Listeria Hfq связывание LhrC - Listeria Hfq binding LhrC

Listeria LhrC
RF00616.jpg
Идентификаторы
СимволLhrC
РфамRF00616
Прочие данные
РНК типГен; мРНК
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000655
PDB структурыPDBe

Listeria LhrC нкРНК был идентифицирован путем скрининга молекул РНК, которые коиммунопреципитированный с РНК шаперон Hfq.[1] Однако ни стабильность, ни активность LhrC, по-видимому, не зависят от присутствия Hfq.[2][3] Эта РНК транскрибируется из межгенной области между белок кодирующие гены cysK, предполагаемый цистеин синтаза и сул, предполагаемый дигидроптероат синтаза. В Listeria monocytogenes четыре дополнительных копии lhrC были идентифицированы в геноме, три из которых расположены в тандемном повторе перед первоначально охарактеризованным lhrC. Эта молекула РНК, по-видимому, сохраняется среди Листерия видов, но не был идентифицирован в других бактериальный разновидность. Он участвует в вирулентность.[2] Прямыми мишенями мРНК LhrC являются адгезия вирулентности LapB и олигопептид-связывающий белок OppA.[2][3] 3 консервативных мотива UCCC, общих для всех копий LhrC, участвуют в связывании мРНК и посттранскрипционной репрессии генов-мишеней. Два других Listerina monocytogenes мРНК Rli22 и Rli33 содержат 2 мотива UCCC и используют их для подавления OPPA Экспрессия мРНК.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Кристиансен Дж. К., Нильсен Дж. С., Эберсбах Т., Валентин-Хансен П., Согаард-Андерсен Л., Каллиполитис Б. Х. (2006). «Идентификация малых Hfq-связывающих РНК в Listeria monocytogenes». РНК. 12 (7): 1383–1396. Дои:10.1261 / rna.49706. ЧВК  1484441. PMID  16682563.
  2. ^ а б c Сиверс, S; Lillebk, EM; Якобсен, К; Лунд, А; Моллеруп, MS; Нильсен, ПК; Kallipolitis, BH (17 июля 2014 г.). «Многокопийная мРНК Listeria monocytogenes регулирует экспрессию вирулентного адгезина LapB». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (14): 9383–9398. Дои:10.1093 / нар / gku630. ЧВК  4132741. PMID  25034691.
  3. ^ а б Сиверс, Сюзанна; Лунд, Аня; Менендес-Гил, Пилар; Нильсен, Аараби; Сторм Моллеруп, Мария; Ламберт Нильсен, Стин; Бух Ларссон, Пернилле; Борх-Йенсен, Йонас; Йоханссон, Йорген (2015). «Многокопийная мРНК LhrC контролирует экспрессию олигопептид-связывающего белка OppA в Listeria monocytogenes». РНК Биология. 12 (9): 985–997. Дои:10.1080/15476286.2015.1071011. ISSN  1555-8584. ЧВК  4615310. PMID  26176322.
  4. ^ Моллеруп, Мария Сторм; Росс, Джозеф Эндрю; Хелфер, Энн-Катрин; Мейструп, Кристина; Ромби, Паскаль; Каллиполитис, Биргитте Хаар (сентябрь 2016 г.). «Два новых члена семейства малых РНК LhrC в Listeria monocytogenes с перекрывающимися регуляторными функциями, но с различными профилями экспрессии». РНК Биология. 13 (9): 895–915. Дои:10.1080/15476286.2016.1208332. ISSN  1555-8584. ЧВК  5013991. PMID  27400116.

внешняя ссылка