HNRPH3 - HNRPH3

HNRNPH3
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPH3, 2H9, HNRPH3, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H3
Внешние идентификаторы	OMIM: 602324 MGI: 1926462 ГомолоГен: 11012 Генные карты: HNRNPH3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q21.3 Начните 68,331,174 бп[1] Конец 68,343,191 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B4 Начните 63,014,664 бп[2] Конец 63,024,217 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • сплайсосомальный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • Обработка РНК • дифференцировка эпителиальных клеток • Сплайсинг РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3189	432467
Ансамбль	ENSG00000096746	ENSMUSG00000020069
UniProt	P31942	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_012207 NM_021644 NM_001322434 NM_001322436 NM_001322437 NM_001322438 NM_001322439 NM_001322440 NM_001322441 NM_001322442 NM_001322443 NM_001322444 NM_001322445 NM_001322446 NM_001322447 NM_001322448 NM_001322449 NM_001322450 NM_001322451 NM_001322452 NM_001322453	NM_001079824 NM_001347457 NM_001359260 NM_001359261
RefSeq (белок)	NP_001309363 NP_001309365 NP_001309366 NP_001309367 NP_001309368 NP_001309369 NP_001309370 NP_001309371 NP_001309372 NP_001309373 NP_001309374 NP_001309375 NP_001309376 NP_001309377 NP_001309378 NP_001309379 NP_001309380 NP_001309381 NP_001309382 NP_036339 NP_067676	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 10: 68.33 - 68.34 Мб	Chr 10: 63.01 - 63.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H3 это белок что у людей кодируется HNRNPH3 ген.^[5][6]

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно выраженных гетерогенные ядерные рибонуклеопротеиды (hnRNPs). HnRNPs являются РНК связывающие белки и они образуют комплекс с гетерогенная ядерная РНК (гяРНК).

Эти белки связаны с пре-мРНК в ядро и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. В то время как все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, кажется, перемещаются между ядром и цитоплазма. Белки hnRNP имеют различные нуклеиновая кислота обязательные свойства.

Белок, кодируемый этим геном, имеет два повтора квази-RRM-доменов, которые связываются с РНК. Он локализуется в ядерных телах ядра. Этот белок участвует в процессе сплайсинга, а также в ранней остановке сплайсинга, вызванной тепловым шоком, временно покидая комплексы hnRNP. Множественная альтернатива варианты расшифровки похоже, присутствуют для этого гена, а некоторые, похоже, имеют интронный областей в мРНК. В настоящее время полностью описаны только два варианта транскрипта.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000096746 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020069 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Маэ Д., Маль П., Гаттони Р., Фишер Н., Маттей М. Г., Стивенин Дж., Фукс Дж. П. (февраль 1997 г.). «Клонирование гетерогенных ядерных рибонуклеопротеидов 2H9 человека. Связь со сплайсингом и остановкой сплайсинга, вызванной ранним тепловым шоком». J Biol Chem. 272 (3): 1827–36. Дои:10.1074 / jbc.272.3.1827. PMID  8999868.
6. «Ген Entrez: HNRPH3 гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H3 (2H9)».

дальнейшее чтение

• Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Оноре Б. (2000). «Ген hnRNP 2H9, который участвует в реакции сплайсинга, является геном множественного сплайсинга». Биохим. Биофиз. Acta. 1492 (1): 108–19. Дои:10.1016 / s0167-4781 (00) 00092-0. PMID  10858537.
• Маэ Д., Фишер Н., Десимо Д., Фукс Дж. П. (2000). «Пространственно-временная регуляция экспрессии гена hnRNP M и 2H9 во время эмбрионального развития мышей». Биохим. Биофиз. Acta. 1492 (2–3): 414–24. Дои:10.1016 / s0167-4781 (00) 00144-5. PMID  11004512.
• Ягуэ Дж., Васкес Дж., Лопес де Кастро Дж. А. (2001). «Посттрансляционная модификация ядерных белков, N (G), N (G) -диметил-Arg, обнаруженная в природном пептидном лиганде HLA класса I». Белковая наука. 9 (11): 2210–7. Дои:10.1110 / пс 9.11.2210. ЧВК  2144492. PMID  11152131.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.