HNRNPA1 - HNRNPA1

HNRNPA1
Доступные конструкции
PDB	Human UniProt search: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1HA1, 1L3K, 1ПГЗ, 1PO6, 1U1K, 1U1L, 1U1M, 1U1N, 1U1O, 1U1P, 1U1Q, 1U1R, 1UP1, 2H4M, 2ЛИВ, 2UP1, 4лет
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPA1, ALS19, ALS20, HNRPA1, HNRPA1L3, IBMPFD3, hnRNP A1, hnRNP-A1, UP 1, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1
Внешние идентификаторы	OMIM: 164017 ГомолоГен: 134664 Генные карты: HNRNPA1
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание РНК, содержащей теломерный повтор; • связывание одноцепочечной ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание одноцепочечной РНК; • Связывание G-богатой цепи теломерной ДНК; • связывание нуклеиновой кислоты; • Связывание РНК; • специфическое связывание белкового домена; • связывание пре-мРНК; • связывание miRNA; • идентичное связывание с белками; • связывание мРНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • каталитическая стадия 2 сплайсосомы; • мембрана; • нуклеоплазма; • сплайсосомальный комплекс; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • рибонуклеопротеин;
Биологический процесс	• Сплайсинг мРНК через сплайсосомы; • транспорт мРНК; • отрицательная регуляция поддержания теломер через теломеразу; • Экспорт РНК из ядра; • обработка мРНК; • положительная регуляция поддержания теломер через теломеразу; • ядерный экспорт; • GO: 0022415 вирусный процесс; • ядерный импорт; • Сплайсинг РНК; • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов; • клеточный ответ на арсенит натрия; • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • Метаболический процесс РНК; • клеточный ответ на голодание по глюкозе; • транспорт;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3178
	н / д
	ENSG00000135486
	н / д
	P09651
	н / д
	NM_002136; NM_031157
	н / д
	NP_002127; NP_112420
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А1 это белок что у людей кодируется HNRNPA1 ген.^[2] Мутации в HNRNPA1 являются причиной боковой амиотрофический склероз и синдром мультисистемная протеинопатия.

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству A / B повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеидов (hnRNP). HnRNPs являются белками, связывающими РНК, и они образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. В то время как все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, кажется, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают отчетливыми свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, имеет два повтора квази-RRM-доменов, которые связываются с РНК. Это один из наиболее распространенных ядерных белков комплексов гяРНП, локализованный в нуклеоплазме. Этот белок, вместе с другими белками hnRNP, экспортируется из ядра, вероятно, связан с мРНК, и немедленно повторно импортируется. Его домен M9 действует как сигнал ядерной локализации и ядерного экспорта. Кодируемый белок участвует в упаковке пре-мРНК в частицы hnRNP, транспорте поли A + мРНК из ядра в цитоплазму и может модулировать выбор сайта сплайсинга. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но полностью описаны только два транскрипта. Эти варианты имеют несколько альтернативных сайтов инициации транскрипции и несколько сайтов полиА.^[3]

Взаимодействия

Было показано, что гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1 взаимодействовать с участием BAT2,^[4] Эндонуклеаза 1, специфичная для структуры лоскута^[5] и IκBα.^[6]

Роль в болезни

Мутации в hnRNP A1 являются причиной боковой амиотрофический склероз и мультисистемная протеинопатия.

использованная литература

^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Saccone S, Biamonti G, Maugeri S, Bassi MT, Bunone G, Riva S, Della Valle G (март 1992 г.). «Присвоение человеческого гена гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина A1 (HNRPA1) хромосоме 12q13.1 путем конкурентной гибридизации кДНК in situ». Геномика. 12 (1): 171–4. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90424-Q. PMID 1733858.
^ «Ген Entrez: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1 HNRPA1».
^ Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон С.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
^ Чай Кью, Чжэн Л., Чжоу М., Турчи Дж.Дж., Шен Б. (декабрь 2003 г.). «Взаимодействие и стимуляция нуклеазной активности человеческого FEN-1 с помощью гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина A1 в процессинге альфа-сегмента во время созревания фрагмента Окадзаки». Биохимия. 42 (51): 15045–52. Дои:10.1021 / bi035364t. PMID 14690413.
^ Hay DC, Kemp GD, Dargemont C, Hay RT (май 2001 г.). «Взаимодействие между hnRNPA1 и IkappaBalpha необходимо для максимальной активации NF-kappaB-зависимой транскрипции». Мол. Cell. Биол. 21 (10): 3482–90. Дои:10.1128 / MCB.21.10.3482-3490.2001. ЧВК 100270. PMID 11313474.

