Имитация SWI - Imitation SWI - Wikipedia

Протеин ISWI или же имитация SWI из дрозофила меланогастер (обыкновенная плодовая муха ), является первым АТФаза подразделение который был изолирован в ISWI хроматин реконструкция семья. Этот белок имеет высокий уровень сходства с SWI / SNF семейство ремоделирования хроматина в АТФазном домене. Вне ATPase домена ISWI теряет сходство с членом семейства SWI / SNF, обладающим SANT домен вместо бромодомен. Белок ISWI может взаимодействовать с несколькими белками, давая три различных комплекса ремоделирования хроматина в Drosophila melanogaster: NURF (нуклеосома фактор ремоделирования), CHRAC (комплекс ремоделирования и сборки хроматина) и ACF (фактор ремоделирования и сборки хроматина с использованием АТФ).

В пробирке, белок ISWI сам по себе может собирать нуклеосомы на линейной ДНК и может перемещать нуклеосомы на линейной ДНК от центра к конечностям. Внутри комплекса CHRAC ISWI катализирует обратную реакцию, перемещая нуклеосомы от конечностей к центру.[1]

Генерация петель в дцДНК

Исследование одной молекулы с использованием атомно-силовая микроскопия (AFM) и привязанное движение частицы (TPM) обнаружил, что ISWI может связывать голую ДНК в отсутствие АТФ, оборачивая ДНК вокруг белка. В присутствии АТФ, белок образует петли ДНК, одновременно генерируя отрицательные суперспирали в шаблоне.[2] Первый рисунок в этой статье показывает три изображения АСМ, на которых одна ДНК, взаимодействующая с ISWI, была нанесена на поверхности слюды. В центре один ISWI связан около конца шаблона дцДНК. На правом изображении показаны две петли ДНК, созданные ISWI. Эти петли содержат суперспирали. Исследование TPM вместо этого показало, что продолжительность петли, сформированной ISWI, была АТФ-зависимой.

Рекомендации

  1. ^ Längst G, Bonte EJ, Corona DF, Becker PB (1999). «Движение нуклеосом с помощью CHRAC и ISWI без нарушения или транс-смещения октамера гистонов». Клетка. 97 (7): 843–52. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80797-7. PMID  10399913.
  2. ^ Лия Г., Индриери М., Оуэн-Хьюз Т., Финци Л., Подеста А., Милани П., Данлэп Д. (2008). «АТФ-зависимая петля ДНК по ISWI». J. Биофотоника. 1 (4): 280–86. Дои:10.1002 / jbio.200810027. ЧВК  3428829. PMID  19343651.