MHC класс III - MHC class III

MHC класс III группа белков, принадлежащих к классу главный комплекс гистосовместимости (MHC). В отличие от других типов MHC, таких как MHC класс I и MHC класс II, из которых их структура и функции в иммунная реакция хорошо определены, MHC класса III плохо определены структурно и функционально. Они не участвуют в антиген привязка (процесс, называемый презентация антигена, классическая функция белков MHC). Лишь немногие из них действительно задействованы в иммунитете, в то время как многие из них сигнальные молекулы в других сотовых коммуникациях. Они в основном известны по своим генам, потому что их кластер генов находится между группами генов класс I и класс II.[1] Кластер генов был обнаружен, когда гены (в частности, компоненты комплемента) C2, C4, и фактор B ) были обнаружены между генами класса I и класса II на коротком (p) плече хромосома человека 6. Позже было обнаружено, что он содержит множество генов различных сигнальных молекул, таких как факторы некроза опухоли (TNF) и белки теплового шока. Описано более 60 генов MHC класса III, что составляет около 28% от общего количества генов MHC (224).[2] Область в кластере генов MHC класса III, которая содержит гены TNF, также известна как MHC класса VI или воспалительная область.[3]

В отличие от других белков MHC, белки MHC класса III вырабатываются, среди прочего, клетками печени (гепатоцитами) и специальными лейкоцитами (макрофагами).

Структура гена

Гены MHC класса III у человека расположены на хромосоме 6 (6p21.3). Он занимает 700 т.п.н. и содержит 61 ген. Кластер генов - это наиболее генная область генома человека. Они в основном похожи на таковые у других животных. Функции многих генов пока неизвестны.[4] Многие ретроэлементы, такие как эндогенный ретровирус человека (HERV) и элементы Alu, расположены в кластере.[5] Область, содержащая гены G11 / C4 / Z / CYP21 / X / Y, варьирующийся по размеру от 142 до 214 т.п.н., известен как самый сложный кластер генов в геноме человека.[6].

Разнообразие

Гены MHC класса III подобны у человека, мыши, лягушки (Xenopus tropicalis) и серого короткохвостого опоссума, но не все гены являются общими. Например, человек NCR3, MIC и MCCD1 отсутствуют у мыши. Человек NCR3 и LST1 отсутствуют у опоссума.[3] Однако птицы (курица и перепел) имеют только один ген, который кодирует ген компонента комплемента (C4).[7] У рыб гены распределены в разных хромосомах.[8]

Рекомендации

  1. ^ Груэн, младший; Вайсман, С.М. (2001). «Гены MHC класса III и IV человека и ассоциации болезней». Границы биологических наук. 6 (3): D960-172. Дои:10.2741 / A658. PMID  11487469.
  2. ^ Консорциум по секвенированию MHC (1999). «Полная последовательность и генная карта главного комплекса гистосовместимости человека». Природа. 401 (6756): 921–923. Bibcode:1999Натура.401..921Т. Дои:10.1038/44853. PMID  10553908. S2CID  186243515.
  3. ^ а б Дикин, Джанин Э; Папенфус, Энтони Т; Белов, Катерина; Кросс, Джозеф Г.Р .; Коггилл, Пенни; Палмер, Софи; Симс, Сара; Скорость, Теренс П; Бек, Стефан; Грейвс, Дженнифер (2006). «Эволюция и сравнительный анализ воспалительной области MHC Class III». BMC Genomics. 7 (1): 281. Дои:10.1186/1471-2164-7-281. ЧВК  1654159. PMID  17081307.
  4. ^ Се, Т; Роуэн, L; Агуадо, B; Ahearn, ME; Мадан, А; Цинь, S; Кэмпбелл, РД; Худ, L (2003). «Анализ области класса III главного комплекса гистосовместимости с плотным геном и его сравнение с мышью». Геномные исследования. 13 (12): 2621–36. Дои:10.1101 / гр.1736803. ЧВК  403804. PMID  14656967.
  5. ^ Докинз, Р. Leelayuwat, C; Гаудиери, S; Тай, G; Хуэй, Дж; Каттлея, S; Мартинес, П.; Кульски, J (1999). «Геномика главного комплекса гистосовместимости: гаплотипы, дупликация, ретровирусы и болезни». Иммунологические обзоры. 167: 275–304. Дои:10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01399.x. PMID  10319268. S2CID  9924684.
  6. ^ Милнер, СМ; Кэмпбелл, RD (2001). «Генетическая организация области III класса MHC человека». Границы биологических наук. 6 (3): D914-926. Дои:10.2741 / A653. PMID  11487476.
  7. ^ Шиина, Т; Симидзу, S; Хосомити, К; Кохара, S; Ватанабэ, S; Hanzawa, K; Бек, S; Кульски, JK; Иноко, Х (2004). «Сравнительный геномный анализ двух областей MHC птиц (перепела и курица)». Журнал иммунологии. 172 (11): 6751–63. Дои:10.4049 / jimmunol.172.11.6751. PMID  15153492.
  8. ^ Sambrook, JG; Фигероа, Ф; Бек, S (2005). «Полногеномный обзор генов главного комплекса гистосовместимости (MHC) и их паралогов у рыбок данио». BMC Genomics. 6: 152. Дои:10.1186/1471-2164-6-152. ЧВК  1309616. PMID  16271140.