Глицилпептид N-тетрадеканоилтрансфераза - Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase

глицилпептид N-тетрадеканоилтрансфераза
Субъединица N-миристоилтрансферазы, связанная с Myristoyl-CoA.png
Кристаллическая структура N-миристоилтрансферазы I типа человека с миристоил-КоА. Миристоил-КоА (красный). ID PDB: 3IU1
Идентификаторы
Номер ЕС2.3.1.97
Количество CAS110071-61-9
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
NMT, N-концевой
Идентификаторы
СимволNMT
PfamPF01233
ИнтерПроIPR022676
CATH3IU1
SCOP23IU1 / Объем / СУПФАМ
NMT, C-концевой
Идентификаторы
СимволNMT_C
PfamPF02799
ИнтерПроIPR022677

В энзимология, а глицилпептид N-тетрадеканоилтрансфераза (EC 2.3.1.97 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

тетрадеканоил-КоА + глицилпептид КоА + N-тетрадеканоилглицилпептид

Таким образом, два субстраты этого фермента тетрадеканоил-КоА и глицилпептид, а его два товары находятся CoA и N-тетрадеканоилглицилпептид. Участвует в N-Миристоилирование белков, а у позвоночных есть два изофермента NMT1 и NMT2.

Помимо тетрадеканоил-КоА, этот фермент также может использовать модифицированные версии этого субстрата.[1] В сетчатке человека еще более широкий спектр жирных кислот, включая 14: 1 n – 9, 14: 2 n – 6 и 12: 0, воспринимается ферментом и прививается ему. активаторы гуанилатциклазы.[2] Это в основном результат наличия в сетчатке особого набора субстратов жирных кислот-КоА.[3]

Номенклатура

Этот фермент принадлежит к семейству трансферазы, особенно те N-ацилтрансферазы переносящие группы, отличные от аминоацильных групп (cd04301). В систематическое название этого класса ферментов тетрадеканоил-КоА: глицилпептид N-тетрадеканоилтрансфераза. Другие широко используемые имена включают пептид N-миристоилтрансфераза (NMT), миристоил-КоА-протеин N-миристоилтрансфераза, миристоил-кофермент A: протеин-N-миристоилтрансфераза, миристоилирующие ферменты, и протеин N-миристоилтрансфераза.

Структурные исследования

На конец 2007 г. 9 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1IIC, 1IID, 1IYK, 1IYL, 1RXT, 2NMT, 2П6Э, 2П6Ф, и 2П6Г.

Фермент складывается в два домена, каждый с двойным EF-рука расположение.

Рекомендации

  1. ^ Heuckeroth RO, Towler DA, Adams SP, Glaser L, Gordon JI (1988). «11- (Этилтио) ундекановая кислота. Аналог миристиновой кислоты с измененной гидрофобностью, который является функциональным для N-миристоилирования пептида ацилтрансферазой зародышей пшеницы и дрожжей». J. Biol. Chem. 263 (5): 2127–33. PMID  3123489.
  2. ^ Рандл, Дана Р .; Rajala, Raju V.S .; Андерсон, Роберт Э. (июль 2002 г.). «Характеристика миристоил-КоА типа I и типа II: протеин N-миристоилтрансфераз с ацил-КоА, обнаруженными на гетерогенно ацилированных белках сетчатки». Экспериментальные исследования глаз. 75 (1): 87–97. Дои:10.1006 / exer.2002.1189. PMID  12123640.
  3. ^ Bereta, G; Пальчевский, К. (10 мая 2011 г.). «Гетерогенное N-концевое ацилирование белков сетчатки является результатом необычного липидного метаболизма сетчатки». Биохимия. 50 (18): 3764–76. Дои:10.1021 / bi200245t. ЧВК  3086940. PMID  21449552.
  • Гертин Д., Гриз-Мирон Л., Риендо Д. (1986). «Идентификация акцептора жирной ацильной цепи полипептида 51 килодальтон в растворимых экстрактах из сердечной ткани мыши». Biochem. Cell Biol. 64 (12): 1249–55. Дои:10.1139 / o86-164. PMID  3566958.