MED4 - MED4

MED4
Идентификаторы
Псевдонимы	MED4, ARC36, DRIP36, HSPC126, TRAP36, VDRIP, субъединица комплекса медиатора 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 605718 MGI: 1914631 ГомолоГен: 8568 Генные карты: MED4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q14.2 Начните 48,053,323 бп[1] Конец 48,095,131 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 D3 Начните 73,510,025 бп[2] Конец 73,518,849 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора тироидного гормона • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • связывание рецептора витамина D • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • основной медиаторный комплекс • мембрана • ядро клетки • посреднический комплекс • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • сигнальный путь рецептора андрогена • сигнальный путь внутриклеточного рецептора стероидного гормона • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	29079	67381
Ансамбль	ENSG00000136146	ENSMUSG00000022109
UniProt	Q9NPJ6	Q9CQA5
RefSeq (мРНК)	NM_014166 NM_001270629	NM_026119
RefSeq (белок)	NP_001257558 NP_054885	NP_080395
Расположение (UCSC)	Chr 13: 48.05 - 48.1 Мб	Chr 14: 73,51 - 73,52 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Med4
Идентификаторы
Символ	Med4
Pfam	PF10018
ИнтерПро	IPR019258
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 4 также известен как медиаторный комплекс субъединица 4 (MED4), компонент Посредник или Белковый комплекс, взаимодействующий с рецептором витамина D3, 36 кДа компонент (DRIP36) - это белок что у людей кодируется MED4 ген.^[5][6][7]

Функция

В белок кодируемый этим геном, является компонентом рецептор витамина D -взаимодействующий белок (КАПИТАТЬ ) комплекс, который функционирует как ядерный рецептор коактиватор. Комплекс DRIP способен активировать ядерные рецепторы лиганд-зависимым образом.^[6]

Взаимодействия

MED4 был показан взаимодействовать с участием MED25.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136146 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022109 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: медиатор MED4 транскрипции РНК-полимеразы II, гомолог субъединицы 4 (S. cerevisiae)».
6. Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Näär AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (апрель 1999 г.). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Природа. 398 (6730): 824–8. Дои:10.1038/19783. PMID  10235266.
7. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
8. Томомори-Сато К., Сато С., Пармели Т.Дж., Бэнкс Калифорния, Сорокина И., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Уошберн М.П., ​​Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж.В. (февраль 2004 г.). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.

дальнейшее чтение

• Конавей Дж. У., Флоренс Л., Сато С., Томомори-Сато С., Пармели Т. Дж., Яо Т., Суонсон С. К., Бэнкс Калифорния, член парламента Уошберна, Конавей Р.К. (2005). «Медиаторный комплекс млекопитающих». FEBS Lett. 579 (4): 904–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.11.031. PMID  15680972.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Икс, Цинь Дж., Рёдер Р.Г. (1999). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Ячейка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
• Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Näär AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (1999). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Природа. 398 (6730): 824–8. Дои:10.1038/19783. PMID  10235266.
• Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (1999). «Комбинированный коактиватор ARC опосредует активацию транскрипции, направленную на хроматин». Природа. 398 (6730): 828–32. Дои:10.1038/19789. PMID  10235267.
• Малик С., Гу В., Ву В., Цинь Дж., Родер Р. (2000). «Произведенный в США транскрипционный коактиватор PC2 является субмодулем TRAP / SMCC и действует синергетически с другими ПК». Мол. Ячейка. 5 (4): 753–60. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80254-3. PMID  10882111.
• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.