DLG1 - DLG1

DLG1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1PDR, 2М3М, 2OQS, 2X7Z, 3RL7, 3RL8, 3W9Y, 4 утра, 4G69
Идентификаторы
Псевдонимы	DLG1, DLGH1, SAP-97, SAP97, dJ1061C18.1.1, hdlg, B130052P05Rik, E-dlg / SAP97, mKIAA4187, диски большого гомолога 1, компонент комплекса полярности каракулей, диски большого каркасного белка MAGUK 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601014 MGI: 107231 ГомолоГен: 20869 Генные карты: DLG1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q29 Начните 197,042,560 бп[1] Конец 197,299,330 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 B2 | 16 22,4 см Начните 31,663,443 бп[2] Конец 31,875,129 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фосфатазы • фосфопротеинфосфатазная активность • связывание ионного канала • связывание с белками цитоскелета • связывание с С-концом белка • связывание ионотропного рецептора глутамата • связывание киназы • Связывание киназы митоген-активируемой протеинкиназы • активность гуанилаткиназы • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера • связывание протеинкиназы • Связывание домена L27 • активность лиганд-зависимого ионного канала • активность регулятора калиевых каналов • связывание кадгерина • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов • структурная составляющая постсинаптической плотности Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • постсинаптическая мембрана • мембрана • межклеточное соединение • двухклеточное плотное соединение • узел Ранвье • синапс • перинуклеарная область цитоплазмы • цитоплазматическая сторона плазматической мембраны • микротрубочки • ядро клетки • клеточная проекционная мембрана • мембранный плот • ионотропный рецепторный комплекс глутамата • внеклеточная экзосома • аппарат Гольджи • латеральная плазматическая мембрана • вставной диск • нервно-мышечное соединение • миелиновая оболочка абаксональной области • боковая петля • мембрана эндоплазматического ретикулума • Комплекс MPP7-DLG1-LIN7 • сарколемма • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • соединение клеток • базолатеральная плазматическая мембрана • клеточная мембрана • эндоплазматический ретикулум • иммунологический синапс • базальная мембрана • апикальная плазматическая мембрана • проекция нейрона • постсинаптическая плотностная мембрана • глутаматергический синапс Биологический процесс • морфогенез эмбриональной скелетной системы • развитие зачатка мочеточника • положительное регулирование полимеризации актиновых филаментов • положительное регулирование транспорта ионов калия • отрицательная регуляция каскада p38MAPK • метаболический процесс белка-предшественника амилоида • морфогенез ткани • развитие репродуктивной структуры • мембранная организация плота • развитие твердого неба • пролиферация эндотелиальных клеток • развитие гладкой мышечной ткани • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • регуляция трансмембранного транспорта ионов натрия • организация астральных микротрубочек • организация актиновых филаментов • контрольная точка митотического клеточного цикла • кластеризация рецепторов • установление или поддержание полярности клеток • отрицательная регуляция пролиферации Т-клеток • ветвление участвует в морфогенезе зачатка мочеточника • регулирование миелинизации • организация кортикальных микротрубочек • установление или поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • GO: 0022415 вирусный процесс • Производство цитокинов Т-лимфоцитами • Активация Т-клеток • перистальтика • локализация рецептора в синапсе • отрицательная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие нервной системы • регулировка формы клеток • установление локализации центросомы • формирование иммунологического синапса • GO: 0033109 Организация кортикального актинового цитоскелета • локализация белка • проявление линз в глазу камерного типа • локализация клеточного белкового комплекса • сборка двухклеточного плотного спая • положительное регулирование пролиферации клеток • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • активация активности протеинкиназы • отрицательная регуляция митотического клеточного цикла • регулирование мембранного потенциала • локализация белка на плазматической мембране • Метаболический процесс GDP • трансмембранный перенос ионов • дефосфорилирование белков • GMP метаболический процесс • химическая синаптическая передача • регуляция потенциала действия клеток сердечной мышцы желудочка • регулирование импорта ионов калия • регулирование активности потенциалзависимых калиевых каналов, участвующих в реполяризации потенциала действия клеток сердечной мышцы желудочка • регуляция экспорта ионов калия через плазматическую мембрану • Каскад MAPK • межклеточная адгезия • поддержание постсинаптической плотностной структуры • локализация рецептора нейромедиатора на мембране постсинаптической специализации • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране • регуляция активности рецепторов NMDA Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1739	13383
Ансамбль	ENSG00000075711	ENSMUSG00000022770
UniProt	Q12959	Q811D0
RefSeq (мРНК)	NM_001098424 NM_001204386 NM_001204387 NM_001204388 NM_001290983 NM_004087 NM_001363865 NM_001366203 NM_001366204 NM_001366205 NM_001366206 NM_001366207 NM_001366208 NM_001366209 NM_001366210 NM_001366211 NM_001366212 NM_001366213 NM_001366214 NM_001366215 NM_001366216 NM_001366217 NM_001366218 NM_001366219 NM_001366220 NM_001366221 NM_001366222	NM_001252433 NM_001252434 NM_001252435 NM_001252436 NM_007862 NM_001357281 NM_001357282
RefSeq (белок)	NP_001091894 NP_001191315 NP_001191316 NP_001191317 NP_001277912 NP_004078 NP_001350794 NP_001353132 NP_001353133 NP_001353134 NP_001353135 NP_001353136 NP_001353137 NP_001353138 NP_001353139 NP_001353140 NP_001353141 NP_001353142 NP_001353143 NP_001353144 NP_001353145 NP_001353146 NP_001353147 NP_001353148 NP_001353149 NP_001353150 NP_001353151	NP_001239362 NP_001239363 NP_001239364 NP_001239365 NP_031888 NP_001344210 NP_001344211
Расположение (UCSC)	Chr 3: 197.04 - 197,3 Мб	Chr 16: 31,66 - 31,88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Диски большой гомолог 1 (DLG1), также известен как синапс-ассоциированный белок 97 или SAP97, это каркасный белок что у людей кодируется SAP97 ген.

