IFRD1 - IFRD1

IFRD1
Идентификаторы
Псевдонимы	IFRD1, PC4, TIS7, регулятор развития, связанный с интерфероном 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603502 MGI: 1316717 ГомолоГен: 31043 Генные карты: IFRD1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q31.1 Начните 112,422,968 бп[1] Конец 112,481,017 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 B1 | 12 18,06 см Начните 40,201,567 бп[2] Конец 40,248,504 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3475	15982
Ансамбль	ENSG00000006652	ENSMUSG00000001627
UniProt	O00458	P19182
RefSeq (мРНК)	NM_001007245 NM_001197079 NM_001197080 NM_001550	NM_013562
RefSeq (белок)	NP_001007246 NP_001184008 NP_001184009 NP_001541	NP_038590
Расположение (UCSC)	Chr 7: 112.42 - 112.48 Мб	Chr 12: 40,2 - 40,25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регулятор развития, связанный с интерфероном 1 это белок что у людей кодируется IFRD1 ген.^[5][6] Ген выражен в основном в нейтрофилы, скелетные и сердечные мышцы, мозг, поджелудочная железа.^[5][6]Гены крысы и мыши, гомологи гена 1-го регулятора развития, связанного с интерфероном (и их белки), также известны под названием PC4. ^[7] и Tis21 соответственно. IFRD1 является членом семейства генов, которое включает второй ген, IFRD2, также известный как SKmc15.^[5][6]

Клиническое значение

IFRD1 был определен как ген-модификатор для кистозный фиброз заболевание легких. У людей эффекторная функция нейтрофилов зависит от типа полиморфизма IRFD1, присутствующего у человека. Данные, полученные на людях и мышах, показывают, что IFRD1 оказывает заметное влияние на патогенез муковисцидоза, регулируя эффекторную функцию нейтрофилов. ^[8]

Индуктор регенерации мышц

IFRD1 (также известный как PC4 или Tis7, см. Выше) участвует в процессе дифференцировки клеток скелетных мышц. Фактически, ингибирование функции IFRD1 в миобластах C2C12 путем трансфекции антисмысловой кДНК IFRD1 или микроинъекции антител против IFRD1 предотвращает их морфологическую и биохимическую дифференциацию, ингибируя экспрессию MyoD и миогенин, ключевые главные гены мышечного развития.^[9] Роль IFRD1 в дифференцировке мышц наблюдалась также in vivo. Мышцы мышей, лишенных IFRD1, демонстрируют снижение уровней белка и мРНК MyoD и миогенина, а после повреждения мышц у молодых мышей наблюдалась задержка регенерации.^[10]

Недавно было показано, что повышающая регуляция IFRD1 in vivo в поврежденных мышцах потенцирует регенерацию мышц за счет увеличения продукции тычинок мышечных клеток (сателлитных клеток).^[11] Основной молекулярный механизм заключается в способности IFRD1 взаимодействовать с MyoD при индукции транскрипционной активности MEF2C. Это зависит от способности IFRD1 избирательно связывать MEF2C, тем самым ингибируя его взаимодействие с HDAC4.^[11][12] Следовательно, IFRD1, по-видимому, действует как положительный кофактор MyoD.^[11][12] Совсем недавно было показано, что IFRD1 усиливает регенерацию мышц с помощью второго механизма, который усиливает MyoD, то есть путем репрессии транскрипционной активности NF-κB, который, как известно, ингибирует накопление мРНК MyoD. IFRD1 подавляет деятельность NF-κB p65 за счет усиления HDAC-опосредованного деацетилирования субъединицы p65, способствуя привлечению HDAC3 к p65. Фактически IFRD1 образует тримолекулярные комплексы с p65 и HDAC3.^[11]

Таким образом, IFRD1 может индуцировать регенерацию мышц, действуя в качестве основного регулятора пути MyoD с помощью множества механизмов. С учетом резкого уменьшения количества миогенных клеток, возникающих при мышечных дегенеративных патологиях, таких как дистрофия Дюшенна, способность IFRD1 усиливать регенеративный процесс предполагает, что IFRD1 может быть терапевтической целью.

Взаимодействия

IFRD1 было показано взаимодействовать с несколькими белками в комплексе SIN3, включая SIN3B, SAP30, NCOR1, и HDAC1.^[13] Более того, белок IFRD1 связывает MyoD, MEF2C, HDAC4, HDAC3 и субъединица p65 NF-κB, образуя тримолекулярные комплексы с HDAC3 и p65 NF-κB белки.^[11][12] Белок IFRD1 также образует гомодимеры.^[12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000006652 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001627 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Buanne P, Incerti B, Guardavaccaro D, Avvantaggiato V, Simeone A, Tirone F (ноябрь 1998 г.). «Клонирование гена регулятора развития человеческого интерферона (IFRD1), кодирующего белок PC4, член нового семейства генов, регулируемых развитием». Геномика. 51 (2): 233–42. Дои:10.1006 / geno.1998.5260. PMID  9722946.
6. «Ген Entrez: регулятор развития 1, связанный с интерфероном IFRD1».
7. Tirone F, Shooter EM (март 1989 г.). «Ранняя регуляция гена фактором роста нервов в клетках PC12: индукция гена, связанного с интерфероном». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (6): 2088–92. Bibcode:1989PNAS ... 86.2088T. Дои:10.1073 / pnas.86.6.2088. ЧВК  286853. PMID  2467301.
8. Гу И, Харли ИТ, Хендерсон Л.Б., Ароноу Б.Дж., Виетор I, Хубер Л.А., Харли Дж.Б., Килпатрик Дж.Р., Лангефельд К.Д., Уильямс А.Х., Джегга АГ, Чен Дж., Уиллс-Карп М., Аршад Ш., Эварт С.Л., Тио С.Л., Flick LM, Filippi MD, Grimes HL, Drumm ML, Cutting GR, Knowles MR, Karp CL (апрель 2009 г.). «Идентификация IFRD1 в качестве гена-модификатора кистозного фиброза легких». Природа. 458 (7241): 1039–42. Bibcode:2009 Натур.458.1039G. Дои:10.1038 / природа07811. ЧВК  2841516. PMID  19242412.
9. Montagnoli A, Guardavaccaro D, Starace G, Tirone F (октябрь 1996 г.). «Сверхэкспрессия предраннего гена PC3, индуцируемого фактором роста нервов, связана с подавлением роста». Рост клеток отличается. 7 (10): 1327–36. PMID  8891336.
10. Вадивелу С.К., Курцбауэр Р., Диплингер Б., Цвейер М., Шафер Р., Верниг А., Вьетор И., Хубер Л.А. (апрель 2004 г.). «Дефекты регенерации мышц и миогенной дифференцировки у мышей без TIS7». Мол. Cell. Биол. 24 (8): 3514–25. Дои:10.1128 / mcb.24.8.3514-3525.2004. ЧВК  381666. PMID  15060170.
11. Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф, Мареска Дж., Колазингари С., Маттей Е., Лира С. А., Фариоли-Веккиоли С., Карузо М., Тироне Ф. (февраль 2011 г.). «PC4 / Tis7 / IFRD1 стимулирует регенерацию скелетных мышц и участвует в дифференцировке миобластов в качестве регулятора MyoD и NF-kappaB». J. Biol. Chem. 286 (7): 5691–707. Дои:10.1074 / jbc.M110.162842. ЧВК  3037682. PMID  21127072.
12. Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф, Буанне П., Кану Н., Карузо М., Тироне Ф. (март 2005 г.). «PC4 коактивирует MyoD, снимая опосредованное гистондеацетилазой 4 ингибирование фактора усиления миоцитов 2C». Мол. Cell. Биол. 25 (6): 2242–59. Дои:10.1128 / MCB.25.6.2242-2259.2005. ЧВК  1061592. PMID  15743821.
13. Vietor I, Vadivelu SK, Wick N, Hoffman R, Cotten M, Seiser C, Fialka I, Wunderlich W., Haase A, Korinkova G, Brosch G, Huber LA (сентябрь 2002 г.). «TIS7 взаимодействует с гистон-деацетилазным комплексом SIN3 млекопитающих в эпителиальных клетках». EMBO J. 21 (17): 4621–31. Дои:10.1093 / emboj / cdf461. ЧВК  125408. PMID  12198164.

