LNX1 - LNX1

LNX1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3B76
Идентификаторы
Псевдонимы	LNX1, LNX, MPDZ, PDZRN2, лиганд numb-белка X 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609732 MGI: 1278335 ГомолоГен: 7819 Генные карты: LNX1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q12 Начните 53,459,301 бп[1] Конец 53,701,405 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 C3.3 Начните 74,592,447 бп[2] Конец 74,702,912 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание домена PDZ • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность • связывание ионов цинка Сотовый компонент • цитоплазма Биологический процесс • гомоолигомеризация белков • убиквитинирование белков • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84708	16924
Ансамбль	ENSG00000072201	ENSMUSG00000029228
UniProt	Q8TBB1	O70263
RefSeq (мРНК)	NM_001126328 NM_032622	NM_001159577 NM_001159578 NM_001159579 NM_001159580 NM_010727 NM_001359074
RefSeq (белок)	NP_001119800 NP_116011	NP_001153049 NP_001153050 NP_001153051 NP_001153052 NP_034857 NP_001346003
Расположение (UCSC)	Chr 4: 53,46 - 53,7 Мб	Chr 5: 74,59 - 74,7 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза LNX является фермент что у людей кодируется LNX1 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

LNX1 был показан взаимодействовать с НАГК,^[8] ОНЕМЕВШИЙ^[6] и PAFAH1B3.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072201 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029228 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Се И, Чжао В., Ван В., Чжао С., Тан Р., Инь К., Чжоу З., Мао Ю. (апрель 2001 г.). «Идентификация человеческого белка LNX, содержащего несколько доменов PDZ». Биохимическая генетика. 39 (3–4): 117–26. Дои:10.1023 / А: 1010269908398. PMID  11521506. S2CID  9150813.
6. Nie J, McGill MA, Dermer M, Dho SE, Wolting CD, McGlade CJ (январь 2002 г.). «LNX функционирует как убиквитинлигаза E3 типа RING, которая нацелена на детерминант судьбы клетки Numb для убиквитин-зависимой деградации». Журнал EMBO. 21 (1–2): 93–102. Дои:10.1093 / emboj / 21.1.93. ЧВК  125803. PMID  11782429.
7. «Ген Entrez: лиганд LNX1 numb-белка X 1».
8. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

дальнейшее чтение

• Dho SE, Jacob S, Wolting CD, French MB, Rohrschneider LR, McGlade CJ (апрель 1998 г.). «Фосфотирозинсвязывающий домен онеменного млекопитающего. Характеристика специфичности связывания и идентификация нового PDZ-домена, содержащего онемение связывающего белка, LNX». Журнал биологической химии. 273 (15): 9179–87. Дои:10.1074 / jbc.273.15.9179. PMID  9535908.
• Райс Д.С., Норткатт Г.М., Куршнер С. (ноябрь 2001 г.). «Белки семейства Lnx функционируют как молекулярные каркасы для белков семейства Numb». Молекулярная и клеточная нейронауки. 18 (5): 525–40. Дои:10.1006 / mcne.2001.1024. PMID  11922143. S2CID  6021682.
• Соллербрант К., Рашпергер Э., Мирза М., Энгстром Ю., Филипсон Л., Юнгдал П.О., Петтерссон РФ (февраль 2003 г.). «Рецептор вируса Коксаки и аденовируса (CAR) образует комплекс с PDZ-доменом, содержащим белок-лиганд-of-numb, белок-X (LNX)». Журнал биологической химии. 278 (9): 7439–44. Дои:10.1074 / jbc.M205927200. PMID  12468544.
• Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Геномные исследования. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Като М., Като М. (апрель 2004 г.). «Идентификация и характеристика генов PDZRN3 и PDZRN4 in silico». Международный журнал молекулярной медицины. 13 (4): 607–13. Дои:10.3892 / ijmm.13.4.607. PMID  15010864.
• Армбруестер В., Заутер М., Ремер К., Бест Б., Хан С., Нти А., Шмид А., Филипп С., Мюллер А., Мюллер-Ланц Н. (октябрь 2004 г.). «Белок Np9 эндогенного ретровируса К человека взаимодействует с лигандом белка X numb». Журнал вирусологии. 78 (19): 10310–9. Дои:10.1128 / JVI.78.19.10310-10319.2004. ЧВК  516385. PMID  15367597.
• Chen J, Xu J, Zhao W., Hu G, Cheng H, Kang Y, Xie Y, Lu Y (ноябрь 2005 г.). «Характеристика человеческого LNX, нового лиганда белка X Numb, который подавляется в глиомах человека». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 37 (11): 2273–83. Дои:10.1016 / j.biocel.2005.02.028. PMID  16002321.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Вайс А., Баумгартнер М., Радзивилл Дж., Деннлер Дж., Мёллинг К. (октябрь 2007 г.). «c-Src является партнером по взаимодействию PDZ и субстратом белка X1 Ligand-of-Numb E3 убиквитинлигазы». Письма FEBS. 581 (26): 5131–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2007.09.062. PMID  17936276. S2CID  43098921.