SAP97 - это млекопитающее МАГУК белок-член семейства, похожий на белок Drosophila Dlg1 (этот белок также называют hDlg1, а ген человека - DLG1). SAP97 экспрессируется по всему телу в эпителиальный клетки. В мозгу он участвует в торговле ионотропные рецепторы от эндоплазматический ретикулум к плазматическая мембрана, и может быть причастен к торговле AMPAR во время синаптической пластичности.

Функция

SAP97 экспрессируется по всему телу в эпителиальных клетках, включая почки и мозг.^[5] Есть некоторые свидетельства того, что SAP97 регулирует межклеточную адгезию во время гибели клеток и может взаимодействовать с ВПЧ. В головном мозге функция SAP97 участвует в транспортировке трансмембранных рецепторов от ER к плазматической мембране.^[6]

Функция SAP97 была исследована путем уменьшения ее выражения на выбить или увеличивая свое выражение гетерологично. Мыши, у которых был отключен ген SAP97, умирают перинатально, имеют волчья пасть и нарушения функции почек.^[7][8] Сверхэкспрессия SAP97 в нейронах млекопитающих приводит к увеличению синаптический прочность.^[9]

Клиническое значение

Мутации в DLG1 связаны с Болезнь Крона.^[10]

три PDZ домены, SH3 домен, домен перехвата, домен I3 и, наконец, неактивный гуанилаткиназа (GK) домен. У каждого из этих доменов есть конкретные взаимодействующие партнеры, которые помогают определить уникальную функцию SAP97.

Альтернативно, n-конец SAP97 может быть сплайсирован так, чтобы он содержал сайт двойного цистеина / пальмитоилирования (α-изоформа) или домен L27 (β-изоформа. Домен L27 участвует в SAP97. олигомеризация с другими молекулами SAP97, CASK и другими белками, содержащими L27-домен.^[11] Также есть миозин Сайт связывания VI рядом с n-концом, который может участвовать во интернализации AMPAR.^[12][13]

Каждый из PDZ-доменов SAP97 имеет разных партнеров по связыванию, включая субъединицу AMPAR GluR1.^[14][15] для первого домена PDZ, и нейролигин за последние. Домен I3 SAP97 является уникальным для SAP97 из семейства MAGUK и, как известно, регулирует постсинаптическую локализацию SAP97.^[9] и связывать белок 4.1N. Домен GK позволяет SAP97 связываться с ГКАП / Белки семейства SAPAP.

