HECW1 - HECW1 - Wikipedia

HECW1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3L4H
Идентификаторы
Псевдонимы	HECW1, NEDL1, HECT, C2 и WW домен, содержащий E3 убиквитин протеин лигазу 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610384 MGI: 2444115 ГомолоГен: 9004 Генные карты: HECW1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7п14.1-п13 Начинать 43,112,629 бп[1] Конец 43,566,001 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A1 | 13 5,29 см Начинать 14,226,438 бп[2] Конец 14,523,228 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • негативная регуляция канонического сигнального пути Wnt • убиквитинирование белков • протеасомно-опосредованный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • полиубиквитинирование белков • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • положительная регуляция белкового катаболического процесса • регуляция морфогенеза дендритов • отрицательная регуляция активности трансмембранного переносчика ионов натрия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23072	94253
Ансамбль	ENSG00000002746	ENSMUSG00000021301
UniProt	Q76N89	Q8K4P8
RefSeq (мРНК)	NM_001287059 NM_015052	NM_001081348 NM_153130 NM_178809
RefSeq (белок)	NP_001273988 NP_055867	NP_001074817
Расположение (UCSC)	Chr 7: 43,11 - 43,57 Мб	Chr 13: 14.23 - 14.52 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Домен HECT, C2 и WW, содержащий убиквитин-протеинлигазу 1 E3 это белок что у человека кодируется HECW1 ген.^[5] У человека это 1606 аминокислоты (179,5 кДа) и изоэлектрическая точка из 5.18.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000002746 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021301 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: домен HECT, C2 и WW, содержащий E3 убиквитин протеин-лигазу 1».
6. Козловский Л.П. (октябрь 2016 г.). «IPC - Калькулятор изоэлектрической точки». Биология Директ. 11 (1): 55. Дои:10.1186 / s13062-016-0159-9. ЧВК  5075173. PMID  27769290. Архивировано из оригинал на 2013-04-29. Получено 2020-01-06.

дальнейшее чтение

• Миядзаки К., Фудзита Т., Одзаки Т., Като С., Куросе Й., Сакамото М., Като С., Гото Т., Итояма Ю., Аоки М., Накагавара А. (март 2004 г.). «NEDL1, новая убиквитин-протеиновая изопептидная лигаза для disheveled-1, нацелена на мутантную супероксиддисмутазу-1». Журнал биологической химии. 279 (12): 11327–35. Дои:10.1074 / jbc.M312389200. PMID  14684739.
• Чансард М., Ван Дж., Тран ХК, Ноймайер Дж., Шим С.Ю., Пак Ю, Белзил С., Ле ХТ, Парк СК, Нгуен, доктор медицины (январь 2011 г.). «Цитоскелетный белок Ndel1 регулирует активность ГТФазы динамина 2». PLOS ONE. 6 (1): e14583. Дои:10.1371 / journal.pone.0014583. ЧВК  3026782. PMID  21283621.
• Шерва Р., Триподис Ю., Беннетт Д.А., Чибник Л.Б., Крейн П.К., де Ягер П.Л., Фаррер Л.А., Сайкин А.Дж., Шульман Д.М., Надж А., Грин Р. «Общегеномное ассоциативное исследование скорости снижения когнитивных функций при болезни Альцгеймера». Болезнь Альцгеймера и деменция. 10 (1): 45–52. Дои:10.1016 / j.jalz.2013.01.008. ЧВК  3760995. PMID  23535033.
• Ли Й, Одзаки Т., Кикучи Х., Ямамото Х., Охира М., Накагавара А. (июнь 2008 г.). «Новая убиквитин-протеинлигаза E3 HECT-типа NEDL1 усиливает p53-опосредованную апоптотическую гибель клеток своим независимым от каталитической активности образом». Онкоген. 27 (26): 3700–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1211032. PMID  18223681.
• Харви К.Ф., Динудом А., Кук Д.И., Кумар С. (март 2001 г.). «Nedd4-подобный белок KIAA0439 является потенциальным регулятором эпителиального натриевого канала». Журнал биологической химии. 276 (11): 8597–601. Дои:10.1074 / jbc.C000906200. PMID  11244092.
• Чжан Л., Харагути С., Кода Т., Хашимото К., Накагавара А. (2011). «Атрофия мышц и дегенерация двигательных нейронов у трансгенных мышей человека NEDL1». Журнал биомедицины и биотехнологии. 2011: 1–7. Дои:10.1155/2011/831092. ЧВК  2952905. PMID  20976258.
• Цуй И, Хе С, Син Ц, Лу К., Ван Дж, Син Дж, Мэн А, Цзя С., Хе Ф, Чжан Л. (май 2011 г.). «SCFFBXL¹⁵ регулирует передачу сигналов BMP, направляя деградацию убиквитинлигазы HECT-типа Smurf1». Журнал EMBO. 30 (13): 2675–89. Дои:10.1038 / emboj.2011.155. ЧВК  3155294. PMID  21572392.
• Шинада К., Цукияма Т., Шо Т., Окумура Ф., Асака М., Хатакеяма С. (январь 2011 г.). «RNF43 взаимодействует с NEDL1 и регулирует транскрипцию, опосредованную p53». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 404 (1): 143–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2010.11.082. HDL:2115/44929. PMID  21108931.
• Левин Д.М., Эк ВЕ, Чжан Р., Лю Х, Онстад Л., Сатер К., Лао-Сириейкс П., Гаммон, доктор медицины, Корли Д.А., Шахин Нью-Джерси, Берд Н. Нирен О, Йе В., Лю Джи, Ромеро И., Бернштейн Л., Ву А.Х., Кассон А.Г., Чанок С.Дж., Харрингтон П., Калдас И., Дебирам-Бичем И., Калдас С., Хейворд Н.К., Фараон П.Д., Фицджеральд Р.К., Макгрегор С. Whiteman DC, Vaughan TL (декабрь 2013 г.). «Полногеномное исследование ассоциации выявляет новые локусы восприимчивости к аденокарциноме пищевода и пищеводу Барретта». Природа Генетика. 45 (12): 1487–93. Дои:10.1038 / ng.2796. ЧВК  3840115. PMID  24121790.