Неоднородность локуса - Locus heterogeneity

Неоднородность локуса возникает, когда мутации в нескольких геномных локусах способны давать одинаковые фенотип (т. е. отдельного признака, паттерна признаков или расстройства), и каждой отдельной мутации достаточно, чтобы независимо вызывать конкретный фенотип.[1] Неоднородность локуса не следует путать с аллельная гетерогенность, в котором один фенотип может быть произведен множеством мутаций, все из которых находятся в одном и том же локусе хромосомы.[1] Точно так же его не следует путать с фенотипическая гетерогенность, у которых разные фенотипы возникают среди организмов с одинаковыми генотипы и условия окружающей среды.[2] Гетерогенность локуса и аллельная гетерогенность - два компонента генетическая гетерогенность.[3]

Гетерогенность локуса может иметь серьезные последствия для ряда заболеваний человека. Например, это было связано с пигментный ретинит[4], гипертрофическая кардиомиопатия[5], несовершенный остеогенез[6], и семейная гиперхолестеринемия[7]. Гетерогенные локусы, участвующие в формировании одного и того же фенотипа, часто участвуют в сходных биологических путях.[1] Роль и степень гетерогенности локуса являются важным фактором при понимании фенотипов заболеваний и при разработке терапевтических методов лечения этих заболеваний.[1]

Выявление причинных генов заболеваний, на которые влияет гетерогенность локуса, затруднено с помощью таких методов генетического анализа, как связь анализ и секвенирование генома.[8] Эти методы основаны на сравнении пораженных членов семьи, но когда разные члены семьи имеют разные вызывающие болезнь гены, такие гены могут быть неточно идентифицированы.[8] Существующие методы были изменены, и были разработаны новые методы для решения этих проблем.[8][9][10]

Пигментный ретинит

Пигментный ретинит это состояние, которое вызывает повреждение светочувствительных клеток сетчатки.[11] Было идентифицировано более 60 генов, мутации которых независимо вызывают пигментный ретинит, и они могут быть унаследованы аутосомно-доминантный, аутосомно-рецессивный, или же Х-связанный шаблон.[12] Примеры таких генов включают родопсин ген (RHO), ген, кодирующий регулятор ГТФазы пигментного ретинита (RGPR) и ген, кодирующий белок пигментного ретинита 2 (RP2).[13]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c d Кейт Б.П., Робертсон Д.Л., Хентжес К.Э. (09.12.2014). «Гены болезни локусной гетерогенности кодируют белки с высокой степенью взаимосвязанности в сети взаимодействия белков человека». Границы генетики. 5: 434. Дои:10.3389 / fgene.2014.00434. ЧВК  4260505. PMID  25538735.
  2. ^ Акерманн М. (август 2015 г.). «Функциональный взгляд на фенотипическую гетерогенность микроорганизмов». Обзоры природы. Микробиология. 13 (8): 497–508. Дои:10.1038 / nrmicro3491. PMID  26145732.
  3. ^ "Словарь терминов по генетике NCI". Национальный институт рака. 2012-07-20. Получено 2019-11-27.
  4. ^ Дайгер С.П., Салливан Л.С., Боун С.Дж. (август 2013 г.). «Гены и мутации, вызывающие пигментный ретинит». Клиническая генетика. 84 (2): 132–41. Дои:10.1111 / cge.12203. ЧВК  3856531. PMID  23701314.
  5. ^ Соломон С.Д., Ярчо Дж. А., Маккенна В., Гейстерфер-Ловранс А., Жермен Р., Салерни Р. и др. (Сентябрь 1990 г.). «Семейная гипертрофическая кардиомиопатия - генетически гетерогенное заболевание». Журнал клинических исследований. 86 (3): 993–9. Дои:10.1172 / JCI114802. ЧВК  296820. PMID  1975599.
  6. ^ Ван Дейк Ф.С., Силленс Д.О. (июнь 2014 г.). «Несовершенный остеогенез: клинический диагноз, номенклатура и оценка степени тяжести». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 164A (6): 1470–81. Дои:10.1002 / ajmg.a.36545. ЧВК  4314691. PMID  24715559.
  7. ^ Гольдштейн Дж. Л., Дана С. Е., Бруншеде Г. Ю., Браун М. С. (март 1975 г.). «Генетическая гетерогенность при семейной гиперхолестеринемии: данные о двух разных мутациях, влияющих на функции рецептора липопротеинов низкой плотности». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 72 (3): 1092–6. Bibcode:1975PNAS ... 72.1092G. Дои:10.1073 / pnas.72.3.1092. ЧВК  432472. PMID  236556.
  8. ^ а б c Рехман А.Ю., Сантос-Кортез Р.Л., Драммонд М.К., Шахзад М., Ли К., Морелл Р.Дж. и др. (Сентябрь 2015 г.). «Проблемы и решения для идентификации генов при наличии гетерогенности семейного локуса». Европейский журнал генетики человека. 23 (9): 1207–15. Дои:10.1038 / ejhg.2014.266. ЧВК  4538203. PMID  25491636.
  9. ^ Ван Д., Хуан Дж. (Май 2006 г.). «Обнаружение неравновесия по сцеплению при наличии гетерогенности локуса». Анналы генетики человека. 70 (Pt 3): 397–409. Дои:10.1111 / j.1529-8817.2005.00229.x. PMID  16674561.
  10. ^ Пал Д.К., Гринберг Д.А. (2002). «Оценка генетической гетерогенности при сложных расстройствах». Человеческая наследственность. 53 (4): 216–26. Дои:10.1159/000066195. PMID  12435885.
  11. ^ Хартонг Д. Т., Берсон Э. Л., Дрыджа Т. П. (ноябрь 2006 г.). "Пигментный ретинит". Ланцет. 368 (9549): 1795–809. Дои:10.1016 / S0140-6736 (06) 69740-7. PMID  17113430.
  12. ^ «RetNet: резюме». sph.uth.edu. Получено 2019-11-27.
  13. ^ Ferrari S, Di Iorio E, Barbaro V, Ponzin D, Sorrentino FS, Parmeggiani F (июнь 2011 г.). «Пигментный ретинит: гены и механизмы болезни». Текущая геномика. 12 (4): 238–49. Дои:10.2174/138920211795860107. ЧВК  3131731. PMID  22131869.