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075711 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022770 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мюллер Б.М., Кистнер У., Вех Р.В., Кейз-Лангхофф С., Беккер Б., Гундельфингер Э.Д., Гарнер С.К. (март 1995 г.). «Молекулярная характеристика и пространственное распределение SAP97, нового пресинаптического белка, гомологичного SAP90 и белку-супрессору больших опухолей дисков Drosophila». Журнал неврологии. 15 (3, часть 2): 2354–66. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.15-03-02354.1995. ЧВК  6578138. PMID  7891172.
6. Sans N, Racca C, Petralia RS, Wang YX, McCallum J, Wenthold RJ (октябрь 2001 г.). «Связанный с синапсом белок 97 избирательно связывается с подмножеством рецепторов AMPA на ранней стадии их биосинтетического пути». Журнал неврологии. 21 (19): 7506–16. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-19-07506.2001. ЧВК  6762903. PMID  11567040.
7. Каруана Г., Бернштейн А. (март 2001 г.). «Черепно-лицевой дисморфогенез, включая волчью пасть у мышей с инсерционной мутацией в гене большого диска». Молекулярная и клеточная биология. 21 (5): 1475–83. Дои:10.1128 / MCB.21.5.1475-1483.2001. ЧВК  86693. PMID  11238884.
8. Махони ZX, Саммут Б., Ксавьер Р.Дж., Каннингем Дж., Гоу Джи, Брим К.Л., Стаппенбек Т.С., Майнер Дж. Х., Сват В. (декабрь 2006 г.). «Диски-большой гомолог 1 регулируют ориентацию гладких мышц в мочеточнике мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (52): 19872–7. Дои:10.1073 / pnas.0609326103. ЧВК  1750896. PMID  17172448.
9. Рамбо Дж., Сиа ГМ, Гарнер СС, Хуганир Р.Л. (июнь 2003 г.). "Синапс-ассоциированная изоформа белка-97 регуляция поверхностных рецепторов AMPA и синаптической функции в культивируемых нейронах". Журнал неврологии. 23 (11): 4567–76. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-11-04567.2003. ЧВК  6740810. PMID  12805297.
10. Сюй С., Чжоу Ф., Тао Дж., Сон Л., Нг СК, Ван Х, Чен Л., И Ф, Ран З, Чжоу Р., Ся Б. (2014). «Секвенирование экзома определяет DLG1 как новый ген потенциальной предрасположенности к болезни Крона в китайском семейном исследовании». PLOS ONE. 9 (6): e99807. Дои:10.1371 / journal.pone.0099807. ЧВК  4061034. PMID  24937328.
11. Ли С., Фан С., Макарова О., Стрейт С., Марголис Б. (март 2002 г.). «Новый и консервативный домен белок-белкового взаимодействия Lin-2 / CASK млекопитающих связывает и рекрутирует SAP97 на латеральную поверхность эпителия». Молекулярная и клеточная биология. 22 (6): 1778–91. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1778-1791.2002. ЧВК  135599. PMID  11865057.
12. Wu H, Nash JE, Zamorano P, Garner CC (август 2002 г.). «Взаимодействие SAP97 с актиновым моторным миозином VI, направленным на минус-конец. Последствия для торговли рецепторами AMPA». Журнал биологической химии. 277 (34): 30928–34. Дои:10.1074 / jbc.M203735200. PMID  12050163.
13. Остервейл Э., Уэллс Д.Г., Мусекер М.С. (январь 2005 г.). «Роль миозина VI в постсинаптической структуре и эндоцитозе глутаматных рецепторов». Журнал клеточной биологии. 168 (2): 329–38. Дои:10.1083 / jcb.200410091. ЧВК  2171578. PMID  15657400.
14. Леонард А.С., Даваре М.А., Хорн М.С., Гарнер С.К., Hell JW (июль 1998 г.). «SAP97 связан с субъединицей GluR1 рецептора альфа-амино-3-гидрокси-5-метилизоксазол-4-пропионовой кислоты». Журнал биологической химии. 273 (31): 19518–24. Дои:10.1074 / jbc.273.31.19518. PMID  9677374.
15. Кай К., Коулман С.К., Ниеми К., Кейнянен К. (август 2002 г.). «Селективное связывание синапс-ассоциированного белка 97 с субъединицей рецептора альфа-амино-5-гидрокси-3-метил-4-изоксазол пропионата GluR-A определяется новым мотивом последовательности». Журнал биологической химии. 277 (35): 31484–90. Дои:10.1074 / jbc.M204354200. PMID  12070168.