дальнейшее чтение

Ким С., Пак Г. Х., Пайк В. К. (1999). «Последние достижения в метилировании белков: ферментативное метилирование белков, связывающих нуклеиновые кислоты». Аминокислоты. 15 (4): 291–306. Дои:10.1007 / BF01320895. PMID 9891755. S2CID 28412209.
Буволи М., Кобианки Ф., Бестаньо М.Г., Манджиаротти А., Басси М.Т., Биамонти Г., Рива С. (1990). «Альтернативный сплайсинг человеческого гена для основного белка A1 генерирует другой белок hnRNP». EMBO J. 9 (4): 1229–35. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08230.x. ЧВК 551799. PMID 1691095.
Гетти А, Болоньези М, Кобианки Ф, Моранди С (1991). «Моделирование по гомологии РНК-связывающего домена в белке hnRNP A1». FEBS Lett. 277 (1–2): 272–6. Дои:10.1016 / 0014-5793 (90) 80863-Е. PMID 2176620. S2CID 29915150.
Биамонти Г., Буволи М., Басси М.Т., Моранди С., Кобианки Ф., Рива С. (1989). «Выделение активного гена, кодирующего человеческий белок hnRNP A1. Доказательства альтернативного сплайсинга». J. Mol. Биол. 207 (3): 491–503. Дои:10.1016/0022-2836(89)90459-2. PMID 2760922.
Буволи М., Биамонти Г., Цулфас П., Басси М. Т., Гетти А., Рива С., Моранди С. (1988). «Клонирование кДНК человеческого белка hnRNP A1 показывает существование множества изоформ мРНК». Нуклеиновые кислоты Res. 16 (9): 3751–70. Дои:10.1093 / nar / 16.9.3751. ЧВК 336554. PMID 2836799.
Рива С., Моранди С., Цулфас П., Пандольфо М., Биамонти Дж., Меррилл Б., Уильямс К. Р., Мультхауп Г., Бейройтер К., Верр Х (1986). «Белок, связывающий одноцепочечную ДНК млекопитающих UP I, получен из корового белка hnRNP A1». EMBO J. 5 (9): 2267–73. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1986.tb04494.x. ЧВК 1167110. PMID 3023065.
Эпплен Ч., Эпплен Дж. Т. (1994). «Экспрессия простых повторяющихся последовательностей (cac) n / (gtg) n в мРНК лимфоцитов человека». Гм. Genet. 93 (1): 35–41. Дои:10.1007 / BF00218910. PMID 7505766. S2CID 22998633.
Сиоми Х., Дрейфус Дж. (1995). «Домен ядерной локализации в белке hnRNP A1». J. Cell Biol. 129 (3): 551–60. Дои:10.1083 / jcb.129.3.551. ЧВК 2120450. PMID 7730395.
Вейгхардт Ф, Биамонти Дж, Рива С (1995). «Нуклео-цитоплазматическое распределение белков hnRNP человека: поиск целевых доменов в hnRNP A1». J. Cell Sci. 108 (2): 545–55. PMID 7769000.
Раджпурохит Р., Ли СО, Пак Джо, Пайк В.К., Ким С. (1994). «Ферментативное метилирование рекомбинантного гетерогенного ядерного белка RNP A1. Двойная субстратная специфичность для S-аденозилметионина: гистон-аргинин N-метилтрансфераза». J. Biol. Chem. 269 (2): 1075–82. PMID 8288564.
Гамильтон Б.Дж., Надь Э., Мальтер Дж.С., Аррик Б.А., Ригби В.Ф. (1993). «Ассоциация гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов A1 и C белков с повторяющимися последовательностями AUUUA». J. Biol. Chem. 268 (12): 8881–7. PMID 8473331.
Майкл В.М., Чой М., Дрейфус Г. (1996). «Сигнал ядерного экспорта в hnRNP A1: опосредованный сигналом, зависимый от температуры путь экспорта ядерного белка». Ячейка. 83 (3): 415–22. Дои:10.1016/0092-8674(95)90119-1. PMID 8521471. S2CID 615927.
Блэк А.С., Ло Дж., Чун С., Баккер А., Фрейзер Дж. К., Розенблатт Дж. Д. (1997). «Специфическое связывание белка, связывающего полипиримидиновый тракт, и hnRNP A1 с элементами CRS ВИЧ-1». Гены вирусов. 12 (3): 275–85. Дои:10.1007 / bf00284648. PMID 8883365. S2CID 11678179.
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Сюй Р.М., Джохан Л., Ченг Х, Майеда А., Крайнер А.Р. (1997). «Кристаллическая структура человеческого UP1, домена hnRNP A1, который содержит два мотива распознавания РНК». Структура. 5 (4): 559–70. Дои:10.1016 / S0969-2126 (97) 00211-6. PMID 9115444.
Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (1997). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (10): 5055–60. Bibcode:1997PNAS ... 94.5055B. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК 24630. PMID 9144189.
Shamoo Y, Krueger U, Rice LM, Williams KR, Steitz TA (1997). «Кристаллическая структура двух РНК-связывающих доменов hnRNP A1 человека с разрешением 1,75 A». Nat. Struct. Биол. 4 (3): 215–22. Дои:10.1038 / nsb0397-215. PMID 9164463. S2CID 9381013.
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджу П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Nat. Genet. 20 (1): 46–50. Дои:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.

Эта белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[1] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1733858-2] Saccone S, Biamonti G, Maugeri S, Bassi MT, Bunone G, Riva S, Della Valle G (март 1992 г.). «Присвоение человеческого гена гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина A1 (HNRPA1) хромосоме 12q13.1 путем конкурентной гибридизации кДНК in situ». Геномика. 12 (1): 171–4. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90424-Q. PMID 1733858.

[3] «Ген Entrez: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1 HNRPA1».

[pmid14667819-4] Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон С.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.

[pmid14690413-5] Чай Кью, Чжэн Л., Чжоу М., Турчи Дж.Дж., Шен Б. (декабрь 2003 г.). «Взаимодействие и стимуляция нуклеазной активности человеческого FEN-1 с помощью гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина A1 в процессинге альфа-сегмента во время созревания фрагмента Окадзаки». Биохимия. 42 (51): 15045–52. Дои:10.1021 / bi035364t. PMID 14690413.

[pmid11313474-6] Hay DC, Kemp GD, Dargemont C, Hay RT (май 2001 г.). «Взаимодействие между hnRNPA1 и IkappaBalpha необходимо для максимальной активации NF-kappaB-зависимой транскрипции». Мол. Cell. Биол. 21 (10): 3482–90. Дои:10.1128 / MCB.21.10.3482-3490.2001. ЧВК 100270. PMID 11313474.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]