HLA-B52 - HLA-B52

Иллюстрация HLA-B с пептидом в связывающем кармане.
B * 5101-β2MG со связанным пептидом 1e27
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B52
АллелиВ * 5201, 5202, 5203,. . .
Структура (Видеть HLA-B )
Общие данные
Locuschr.6 6п21.31

HLA-B52 (B52) - это HLA -B серотип. Серотип определяет наиболее распространенные генные продукты HLA-B * 52.[1]

B52 - это расщепленный антиген из широкий антиген B5, и является сестринским типом B51. B * 5201, вероятно, образовался в результате преобразование гена событие между другим аллелем HLA-B и HLA-B * 5101.[2]В группе аллелей B * 52 имеется ряд аллелей.[3]

Серотип

Серотипы B52, B5, B51 и B53 распознавание продукта гена HLA B * 5201[4]
В * 52B52B5B51B53Образец
аллель%%%%размер (N)
*5201842712823
Ссылка на все аллели на IMGT /HLA База данных на EBI
HLA * 5201 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[5]Китай Юньнань Лису21.7
[5]Китай Юньнань Ну18.6
[5]Болгария цыганская18.2
[5]Венесуэла Сьерра-де-Периха Юкпа12.8
[5]Индия Андхра-Прадеш Голла12.0
[5]Япония Центральная10.7
[5]Япония10.4
[5]Грузия Тибилиси Курды10.3
[5]Мали Бандиагара8.3
[5]Южная Африка Натал Тамил8.2
[5]Израиль Ашк. и не-ашк. Евреи7.3
[5]Индусы Северной Индии6.7
[5]Китай Пекин6.1
[5]Индия Нью-Дели6.1
[5]Индия Мумбаи Маратхи5.6
[5]Тунис Ганнуш5.5
[5]Таиланд pop35.1
[5]Парсы западного побережья Индии5.0
[5]Индия Северный Дели4.9
[5]Мексика Местис4.9
[5]Аргентина Тоба Росарио4.7
[5]Мексика Zaptotec Oaxaca4.5
[5]США испаноязычный4.5
[5]Китай Цинхай Хуэй4.1
[5]Китай Внутренняя Монголия3.9
[5]Китай Северная Хань3.8
[5]Оман3.8
[5]Сенегал Ниохоло Манденка3.7
[5]Болгария3.6
[5]Таиланд3.5
[5]Кот-д'Ивуар Akan Adiopodoume3.4
[5]Венесуэла Перха Гора Бари3.4
[5]Италия Северная поп 13.3
[5]Суданский3.3
[5]румынский3.2
[5]Сингапур Риау Малайский3.0
[5]Автономный регион Тибетцы2.8
[5]Россия Тува поп 22.8
[5]Южная Корея поп 32.8
[5]Иран Белудж2.5
[5]Тунис2.5
[5]Иордания Амман2.4
[5]США Гавайи Окинава2.4
[5]Сингапурские яванские индонезийцы2.0
[5]Испания Восточная Андалусия1.8
[5]Македония поп 41.6
[5]Уганда Кампала1.6
[5]Бельгия1.5
[5]Мексика Гвадалахара Mestizos pop21.5
[5]Сингапур Тайский1.5
[5]Бразилия1.4
[5]Китай Юньнань Лису1.4
[5]Азорские острова Санта-Мария и Сан-Мигель1.3
[5]Юго-Восток Франции1.2
[5]Италия Северная Павия1.2
[5]Саудовская Аравия Guraiat and Hail1.2
[5]Мексика Штат Чиуауа Тараумара1.1
[5]Тунис Тунис1.1
[5]Израильские арабские друзы1.0
[5]Япония Айну Хоккайдо1.0
[5]Центр Португалии1.0
[5]Сингапурский китайский1.0
[5]Тайвань Миннан поп 11.0
[5]США Кавказский1.0
[5]Центральные острова Азорских островов0.9
[5]Китай Южный Хан0.9
[5]Македония поп 40.7
[5]Марокко Надор Металса Класс I0.7
[5]Грузия Сванети Сваны0.6
[5]Южная Ирландия0.6
[5]Италия Бергамо0.6

Аллели

Имеется 18 аллелей с 14 вариантами аминокислотной последовательности в B52. Из них только 9 встречаются достаточно часто, чтобы иметь надежный серотип. В * 5201 является наиболее распространенным, но другие имеют большое региональное распространение.

