Лектин бобовых - Legume lectin - Wikipedia

Лектиновый домен бобовых (или лектиновый домен L-типа)
PDB 1лем EBI.jpg
Структура сайта связывания моносахаридов лектина чечевицы.[1]
Идентификаторы
СимволLectin_legB
PfamPF00139
Pfam кланCL0004
ИнтерПроIPR001220
PROSITEPDOC00278
SCOP21лем / Объем / СУПФАМ

В лектины бобовых (или лектины L-типа) представляют собой семейство сахаросвязывающих белков или лектины содержится в семенах и, в меньших количествах, в корнях, стеблях, листьях и коре растений семейства Fabaceae.[2][3] Точная функция лектинов бобовых культур in vivo неизвестно, но они, вероятно, участвуют в защите растений от хищников. Также были обнаружены родственные белки в других семействах растений и животных. На протяжении десятилетий они использовались в качестве модельной системы для изучения белок-углеводных взаимодействий, поскольку демонстрируют удивительное разнообразие специфичности связывания и их легко получить и очистить. За прошедшие годы было собрано впечатляющее количество структурных данных.[3] К хорошо изученным членам этого семейства белков относятся: фитогемагглютинин и конканавалин А.

Связывание сахара лектинами бобовых культур

Лектины бобовых используют гениальную основу для связывания определенных сахаров. Этот каркас состоит из консервативного сайта связывания моносахарида, в котором четыре консервативных остатка из четырех отдельных областей в белке придают аффинность (см. Рисунок), вариабельной петли, которая придает моносахаридоспецифичность, и ряда субсайтов вокруг сайта связывания моносахарида, которые содержат дополнительные остатки сахара или гидрофобные группы.[3]

Четвертичная структура

Лектины бобовых культур интересны и с точки зрения белковой структуры. Несмотря на консервативную структуру субъединицы лектина бобовых, они могут принимать широкий спектр четвертичных структур.[4][5]Причина этой замечательной изменчивости, вероятно, кроется во взаимодействии с поливалентными лигандами.[6]

Типичный мономер лектина бобовых (чечевица лектин), в комплексе с сахаром (глюкоза ). Четыре петли для связывания сахара показаны разными цветами. Переменная петля, которая придает моносахаридную специфичность, показана оранжевым.
Четвертичные структуры некоторых лектинов бобовых культур. Одна из субъединиц имеет одинаковую ориентацию во всех структурах для простоты сравнения.

Рекомендации

  1. ^ Loris R, Casset F, Bouckaert J, et al. (Декабрь 1994 г.). «Сайт связывания моносахаридов лектина чечевицы: исследование рентгеновского и молекулярного моделирования». Glycoconj. J. 11 (6): 507–17. Дои:10.1007 / bf00731301. PMID  7696853.
  2. ^ Шэрон Н., Лис Х. (ноябрь 1990 г.). «Лектины бобовых - большое семейство гомологичных белков». FASEB J. 4 (14): 3198–208. Дои:10.1096 / fasebj.4.14.2227211. PMID  2227211.
  3. ^ а б c Лорис Р., Хамелрик Т., Букерт Дж., Винс Л. (март 1998 г.). «Лектиновый состав бобовых культур». Биохим. Биофиз. Acta. 1383 (1): 9–36. Дои:10.1016 / S0167-4838 (97) 00182-9. PMID  9546043.
  4. ^ Манодж Н., Сугуна К. (октябрь 2001 г.). «Сигнатура четвертичной структуры в последовательностях лектинов бобовых культур». Protein Eng. 14 (10): 735–45. Дои:10.1093 / белок / 14.10.735. PMID  11739891.
  5. ^ Браузер PDBe для лектиновых сборок бобовых
  6. ^ Хэмелрик Т.В., Мур Дж. Г., Криспелс М. Дж., Лорис Р., Винс Л. (июнь 2000 г.). «Роль слабых белок-белковых взаимодействий в мультивалентном связывании лектина и углеводов: кристаллическая структура поперечно-сшитого FRIL». J. Mol. Биол. 299 (4): 875–83. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3785. PMID  10843844.