IWS1 - IWS1

IWS1
Идентификаторы
Псевдонимы	IWS1, SUPT6H взаимодействующий белок, взаимодействует с SUPT6H, фактор сборки CTD 1
Внешние идентификаторы	MGI: 1920723 ГомолоГен: 134421 Генные карты: IWS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q14.3 Начинать 127,436,207 бп[1] Конец 127,526,886 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 | 18 B1 Начинать 32,067,741 бп[2] Конец 32,104,328 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транспорт мРНК • Сплайсинг РНК • регуляция ацетилирования гистона H4 • регуляция обработки мРНК • обработка мРНК • регуляция экспорта мРНК из ядра • регуляция триметилирования гистонов H3-K36 • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция ДНК-шаблонной транскрипции, элонгации Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55677	73473
Ансамбль	ENSG00000163166	ENSMUSG00000024384
UniProt	Q96ST2	Q8C1D8
RefSeq (мРНК)	NM_017969	NM_173441
RefSeq (белок)	NP_060439	NP_775617
Расположение (UCSC)	Chr 2: 127,44 - 127,53 Мб	Chr 18: 32.07 - 32,1 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог белка IWS1 также известен как взаимодействует с Spt6 (IWS1) - это белок что у людей кодируется IWS1 ген.^[5]

IWS1 - это транскрипция коэффициент удлинения. Впервые он был обнаружен во время поиска РНК-полимераза II -связанные факторы удлинения в дрожжи; он напрямую взаимодействует с РНК-полимеразой II (RNAPII) и является фосфорилированный в казеинкиназа II (CKII) сайты.^[6]

Гомолог человека, который физически взаимодействует с протеин аргининметилтрансфераза 5 (PRMT5), необходим для выживания клеток.^[7] Он также задействует гистон-метилтрансферазу SET2 (белок HYPB, взаимодействующий с Хантингтином, также известный как SETD2 ) к RNAPII во время элонгации транскрипции и необходим для триметилирования H3K36.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163166 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024384 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: IWS1 гомолог IWS1 (S. cerevisiae)».
6. Krogan NJ, Kim M, Ahn SH, Zhong G, Kobor MS, Cagney G, Emili A, Shilatifard A, Buratowski S, Greenblatt JF (октябрь 2002 г.). «Факторы элонгации РНК-полимеразы II Saccharomyces cerevisiae: целенаправленный протеомный подход». Молекулярная и клеточная биология. 22 (20): 6979–92. Дои:10.1128 / MCB.22.20.6979-6992.2002. ЧВК  139818. PMID  12242279.
7. Лю З., Чжоу З., Чен Г., Бао С. (февраль 2007 г.). «Предполагаемый фактор элонгации транскрипции hIws1 необходим для пролиферации клеток млекопитающих». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 353 (1): 47–53. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.11.133. PMID  17184735.
8. Йо С.М., Лукас Дж.С., Джонс К.А. (декабрь 2008 г.). «Комплекс Iws1: Spt6: CTD контролирует котранскрипционный биосинтез мРНК и HYPB / Setd2-опосредованное метилирование гистона H3K36». Гены и развитие. 22 (24): 3422–34. Дои:10.1101 / gad.1720008. ЧВК  2607075. PMID  19141475.

дальнейшее чтение

• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Линь Y, Смит AJ, Морган GT (2006). «Мотив последовательности, консервативный в различных ядерных белках, идентифицирует домен взаимодействия белков, используемый для ядерного нацеливания TFIIS человека». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (8): 2219–29. Дои:10.1093 / нар / gkl239. ЧВК  1450333. PMID  16648364.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Лю З., Чжоу З., Чен Г., Бао С. (февраль 2007 г.). «Предполагаемый фактор элонгации транскрипции hIws1 необходим для пролиферации клеток млекопитающих». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 353 (1): 47–53. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.11.133. PMID  17184735.
• Yoh SM, Cho H, Pickle L, Evans RM, Jones KA (январь 2007 г.). «Домен Spt6 SH2 связывает Ser2-P RNAPII, чтобы направлять Iws1-зависимый сплайсинг и экспорт мРНК». Гены и развитие. 21 (2): 160–74. Дои:10.1101 / gad.1503107. ЧВК  1770899. PMID  17234882.