Циклогидролаза IMP - IMP cyclohydrolase
| Циклогидролаза IMP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 3.5.4.10 | ||||||||
| Количество CAS | 9013-81-4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Циклогидролазоподобный белок IMP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура пуро из methanothermobacter thermoautotrophicus | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | IMP_cyclohyd | ||||||||
| Pfam | PF07826 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR020600 | ||||||||
| |||||||||
В энзимология, Циклогидролаза IMP (EC 3.5.4.10 ) является фермент который катализирует то химическая реакция
- IMP + H2О 5-формамидо-1- (5-фосфо-D-рибозил) имидазол-4-карбоксамид
Таким образом, два субстраты этого фермента IMP и ЧАС2О, тогда как его товар является 5-формамидо-1- (5-фосфо-D-рибозил) имидазол-4-карбоксамид.
Этот фермент принадлежит к семейству гидролазы, те, которые действуют на связи углерод-азот, отличные от пептидных связей, особенно в циклических амидинах. В систематическое название этого класса ферментов ИМП 1,2-гидролаза (дециклизирующая). Другие широко используемые имена включают инозиниказа, и инозинатциклогидролаза. Этот фермент катализирует циклизация 5-формиламидоимидазол-4-карбоксамид рибонуклеотида до IMP, реакция, которая важна для de novo пурин биосинтез в архей разновидность.[1]
Структурные исследования
В большинстве случаев это одно-домен белок устроен так, чтобы сформировать общий складывать состоящий из четырехслойной альфа -бета -бета-альфа ядро структура. Два антипараллельный бета-листы упаковываются друг против друга и покрыты альфа-спирали на одном лице молекула. Белок структурно аналогично членам N-концевой нуклеофил (NTN) гидролаза надсемейство. На самом деле на поверхности циклогидролазы IMP был обнаружен глубокий карман в положении, эквивалентном положению активные сайты NTN-гидролаз, но N-концевой нуклеофил обнаружить не удалось. Поэтому считается, что это фермент структурно, но не функционально подобен членам семейства NTN-гидролаз.[2]
На конец 2007 г. 14 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1Г8М, 1М9Н, 1OZ0, 1П4Р, 1PKX, 1PL0, 1 ТГц, 2B1G, 2B1I, 2IU0, 2IU3, 2НТК, 2NTL, и 2NTM.
Рекомендации
- ^ Graupner M, Xu H, White RH (март 2002 г.). «Новый класс циклогидролаз IMP в Methanococcus jannaschii». J. Bacteriol. 184 (5): 1471–3. Дои:10.1128 / jb.184.5.1471-1473.2002. ЧВК 134845. PMID 11844782.
- ^ Саридакис В., Кристендат Д., Тайгесен А., Эроусмит С.Х., Эдвардс А.М., Пай Е.Ф. (июль 2002 г.). «Кристаллическая структура консервативного белка Methanobacterium thermoautotrophicum MTH1020 выявляет NTN-гидролазную складку». Белки. 48 (1): 141–3. Дои:10.1002 / prot.10147. PMID 12012346. S2CID 29556936.
дальнейшее чтение
- ФЛАКС ДЖ. Г., ЭРВИН М ДЖ., БУКАНЕН ДЖ. М. (1957). «Биосинтез пуринов. XVIII 5-амино-1-рибозил-4-имидазолкарбоксамид, 5'-фосфаттрансмилаза и инозиниказа». J. Biol. Chem. 229 (2): 603–12. PMID 13502325.
| Этот EC 3.5 фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |