MCF2 - MCF2

MCF2
Идентификаторы
Псевдонимы	MCF2, ARHGEF21, DBL, MCF.2 трансформирующая последовательность, полученная из клеточной линии
Внешние идентификаторы	OMIM: 311030 MGI: 96932 ГомолоГен: 3917 Генные карты: MCF2
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq27.1 Начните 139,581,770 бп[1] Конец 139,708,227 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A6 | X 33,5 см Начните 60,055,956 бп[2] Конец 60,179,089 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • цитоскелет • мембрана Биологический процесс • регуляция передачи сигнала белка Rho • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • положительная регуляция апоптотического процесса • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • отрицательная регуляция аксоногенеза • развитие дендритов • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4168	109904
Ансамбль	ENSG00000101977	ENSMUSG00000031139
UniProt	P10911	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001099855 NM_001171876 NM_001171877 NM_001171878 NM_001171879 NM_005369	NM_001289730 NM_001289731 NM_133197 NM_001358998 NM_001358999 NM_001359000 NM_001359001
RefSeq (белок)	NP_001093325 NP_001165347 NP_001165348 NP_001165349 NP_001165350 NP_005360	н / д
Расположение (UCSC)	Chr X: 139,58 - 139,71 Мб	Chr X: 60.06 - 60.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

В Протоонкоген DBL это белок что у людей кодируется MCF2 ген.^[5][6][7]

Часто используемое имя DBL происходит от «диффузной В-клеточной лимфомы», рак тип, в котором этот ген был впервые идентифицирован как онкоген,^[8] а имя MCF2 Название происходит от «трансформирующей последовательности, полученной из линии клеток MCF.2».^[9]

DBL - член-основатель большой семьи факторы обмена гуаниновых нуклеотидов которые имеют общие DBL-гомология (DH) домен), поэтому DBL также называется членом этого семейства RhoGEF как ARHGEF21. Домены DH функционируют для активации малые GTPases из Семья Ро облегчая выпуск ВВП от неактивной Rho GTPase и связывания GTP чтобы активировать его. В частности, DBL активирует члена семьи Ро. Cdc42.^[10]

Генные рекомбинации, которые приводят к потере N-концевых областей, производят варианты MCF2 с онкогенной активностью. [Поставляется OMIM]^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101977 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031139 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ногучи Т., Галланд Ф., Батоз М., Маттей М.Г., Бирнбаум Д. (декабрь 1988 г.). «Активация онкогена mcf.2 путем делеции аминоконцевых кодирующих последовательностей». Онкоген. 3 (6): 709–15. PMID  2577874.
6. Галланд Ф, Стефанова М, Лафаж М, Бирнбаум Д (июль 1992 г.). «Локализация 5 'конца онкогена MCF2 на хромосоме 15q15 ---- q23 человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 60 (2): 114–6. Дои:10.1159/000133316. PMID  1611909.
7. «Ген Entrez: трансформирующая последовательность, полученная из линии клеток MCF2 MCF.2».
8. Ева А., Ааронсон С.А. (18 июля 1985 г.). «Выделение нового онкогена человека из диффузной В-клеточной лимфомы». Природа. 316 (6025): 273–5. Дои:10.1038 / 316273a0. PMID  3875039. S2CID  4268140.
9. Ногучи Т., Маттей М.Г., Оберле И., Планш Дж., Имбер Дж., Пеласси С. и др. (Май 1987 г.). «Локализация трансформирующей последовательности mcf.2 в Х-хромосоме». Журнал EMBO. 6 (5): 1301–7. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02368.x. ЧВК  553933. PMID  3038515.
10. Fort P, Blangy A (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды». Геномная биология и эволюция. 9 (6): 1471–1486. Дои:10.1093 / gbe / evx100. ЧВК  5499878. PMID  28541439.

