MED25 - MED25

MED25
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2KY6, 2L6U, 2XNF, 2L23
Идентификаторы
Псевдонимы	MED25, ACID1, ARC92, CMT2B2, P78, PTOV2, BVSYS, TCBAP0758, субъединица 25 медиаторного комплекса
Внешние идентификаторы	OMIM: 610197 MGI: 1922863 ГомолоГен: 12614 Генные карты: MED25
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.33 Начинать 49,818,279 бп[1] Конец 49,840,383 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B3 | 7 28,95 см Начинать 44,876,765 бп[2] Конец 44,892,712 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • связывание рецептора ретиноевой кислоты • связывание рецептора ретиноида X Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • посреднический комплекс Биологический процесс • положительная регуляция остановки клеточного цикла • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция связывания хроматина • отрицательная регуляция пролиферации фибробластов • положительная регуляция сборки медиаторного комплекса • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	81857	75613
Ансамбль	ENSG00000104973	ENSMUSG00000002968
UniProt	Q71SY5	Q8VCB2
RefSeq (мРНК)	NM_030973 NM_001378355	NM_029365 NM_001331206 NM_001331207 NM_001331208
RefSeq (белок)	NP_112235 NP_001365284	NP_001318135 NP_001318136 NP_001318137 NP_083641
Расположение (UCSC)	Chr 19: 49,82 - 49,84 Мб	Chr 7: 44,88 - 44,89 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 25 является фермент что у людей кодируется MED25 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

MED25 был показан взаимодействовать с MED4.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104973 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002968 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
6. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
7. «Ген Entrez: медиатор MED25 транскрипции РНК-полимеразы II, субъединица 25 гомолог (S. cerevisiae)».
8. Томомори-Сато К., Сато С., Пармели Т.Дж., Бэнкс Калифорния, Сорокина И., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Уошберн М.П., ​​Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж.В. (февраль 2004 г.). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». Журнал биологической химии. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.

дальнейшее чтение

• Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W., Tjian R (апрель 1999 г.). «Комбинированный коактиватор ARC опосредует активацию транскрипции, направленную на хроматин». Природа. 398 (6730): 828–32. Дои:10.1038/19789. PMID  10235267. S2CID  23646963.
• Ван К., Маккарти И.М., Балаш Л., Ли Ю., Штайнер М.С. (август 2002 г.). «КДНК, полученная из простаты, которая картирована на хромосоме 19 человека, кодирует новый белок». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 296 (2): 281–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00872-0. PMID  12163014.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния, Пармели Т.Дж., Сорокина И., Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж. У. (декабрь 2003 г.). "Гомолог транскрипционного коактиватора Drosophila melanogaster интерсекс у млекопитающих является субъединицей комплекса медиатора млекопитающих". Журнал биологической химии. 278 (50): 49671–4. Дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID  14576168.
• Томомори-Сато К., Сато С., Пармели Т.Дж., Бэнкс Калифорния, Сорокина И., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Уошберн М.П., ​​Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж.В. (февраль 2004 г.). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». Журнал биологической химии. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.
• Mittler G, Stühler T., Santolin L, Uhlmann T., Kremmer E, Lottspeich F, Berti L, Meisterernst M (декабрь 2003 г.). «Новый сайт стыковки на Mediator имеет решающее значение для активации VP16 в клетках млекопитающих». Журнал EMBO. 22 (24): 6494–504. Дои:10.1093 / emboj / cdg619. ЧВК  291814. PMID  14657022.
• Ян Ф., ДеБомонт Р., Чжоу С., Няэр А.М. (февраль 2004 г.). «Привлекаемая активатором субъединица коактиватора / кофактора / медиатора ARC92 является функционально важной мишенью активатора транскрипции VP16». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (8): 2339–44. Дои:10.1073 / pnas.0308676100. ЧВК  356952. PMID  14983011.
• Сато С., Томомори-Сато К., Пармели Т.Дж., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Суонсон С.К., Бэнкс Калифорния, Джин Дж., Цай Й., Уошберн М.П., ​​Конавей Д.В., Конавей Р.К. (июнь 2004 г.). «Набор консенсусных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Молекулярная клетка. 14 (5): 685–91. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID  15175163.
• Чжан X, Крутчинский А., Фукуда А., Чен В., Ямамура С., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (июль 2005 г.). «MED1 / TRAP220 существует преимущественно в субпопуляции TRAP / медиатора, обогащенной РНК-полимеразой II, и необходим для ER-опосредованной транскрипции». Молекулярная клетка. 19 (1): 89–100. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.05.015. PMID  15989967.
• Ли HK, Пак UH, Ким EJ, Ум SJ (август 2007 г.). «MED25 отличается от TRAP220 / MED1 тем, что взаимодействует с CBP для активации ретиноидных рецепторов». Журнал EMBO. 26 (15): 3545–57. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601797. ЧВК  1949011. PMID  17641689.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о невропатии Шарко-Мари-Тута 2 типа