MGME1 - MGME1

MGME1
Идентификаторы
ПсевдонимыMGME1, C20orf72, DDK1, MTDPS11, bA504H3.4, экзонуклеаза 1 поддержания митохондриального генома
Внешние идентификаторыOMIM: 615076 MGI: 1921778 ГомолоГен: 12573 Генные карты: MGME1
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение MGME1
Геномное расположение MGME1
Группа20p11.23Начинать17,969,018 бп[1]
Конец17,991,122 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001310338
NM_001310339
NM_052865
NM_001363738

NM_001289630
NM_001289631
NM_028984
NM_001355688

RefSeq (белок)

NP_001297267
NP_001297268
NP_443097
NP_001350667

NP_001276559
NP_001276560
NP_083260
NP_001342617

Расположение (UCSC)Chr 20: 17.97 - 17.99 МбChr 2: 144,27 - 144,28 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Поддерживающая экзонуклеаза 1 митохондриального генома, сокращенно MGME1, является фермент что у людей кодируется MGME1 ген.[5][6] MGME1 - это 344 аминокислоты длинный белок принадлежат к семейству нуклеаз PD- (D / E) XK.[5][6] Он локализуется на митохондрии где это важно для поддержания митохондриального генома. Мутации с потерей функции в MGME1 приводят к дефектам митохондриальной ДНК, включая истощение митохондриальной ДНК, дупликации, делеции и усиление промежуточных звеньев репликации.[6][5][7] Также происходит накопление 7S ДНК, короткой одноцепочечной линейной цепи ДНК. Дефицит MGME1 у человека приводит к мультисистемному митохондриальная болезнь.[5]

Функция

Активность MGME1 была изучена с использованием очищенного белка в бесклеточной среде. in vitro анализы. В совокупности эти исследования предполагают, что MGME1 выполняет функцию удаления одноцепочечных нуклеотидных лоскутов, которые возникают во время митохондриальная ДНК репликация и / или Ремонт ДНК. MGME1 отдает предпочтение разрезанию одноцепочечной ДНК со слабой активностью в отношении дуплексной ДНК и отсутствием активности в отношении РНК.[5][6] Он действует как эндо- / экзонуклеаза, требуя для расщепления свободный 5'- или 3'-конец.[5][6] MGME1 может разрезать субстраты с лоскутом 5´, которые имитируют промежуточные соединения праймера / ремонта.[5][8] Более того, MGME1 удаляет одноцепочечные 5´-лоскуты в анализах репликации реконструированной митохондриальной ДНК, где это необходимо для включения перевязка вновь синтезированной нити.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125871 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027424 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d е ж грамм Корнблюм С., Николлс Т.Дж., Хаак Т.Б., Шелер С., Пеева В., Данхаузер К. и др. (Февраль 2013). «Мутации с потерей функции в MGME1 нарушают репликацию мтДНК и вызывают мультисистемное митохондриальное заболевание». Природа Генетика. 45 (2): 214–9. Дои:10,1038 / нг.2501. ЧВК  3678843. PMID  23313956.
  6. ^ а б c d е Szczesny RJ, Hejnowicz MS, Steczkiewicz K, Muszewska A, Borowski LS, Ginalski K, Dziembowski A (март 2013 г.). «Идентификация новой митохондриальной эндо- / экзонуклеазы человека Ddk1 / c20orf72, необходимой для поддержания надлежащих уровней ДНК 7S». Исследования нуклеиновых кислот. 41 (5): 3144–61. Дои:10.1093 / nar / gkt029. ЧВК  3597694. PMID  23358826.
  7. ^ Николс Т.Дж., Журка Г., Пеева В., Шёлер С., Щесны Р.Дж., Цизевски Д. и др. (Декабрь 2014 г.). «Линейные фрагменты мтДНК и необычные перестройки мтДНК, связанные с патологической недостаточностью экзонуклеазы MGME1». Молекулярная генетика человека. 23 (23): 6147–62. Дои:10,1093 / hmg / ddu336. ЧВК  4222359. PMID  24986917.
  8. ^ а б Uhler JP, Thörn C, Nicholls TJ, Matic S, Milenkovic D, Gustafsson CM, Фалькенберг М (Июль 2016 г.). «MGME1 обрабатывает лоскуты в лигируемые разрывы во взаимодействии с ДНК-полимеразой γ во время репликации мтДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (12): 5861–71. Дои:10.1093 / нар / gkw468. ЧВК  4937333. PMID  27220468.