дальнейшее чтение

• Рон Д., Заннини М., Льюис М., Викнер Р. Б., Хант Л. Т., Грациани Г. и др. (Апрель 1991 г.). «Область proto-dbl, необходимая для его трансформирующей активности, демонстрирует сходство последовательностей с геном дрожжевого клеточного цикла, CDC24, и геном кластера точки останова человека, bcr». Новый биолог. 3 (4): 372–9. PMID  2065022.
• Троник С.Р., Макбрайд О.В., Попеску Н.С., Ева А. (октябрь 1989 г.). «Хромосомная локализация последовательностей онкогенов DBL». Геномика. 5 (3): 546–53. Дои:10.1016/0888-7543(89)90022-0. PMID  2613238.
• Рон Д., Троник С. Р., Ааронсон С. А., Ева А. (август 1988 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика протоонкогена dbl человека: доказательства того, что его сверхэкспрессия достаточна для трансформации клеток NIH / 3T3». Журнал EMBO. 7 (8): 2465–73. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb03093.x. ЧВК  457116. PMID  3056717.
• Ева А., Веккио Дж., Рао С.Д., Троник С.Р., Ааронсон С.А. (апрель 1988 г.). «Прогнозируемый онкогенный продукт DBL определяет отдельный класс трансформирующих белков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 85 (7): 2061–5. Дои:10.1073 / pnas.85.7.2061. ЧВК  279928. PMID  3281159.
• Шривастава С.К., Уилок Р.Х., Ааронсон С.А., Ева А. (декабрь 1986 г.). «Идентификация белка, кодируемого онкогеном диффузной В-клеточной лимфомы (dbl) человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 83 (23): 8868–72. Дои:10.1073 / пнас.83.23.8868. ЧВК  387034. PMID  3491366.
• Харт М.Дж., Ева А., Зангрилли Д., Ааронсон С.А., Эванс Т., Церионе Р.А., Чжэн Ю. «Клеточная трансформация и активность обмена гуаниновых нуклеотидов катализируются общим доменом на продукте онкогена dbl». Журнал биологической химии. 269 (1): 62–5. PMID  8276860.
• Нисида К., Казиро Ю., Сато Т. (октябрь 1999 г.). «Ассоциация протоонкогенного продукта dbl с субъединицами бета-гамма G-белка». Письма FEBS. 459 (2): 186–90. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01244-2. PMID  10518015. S2CID  83524892.
• Като Дж., Казиро Ю., Сато Т. (февраль 2000 г.). «Активация фактора обмена гуаниновых нуклеотидов Dbl после ACK1-зависимого фосфорилирования тирозина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 268 (1): 141–7. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2106. PMID  10652228.
• Чжу К., Дебречени Б., Ли Р., Чжэн Ю. (август 2000 г.). «Идентификация Rho GTPase-зависимых сайтов в домене гомологии Dbl онкогенного Dbl, которые необходимы для трансформации». Журнал биологической химии. 275 (34): 25993–6001. Дои:10.1074 / jbc.M003780200. PMID  10854437.
• Пальмиери Дж., Де Францискис V, Казамассими А., Романо Дж., Турин А., Пингиторе П. и др. (Июль 2000 г.). «Протоонкоген dbl человека в 85 т.п.н. xq26 и определение сайта инициации транскрипции». Ген. 253 (1): 107–15. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00212-2. PMID  10925207.
• Джин С., Экстон Дж. Х. (ноябрь 2000 г.). «Активация RhoA ассоциацией Galpha (13) с Dbl». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 277 (3): 718–21. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3744. PMID  11062019.
• Чжу К., Дебрецен Б., Би Ф, Чжэн Ю. (январь 2001 г.). «Олигомеризация домена DH важна для индуцированной Dbl трансформации». Молекулярная и клеточная биология. 21 (2): 425–37. Дои:10.1128 / MCB.21.2.425-437.2001. ЧВК  86589. PMID  11134331.
• Ванни С., Манчини П., Гао И., Оттавиано С., Гуо Ф., Салани Б. и др. (Май 2002 г.). «Регулирование прото-Dbl путем нацеливания на внутриклеточную мембрану и стабильности белка». Журнал биологической химии. 277 (22): 19745–53. Дои:10.1074 / jbc.M111025200. PMID  11907027.
• Веннерберг К., Эллербрук С.М., Лю Р.Й., Карноуб А.Е., Берридж К., Дер С.Дж. (декабрь 2002 г.). «Сигналы RhoG параллельно с Rac1 и Cdc42». Журнал биологической химии. 277 (49): 47810–7. Дои:10.1074 / jbc.M203816200. PMID  12376551.
• Комай К., Окаяма Р., Китагава М., Яги Х., Чихара К., Сиодзава С. (декабрь 2002 г.). «Альтернативные варианты сплайсинга протоонкогена DBL человека (MCF-2)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 299 (3): 455–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02645-1. PMID  12445822.
• Комай К., Мукаэ-Сакаири Н., Китагава М., Сиодзава С. (октябрь 2003 г.). «Характеристика новых вариантов сплайсинга мышиного протоонкогена MCF-2 (DBL)» (PDF). Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 309 (4): 906–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.08.088. PMID  13679059.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р. и др. (Январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.