HIST1H2BD - HIST1H2BD

H2BC5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5кгф
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BC5, H2B.1B, H2B / b, H2BFB, HIRIP2, dJ221C16.6, гистоновый кластер 1, H2bd, гистоновый кластер 1, член семейства H2B d, H2BFG, H2BFL, H2B / k, H2B / l, H2B / h, H2BFK, HIST1H2BE , HIST1H2BC, HIST1H2BG, HIST1H2BI, H2BFA, H2BFH, H2B / a, H2B / g, HIST1H2BF, HIST1H2BD, кластерный гистон H2B 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602799 MGI: 1925553 ГомолоГен: 134740 Генные карты: H2BC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.2 Начните 26,158,146 бп[1] Конец 26,171,349 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • хромосома • нуклеосома • внеклеточная экзосома • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль • внеклеточный Биологический процесс • сборка нуклеосом • убиквитинирование белков • врожденный иммунный ответ слизистой оболочки • защитный ответ на бактерию • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3017	78303
Ансамбль	ENSG00000158373	н / д
UniProt	P58876 P62807	Q9D2U9
RefSeq (мРНК)	NM_021063 NM_138720	NM_030082
RefSeq (белок)	NP_066407 NP_619790 NP_003517 NP_001368918	NP_084358
Расположение (UCSC)	Chr 6: 26.16 - 26.17 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H2B типа 1-D это белок что у людей кодируется HIST1H2BD ген.^[4][5][6]

Гистоны основные ядерные белки которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна в эукариот. Нуклеосомы состоят из приблизительно 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг октамера гистонов, состоящего из пар каждого из четырех ядерных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). В хроматин Волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка. Этот ген не имеет интронов и кодирует члена семейства гистонов H2B. Два транскрипта, кодирующие один и тот же белок, были идентифицированы для этого гена, который обнаружен в большом кластере гистоновых генов на хромосоме 6p22-p21.3.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158373 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Альбиг В., Кардалину Е., Драбент Б., Циммер А., Денеке Д. (ноябрь 1991 г.). «Изоляция и характеристика двух гистоновых генов человека H1 в кластерах основных гистоновых генов». Геномика. 10 (4): 940–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-Ф. PMID  1916825.
5. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
6. «Ген Entrez: гистоновый кластер 1 HIST1H2BD, H2bd».

дальнейшее чтение

• Альбиг В., Киошис П., Поустка А. и др. (1997). «Организация гена гистонов человека: нерегулярное расположение в большом кластере». Геномика. 40 (2): 314–22. Дои:10.1006 / geno.1996.4592. PMID  9119399.
• Альбиг В., Доенеке Д. (1998). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Гм. Genet. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656. S2CID  38539096.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека, ассоциированного с хроматином». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Лорейн С., Куиви Дж. П., Монье-Гавел Ф. и др. (1998). «Ядровые гистоны и HIRIP3, новый белок, связывающий гистоны, напрямую взаимодействуют с белком-повторов WD HIRA». Мол. Cell. Биол. 18 (9): 5546–56. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5546. ЧВК  109139. PMID  9710638.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чунг В.Л., Аджиро К., Самедзима К. и др. (2003). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредуется стерильной двадцать киназой млекопитающих». Ячейка. 113 (4): 507–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00355-6. PMID  12757711. S2CID  21854.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). «Ингибирование ацетилирования ядер гистонов канцерогенным никелем (II)». Мол. Cell. Биохим. 279 (1–2): 133–9. Дои:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID  16283522. S2CID  25071586.
• Zhu B, Zheng Y, Pham AD, et al. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B человека: вовлеченные факторы и их роль в регуляции гена HOX». Мол. Ячейка. 20 (4): 601–11. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID  16307923.
• Bonenfant D, Coulot M, Towbin H и др. (2006). «Характеристика вариантов гистона H2A и H2B и их посттрансляционных модификаций с помощью масс-спектрометрии». Мол. Cell. Протеомика. 5 (3): 541–52. Дои:10.1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID  16319397.
• Сиути Н., Рот М.Дж., Миззен С.А. и др. (2006). «Ген-специфическая характеристика человеческого гистона H2B путем диссоциации электронного захвата». J. Proteome Res. 5 (2): 233–9. Дои:10.1021 / pr050268v. PMID  16457587.
• Beck HC, Nielsen EC, Matthiesen R et al. (2006). «Количественный протеомный анализ посттрансляционных модификаций гистонов человека». Мол. Cell. Протеомика. 5 (7): 1314–25. Дои:10.1074 / mcp.M600007-MCP200. PMID  16627869.
• Паври Р., Чжу Б., Ли Г. и др. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B действует совместно с FACT, регулируя удлинение с помощью РНК-полимеразы II». Ячейка. 125 (4): 703–17. Дои:10.1016 / j.cell.2006.04.029. PMID  16713563. S2CID  2614680.