MED6 - MED6

MED6
Идентификаторы
Псевдонимы	MED6, ARC33, NY-REN-28, субъединица медиаторного комплекса 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 602984 MGI: 1917042 ГомолоГен: 3990 Генные карты: MED6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q24.2 Начните 70,581,257 бп[1] Конец 70,600,690 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 D1 Начните 81,573,557 бп[2] Конец 81,595,008 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • посреднический комплекс • основной медиаторный комплекс • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Сборка транскрипционного преинициативного комплекса РНК-полимеразы II • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10001	69792
Ансамбль	ENSG00000133997	ENSMUSG00000002679
UniProt	O75586	Q921D4
RefSeq (мРНК)	NM_005466 NM_001284209 NM_001284210 NM_001284211	NM_027213 NM_001347384 NM_001347385 NM_001347386
RefSeq (белок)	NP_001271138 NP_001271139 NP_001271140 NP_005457	NP_001334313 NP_001334314 NP_001334315
Расположение (UCSC)	Chr 14: 70,58 - 70,6 Мб	Chr 12: 81,57 - 81,6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Med6
Идентификаторы
Символ	Med6
Pfam	PF04934
ИнтерПро	IPR007018
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 6 является одним из подразделений Медиаторный комплекс. Это фермент что у людей кодируется MED6 ген.^[5][6][7]

Семейство белков

Эта семейство белков представляют собой субъединицу 6 белка-медиатора транскрипции, которая необходима для активация многих РНК-полимеразы II промоутеры и которые консервированный от дрожжи к люди.^[5]

Взаимодействия

MED6 был показан взаимодействовать с участием:

