LUC7L3 - LUC7L3

LUC7L3
Идентификаторы
Псевдонимы	LUC7L3, CRA, CREAP-1, CROP, LUC7A, OA48-18, hLuc7A, LUC7 like 3 фактор сплайсинга пре-мРНК
Внешние идентификаторы	OMIM: 609434 MGI: 1914934 ГомолоГен: 75056 Генные карты: LUC7L3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.33 Начните 50,719,565 бп[1] Конец 50,756,219 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 Д Начните 94,287,890 бп[2] Конец 94,321,988 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание мРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • U1 snRNP • Пресплицеосома U2-типа • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное пятнышко Биологический процесс • обработка мРНК • Выбор сайта сплайсинга мРНК • Сплайсинг РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51747	67684
Ансамбль	ENSG00000108848	ENSMUSG00000020863
UniProt	O95232	Q5SUF2
RefSeq (мРНК)	NM_006107 NM_016424 NM_001330330	NM_026313 NM_001361573 NM_001361574 NM_001361575
RefSeq (белок)	NP_001317259 NP_006098 NP_057508	NP_080589 NP_001348502 NP_001348503 NP_001348504
Расположение (UCSC)	Chr 17: 50,72 - 50,76 Мб	Chr 11: 94.29 - 94.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LUC7 like 3 фактор сплайсинга пре-мРНК (LUC7L3), также известный как Сверхэкспрессируемый белок, связанный с устойчивостью к цисплатину, или УРОЖАЙ, это человек ген.^[5]

Этот ген кодирует цисплатин сверхэкспрессия, связанная с резистентностью белок (ОБРЕЗАТЬ). В N-концевой половина CROP содержит мотивы цистеина / гистидина и лейцин молнии повторяется, а C-терминал половина богата аргинин и глутамат остатки (домен RE) и остатки аргинина и серина (домен RS). Этот белок с пятнами локализуется в ядро, и могли участвовать в формировании крутой через домены RE и RS. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108848 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020863 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: сверхэкспрессируемый белок, связанный с устойчивостью к цисплатину CROP».

внешние ссылки

• Человек LUC7L3 расположение генома и LUC7L3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Нишии Ю., Моришима М., Какехи Ю. и др. (2000). «CROP / Luc7A, новый богатый серином / аргинином ядерный белок, выделенный из устойчивой к цисплатину линии клеток». FEBS Lett. 465 (2–3): 153–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01744-5. PMID  10631324. S2CID  7918526.
• Чин Л.С., Сингх С.К., Ван К., Мюррей С.Ф. (2000). «Идентификация генов, индуцированных окадаиновой кислотой, путем дифференциального отображения мРНК в клетках глиомы». J. Biomed. Наука. 7 (2): 152–9. Дои:10.1007 / BF02256622. PMID  10754390.
• Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С. и др. (2001). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Nat. Биотехнология. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Умехара Х., Нишии Й., Моришима М. и др. (2003). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином / аргинином ядерного белка CROP / Luc7A». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 301 (2): 324–9. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6. PMID  12565863.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Браун В., Браун Р.А., Озинский А. и др. (2006). «Специфичность связывания цитоплазматических доменов Toll-подобных рецепторов». Евро. J. Immunol. 36 (3): 742–53. Дои:10.1002 / eji.200535158. ЧВК  2762736. PMID  16482509.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Пуиг О, Брагадо-Нильссон Э, Коски Т., Серафин Б. (2007). «U1 snRNP-ассоциированный фактор Luc7p влияет на выбор 5'-сайта сплайсинга у дрожжей и человека». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (17): 5874–85. Дои:10.1093 / нар / гкм505. ЧВК  2034479. PMID  17726058.