TRIM63 - TRIM63

TRIM63
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3DDT, 4M3L, 2D8U
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM63, IRF, MURF1, MURF2, RNF28, SMRZ, трехчастный мотив, содержащий 63
Внешние идентификаторы	OMIM: 606131 MGI: 2447992 ГомолоГен: 41878 Генные карты: TRIM63
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.11 Начинать 26,051,304 бп[1] Конец 26,068,436 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D3 Начинать 134,315,120 бп[2] Конец 134,329,629 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание тайтина • активность преобразователя сигнала • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • Группа M • сократительное волокно • Z диск • микротрубочки • ядро клетки • внутриклеточный Биологический процесс • атрофия скелетных мышц • сокращение мышц • ответ на глюкокортикоиды • ответ на интерлейкин-1 • убиквитинирование белков • ответ на электрический стимул, участвующий в регуляции адаптации мышц • преобразование сигнала • отрицательная регуляция гипертрофии сердечной мышцы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84676	433766
Ансамбль	ENSG00000158022	ENSMUSG00000028834
UniProt	Q969Q1	Q38HM4
RefSeq (мРНК)	NM_032588	NM_001039048 NM_001369245
RefSeq (белок)	NP_115977	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 26.05 - 26.07 Мб	Chr 4: 134,32 - 134,33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза TRIM63, также известный как «MuRF1», является фермент что у людей кодируется TRIM63 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член семейства белков цинковых пальцев RING, обнаруженный в поперечно-полосатых мышцах и радужной оболочке. Продукт этого гена локализован в решетках Z-линии и M-линии миофибрилл, где N-концевые и C-концевые области тайтина соответственно связываются с саркомером. Исследования связывания in vitro показали, что этот белок также связывается непосредственно с тайтином рядом с областью активности киназы, содержащей тайтин. Другой член этого семейства белков связывается с микротрубочками. Поскольку эти члены семейства могут образовывать гетеродимеры, это предполагает, что эти белки могут служить связующим звеном между тайтинкиназой и микротрубочко-зависимыми сигнальными путями в мышцах.^[7]

Белок, кодируемый геном Trim63, также называется MuRF1. MuRF1 - это название, наиболее часто используемое в литературе, оно расшифровывается как «Muscle RING Finger 1». Структурно существует два тесно связанных MuRF, MuRF2 и MuRF3. У них также есть коды TRIM: MuRF2 - TRIM55; MuRF3 - это TRIM54.

Взаимодействия

Trim63 / MuRF1 оказался Убиквитинлигаза E3. Его основной субстрат - тяжелая цепь миозина. MuRF1 активируется во время атрофии скелетных мышц - и, следовательно, деградации тяжелой цепи миозина, которая является основным компонентом саркомер, является важным механизмом разрушения скелетных мышц в условиях атрофии. Было показано, что MuRF1 активируется во время денервации, введения глюкокортикоидов, иммобилизации и гипсовой повязки (когда на конечность накладывается гипсовая повязка для ее обездвиживания). Все эти методы лечения вызывают атрофию скелетных мышц.

TRIM63 был показан взаимодействовать с Титин,^[5] GMEB1^[8] и SUMO2.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158022 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028834 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Центнер Т., Яно Дж., Кимура Е., МакЭлхинни А.С., Пелин К., Витт С.К., Банг М.Л., Тромбитас К., Гранзье Х., Грегорио С.К., Соримачи Х., Лабейт С. (март 2001 г.). «Идентификация специфичных для мышц белков безымянного пальца как потенциальных регуляторов домена тайтинкиназы». Дж Мол Биол. 306 (4): 717–26. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4448. PMID  11243782.
6. Дай К.С., Лев CC (июнь 2001 г.). «Новый белок цинкового пальца RING поперечно-полосатой мышцы человека, SMRZ, взаимодействует с SMT3b через свой домен RING». J Biol Chem. 276 (26): 23992–9. Дои:10.1074 / jbc.M011208200. PMID  11283016.
7. "Entrez Gene: TRIM63 трехчастный мотив, содержащий 63".
8. McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (апрель 2002 г.). «Мышечно-специфический RING finger-1 взаимодействует с тайтином для регулирования саркомерной M-линии и структуры толстых филаментов и может выполнять ядерные функции посредством взаимодействия с глюкокортикоидным модулирующим элементом, связывающим белок-1». J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. Дои:10.1083 / jcb.200108089. ЧВК  2173255. PMID  11927605.

дальнейшее чтение

• Bodine SC, Latres E, Baumhueter S, et al. (2001). «Идентификация убиквитинлигаз, необходимых для атрофии скелетных мышц». Наука. 294 (5547): 1704–8. Дои:10.1126 / science.1065874. PMID  11679633.
• McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H и др. (2002). «Мышечно-специфический RING finger-1 взаимодействует с тайтином для регулирования саркомерной M-линии и структуры толстых филаментов и может выполнять ядерные функции через свое взаимодействие с глюкокортикоидным модулирующим элементом, связывающим белок-1». J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. Дои:10.1083 / jcb.200108089. ЧВК  2173255. PMID  11927605.
• Вистоу Г., Бернштейн С.Л., Рэй С. и др. (2002). «Анализ экспрессируемых последовательностей радужной оболочки глаза взрослого человека для проекта NEIBank: факторы стероидного ответа и сходство с пигментным эпителием сетчатки». Мол. Vis. 8: 185–95. PMID  12107412.
• Пизон В., Яковенко А., Ван Дер Вен П.Ф. и др. (2003). «Временная ассоциация тайтина и миозина с микротрубочками в формирующихся миофибриллах, управляемая белком MURF2 RING-finger». J. Cell Sci. 115 (Pt 23): 4469–82. Дои:10.1242 / jcs.00131. PMID  12414993.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кедар В., МакДоноу Х., Арья Р. и др. (2005). «Мышечно-специфическое кольцо пальца 1 представляет собой добросовестную убиквитинлигазу, которая разрушает сердечный тропонин I.» Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (52): 18135–40. Дои:10.1073 / pnas.0404341102. ЧВК  539735. PMID  15601779.
• Витт Ш., Гранзье Х., Витт С.С., Лабейт С. (2005). «MURF-1 и MURF-2 нацелены на определенную подгруппу миофибриллярных белков с избыточностью: к пониманию MURF-зависимого убиквитинирования мышц». J. Mol. Биол. 350 (4): 713–22. Дои:10.1016 / j.jmb.2005.05.021. PMID  15967462.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Дусет М., Рассел А.П., Леже Б. и др. (2007). «Передача сигналов атрофии и гипертрофии мышц у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких». Являюсь. J. Respir. Крит. Care Med. 176 (3): 261–9. Дои:10.1164 / rccm.200605-704OC. PMID  17478621.