по длине, чувствительные к метилированию CpG родственные сайты связывания в большинстве промоторов человека». J. Mol. Биол. 314 (5): 1029–1039. Дои:10.1006 / jmbi.2000.5198. PMID  11743720.
• Каул С., Блэкфорд Дж. А., Чо С., Саймонс СС (2002). «Ubc9 - новый модулятор индукционных свойств рецепторов глюкокортикоидов». J. Biol. Chem. 277 (15): 12541–12549. Дои:10.1074 / jbc.M112330200. PMID  11812797.
• Surdo PL, Боттомли MJ, Sattler M, Scheffzek K (2004). «Анализ кристаллической структуры и ядерно-магнитного резонанса домена SAND из белка-1, связывающего модулирующий элемент глюкокортикоидов, выявляет области связывания дезоксирибонуклеиновой кислоты и цинка». Мол. Эндокринол. 17 (7): 1283–1295. Дои:10.1210 / me.2002-0409. PMID  12702733.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–1332. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Цурума К., Накагава Т., Сиракура Н., Хаяси Н., Уэхара Т., Номура Ю. (2005). «Регулирование прокаспазы-2 посредством глюкокортикоидного модулирующего элемента-связывающего белка 1 посредством взаимодействия с доменом рекрутирования каспазы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 325 (4): 1246–1251. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.145. PMID  15555560.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–1178. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Цурума К., Накагава Т., Моримото Н., Минами М., Хара Х., Уэхара Т., Номура Ю. (2006). «Белок 1, связывающий модулирующий глюкокортикоидный элемент, связывается с инициаторными прокаспазами и ингибирует апоптоз, вызванный ишемией, и повреждение нейронов». J. Biol. Chem. 281 (16): 11397–11404. Дои:10.1074 / jbc.M510597200. PMID  16497673.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–1292. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243.