LIN7C - LIN7C

LIN7C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3LRA
Идентификаторы
Псевдонимы	LIN7C, LIN-7-C, LIN-7C, MALS-3, MALS3, VELI3, гомолог lin-7 C, компонент комплекса полярности клеток крохи
Внешние идентификаторы	OMIM: 612332 MGI: 1330839 ГомолоГен: 22649 Генные карты: LIN7C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п14.1 Начинать 27,494,418 бп[1] Конец 27,506,769 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 E3 | 2 56,65 см Начинать 109,890,853 бп[2] Конец 109,901,003 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • специфическое связывание белкового домена • связывание с белками цитоскелета • Связывание домена L27 • Связывание домена PDZ Сотовый компонент • цитоплазма • постсинаптическая мембрана • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • мембрана • межклеточное соединение • двухклеточное плотное соединение • клеточная мембрана • Комплекс MPP7-DLG1-LIN7 • соединение клеток • базолатеральная плазматическая мембрана • проекция нейрона • пресинапс • синапс • глутаматергический синапс Биологический процесс • локализация белка в базолатеральной плазматической мембране • поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • транспорт белка • морфогенез эпителиального листка • GO: 0010554 секреция нейротрансмиттера • экзоцитоз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55327	22343
Ансамбль	ENSG00000148943	ENSMUSG00000027162
UniProt	Q9NUP9	O88952
RefSeq (мРНК)	NM_018362	NM_011699
RefSeq (белок)	NP_060832	NP_035829
Расположение (UCSC)	Chr 11: 27.49 - 27.51 Мб	Chr 2: 109,89 - 109,9 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лин-7 гомолог C это белок что у людей кодируется LIN7C ген.^[5][6]

Взаимодействия

LIN7C был показан взаимодействовать с:

• DLG1,^[7]
• KCNJ12,^[7][8] и
• KCNJ4.^[7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148943 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027162 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джо К., Дерин Р., Ли М., Бредт Д.С. (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS / Velis-1, -2 и -3: семейства гомологов LIN-7 млекопитающих, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптическим комплексом постсинаптической плотности-95 / рецептора NMDA». J Neurosci. 19 (11): 4189–99. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.19-11-04189.1999. ЧВК  6782594. PMID  10341223.
6. «Ген Entrez: LIN7C гомолог lin-7 C (C. elegans)».
7. Леонудакис Д., Конти Л. Р., Радеке С. М., Макгуайр Л. М., Ванденберг, Калифорния (апрель 2004 г.). «Мультибелковый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с калиевыми каналами внутреннего выпрямителя Kir2». J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. Дои:10.1074 / jbc.M400284200. PMID  14960569.
8. Леонудакис Д., Конти Л. Р., Андерсон С., Радеке С. М., Макгуайр Л. М., Адамс М.Э., Фроенер С.К., Йейтс Дж. Р., Ванденберг, Калифорния (май 2004 г.). «Белковые комплексы переноса и закрепления, выявленные протеомным анализом белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. Дои:10.1074 / jbc.M400285200. PMID  15024025.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Бекамель С., Алонсо Дж., Галеотти Н., Демей Э, Жуэн П., Ульмер К., Дюмуи А., Бокарт Дж., Марин П. (2002). «Синаптические мультибелковые комплексы, связанные с рецепторами 5-HT (2C): протеомный подход». EMBO J. 21 (10): 2332–42. Дои:10.1093 / emboj / 21.10.2332. ЧВК  126011. PMID  12006486.
• Хори К., Конно Д., Маруока Х, Собуэ К. (2003). «MALS является партнером связывания IRSp53 в межклеточных контактах». FEBS Lett. 554 (1–2): 30–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01074-3. PMID  14596909. S2CID  30329043.
• Леонудакис Д., Конти Л. Р., Радеке С. М., Макгуайр Л. М., Ванденберг Калифорния (2004). «Мультибелковый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с калиевыми каналами внутреннего выпрямителя Kir2». J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. Дои:10.1074 / jbc.M400284200. PMID  14960569.
• Леонудакис Д., Конти Л. Р., Андерсон С., Радеке С. М., Макгуайр Л. М., Адамс М. Е., Фроенер С. К., Йейтс Дж. Р., Ванденберг, Калифорния (2004). «Белковые комплексы переноса и закрепления, выявленные протеомным анализом белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. Дои:10.1074 / jbc.M400285200. PMID  15024025.
• Петроски KY, Ou HD, Löhr F, Dötsch V, Lim WA (2006). «Общая модель предпочтительной гетеро-олигомеризации доменов LIN-2/7: механизм, лежащий в основе направленной сборки супрамолекулярных сигнальных комплексов». J. Biol. Chem. 280 (46): 38528–36. Дои:10.1074 / jbc.M506536200. PMID  16147993.
• Мендес С.С., Гомес Д.А., Томпсон М., Соуто, Северная Каролина, Гоес Т.С., Гус А.М., Родригес М.А., Гомес М.В., Натансон М.Х., Лейте М.Ф. (2006). «Инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор типа III предпочтительно передает апоптотические сигналы Ca2 + в митохондрии». J. Biol. Chem. 280 (49): 40892–900. Дои:10.1074 / jbc.M506623200. PMID  16192275.
• Бол Дж, Браймер Н., Лайонс С., Ванде Поль С.Б. (2007). «Белок семейства звездной пыли MPP7 образует трехкомпонентный комплекс с LIN7 и DLG1, который регулирует стабильность и локализацию DLG1 на стыках клеток». J. Biol. Chem. 282 (13): 9392–400. Дои:10.1074 / jbc.M610002200. PMID  17237226.
• Онда Т., Удзава К., Накашима Д., Сайто К., Ивадатэ Ю., Секи Н., Шибахара Т., Танзава Х. (2007). «Lin-7C / VELI3 / MALS-3: важный компонент при метастазировании плоскоклеточной карциномы человека» (PDF). Рак Res. 67 (20): 9643–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1911. PMID  17942893.