HMGN1 - HMGN1

HMGN1
Идентификаторы
Псевдонимы	HMGN1, HMG14, связывающий домен 1 нуклеосомы группы высокой подвижности
Внешние идентификаторы	OMIM: 163920 MGI: 96120 ГомолоГен: 3643 Генные карты: HMGN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.2 Начните 39,342,315 бп[1] Конец 39,349,647 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеосомной ДНК • Связывание ДНК • связывание хроматина Сотовый компонент • цитоплазма • хроматин • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • позитивная регуляция ДНК-темплатной транскрипции, элонгации • репарация димера пиримидина путем эксцизионной репарации нуклеотидов • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • организация хроматина • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • ответ на УФ-Б • ответ на УФ-С • регуляция развития, гетерохронная • постэмбриональный морфогенез глаза камерного типа • регуляция пролиферации эпителиальных клеток • положительная регуляция активности НАД + АДФ-рибозилтрансферазы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3150	15312
Ансамбль	ENSG00000205581	ENSMUSG00000040681
UniProt	P05114	P18608
RefSeq (мРНК)	NM_004965	NM_008251
RefSeq (белок)	NP_004956	NP_032277
Расположение (UCSC)	Chr 21: 39.34 - 39.35 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Негистоновый хромосомный белок HMG-14 это белок что у людей кодируется HMGN1 ген.^[4][5][6]

Функция

Хромосомный белок HMG14 и его близкий аналог HMG17 (MIM 163910) привязать к внутренней стороне нуклеосомная ДНК, потенциально изменяя взаимодействие между ДНК и октамер гистонов. Два белка могут участвовать в процессе, который поддерживает транскрибируемые гены в уникальном хроматин конформация.^[7] Их повсеместное распространение и относительная численность, а также высокая эволюционная консервативность ДНК-связывающего домена белков семейства HMG14 позволяют предположить, что они могут участвовать в важной клеточной функции.^[6]

Взаимодействия

Было показано, что HMGN1 взаимодействовать с участием YWHAZ.^[8]

Смотрите также

• HMGN2
• Белок группы высокой подвижности HMG14 и HMG17

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000205581 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ландсман Д., Сриканта Т., Вестерманн Р., Бустин М. (декабрь 1986 г.). «Хромосомный белок HMG-14. Полная последовательность кДНК человека и свидетельство мультигенного семейства». Журнал биологической химии. 261 (34): 16082–6. PMID  3782107.
5. Ландсман Д., Макбрайд О. В., Соарес Н., Криппа М. П., Сриканта Т., Бастин М. (февраль 1989 г.). «Хромосомный белок HMG-14. Идентификация, характеристика и хромосомная локализация функционального гена из большого человеческого мультигенного семейства». Журнал биологической химии. 264 (6): 3421–7. PMID  2563381.
6. "Ген Entrez: домен связывания нуклеосомы 1 группы с высокой подвижностью HMGN1".
7. Мартинес де Пас А, Аусио Дж (2016). "HMGNs: заклинатели усилителя". BioEssays. 38 (3): 226–31. Дои:10.1002 / bies.201500157. PMID  26709929. S2CID  24768724.
8. Prymakowska-Bosak M, Hock R, Catez F, Lim JH, Birger Y, Shirakawa H, Lee K, Bustin M (октябрь 2002 г.). «Митотическое фосфорилирование хромосомного белка HMGN1 ингибирует ядерный импорт и способствует взаимодействию с белками 14.3.3». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6809–19. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6809-6819.2002. ЧВК  134047. PMID  12215538.

