MADD (ген) - MADD (gene)

MADD
Идентификаторы
Псевдонимы	MADD, DENN, IG20, RAB3GEP, домен смерти, активирующий MAP-киназу
Внешние идентификаторы	OMIM: 603584 MGI: 2444672 ГомолоГен: 14249 Генные карты: MADD
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p11.2 Начните 47,269,161 бп[1] Конец 47,330,031 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E1 Начните 91,137,360 бп[2] Конец 91,183,837 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора смерти • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • активность активатора протеинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Раб гуанил-нуклеотидный фактор обмена активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • фаза выполнения апоптоза • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • регуляция передачи сигнала Rab-белка • регуляция клеточного цикла • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • активация активности MAPK • регуляция внешнего апоптотического сигнального пути через рецепторы домена смерти • апоптотический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8567	228355
Ансамбль	ENSG00000110514	ENSMUSG00000040687
UniProt	Q8WXG6	Q80U28
RefSeq (мРНК)	NM_001135943 NM_001135944 NM_003682 NM_130470 NM_130471 NM_130472 NM_130473 NM_130474 NM_130475 NM_130476	NM_001177719 NM_001177720 NM_001177721 NM_001177722 NM_001177723 NM_001177724 NM_001177725 NM_001177726 NM_001177727 NM_001177728 NM_001177729 NM_145527
RefSeq (белок)	NP_001129415 NP_001129416 NP_003673 NP_569826 NP_569827 NP_569828 NP_569829 NP_569830 NP_569831 NP_569832 NP_001363500 NP_001363501 NP_001363502 NP_001363503 NP_001363504 NP_001363505 NP_001363506 NP_001363507 NP_001363508 NP_001363509 NP_001363510 NP_001363511 NP_001363512 NP_001363513 NP_001363514 NP_001363515 NP_001363522 NP_001363523 NP_001363524 NP_001363525 NP_001363526 NP_001363527 NP_001363528 NP_001363529 NP_001363530 NP_001363531 NP_001363532 NP_001363533 NP_001363534 NP_001363535 NP_001363536 NP_001363537 NP_001363538 NP_001363539 NP_001363540 NP_001363541 NP_001363542 NP_001363543 NP_001363544 NP_001363545 NP_001363546 NP_001363547 NP_001363548 NP_001363549 NP_001363550 NP_001363551 NP_001363552 NP_001363553 NP_001363554 NP_001363555 NP_001363556 NP_001363557 NP_001363558 NP_001363559 NP_001363560 NP_001363561 NP_001363562 NP_001363563 NP_001363564 NP_001363565 NP_001363566 NP_001363567 NP_001363568 NP_001363569 NP_001363570 NP_001363571 NP_001363572 NP_001363573 NP_001363574 NP_001363575 NP_001363576 NP_001363577 NP_001363578 NP_001363579 NP_001363580 NP_001363581 NP_001363582 NP_001363583 NP_001363584 NP_001363585 NP_001363586 NP_001363587 NP_001363588 NP_001363589 NP_001363590 NP_001363591 NP_001363592	NP_001171190 NP_001171191 NP_663502
Расположение (UCSC)	Chr 11: 47,27 - 47,33 Мб	Chr 2: 91,14 - 91,18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок домена смерти, активирующий киназу MAP является фермент что у людей кодируется MADD ген.^[5][6][7]

Фактор некроза опухоли альфа (TNF-альфа) - это сигнальная молекула, которая взаимодействует с одним из двух рецепторов на клетках, нацеленных на апоптоз. Сигнал апоптоза передается внутри этих клеток цитоплазматическими адапторными белками. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой адаптерный белок, содержащий домен смерти, который взаимодействует с доменом смерти рецептора 1 TNF-альфа для активации митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK) и распространения апоптотического сигнала. Он связан с мембраной и экспрессируется на более высоком уровне в неопластических клетках, чем в нормальных клетках. Для этого гена описано несколько вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110514 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040687 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Schievella AR, Chen JH, Graham JR, Lin LL (июнь 1997 г.). «MADD, новый белок домена смерти, который взаимодействует с рецептором фактора некроза опухоли 1 типа и активирует митоген-активированную протеинкиназу». J Biol Chem. 272 (18): 12069–75. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12069. PMID  9115275.
6. Чоу В.Т., Лим К.М., Лим Д. (ноябрь 1998 г.). «Ген DENN человека: геномная организация, альтернативный сплайсинг и локализация в хромосоме 11p11.21-p11.22». Геном. 41 (4): 543–52. Дои:10.1139 / gen-41-4-543. PMID  9796103.
7. «Ген Entrez: MADD MAP-киназа, активирующая домен смерти».