дальнейшее чтение

• Тирон Ф., Стрелок Э.М. (1989). «Ранняя регуляция гена фактором роста нервов в клетках PC12: индукция гена, связанного с интерфероном». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (6): 2088–92. Bibcode:1989PNAS ... 86.2088T. Дои:10.1073 / pnas.86.6.2088. ЧВК  286853. PMID  2467301.
• Варнум BC, Лим RW, Хершман HR (1989). «Характеристика TIS7, гена, индуцированного в клетках Swiss 3T3 опухолевым промотором тетрадеканоилфорболацетатом». Онкоген. 4 (10): 1263–5. PMID  2797820.
• Guardavaccaro D, Ciotti MT, Schäfer BW, Montagnoli A, Tirone F (1995). «Подавление дифференцировки в миобластах, лишенных интерферон-родственного белка PC4». Рост клеток отличается. 6 (2): 159–69. PMID  7756174.
• Гуардаваккаро Д., Монтаньоли А., Чиотти М. Т., Гатти А., Лотти Л., Ди Лаззаро С., Торриси М. Р., Тироне Ф. (1994). «Фактор роста нервов регулирует внутриклеточную локализацию белка PC4, индуцируемого фактором роста нервов, в клетках PC12». J. Neurosci. Res. 37 (5): 660–74. Дои:10.1002 / jnr.490370514. PMID  8028043. S2CID  20845428.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ge H, Si Y, Roeder RG (1998). «Выделение кДНК, кодирующих новые коактиваторы транскрипции p52 и p75, выявляет альтернативный регуляторный механизм активации транскрипции». EMBO J. 17 (22): 6723–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.22.6723. ЧВК  1171017. PMID  9822615.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). «Анализ экспрессирующей последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 205–20. PMID  12107410.
• Vietor I, Vadivelu SK, Wick N, Hoffman R, Cotten M, Seiser C, Fialka I, Wunderlich W, Haase A, Korinkova G, Brosch G, Huber LA (2002). «TIS7 взаимодействует с гистон-деацетилазным комплексом SIN3 млекопитающих в эпителиальных клетках». EMBO J. 21 (17): 4621–31. Дои:10.1093 / emboj / cdf461. ЧВК  125408. PMID  12198164.
• Рот А., Гилл Р., Черта Ю. (2003). «Временные и пространственные паттерны экспрессии генов после экспериментального инсульта на модели крысы и характеристика PC4, потенциального регулятора транскрипции». Мол. Cell. Неврологи. 22 (3): 353–64. Дои:10.1016 / S1044-7431 (02) 00039-8. PMID  12691737. S2CID  2364009.
• Имабаяси Х, Мори Т., Годзё С., Киёно Т., Сугияма Т., Ирие Р., Исогай Т., Хата Дж., Тояма Ю., Умедзава А. (2003). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID  12878157.
• Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф, Буанне П., Кану Н., Карузо М., Тироне Ф. (2005). «PC4 коактивирует MyoD, снимая опосредованное гистондеацетилазой 4 ингибирование фактора усиления миоцитов 2C». Мол. Cell. Биол. 25 (6): 2242–59. Дои:10.1128 / MCB.25.6.2242-2259.2005. ЧВК  1061592. PMID  15743821.
• Vietor I, Kurzbauer R, Brosch G, Huber LA (2005). «TIS7-регуляция остеопонтина (OPN) гена-мишени бета-катенина / Tcf-4 является зависимой от гистондеацетилазы». J. Biol. Chem. 280 (48): 39795–801. Дои:10.1074 / jbc.M509836200. PMID  16204248.
• Го Х, Гао Ц, Ми З, Чжан Дж, Го ПК (2007). «Характеристика связывающего домена PC4 и его взаимодействия с HNF4alpha». J. Biochem. 141 (5): 635–40. Дои:10.1093 / jb / mvm066. PMID  17317687.