LIMA1 - LIMA1 - Wikipedia

LIMA1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2D8Y
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMA1, EPLIN, SREBP3, домен LIM и связывание актина 1, LDLCQ8
Внешние идентификаторы	OMIM: 608364 MGI: 1920992 ГомолоГен: 9484 Генные карты: LIMA1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.12 Начинать 50,175,788 бп[1] Конец 50,283,546 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 F1 | 15 56,13 см Начинать 99,778,470 бп[2] Конец 99,875,456 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актиновой нити • связывание актина • связывание мономера актина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание кадгерина Сотовый компонент • соединение клеток • борозда декольте • цитоскелет • кисть границы • стрессовое волокно • очаговая адгезия • актиновый цитоскелет • цитоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция деполимеризации актиновых филаментов • взъерошенная организация • узел пучка актиновых филаментов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51474	65970
Ансамбль	ENSG00000050405	ENSMUSG00000023022
UniProt	Q9UHB6	Q9ERG0
RefSeq (мРНК)	NM_001113546 NM_001113547 NM_001243775 NM_016357	NM_001113545 NM_023063
RefSeq (белок)	NP_001107018 NP_001107019 NP_001230704 NP_057441	NP_001107017 NP_075550
Расположение (UCSC)	Chr 12: 50.18 - 50.28 Мб	Chr 15: 99,78 - 99,88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LIM-домен и актин-связывающий белок 1 это белок что в люди кодируется LIMA1 ген.^[5][6][7][8]

ЭПЛИН - это цитоскелет -ассоциированный белок что тормозит актин нить деполимеризация и поперечно сшивает нити в пучки (Maul et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000050405 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023022 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чен С., Мол Р.С., Ким Х.Р., Чанг Д.Д. (июль 2000 г.). «Характеристика человеческого гена EPLIN (эпителиальный белок, потерянный в новообразовании) выявляет различные промоторы для двух изоформ EPLIN». Ген. 248 (1–2): 69–76. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00144-X. PMID  10806352.
6. Мол Р.С., Чанг Д.Д. (февраль 2000 г.). «ЭПЛИН, эпителиальный белок, потерянный в новообразовании». Онкоген. 18 (54): 7838–41. Дои:10.1038 / sj.onc.1203206. PMID  10618726.
7. Мол Р.С., Сонг Й., Аманн К.Дж., Гербин С.К., Поллард Т.Д., Чанг Д.Д. (февраль 2003 г.). «ЭПЛИН регулирует динамику актина путем сшивания и стабилизации нитей». J Cell Biol. 160 (3): 399–407. Дои:10.1083 / jcb.200212057. ЧВК  2172667. PMID  12566430.
8. "Ген Entrez: LIMA1 домен и связывание актина 1".

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ван Д., Гонг И, Цинь В. и др. (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID  16083285.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.