Болезнь

При язвенном колите

HLA-B52, по-видимому, имеет самую сильную связь с язвенный колит в Японии.[6][7] Эта форма заболевания часто встречается при Артериит Такаясу.[8][9]

При артериите Такаясу

Артериит Такаясу имеет независимую связь с заболеванием, ассоциированным с B52.[10][11] Связь с B * 5201 увеличивает риск легочного инфаркт, ишемическая болезнь сердца, аортальная регургитация, системный гипертония, стеноз почечной артерии, цереброваскулярное заболевание и нарушение зрения.[12]

Рекомендации

  1. ^ Marsh, S.G .; Альберт, Э. Д .; Bodmer, W. F .; Bontrop, R.E .; Dupont, B .; Erlich, H.A .; Fernández-Viña, M .; Герати, Д. Э .; Holdsworth, R .; Hurley, C.K .; Lau, M .; Lee, K. W .; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, W. R .; Müller, C.R .; Parham, P .; Petersdorf, E.W .; Сасадзуки, Т .; Strominger, J. L .; Svejgaard, A .; Terasaki, P. I .; Tiercy, J.M .; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010». Тканевые антигены. 75 (4): 291–455. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x. ЧВК  2848993. PMID  20356336.
  2. ^ Кокс С.Т., Маквинни А.Дж., Робинсон Дж. И др. (Январь 2003 г.). «Клонирование и секвенирование полноразмерных генов HLA-B и -C» (PDF). Тканевые антигены. 61 (1): 20–48. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.610103.x. PMID  12622774. Архивировано из оригинал (PDF) на 2008-10-28. Получено 2008-08-03.
  3. ^ Хаяси Х., Эннис П.Д., Арига Х. и др. (Январь 1989 г.). «HLA-B51 и HLA-Bw52 отличаются только двумя аминокислотами, которые находятся в спиральной области домена альфа 1». J. Immunol. 142 (1): 306–11. PMID  2909619.
  4. ^ получено из IMGT / HLA
  5. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний ау топор ай az ба bb до н.э bd быть парень bg бх би Ъ bk бл бм млрд бо бп бк br bs Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net ". Тканевые антигены. 61 (5): 403–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660. Внешняя ссылка в | название = (помощь)
  6. ^ Сугимура К., Асакура Х., Мизуки Н. и др. (Февраль 1993 г.). «Анализ генов в области HLA, влияющих на предрасположенность к язвенному колиту». Гм. Иммунол. 36 (2): 112–8. Дои:10.1016 / 0198-8859 (93) 90113-Ф. PMID  8096500.
  7. ^ Номура Э., Киноути Ю., Негоро К. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Картирование локуса восприимчивости к болезни в хромосоме 6p у японских пациентов с язвенным колитом». Гены иммунной. 5 (6): 477–83. Дои:10.1038 / sj.gene.6364114. PMID  15215890.
  8. ^ Оянаги, Хиронобу; Ishihata, R; Ishikawa, H; и другие. (Февраль 1994 г.), «Язвенный колит, связанный с болезнью Такаясу», Междунар. Med., 33 (2): 127–129, Дои:10.2169 / internalmedicine.33.127, PMID  7912572
  9. ^ Сато, Р. Сато, Y; Ishikawa, H; и другие. (Декабрь 1994 г.), «Болезнь Такаясу, связанная с язвенным колитом», Междунар. Med., 33 (12): 759–763, Дои:10.2169 / internalmedicine.33.759, PMID  7718956
  10. ^ Кимура А., Китамура Х, Дэйт У, Нумано Ф (август 1996). «Комплексный анализ генов HLA при артериите Такаясу в Японии». Int. Дж. Кардиол. 54 Дополнение: S61–9. Дои:10.1016 / s0167-5273 (96) 88774-2. PMID  9119528.
  11. ^ Йошида М., Кимура А., Кацураги К., Нумано Ф., Сасадзуки Т. (август 1993 г.). «Типирование ДНК гена HLA-B при артериите Такаясу». Тканевые антигены. 42 (2): 87–90. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1993.tb02242.x. PMID  7903491.
  12. ^ Китамура Х., Кобаяши Й., Кимура А., Нумано Ф. (октябрь 1998 г.). «Ассоциация клинических проявлений с аллелями HLA-B при артериите Такаясу». Int. Дж. Кардиол. 66 Приложение 1: S121–6. Дои:10.1016 / S0167-5273 (98) 00159-4. PMID  9951811.