дальнейшее чтение

• Паш Дж., Попеску Н., Маточа М., Рапопорт С., Бустин М. (май 1990 г.). «Ген хромосомного белка HMG-14 картируется в области синдрома Дауна хромосомы 21 человека и сверхэкспрессируется при трисомии 16 мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (10): 3836–40. Bibcode:1990ПНАС ... 87.3836П. Дои:10.1073 / pnas.87.10.3836. ЧВК  53998. PMID  2140193.
• Леффак М., Тремпе Дж. П. (июль 1985 г.). «Гистон H1 и HMG 14/17 откладываются в ядре неслучайно». Исследования нуклеиновых кислот. 13 (13): 4853–69. Дои:10.1093 / nar / 13.13.4853. ЧВК  321831. PMID  4022776.
• Постников Ю.В., Триешманн Л., Рикерс А., Бустин М. (сентябрь 1995 г.). «Гомодимеры хромосомных белков HMG-14 и HMG-17 в ядрах нуклеосом». Журнал молекулярной биологии. 252 (4): 423–32. Дои:10.1006 / jmbi.1995.0508. PMID  7563062.
• Динг Х.Ф., Римский С., Бэтсон С.К., Бустин М., Хансен У. (август 1994 г.). «Стимуляция удлинения РНК-полимеразы II хромосомным белком HMG-14». Наука. 265 (5173): 796–9. Bibcode:1994Научный ... 265..796D. Дои:10.1126 / science.8047885. PMID  8047885.
• Паш Дж. М., Альфонсо П. Дж., Бустин М. (июнь 1993 г.). «Аберрантная экспрессия хромосомного белка 14 группы высокой подвижности влияет на клеточную дифференциацию». Журнал биологической химии. 268 (18): 13632–8. PMID  8514795.
• Бастин М., Альфонсо П. Дж., Паш Дж. М., Уорд Дж. М., Гирхарт Дж. Д., Ривз Р. Х. (декабрь 1995 г.). «Характеристика трансгенных мышей с повышенным содержанием хромосомного белка HMG-14 в их хроматине». ДНК и клеточная биология. 14 (12): 997–1005. Дои:10.1089 / dna.1995.14.997. PMID  8534374.
• Хок Р., Шеер Ю., Бастин М. (декабрь 1998 г.). «Хромосомные белки HMG-14 и HMG-17 высвобождаются из митотических хромосом и импортируются в ядро ​​посредством активного транспорта». Журнал клеточной биологии. 143 (6): 1427–36. Дои:10.1083 / jcb.143.6.1427. ЧВК  2132996. PMID  9852141.
• Луи Д.Ф., Глор К.К., Галасинский С.К., Ресинг К.А., Ан Н.Г. (январь 2000 г.). «Фосфорилирование и субклеточное перераспределение белков 14 и 17 групп с высокой подвижностью, проанализировано с помощью масс-спектрометрии». Белковая наука. 9 (1): 170–9. Дои:10.1110 / пс.9.1.170. ЧВК  2144438. PMID  10739259.
• Бергель М., Эррера Дж. Э., Тэтчер Б. Дж., Примаковска-Босак М., Василев А., Накатани Ю., Мартин Б., Бустин М. (апрель 2000 г.). «Ацетилирование новых сайтов в нуклеосомном связывающем домене хромосомного белка HMG-14 с помощью p300 изменяет его взаимодействие с нуклеосомами». Журнал биологической химии. 275 (15): 11514–20. Дои:10.1074 / jbc.275.15.11514. PMID  10753971.
• Примаковска-Босак М., Мистели Т., Эррера Дж. Э., Ширакава Х., Биргер Ю., Гарфилд С., Бустин М. (август 2001 г.). «Митотическое фосфорилирование предотвращает связывание белков HMGN с хроматином». Молекулярная и клеточная биология. 21 (15): 5169–78. Дои:10.1128 / MCB.21.15.5169-5178.2001. ЧВК  87241. PMID  11438671.
• Prymakowska-Bosak M, Hock R, Catez F, Lim JH, Birger Y, Shirakawa H, Lee K, Bustin M (октябрь 2002 г.). «Митотическое фосфорилирование хромосомного белка HMGN1 ингибирует ядерный импорт и способствует взаимодействию с белками 14.3.3». Молекулярная и клеточная биология. 22 (19): 6809–19. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6809-6819.2002. ЧВК  134047. PMID  12215538.
• Soloaga A, Thomson S, Wiggin GR, Rampersaud N, Dyson MH, Hazzalin CA, Mahadevan LC, Arthur JS (июнь 2003 г.). «MSK2 и MSK1 опосредуют индуцированное митогеном и стрессом фосфорилирование гистона H3 и HMG-14». Журнал EMBO. 22 (11): 2788–97. Дои:10.1093 / emboj / cdg273. ЧВК  156769. PMID  12773393.
• Цзоу Й, Цзян Х, Ван И (май 2004 г.). «Идентификация новых сайтов фосфорилирования in vivo в белке группы N1 с высокой подвижностью из клеток рака груди человека MCF-7». Биохимия. 43 (20): 6322–9. Дои:10.1021 / bi0362828. PMID  15147216.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.