HIST1H2AK - HIST1H2AK

H2AC15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4QYL, 5кгф
Идентификаторы
Псевдонимы	H2AC15, H2A / d, H2AFD, гистоновый кластер 1, H2ak, гистоновый кластер 1 H2A член семейства k, HIST1H2AK, H2A-кластерный гистон 15, H2AC11, H2AC14, H2AC17, H2AC16, H2AC13, H2A.1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602788 MGI: 2448287 ГомолоГен: 134305 Генные карты: H2AC15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.1 Начинать 27,837,947 бп[1] Конец 27,838,339 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ферментов • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков Сотовый компонент • ядерный хроматин • нуклеосома • внеклеточная экзосома • ядро клетки • хромосома Биологический процесс • подавление хроматина • организация хроматина • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8330	319164
Ансамбль	ENSG00000275221	н / д
UniProt	P0C0S8	C0HKE2 B2RVF0 C0HKE1 C0HKE3 C0HKE4 C0HKE5 C0HKE6 C0HKE7 C0HKE8 C0HKE9
RefSeq (мРНК)	NM_003510	NM_178189
RefSeq (белок)	NP_066408 NP_003505	NP_001171015.1 NP_783591.2 NP_835489.1 NP_835491.1 NP_835492.1 NP_835493.1 NP_835494.1 NP_835495.1 NP_835496.1 NP_835493 NP_835496 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835492 NP_835491 NP_783591 NP_001171015 NP_783591 NP_835493 NP_835496 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835489 NP_001171015 NP_835496 NP_835491 NP_835493 NP_835494 NP_835495 NP_835492 NP_783591 NP_835494 NP_835489 NP_835495 NP_835491 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_835495 NP_835489 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_835492 NP_835491 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_835491 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835492 NP_783591 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_783591 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_001171015 NP_835493 NP_835496 NP_783591 NP_835489 NP_835495 NP_835494 NP_835491 NP_835492 NP_001171015 NP_835493 NP_835496
Расположение (UCSC)	Chr 6: 27,84 - 27,84 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H2A типа 1 это белок что у людей кодируется HIST1H2AK ген.^[4][5][6]

Гистоны основные ядерные белки которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна в эукариоты. Два молекулы каждого из четырех ядерных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которых примерно 146 п.н. ДНК упакован в повторяющиеся единицы, называемые нуклеосомы. Линкерный гистон H1 взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и функционирует в уплотнении хроматин в структуры более высокого порядка. Этот ген не имеет интронов и кодирует члена семейства гистонов H2A. Транскрипты этого гена лишены полиА-хвостов, но вместо этого содержат палиндромный терминатор. Этот ген находится в небольшом кластере гистоновых генов на хромосоме 6p22-p21.3.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000275221 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Альбиг В., Денеке Д. (февраль 1998 г.). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Hum Genet. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656. S2CID  38539096.
5. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
6. «Энтрез Ген: гистоновый кластер 1 HIST1H2AK, H2ak».

дальнейшее чтение

• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Альбиг В., Траппе Р., Кардалину Э. и др. (1999). «Комплемент гистонового гена H2A и H2B человека». Биол. Chem. 380 (1): 7–18. Дои:10.1515 / BC.1999.002. PMID  10064132. S2CID  12807248.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 за счет ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Чжан Ю., Гриффин К., Мондал Н., Парвин Дж. Д. (2004). «Фосфорилирование гистона H2A ингибирует транскрипцию на матрице хроматина». J. Biol. Chem. 279 (21): 21866–72. Дои:10.1074 / jbc.M400099200. PMID  15010469.
• Айхара Х., Накагава Т., Ясуи К. и др. (2004). «Нуклеосомная гистинкиназа-1 фосфорилирует H2A Thr 119 во время митоза в раннем эмбрионе дрозофилы». Genes Dev. 18 (8): 877–88. Дои:10.1101 / gad.1184604. ЧВК  395847. PMID  15078818.
• Ван Х, Ван Л., Эрдджумент-Бромаж Х и др. (2004). «Роль убиквитинирования гистона H2A в сайленсинге Polycomb». Природа. 431 (7010): 873–8. Bibcode:2004 Натур.431..873Вт. Дои:10.1038 / природа02985. PMID  15386022. S2CID  4344378.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Хагивара Т., Хидака Ю., Ямада М. (2005). «Удаление гистона H2A и H4 по аргинину 3 в гранулоцитах HL-60». Биохимия. 44 (15): 5827–34. Дои:10.1021 / bi047505c. PMID  15823041.
• Bonenfant D, Coulot M, Towbin H и др. (2006). «Характеристика вариантов гистона H2A и H2B и их посттрансляционных модификаций с помощью масс-спектрометрии». Мол. Клетка. Протеомика. 5 (3): 541–52. Дои:10.1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID  16319397.
• Цао Р, Цукада Й, Чжан И (2006). «Роль Bmi-1 и Ring1A в убиквитилировании H2A и подавлении гена Hox». Мол. Клетка. 20 (6): 845–54. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.12.002. PMID  16359901.
• Boyne MT, Pesavento JJ, Mizzen CA, Kelleher NL (2006). «Точная характеристика гистонов человека в семействе генов H2A с помощью масс-спектрометрии сверху вниз». J. Proteome Res. 5 (2): 248–53. Дои:10.1021 / pr050269n. PMID  16457589.
• Бергинк С., Саломонс Ф.А., Хугстратен Д. и др. (2006). «Повреждение ДНК запускает зависимое от эксцизионной репарации нуклеотидное моноубиквитилирование гистона H2A». Genes Dev. 20 (10): 1343–52. Дои:10.1101 / gad.373706. ЧВК  1472908. PMID  16702407.