дальнейшее чтение

• Чоу В.Т., Ли СС (1997). «DENN, новый ген человека, дифференциально экспрессирующийся в нормальных и опухолевых клетках». ДНК Seq. 6 (5): 263–73. Дои:10.3109/10425179609020873. PMID  8988362.
• Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID  9205841.
• Чжан Ю., Чжоу Л., Миллер CA (1998). «Сплайсинговый вариант белка домена смерти, который регулируется митоген-активируемой киназой, является субстратом для N-концевой киназы c-Jun в центральной нервной системе человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (5): 2586–91. Дои:10.1073 / pnas.95.5.2586. ЧВК  19423. PMID  9482930.
• Судзуки Ю., Исихара Д., Сасаки М. и др. (2000). «Статистический анализ 5'-нетранслируемой области мРНК человека с использованием библиотек кДНК« олиго-кэпированных »». Геномика. 64 (3): 286–97. Дои:10.1006 / geno.2000.6076. PMID  10756096.
• Теллиез Дж. Б., Бин К. М., Лин Л. Л. (2000). «LRDD, новый белок, содержащий повторы и домен смерти, богатый лейцином». Биохим. Биофиз. Acta. 1478 (2): 280–8. Дои:10.1016 / S0167-4838 (00) 00029-7. PMID  10825539.
• Ивасаки К., Тойонага Р. (2000). «Гомолог фактора обмена Rab3 GDP / GTP AEX-3 выполняет двойную функцию в синаптической передаче». EMBO J. 19 (17): 4806–16. Дои:10.1093 / emboj / 19.17.4806. ЧВК  302062. PMID  10970871.
• Аль-Зуби AM, Ефимова Е.В., Кайтхамана С. и др. (2002). «Противоположные эффекты IG20 и его изоформ сплайсинга, MADD и DENN-SV, на апоптоз, индуцированный фактором некроза опухоли альфа, и активацию каспазы-8 и -3». J. Biol. Chem. 276 (50): 47202–11. Дои:10.1074 / jbc.M104835200. PMID  11577081.
• Лим К.М., Чоу В.Т. (2002). «Индукция выраженного апоптоза в линиях раковых клеток млекопитающих путем обработки антисмысловой ДНК для отмены экспрессии DENN (дифференциально экспрессируется в нормальных и опухолевых клетках)». Мол. Канцероген. 35 (3): 110–26. Дои:10.1002 / mc.10082. PMID  12410563. S2CID  21107199.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белок-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ефимова Е., Мартинез О., Локшин А. и др. (2004). «IG20, вариант сплайсинга MADD, увеличивает восприимчивость клеток к гамма-облучению и индуцирует растворимые медиаторы, которые подавляют рост опухолевых клеток». Рак Res. 63 (24): 8768–76. PMID  14695193.
• Ефимова Е.В., Аль-Зуби А.М., Мартинес О. и др. (2004). «IG20, в отличие от DENN-SV, (варианты сплайсинга MADD) подавляет выживаемость опухолевых клеток и увеличивает их восприимчивость к апоптозу и противораковым препаратам». Онкоген. 23 (5): 1076–87. Дои:10.1038 / sj.onc.1207210. PMID  14716293.
• Лим К.М., Йео В.С., Чоу В.Т. (2004). «Антисмысловое прекращение экспрессии DENN вызывает апоптоз лейкозных клеток in vitro, вызывает регрессию опухоли in vivo и изменяет транскрипцию генов, участвующих в апоптозе и клеточном цикле». Int. J. Рак. 109 (1): 24–37. Дои:10.1002 / ijc.11660. PMID  14735464. S2CID  10327890.
• Дель Вильяр К., Миллер КА (2004). «Подавление DENN / MADD, белка, связывающего рецептор TNF, коррелирует с гибелью нейронных клеток в нейронах мозга и гиппокампа при болезни Альцгеймера». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (12): 4210–5. Дои:10.1073 / pnas.0307349101. ЧВК  384720. PMID  15007167.
• Xu Y, Kulkosky J, Acheampong E, et al. (2004). «ВИЧ-1-опосредованный апоптоз нейрональных клеток: проксимальные молекулярные механизмы ВИЧ-1-индуцированной энцефалопатии». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (18): 7070–5. Дои:10.1073 / pnas.0304859101. ЧВК  406467. PMID  15103018.
• Рамасвами М., Ефимова Е.В., Мартинес О. и др. (2005). «IG20 (вариант сплайсинга 5 MADD), проапоптотический белок, взаимодействует с DR4 / DR5 и усиливает индуцированный TRAIL апоптоз за счет увеличения рекрутирования FADD и каспазы-8 на DISC». Онкоген. 23 (36): 6083–94. Дои:10.1038 / sj.onc.1207804. PMID  15208670.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ху Ю.Ф., Чжан Х.Л., Цай Т. и др. (2006). «Интерактом ИА-2» (PDF). Диабетология. 48 (12): 2576–81. Дои:10.1007 / s00125-005-0037-у. PMID  16273344. S2CID  9765497.