HIST1H3F - HIST1H3F

H3C7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4LLB, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4HON, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3КМТ, 4YM6, 4A7J, 3UEE, 2кВт, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4ЛКА, 5CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3АЖ, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2кВтДж, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4YM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3СОУ, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2Б2У, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Идентификаторы
Псевдонимы	H3C7, H3 / i, H3FI, гистоновый кластер 1, H3f, гистоновый кластер 1 Член семейства H3 f, кластерный гистон 7 H3, HIST1H3F, H3C4, H3C12, H3C2, H3C8, H3C10, H3C3, H3C6, H3C1, H3C11
Внешние идентификаторы	OMIM: 602816 MGI: 2448350 ГомолоГен: 134472 Генные карты: H3C7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.2 Начните 26,250,195 бп[1] Конец 26,250,605 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание гистонов • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание кадгерина • связывание нуклеосомной ДНК Сотовый компонент • ядерная нуклеосома • мембрана • нуклеоплазма • хромосома • внеклеточная область • ядерная хромосома • внеклеточная экзосома • ядерная хромосома, теломерная область • нуклеосома • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • теломерная организация • метаболический процесс клеточного белка • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • гетеротетрамеризация белков • коагуляция крови • Сборка нуклеосом, зависимая от репликации ДНК • регуляция сайленсинга генов • подавление хроматина на рДНК • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • организация хроматина • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • сборка нуклеосом • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-7 • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8968	319153
Ансамбль	ENSG00000277775	н / д
UniProt	P68431	P68433
RefSeq (мРНК)	NM_021018	NM_178207
RefSeq (белок)	NP_066298 NP_003520 NP_003525 NP_003527	NP_835513 NP_835514 NP_038578 NP_659539
Расположение (UCSC)	Chr 6: 26.25 - 26.25 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H3.1 это белок что у людей кодируется HIST1H3F ген.^[4][5][6]

Гистоны основные ядерные белки, которые отвечают за нуклеосома структура хромосомного волокна в эукариоты. Эта структура состоит примерно из 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг нуклеосомы, октамера, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3, и H4 ). В хроматин Волокно дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка. Этот ген без интронов и кодирует член семейства гистонов H3. Транскрипты этого гена отсутствуют. полиА хвосты; вместо этого они содержат палиндромный завершающий элемент. Этот ген находится в большом кластере гистоновых генов на хромосома 6p 22-п. 21.3.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000277775 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Альбиг В., Киошис П., Поустка А., Меерганс К., Денеке Д. (апрель 1997 г.). «Организация гена гистонов человека: нерегулярное расположение в большом кластере». Геномика. 40 (2): 314–22. Дои:10.1006 / geno.1996.4592. PMID  9119399.
5. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
6. «Ген Entrez: HIST1H3F гистоновый кластер 1, H3f».

дальнейшее чтение

• Альбиг В., Кардалину Э., Драбент Б. и др. (1991). «Изоляция и характеристика двух гистоновых генов человека H1 в кластерах основных гистоновых генов». Геномика. 10 (4): 940–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-Ф. PMID  1916825.
• Альбиг В., Доенеке Д. (1998). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Гм. Genet. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656. S2CID  38539096.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Ри С., Эйзенхабер Ф., О'Кэрролл Д. и др. (2000). «Регуляция структуры хроматина с помощью сайт-специфичных гистоновых H3-метилтрансфераз». Природа. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000Натурал.406..593р. Дои:10.1038/35020506. PMID  10949293. S2CID  205008015.
• Hsu JY, Sun ZW, Li X и др. (2000). «Митотическое фосфорилирование гистона H3 регулируется Ipl1 / aurora киназой и Glc7 / PP1 фосфатазой у почкующихся дрожжей и нематод». Ячейка. 102 (3): 279–91. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00034-9. PMID  10975519. S2CID  16057773.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С. и др. (2001). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Натур.410..116л. Дои:10.1038/35065132. PMID  11242053. S2CID  4331863.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Ян Л., Ся Л., Ву Д.Й. и др. (2002). «Молекулярное клонирование ESET, новой гистон-H3-специфической метилтрансферазы, которая взаимодействует с фактором транскрипции ERG». Онкоген. 21 (1): 148–52. Дои:10.1038 / sj.onc.1204998. PMID  11791185.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сяо Б., Цзин С., Уилсон Дж. Р. и др. (2003). «Структура и каталитический механизм гистонметилтрансферазы человека SET7 / 9» (PDF). Природа. 421 (6923): 652–6. Bibcode:2003Натура.421..652X. Дои:10.1038 / природа01378. PMID  12540855. S2CID  4423407.
• Koessler H, Doenecke D, Albig W (2003). «Аберрантный паттерн экспрессии зависимых от репликации генов подтипа гистона h3 в линиях опухолевых клеток человека». ДНК клетки биол. 22 (4): 233–41. Дои:10.1089/104454903321908629. PMID  12823900.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Couture JF, Collazo E, Hauk G, Trievel RC (2006). «Структурная основа специфичности сайта метилирования SET7 / 9». Nat. Struct. Мол. Биол. 13 (2): 140–6. Дои:10.1038 / nsmb1045. PMID  16415881. S2CID  38483056.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.