• Циклинзависимая киназа 8,^{[8][9][10][11]}
• Рецептор эстрогена альфа,^[11]
• MED21,^[12] и
• Рецептор гормона щитовидной железы альфа.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133997 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002679 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли Ю.К., Мин С., Гим Б.С., Ким Ю.Дж. (август 1997 г.). «Белок-медиатор транскрипции, который необходим для активации многих промоторов РНК-полимеразы II и сохраняется от дрожжей до человека». Мол. Cell. Биол. 17 (8): 4622–32. Дои:10.1128 / MCB.17.8.4622. ЧВК  232315. PMID  9234719.
6. Jiang YW, Veschambre P, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Conaway JW, Conaway RC, Kornberg RD (август 1998 г.). "Медиатор транскрипции у млекопитающих и его возможная роль в качестве конечной точки путей передачи сигнала". Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (15): 8538–8543. Bibcode:1998PNAS ... 95.8538J. Дои:10.1073 / пнас.95.15.8538. ЧВК  21111. PMID  9671713.
7. «Ген Entrez: медиатор MED6 транскрипции РНК-полимеразы II, гомолог субъединицы 6 (S. cerevisiae)».
8. Ян Ф., ДеБомонт Р., Чжоу С., Няэр А.М. (февраль 2004 г.). «Привлекаемая активатором субъединица коактиватора / кофактора / медиатора ARC92 является функционально важной мишенью активатора транскрипции VP16». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (8): 2339–44. Bibcode:2004ПНАС..101.2339Y. Дои:10.1073 / pnas.0308676100. ЧВК  356952. PMID  14983011.
9. Ван Г, Кантин GT, Стивенс Дж. Л., Берк А. Дж. (Июль 2001 г.). «Характеристика медиаторных комплексов из ядерного экстракта клеток HeLa». Мол. Cell. Биол. 21 (14): 4604–13. Дои:10.1128 / MCB.21.14.4604-4613.2001. ЧВК  87123. PMID  11416138.
10. Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Икс, Цинь Дж., Родер Р.Г. (март 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Ячейка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
11. Кан Ю.К., Гермах М., Юань С.Х., Родер Р.Г. (март 2002 г.). «Коактиваторный комплекс TRAP / медиатор напрямую взаимодействует с альфа- и бета-рецепторами эстрогена через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2642–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.2642K. Дои:10.1073 / pnas.261715899. ЧВК  122401. PMID  11867769.
12. Сунь X, Чжан И, Чо Х, Рикерт П., Лис Э, Лейн В., Рейнберг Д. (август 1998 г.). «NAT, человеческий комплекс, содержащий полипептиды Srb, который действует как негативный регулятор активированной транскрипции». Мол. Ячейка. 2 (2): 213–22. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80131-8. PMID  9734358.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Сунь X, Чжан И, Чо Х, Рикерт П., Лис Э, Лейн В., Рейнберг Д. (1998). «NAT, человеческий комплекс, содержащий полипептиды Srb, который действует как негативный регулятор активированной транскрипции». Мол. Ячейка. 2 (2): 213–222. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80131-8. PMID  9734358.
• Гу В., Малик С., Ито М., Юань С.Х., Фонделл Д.Д., Чжан Х, Мартинес Э., Цинь Дж., Рёдер Р.Г. (1999). «Новый человеческий SRB / MED-содержащий кофакторный комплекс, SMCC, участвующий в регуляции транскрипции». Мол. Ячейка. 3 (1): 97–108. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80178-1. PMID  10024883.
• Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Икс, Цинь Дж., Рёдер Р.Г. (1999). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Ячейка. 3 (3): 361–370. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
• Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Näär AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (1999). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Природа. 398 (6730): 824–828. Bibcode:1999Натура.398..824р. Дои:10.1038/19783. PMID  10235266. S2CID  204992765.
• Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (1999). «Комбинированный коактиватор ARC опосредует активацию транскрипции, направленную на хроматин». Природа. 398 (6730): 828–832. Bibcode:1999Натура.398..828Н. Дои:10.1038/19789. PMID  10235267. S2CID  23646963.
• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Int. J. Рак. 83 (4): 456–464. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
• Ge K, Guermah M, Yuan CX, Ito M, Wallberg AE, Spiegelman BM, Roeder RG (2002). «Коактиватор транскрипции TRAP220 необходим для адипогенеза, стимулированного PPAR гамма 2». Природа. 417 (6888): 563–567. Bibcode:2002Натура 417..563Г. Дои:10.1038 / 417563a. PMID  12037571. S2CID  4432077.
• Като Ю., Хабас Р., Кацуяма Ю., Няар А. М., Хе Икс (2002). «Компонент комплекса ARC / Mediator, необходимый для передачи сигналов TGF beta / Nodal». Природа. 418 (6898): 641–646. Bibcode:2002Натура.418..641K. Дои:10.1038 / природа00969. PMID  12167862. S2CID  4330754.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния, Сорокина И., Пармели Т.Дж., Конг С.Е., Джин Дж., Цай Й., Лейн В.С., Брауэр С.С., Конавей Р.С., Конавей Д.В. (2003). «Идентификация медиаторных субъединиц млекопитающих с подобием дрожжевых медиаторных субъединиц Srb5, Srb6, Med11 и Rox3». J. Biol. Chem. 278 (17): 15123–15127. Дои:10.1074 / jbc.C300054200. PMID  12584197.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния, Пармели Т.Дж., Сорокина И., Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж. В. (2004). "Гомолог транскрипционного коактиватора Drosophila melanogaster интерсекс у млекопитающих является субъединицей комплекса медиатора млекопитающих". J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–49674. Дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID  14576168.
• Томомори-Сато К., Сато С., Пармели Т.Дж., Бэнкс КА, Сорокина И., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Уошберн М.П., ​​Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж.В. (2004). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–5851. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.
• Ян Ф., ДеБомонт Р., Чжоу С., Няэр А. М. (2004). «Привлекаемая активатором субъединица коактиватора / кофактора / медиатора ARC92 является функционально важной мишенью активатора транскрипции VP16». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (8): 2339–2344. Bibcode:2004ПНАС..101.2339Y. Дои:10.1073 / pnas.0308676100. ЧВК  356952. PMID  14983011.
• Сато С., Томомори-Сато К., Пармели Т.Дж., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Суонсон С.К., Бэнкс, Калифорния, Джин Дж., Цай Й., Уошберн М.П., ​​Конавей Д.В., Конавей Р.К. (2004). «Набор согласованных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Мол. Ячейка. 14 (5): 685–691. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID  15175163.
• Паври Р., Льюис Б., Ким Т.К., Дилворт Ф.Дж., Эрдджумент-Бромаж Х., Темпст П., де Мурсия Г., Эванс Р., Шамбон П., Рейнберг Д. (2005). «PARP-1 определяет специфичность пути передачи сигналов ретиноидов посредством прямой модуляции медиатора». Мол. Ячейка. 18 (1): 83–96. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.02.034. PMID  15808511.

внешние ссылки

• MED6 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• MED6 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR007018