| объем = 25 | issue = 6 | pages = 542–53 | date = июнь 2003 г. | pmid = 12766944 | doi = 10.1002 / bies.10286}}

• Мукерджи А., Варма С.К., Натараджан К. (февраль 1972 г.). «Нестабильность голеностопного сустава при полиомиелите». Индийский журнал педиатрии. 39 (289): 37–8. Дои:10.1007 / BF02799404. PMID  5024025. S2CID  46659798.
• Ким Э., Нитхаммер М., Ротшильд А., Ян Ю.Н., Шенг М. (ноябрь 1995 г.). «Кластеризация K + каналов шейкерного типа путем взаимодействия с семейством мембран-ассоциированных гуанилаткиназ». Природа. 378 (6552): 85–8. Дои:10.1038 / 378085a0. PMID  7477295. S2CID  4362906.
• Lue RA, Marfatia SM, Branton D, Chishti AH (октябрь 1994 г.). «Клонирование и характеристика hdlg: человеческий гомолог дисков Drosophila, большой супрессор опухоли связывается с белком 4.1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (21): 9818–22. Дои:10.1073 / пнас.91.21.9818. ЧВК  44908. PMID  7937897.
• Niethammer M, Kim E, Sheng M (апрель 1996 г.). «Взаимодействие между С-концом субъединиц рецептора NMDA и множеством членов семейства PSD-95 мембраносвязанных гуанилаткиназ». Журнал неврологии. 16 (7): 2157–63. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-07-02157.1996. ЧВК  6578538. PMID  8601796.
• Azim AC, Knoll JH, Marfatia SM, Peel DJ, Bryant PJ, Chishti AH (декабрь 1995 г.). «DLG1: расположение в хромосоме ближайшего человеческого гомолога большого гена-супрессора опухолей дисков Drosophila». Геномика. 30 (3): 613–6. Дои:10.1006 / geno.1995.1286. PMID  8825652.
• Лю Р.А., Брандин Э., Чан Э.П., Брантон Д. (ноябрь 1996 г.). «Два независимых домена hDlg достаточны для субклеточного нацеливания: конформационная единица PDZ1-2 и альтернативно сплайсированный домен». Журнал клеточной биологии. 135 (4): 1125–37. Дои:10.1083 / jcb.135.4.1125. ЧВК  2133382. PMID  8922391.
• Такеучи М., Хата Й, Хирао К., Тойода А., Ирие М., Такай Й. (май 1997 г.). «SAPAPs. Семейство белков, связанных с PSD-95 / SAP90, локализованных в постсинаптической плотности». Журнал биологической химии. 272 (18): 11943–51. Дои:10.1074 / jbc.272.18.11943. PMID  9115257.
• Хорио Й., Хибино Х., Инанобе А., Ямада М., Исии М., Тада Й., Сато Е., Хата Й, Такай Й, Курачи Й (май 1997 г.). «Кластеризация и усиление активности внутреннего выпрямляющего калиевого канала, Kir4.1, за счет якорного белка PSD-95 / SAP90». Журнал биологической химии. 272 (20): 12885–8. Дои:10.1074 / jbc.272.20.12885. PMID  9148889.
• Ли СС, Вайс Р.С., Хавьер Р.Т. (июнь 1997 г.). «Связывание онкопротеинов вируса человека с hDlg / SAP97, млекопитающим, гомологом большого белка-супрессора опухоли дисков Drosophila». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (13): 6670–5. Дои:10.1073 / пнас.94.13.6670. ЧВК  21216. PMID  9192623.
• Сато К., Янаи Х., Сенда Т., Коху К., Накамура Т., Окумура Н., Мацумине А., Кобаяши С., Тоошима К., Акияма Т. (июнь 1997 г.). «DAP-1, новый белок, который взаимодействует с гуанилаткиназоподобными доменами hDLG и PSD-95». Гены в клетки. 2 (6): 415–24. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1997.1310329.x. PMID  9286858. S2CID  8934092.
• Ханада Т., Линь Л., Чанди К.Г., О СС, Чишти А.Х. (октябрь 1997 г.). «Человеческий гомолог большого опухолевого супрессора дисков Drosophila связывается с тирозинкиназой p56lck и калиевым каналом Kv1.3 Shaker типа в Т-лимфоцитах». Журнал биологической химии. 272 (43): 26899–904. Дои:10.1074 / jbc.272.43.26899. PMID  9341123.
• Reuver SM, Garner CC (апрель 1998 г.). «Опосредованная E-кадгерином клеточная адгезия привлекает SAP97 в кортикальный цитоскелет». Журнал клеточной науки. 111 (8): 1071–80. PMID  9512503.
• Леонард А.С., Даваре М.А., Хорн М.С., Гарнер С.К., Hell JW (июль 1998 г.). «SAP97 связан с субъединицей GluR1 рецептора альфа-амино-3-гидрокси-5-метилизоксазол-4-пропионовой кислоты». Журнал биологической химии. 273 (31): 19518–24. Дои:10.1074 / jbc.273.31.19518. PMID  9677374.
• Дегучи М., Хата Й, Такеучи М., Идэ Н, Хирао К., Яо И., Ирие М., Тойода А., Такай Ю. (октябрь 1998 г.). «НАЧАЛО (мозг, обогащенный гуанилаткиназным белком), новый нейрональный белок, связывающий PSD-95 / SAP90». Журнал биологической химии. 273 (41): 26269–72. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26269. PMID  9756850.
• Бренман Дж. Э., Топинка Дж. Р., Купер Э. К., Макги А. В., Розен Дж., Милрой Т., Ральстон Х. Дж., Бредт Д. С. (ноябрь 1998 г.). «Локализация постсинаптической плотности-93 в дендритных микротрубочках и взаимодействие с белком 1A, связанным с микротрубочками». Журнал неврологии. 18 (21): 8805–13. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.18-21-08805.1998. ЧВК  6793550. PMID  9786987.
• Bassand P, Bernard A, Rafiki A, Gayet D, Khrestchatisky M (июнь 1999 г.). «Дифференциальное взаимодействие мотивов tSXV субъединиц рецептора NR1 и NR2A NMDA с PSD-95 и SAP97». Европейский журнал нейробиологии. 11 (6): 2031–43. Дои:10.1046 / j.1460-9568.1999.00611.x. PMID  10336672. S2CID  25611356.
• Файрстейн Б.Л., Файрештайн Б.Л., Бренман Дж. Э., Аоки С., Санчес-Перес А. М., Эль-Хусейни А. Е., Бредт Д. С. (ноябрь 1999 г.). "Cypin: цитозольный регулятор постсинаптического нацеливания PSD-95". Нейрон. 24 (3): 659–72. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81120-4. PMID  10595517.
• Хибино Х., Инанобе А., Танемото М., Фудзита А., Дои К., Кубо Т., Хата Й, Такай Й, Курачи Й (январь 2000 г.). «Заякоренные белки придают чувствительность G-белка к K (+) каналу внутреннего выпрямителя через домен GK». Журнал EMBO. 19 (1): 78–83. Дои:10.1093 / emboj / 19.1.78. ЧВК  1171779. PMID  10619846.
• Адей Н.Б., Хуанг Л., Ормонд П.А., Баумгард М.Л., Перо Р., Биредди Д.В., Тавтиджан С.В., Бартель П.Л. (январь 2000 г.). «Фосфорилирование треонина PDZ-связывающего домена MMAC1 / PTEN как ингибирует, так и стимулирует связывание PDZ». Исследования рака. 60 (1): 35–7. PMID  10646847.

Microsoft Windows Windows Microsoft word Microsoft электростанции